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陆地棉ZF-HD蛋白的全基因组分析
被引量:
4
1
作者
倪万潮
徐珍珍
沈新莲
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2016年第6期519-526,共8页
ZF-HD(Zinc finger-homeodomain)蛋白属于同源异型盒蛋白家族,在动植物发育过程中起重要的作用。利用生物信息学的手段,研究陆地棉标准系TM-1基因组中ZF-HD蛋白的数目、亚细胞定位、染色体分布、基序、进化关系和组织表达情况。TM-1中共...
ZF-HD(Zinc finger-homeodomain)蛋白属于同源异型盒蛋白家族,在动植物发育过程中起重要的作用。利用生物信息学的手段,研究陆地棉标准系TM-1基因组中ZF-HD蛋白的数目、亚细胞定位、染色体分布、基序、进化关系和组织表达情况。TM-1中共有35个Gh ZHD蛋白成员,且大部分成员定位到细胞核内;分布在20条染色体和2条Scaffold上,且具有11对直系同源基因;进化树分析表明,TM-1基因组中的ZF-HD蛋白大致分为6个小组,每个小组成员间具有类似的基序类型和排列顺序;大部分Gh ZHD基因在胚珠和纤维组织中表达,还有部分基因在根、茎、花、蕾和分生区中表达,在叶和愈伤组织中表达的基因最少。
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关键词
陆地棉
zf-hd蛋白
生物信息
组织表达分析
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职称材料
题名
陆地棉ZF-HD蛋白的全基因组分析
被引量:
4
1
作者
倪万潮
徐珍珍
沈新莲
机构
江苏省农业科学院经济作物研究所/农业部长江下游棉花和油菜重点实验室
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2016年第6期519-526,共8页
基金
国家科技重大专项--转基因生物新品种培育(2011ZX08005)
江苏省支撑计划(BE2014389)
文摘
ZF-HD(Zinc finger-homeodomain)蛋白属于同源异型盒蛋白家族,在动植物发育过程中起重要的作用。利用生物信息学的手段,研究陆地棉标准系TM-1基因组中ZF-HD蛋白的数目、亚细胞定位、染色体分布、基序、进化关系和组织表达情况。TM-1中共有35个Gh ZHD蛋白成员,且大部分成员定位到细胞核内;分布在20条染色体和2条Scaffold上,且具有11对直系同源基因;进化树分析表明,TM-1基因组中的ZF-HD蛋白大致分为6个小组,每个小组成员间具有类似的基序类型和排列顺序;大部分Gh ZHD基因在胚珠和纤维组织中表达,还有部分基因在根、茎、花、蕾和分生区中表达,在叶和愈伤组织中表达的基因最少。
关键词
陆地棉
zf-hd蛋白
生物信息
组织表达分析
Keywords
Gossypium hirsumm L.
zf-hd
protein
bioinformatics
tissue-expression analysis
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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作者
出处
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被引量
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1
陆地棉ZF-HD蛋白的全基因组分析
倪万潮
徐珍珍
沈新莲
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2016
4
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