lncRNA CASC9、YKT6在口腔鳞状细胞癌中表达意义及预后价值研究

目的探讨长链非编码RNA肿瘤易感性候选基因9(lncRNA CASC9)、YKT6在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中表达意义及预后价值。方法选取2016年1月至2018年1月在陕西中医药大学附属医院诊治的110例OSCC患者作为研究对象。采用实时荧光定量PCR法检测患者OSCC癌组织及癌旁组织lncRNA CASC9、YKT6 mRNA表达。采用免疫组化检测OSCC癌组织及癌旁组织YKT6蛋白表达。Kaplan-Meier曲线分析不同lncRNA CASC9、YKT6 mRNA表达对OSCC患者预后的影响。Cox回归模型分析影响OSCC预后的因素。结果OSCC癌组织lncRNA CASC9、YKT6 mRNA表达分别为3.12±0.57、2.69±0.42,均明显高于癌旁组织(依次为1.02±0.25、1.13±0.21),差异有统计学意义(t=35.386、34.843,P<0.05)。OSCC癌组织YKT6蛋白阳性率为81.82%(90/110),高于癌旁组织[9.09%(10/110)],差异有统计学意义(χ^(2)=117.333,P<0.05)。OSCC癌组织lncRNA CASC9与YKT6 mRNA表达呈正相关(r=0.788,P<0.001)。TNM分期Ⅲ~Ⅳ期、低分化及有淋巴结转移的OSCC癌组织lncRNA CASC9、YKT6 mRNA表达高于TNM分期Ⅰ~Ⅱ期、高中分化及无淋巴结转移的OSCC癌组织lncRNA CASC9、YKT6 mRNA表达,差异有统计学意义(均P<0.05)。lncRNA CASC9高表达组、YKT6 mRNA高表达组5年累积生存率低于lncRNA CASC9低表达组、YKT6 mRNA低表达组,差异有统计学意义(Log-rankχ^(2)=7.080、8.741,P=0.008、0.003)。lncRNA CASC9高表达、YKT6 mRNA高表达、TNM分期Ⅲ~Ⅳ期、低分化及有淋巴结转移是OSCC患者预后危险因素。结论OSCC癌组织中lncRNA CASC9、YKT6表达升高,两者可作为评估OSCC患者预后的肿瘤标志物。

冠心病患者外周血单个核细胞YKT6基因表达及其临床意义

目的：研究YKT6在冠心病（coronary heart disease,CHD）患者外周血单个核细胞中的表达及其与疾病发生、发展的关系.方法：分别采用半定量逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）和Westen blot检测40例CHD患者和37例健康者YKT6 mRNA和蛋白表达.结果：CHD患者外周血单个核细胞中YKT6 mRNA和蛋白表达均明显高于健康者（P＜0.05）.结论：YKT6表达与CHD发生存在一定相关性,在CHD发病过程中可能起重要作用,为CHD的诊断和预防提供了新线索.

YKT6在非小细胞肺癌中的表达及临床意义

目的:探究YKT6在非小细胞肺癌中的表达情况,阐明YKT6表达与临床分期的关系以及对于非小细胞肺癌患者的诊断和预后价值。方法:通过TCGA、Ualcan、HPA等公共数据库,使用R语言(3.6.3版本) ggplot2包、pROC包、survival包等分析YKT6在非小细胞肺癌中的表达及其与预后的关系。结果:通过分析TCGA数据显示,YKT6在膀胱尿路上皮癌、乳腺癌等多种肿瘤中高表达。Ualcan数据库分析发现YKT6在肺腺癌和肺鳞癌组织中的表达水平高于癌旁组织,其表达与肺癌的病理分期呈显著相关。YKT6蛋白在肺腺癌和肺鳞癌组织中均呈中等水平以上的表达,而正常肺组织几乎不表达。K-M分析表明,YKT6的表达水平与肺腺癌患者的总生存呈显著负相关,而其表达上调对肺腺癌和肺鳞癌均具有诊断价值。结论:YKT6在非小细胞肺癌中表达上调,其表达与肺腺癌患者总生存显著相关,有望成为非小细胞肺癌诊断和治疗的潜在靶点。

