谢瓦氏曲霉间型变种YchF基因cDNA全长克隆及序列分析

从谢瓦氏曲霉间型变种抑制性差减杂交(SSH)文库中,筛选到一个子囊孢子时期差异表达的序列标签A0128.860,以其序列为模板设计特异性引物,利用RT-PCR及RACE技术克隆获得了该基因的全长cD-NA,命名为eYchF。生物信息学分析显示,该基因包含一个1182bp的完整开放阅读框(ORF),编码393个氨基酸,相对分子质量为43.4669kD,预测的理论等电点为6.99,包括一个保守的G domain(guanine nucleotide-binding domain)和一个TGS(ThrRS,GTPase,Spo T)domain,为疏水蛋白。序列同源性分析表明:该基因与棒曲霉(Aspergillus clavatus NRRL1)的GTP结合蛋白YchF相似度为84%,谢瓦氏曲霉间型变种YchF基因的克隆及生物信息学分析为YchF的进一步研究奠定了基础。

依赖于核糖体的NTP酶YchF和YihA的结合特性及酶活性研究（英文）

P-环NTP酶(GTP酶和ATP酶)普遍存在于真核生物和原核生物中,参与调节不同的细胞进程.Ych F和Yih A是细菌中两种高度保守的NTP酶,但其生理功能仍然不清楚.之前的研究表明这两种NTP酶可以与核糖体或者核糖体亚基结合.我们检测了在不同核苷酸存在的情况下,大肠杆菌Y ch F和Yih A蛋白与核糖体30S、50S、70S颗粒的结合情况,同时也探究了核糖体亚基的结合是否与N TP酶活性的激活有关.数据表明Ych F与70S结合,Yih A与50S结合.70S核糖体能同时激活Y ch F的ATP酶和GTP酶活性.然而Yih A的GTP酶活性可以分别被50S和70S激活,并且70S呈现了8.8倍的激活效应.这些数据为进一步研究这两种保守的NTPase的生理功能奠定了基础.

特异性GTP酶YchF及其在蛋白质生物合成中的功能研究进展

GTP酶是一类参与多种重要细胞过程的蛋白质,例如信号转导、核糖体组装、细胞运动、细胞内转运和翻译等。在真核生物、细菌和古细菌中存在一组普遍保守的GTP酶,YchF是其中之一,这些普遍保守的GTP酶一般参与细胞中的蛋白质翻译、核糖体合成和蛋白质的靶向运输等。除YchF功能未知之外,其余酶的功能均与蛋白质的生物合成或核糖体组装相关。蛋白质是生物体内具有重要功能的大分子,核糖体的异常组装会导致胞内蛋白生物合成紊乱,严重时导致细胞死亡从而对机体造成伤害。探讨YchF及其同源物的功能具有重要的现实意义。本文从YchF的结构出发,探讨其结构可能具备的功能、结合蛋白的研究进展,以期为揭示YchF在细胞中的功能提供研究思路。