ZFR2与头颈部鳞癌预后和人乳头瘤病毒感染的相关性研究

目的 探究头颈部鳞癌中ZFR2的表达特征,揭示其与人乳头瘤病毒(human papilloma virus, HPV)感染的关系。方法 利用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas project, TCGA)数据库中头颈部鳞癌患者的RNA表达数据集和相应的临床特征信息,依据无病间隔时间(disease-free interval, DFI)筛选差异基因ZFR2作为目标基因,将患者分为ZFR2高表达组和ZFR2低表达组,比较两组患者的总生存时间,探索ZFR2对头颈部鳞癌的预后价值;提取数据库头颈部鳞癌患者ZFR2表达最高的1/3和ZFR2表达最低的1/3患者的基因表达数据,进行差异基因分析,基线特征没有差异,每组是185例,并对差异基因进行生物信息富集分析,预测ZFR2在头颈部鳞癌的生物学功能。下载TCGA数据库头颈部鳞癌患者临床特征数据,结合ZFR2基因表达谱进行数据整合分析ZFR2与肿瘤患者HPV感染状态的关系。结果 通过头颈部鳞癌患者TCGA表达谱数据和生存时间数据分析,筛选到预后相关基因ZFR2;Kaplan-Meier生存分析显示ZFR2高表达组的患者总生存时间明显更长。生物信息学分析显示ZFR2生物功能主要富集于神经活性配体-受体相互作用等生物学特征通路;TCGA数据库的HPV检测阳性的头颈部鳞癌患者的ZFR2表达显著高于HPV检测阴性的患者,ZFR2的表达与HPV感染免疫浸润相关基因的表达也具有一致性。结论 ZFR2与头颈部鳞癌患者的生存预后密切相关。ZFR2可能参与调节头颈部鳞癌患者HPV感染导致的免疫浸润。