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SOCS3、STEAP4、MK2和ZFP36基因间及基因-环境交互作用与新疆维吾尔族人群高血压的关联研究
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作者 张晶晶 姚晓光 +5 位作者 周玲 林娜 郭艳英 王红梅 王磊 李南方 《医学研究杂志》 2014年第2期22-27,共6页
目的研究SOCS3、STEAP4、MK2和ZFP36基因间及基因一环境交互作用与新疆维吾尔族人群高血压的相关性。方法采取以流行病学调查为基础的病例对照研究,选取872例维吾尔族自然人群(高血压组399例,正常对照组473例)作为研究对象。首先对S... 目的研究SOCS3、STEAP4、MK2和ZFP36基因间及基因一环境交互作用与新疆维吾尔族人群高血压的相关性。方法采取以流行病学调查为基础的病例对照研究,选取872例维吾尔族自然人群(高血压组399例,正常对照组473例)作为研究对象。首先对STEAP4、MK2及ZFP36进行测序筛查维吾尔族高血压患者的基因变异位点,然后选择出代表性变异位点,而SOCS3基因则是查阅文献后直接选择代表性的标签SNPs,之后应用TaqMan-PCR基因型鉴定和病例对照研究,并结合多因子降维法(multifactordimentionalityreduction,MDR)分析基因一基因、基因一环境的交互作用。结果4个基因的10个TagSNPs变异位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P〉0.05)。在高血压及对照组中SOCS3基因rs9914220位点及STEAP4基因rs8122位点基因型频率分布有差异(X2=7.07,P=0.029;矿=8.631,P=0.013)。单体型分析发现SOCS3基因H4G-C-A在对照组的频率高于高血压组(10.47%VS6.58%%),差异有统计学意义(P=0.006)。MDR结果显示,在所有模型中,SOCS3rs9914220基因和超重肥胖交互作用检验准确性最高,为61.58%,交叉验证一致性为10/10,P=0.001。应用Logistic回归分析校正性别、年龄、空腹血糖、TC、TG等影响因素后显示,SOCS3基因rs9914220(CC+CT)合并BMI作用增加新疆维吾尔族人群高血压发生风险(OR=1.025,95%CI:1.002-1.049,P=0.033)。结论SOCS3基因rs9914220(CC+CT)合并超重肥胖时可能进一步增加新疆维吾尔族人群高血压的风险。 展开更多
关键词 高血压病 新疆维吾尔族 交互作用 SOCS3基因 STEAP4基因 MK2基因 zfp36基因
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MK2、ZFP36基因变异与新疆维吾尔族人群高密度脂蛋白胆固醇水平的相关性 被引量:5
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作者 李南方 林娜 +3 位作者 姚晓光 王红梅 周玲 郭艳英 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期345-351,共7页
目的探讨MK2及ZFP36基因功能区多态位点与新疆和田地区维吾尔族人高密度脂蛋白胆固醇(highdensitytipoproteincholesterol,HDL—C)的相关性。方法应用整群随机抽样方法抽取930名维吾尔族人外周静脉血,检测其血脂水平以及肿瘤坏死因... 目的探讨MK2及ZFP36基因功能区多态位点与新疆和田地区维吾尔族人高密度脂蛋白胆固醇(highdensitytipoproteincholesterol,HDL—C)的相关性。方法应用整群随机抽样方法抽取930名维吾尔族人外周静脉血,检测其血脂水平以及肿瘤坏死因子-α,并在维吾尔族血脂异常人群中测序筛查MK2及ZFP36基因功能区的变异位点,选取代表性位点,应用TaqMan-PCR在大样本人群中进行基因型鉴定及病例一对照关联研究。结果(1)年龄小于50岁维吾尔族男性MK2基因rs45514798多态与HDL—C可能相关(P=0.054,控制年龄、吸烟、饮酒、腹围、腰臀比、体重指数、肿瘤坏死因子-α之后OR为0.261,95%CI为0.082~0.833)。(2)MK2基因rs45514798显性模型在小于50岁男性的不同基因型间总胆固醇、HDL—C水平、低密度脂蛋白胆固醇水平的差异具有统计学意义(P均〈0.05)。小于50岁女性中rs45514798显性模型基因型间总胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇差异具有统计学意义(P〈0.05)。(3)ZFP36基因多态性的基因型在低HDL—C组和对照组分布比较差异无统计学意义。结论MK2基因rs45514798位点可能与年龄小于50岁的新疆维吾尔族男性HDL—C相关,ZFP36基因与新疆维吾尔族人群HDL—C不相关。 展开更多
关键词 MK2基因 zfp36基因 遗传多态性 维吾尔族 高密度脂蛋白胆固醇
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锌指蛋白36基因变异与新疆维吾尔族人群肥胖的相关性研究 被引量:2
