目的:基于网络药理学从"多成分-多靶点-多通路"的角度探讨育阴软肝颗粒(Yuyin Ruangan granules,YRG)抗肝纤维化(hepatic fibrosis,HF)的物质基础与作用机制。方法:通过TCMSP数据库及CTD数据库筛选YRG中药的化学成分及其对应...目的:基于网络药理学从"多成分-多靶点-多通路"的角度探讨育阴软肝颗粒(Yuyin Ruangan granules,YRG)抗肝纤维化(hepatic fibrosis,HF)的物质基础与作用机制。方法:通过TCMSP数据库及CTD数据库筛选YRG中药的化学成分及其对应的作用靶点,采用CooLGeN和GeneCards数据库询查HF的靶点,利用DAVID数据库对HF靶点进行基因本体(gene-ontology, GO)分析与京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路分析,借助Cytoscape软件构建化合物-靶点、疾病-中药-成分-靶点及成分-靶点-通路网络;利用STRING数据库和Cytoscape软件绘制蛋白互作(protein protein interaction,PPI)网络图,并进行网络拓扑结构分析;最后通过Systems Dock Web Site对核心成分与核心靶点进行分子对接验证。结果:通过筛选共得到YRG中药的43个化学成分,433个YRG中药的靶点基因,HF的靶点基因共1 463个,通过两者的匹配,得到共同基因80个。通过化合物-靶点网络和PPI网络互作筛选出与HF相关度较大的核心成分是beta-sitosterol,stigmasterol,quercetin,oligopeptides,heparin等,核心靶点:信号转导与转录激活因子(signal transducer and activator of transcription3,STAT3)、白细胞介素(inter leukin 6,IL-6)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor, TNF-α)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor, EGFR)等。结论:YRG治疗HF是一个"多成分-多靶点-多通路"的复杂过程,为进一步研究YRG抗HF的物质基础及作用机制提供了理论依据。展开更多
文摘目的:基于网络药理学从"多成分-多靶点-多通路"的角度探讨育阴软肝颗粒(Yuyin Ruangan granules,YRG)抗肝纤维化(hepatic fibrosis,HF)的物质基础与作用机制。方法:通过TCMSP数据库及CTD数据库筛选YRG中药的化学成分及其对应的作用靶点,采用CooLGeN和GeneCards数据库询查HF的靶点,利用DAVID数据库对HF靶点进行基因本体(gene-ontology, GO)分析与京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路分析,借助Cytoscape软件构建化合物-靶点、疾病-中药-成分-靶点及成分-靶点-通路网络;利用STRING数据库和Cytoscape软件绘制蛋白互作(protein protein interaction,PPI)网络图,并进行网络拓扑结构分析;最后通过Systems Dock Web Site对核心成分与核心靶点进行分子对接验证。结果:通过筛选共得到YRG中药的43个化学成分,433个YRG中药的靶点基因,HF的靶点基因共1 463个,通过两者的匹配,得到共同基因80个。通过化合物-靶点网络和PPI网络互作筛选出与HF相关度较大的核心成分是beta-sitosterol,stigmasterol,quercetin,oligopeptides,heparin等,核心靶点:信号转导与转录激活因子(signal transducer and activator of transcription3,STAT3)、白细胞介素(inter leukin 6,IL-6)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor, TNF-α)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor, EGFR)等。结论:YRG治疗HF是一个"多成分-多靶点-多通路"的复杂过程,为进一步研究YRG抗HF的物质基础及作用机制提供了理论依据。