长角血蜱Ykt6蛋白抗东方泰勒虫感染的生物学效应

为了解Ykt6基因在蜱体中影响东方泰勒虫感染的生物学效果,通过长角血蜱实验室培养株和野外株,评估Ykt6蛋白对东方泰勒虫侵染长角血蜱过程中蜱的存活率、繁殖率以及对东方泰勒虫感染率等指标的生物学效果。结果显示,Ykt6基因参与了东方泰勒虫与长角血蜱之间的宿主-寄生虫相互作用。Ykt6基因的表达水平与东方泰勒虫在长角血蜱体内的存活和繁殖能力密切相关,当该基因表达水平降低时,东方泰勒虫的存活率和繁殖能力显著下降。进一步的研究发现,Ykt6基因的变异可能影响东方泰勒虫与长角血蜱之间的相互作用。一些野外长角血蜱个体具有Ykt6基因的突变,导致东方泰勒虫在长角血蜱体内的存活和繁殖能力显著下降。这一发现提示,Ykt6基因的变异可能是东方泰勒虫入侵长角血蜱的一个关键因素。总之,Ykt6基因对东方泰勒虫入侵长角血蜱具有重要影响。通过研究Ykt6基因的功能和变异,可以深入了解东方泰勒虫与长角血蜱之间的相互作用,为控制东方泰勒虫入侵提供新的思路和方法。这将有助于保护人畜健康和生态环境的平衡。

YKT6蛋白的结构与功能及其在肿瘤中的研究进展

可溶性N-乙基马来酰亚胺敏感性因子附着蛋白受体(SNARE)蛋白是一类跨膜蛋白,能够介导突触小泡融合、递质释放和蛋白质转运等多种细胞过程。YKT6是SNARE蛋白家族的一员,参与多种囊泡运输途径,包括分泌、内吞和自噬。此外,YKT6还与肿瘤的发生及进展具有密切联系。全文总结了YKT6蛋白的结构和功能及其在肿瘤发生及进展中的重要作用。

Chemoproteomics identifies Ykt6 as the direct target of schisandrin A for neuroprotection

Schisandrin A is a natural dibenzocyclooctene lignan with potent neuroprotective activity.However,the specific mechanisms or direct target proteins have not been clarified up to now.In this study,we designed and synthesized the probes of schisandrin A with photoreactive diazirine and clickable alkyne to identify its direct target in SH-SY5Y cells by employing activity-based protein profiling(ABPP)technique.Ykt6 was prominent among the 13 proteins obtained with high confidence and we confirmed Ykt6 as the direct target of schisandrin A by CETSA,IF,SPR and knockdown assay.Functionally,schisandrin A protected the cells against the injury induced by glutamate by regulating autophagy via Ykt6.This discovery may provide a novel therapeutic option for various neuronal cell damage-mediated diseases.

Ykt6结构与膜融合功能研究进展

真核细胞含有复杂的内膜系统,细胞内的物质交换通过囊泡运输方式来完成。囊泡运输主要包括运输囊泡的出芽、定向移动、锚定和膜融合等过程,SNAREs蛋白在膜融合过程中发挥重要作用。SNAREs分为定位于运输囊泡上的v-SNARE和定位于靶位膜上的t-SNARE,二者相互作用形成SNARE复合体,促进膜融合的发生。Ykt6是真核生物高度保守的一种SNAREs蛋白,由N-末端longin结构域、SNARE core结构域和C-末端CAAX盒组成。细胞质中longin结构域、SNARE core结构域和脂质相互作用具有多种构象。棕榈酰化的Ykt6由无活性的自抑构象转变为有活性的开放构象参与囊泡转运过程,在膜融合和囊泡融合中起着重要作用。本文主要介绍近年来有关SNARE Ykt6的结构与功能研究进展。

脂质修饰引致的构象转换调控Longin结构域SNARE Ykt6的膜融合功能

SNARE蛋白在膜融合过程中起核心作用。绝大多数SNARE蛋白通过它们的跨膜结构域永久地锚定在膜上。

巴西橡胶树SNARE蛋白全长cDNA克隆及其序列特征分析

从巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)差减cDNA文库中筛选到一个与SNARE蛋白同源性较高的基因片段,根据其序列信息设计特异引物,采用cDNA末端快速扩增技术RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)进行差异片段的5′和3′端的扩增,获得了长度为1 070 bp的全长cDNA克隆R295。序列分析表明该基因包含600 bp的开放阅读框,5′-UTR为93 bp,3′-UTR为377 bp,编码199个氨基酸。该基因编码的蛋白具有一个SNARE coiled-coil保守区、一个典型的VAMP基元及一个羧基端的CAAX基元。同源分析表明该蛋白属于一类特殊的longins蛋白。RT-PCR检测表明它在胶乳中特异表达,在叶中没有表达。

自噬溶酶体调控机制及其与宫颈癌变的关系

宫颈癌是全世界女性发病率及死亡人数第4位的癌症[1],高危人乳头瘤病毒(high risk-human papilloma virus,HR-HPV)持续感染可导致女性患宫颈癌[2]。全世界每年新发宫颈癌病例中近1/3发生在中国,在中国宫颈癌仍是重要的公共卫生问题[3]。因此,深入研究HRHPV引起宫颈癌变的机制对于减少宫颈癌变的发生发展有非常重要的临床意义。自噬是高度诱导的细胞内降解系统。