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作者 努尔布维·吐尔孙 姚晓光 +5 位作者 李南方 郭艳英 张菊红 严治涛 周玲 洪静 《中华生物医学工程杂志》 CAS 2013年第2期110-116,共7页
目的 研究锌指蛋白36(ZFP36)基因多态性与新疆维吾尔族人群肥胖的相关性.方法 采用整群随机抽样方法抽取932例维吾尔族人群作为研究对象,检测其表型资料.在48例维吾尔族肥胖人群中测序筛查ZFP36基因功能区的变异位点,选取代表性变异位... 目的 研究锌指蛋白36(ZFP36)基因多态性与新疆维吾尔族人群肥胖的相关性.方法 采用整群随机抽样方法抽取932例维吾尔族人群作为研究对象,检测其表型资料.在48例维吾尔族肥胖人群中测序筛查ZFP36基因功能区的变异位点,选取代表性变异位点.应用TaqMan-PCR在大样本人群中进行基因型鉴定及病例-对照关联研究.结果 ZFP36基因rs3746083位点CC、CT、TT基因型及C、T等位基因在按体质量指数(BMI)分组的肥胖、超重、正常组分布频率差异无统计学意义(P>0.05).按腰围分组的腹型肥胖组和正常组之间该位点3种基因型分布频率差异无统计学意义(P>0.05),但其等位基因分布频率差异有统计学意义(x2=14.314,P<0.05).在男性腹型肥胖组和正常组间,rs3746083位点CC、CT、TT基因型及C、T等位基因分布频率差异有统计学意义(x2=6.264,x2=8.307,P<0.05),但在女性差异却无统计学意义(P>0.05).rs3746083位点CT+TT基因型与CC基因型之间与空腹血糖浓度及胰岛素抵抗指数差异有统计学意义(P<0.05).rs251864基因型在男性腹型肥胖组和正常组之间的AA、AG、GG种基因型频率差异有统计学意义(P<0.05),但在女性两组之间rs251864 3种基因型及等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05).结论 ZFP36基因rs3746083变异位点与维吾尔族男性腹型肥胖可能有相关性. 展开更多
关键词 zfp36基因 基因多态性 维吾尔族 肥胖
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RNA结合蛋白ZFP36可能是甲状腺乳头状癌无进展生存期的重要预测靶标
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作者 燕豪 解杰 +1 位作者 卢秀波 樊玉霞 《中国普外基础与临床杂志》 CAS 2022年第9期1195-1200,共6页
目的 基于RNA结合蛋白(RNA-binding proteins,RBPs)基因集筛选与甲状腺乳头状癌(papillary thyroid cancer,PTC)患者无进展生存(progression-free survival,PFS)情况有关的预后预测靶标。方法 从UCSC Xena数据库中获取PTC患者的临床病... 目的 基于RNA结合蛋白(RNA-binding proteins,RBPs)基因集筛选与甲状腺乳头状癌(papillary thyroid cancer,PTC)患者无进展生存(progression-free survival,PFS)情况有关的预后预测靶标。方法 从UCSC Xena数据库中获取PTC患者的临床病理资料,同时从郑州大学第一附属医院获取行甲状腺手术的PTC患者的癌组织及其配对癌旁(距离癌组织以远2.0 cm处)组织标本。从多个公开数据集的综合分析情况确定PTC癌组织和正常甲状腺组织间差异表达RBPs基因,同时应用Cox单因素和多因素分析来筛选与PFS相关的RBPs基因并从基因和蛋白表达方面对此进行验证;然后进一步采用Cox单因素和多因素分析筛选与PFS相关的影响因素并以此构建可预测PTC患者PFS概率的列线图。结果 ①本研究从UCSC Xena数据库中共纳入PTC患者424例,从临床收集到30例PTC患者。②最终识别出在PTC中7个下调的RBPs基因(KHDRBS2、PPARGC1A、ZFP36L2、SMAD9、ARHGEF28、TDRD9、ZFP36)和3个上调的RBPs基因(ZMAT3、MVP、IGF2BP2)。③ Cox多因素分析筛选出与PFS相关的1个RBPs基因ZFP36。④ Western blot法检测临床PTC患者的癌组织中ZFP36蛋白表达情况与在数据库PTC患者的癌组织中的基因表达情况基本一致。⑤将筛选出的与PFS相关的RBPs基因ZFP36与PFS有关的影响因素(T和M分期)用来构建的列线图预测1、3、5年PFS率的受试者工作特征曲线下面积分别为0.80 [95%CI(0.69,0.91)]、0.72 [95%CI(0.62,0.81)]和0.64 [95%CI(0.50,0.77)],列线图的C指数为0.724[95%CI(0.685,0.763)],其3年PFS概率校准曲线与理想对角线非常接近。结论 从本研究数据库资料结合临床病例资料的初步研究结果提示,RBPs ZFP36基因可能是PTC患者的潜在预后靶标。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 RNA结合蛋白 zfp36基因
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