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锌指蛋白基因ZMYM2来源环状RNA hsa_circ_0029625的 特征分析和功能预测 被引量:2
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作者 林铭珍 周新科 +6 位作者 姚文霞 潘劲辉 董志杰 王知源 肖瑶 黄伟 梁敏 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2022年第6期581-591,共11页
目的环状RNA(circRNA)在多种生理病理过程中均发挥重要作用,但仍有许多circRNAs的功能尚待发掘,文章旨在研究锌指蛋白基因ZMYM2转录形成的环状RNA hsa_circ_0029625的主要特征,并对其进行功能预测和初步探究。方法从反向剪接位点及全长... 目的环状RNA(circRNA)在多种生理病理过程中均发挥重要作用,但仍有许多circRNAs的功能尚待发掘,文章旨在研究锌指蛋白基因ZMYM2转录形成的环状RNA hsa_circ_0029625的主要特征,并对其进行功能预测和初步探究。方法从反向剪接位点及全长测序验证、核糖核酸酶R(RNase R)抵抗实验(细胞样本分为RNase R组和对照组)、细胞核质RNA分离实验、翻译蛋白潜能四个方面探究该circRNA的基本特征。利用荧光实时定量PCR实验初步探究该circRNA在胃癌中的表达。通过生物信息学预测circRNA上潜在结合的微小RNA(miRNA),并应用基因本体论(GO)对下游靶基因进行功能注释,初步验证下游靶基因,筛选和分析下游关键基因。结果hsa_circ_0029625是由ZMYM2转录本NM_003453反向剪接形成,全长测序比对结果符合预期。hsa_circ_0029625可耐受RNase R,主要位于细胞质。蛋白翻译分析显示:hsa_circ_0029625可能编码多肽。RNA定量分析显示:该circRNA在胃癌组织中较癌旁组织明显下调。荧光实时定量PCR实验验证5个下游靶基因在胃癌组织中表达下调。GO功能注释显示:靶基因主要涉及转录等生物过程以及转录调节活性等分子功能。结论锌指蛋白基因ZMYM2来源环状RNA hsa_circ_0029625具有环状RNA的基本特征,有编码多肽潜能,可能通过海绵miRNAs参与多种生物学过程及功能,在胃癌样本中低表达及生物信息学预测提示其可作为胃癌潜在靶点。 展开更多
关键词 zmym2 环状RNA 翻译蛋白潜能 MIRNA 功能预测 胃癌
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EV713C蛋白酶与ZMYM2相互作用及功能初探
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作者 阮旭琴 吴雅妮 +3 位作者 李卉 李卓然 谈娟 乔文涛 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期771-780,共10页
肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)为小RNA病毒科肠道病毒属A组病毒的代表株,感染可引发手足口病(Hand-foot and mouth disease,HFMD),严重危害儿童健康。EV713C蛋白酶(3C)是其编码的主要蛋白酶之一,在病毒多蛋白加工过程中发挥关键作... 肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)为小RNA病毒科肠道病毒属A组病毒的代表株,感染可引发手足口病(Hand-foot and mouth disease,HFMD),严重危害儿童健康。EV713C蛋白酶(3C)是其编码的主要蛋白酶之一,在病毒多蛋白加工过程中发挥关键作用,同时切割细胞蛋白以利于病毒复制。为进一步了解EV71与宿主间博弈关系,本课题组前期以3C为诱饵进行酵母双杂交实验,筛选与3C发生相互作用的可能底物,钓取到锌指MYM型蛋白2(Zinc finger MYM-type protein 2,ZMYM2)。ZMYM2是一种具有锌指结构的转录因子,与细胞中重要的抗病毒小体PML核体(PML nuclear bodies,PML-NBs)的形成及稳定性相关。本文选择3C与ZMYM2关系展开研究,确证二者相互作用并初探生物学功能。首先通过免疫共沉淀实验确证3C与ZMYM2之间存在相互作用;随后分析功能,发现过表达ZMYM2抑制EV71复制;敲减内源ZMYM2有利于EV71的复制;分析3C对ZMYM2影响,发现3C剂量依赖性切割ZMYM2,ZMYM2上至少具有2个3C的识别位点。本研究为解析ZMYM2功能及进一步了解EV71与宿主先天免疫间博弈关系提供了新的实验证据。 展开更多
关键词 肠道病毒71型(EV71) 3C蛋白酶 zmym2蛋白
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Novel mutation c.2090_2091del in neurodevelopmental-craniofacial syndrome with variable renal and cardiac abnormalities in an 18.5-mo-old boy:A case report
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作者 Yi Li Zheng Zhou +1 位作者 Yan Xu Zhi-Ru Wang 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2023年第16期3891-3898,共8页
BACKGROUND Neurodevelopmental-craniofacial syndrome with variable renal and cardiac abnormalities(NECRC)is a rare,autosomal,dominant neurological disorder caused by mutations in the ZMYM2 gene.To date,the clinical and... BACKGROUND Neurodevelopmental-craniofacial syndrome with variable renal and cardiac abnormalities(NECRC)is a rare,autosomal,dominant neurological disorder caused by mutations in the ZMYM2 gene.To date,the clinical and functional characteristics of the novel ZMYM2 mutation c.2090_2091del have not yet been reported.CASE SUMMARY The patient was an 18.5-mo-old Chinese boy with motor and language delay,microcephaly,facial dysmorphism,moderate malnutrition,single palmar crease on the left hand,synpolydactyly of the right foot,hypotonia and feeding problems.The boy who was diagnosed with NECRC was enrolled in the First Affiliated Hospital,Henan University of Chinese Medicine,and his clinical data were collected.From the whole-exon sequencing(WES)data,the pathogenic SNVs/InDels were identified,and the molecular findings were characterized.WES revealed that the heterozygous variant in the ZMYM2 gene was c.2090_20-91del,p.Ser697TrpfsTer3,a frameshift mutation,which is a NECRC-related gene mutation.CONCLUSION We performed a systematic literature review to identify and characterize NECRC.Substantial evidence from the literature indicated that patients with ZMYM2 gene mutation showed different degrees of intellectual disability,motor and language retardation,facial dysmorphism,and a few had congenital heart defects,kidney and urinary tract abnormalities.Early diagnosis and prompt management with comprehensive rehabilitation training are beneficial,but may not improve long-term outcomes. 展开更多
关键词 zmym2 NECRC Frameshift mutation Global developmental delay Case report
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筛选EV71 3C蛋白酶切割的宿主细胞蛋白
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作者 阮旭琴 姚云芳 +1 位作者 谈娟 乔文涛 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期23-29,共7页
肠道病毒EV71型是引起儿童手足口病的主要病原体,3C是其编码的蛋白酶之一.3C在切割病毒前体蛋白为成熟蛋白的同时.切割一些具有重要功能的细胞蛋白,影响细胞的生理功能.为进一步了解EV71与宿主的关系,明确EV71致病机制的细节,在前期以3... 肠道病毒EV71型是引起儿童手足口病的主要病原体,3C是其编码的蛋白酶之一.3C在切割病毒前体蛋白为成熟蛋白的同时.切割一些具有重要功能的细胞蛋白,影响细胞的生理功能.为进一步了解EV71与宿主的关系,明确EV71致病机制的细节,在前期以3C蛋白为诱饵开展的酵母双杂交工作的基础上,选取了5种细胞蛋白,分析其是否是3C蛋白可能的切割底物.发现ZMYM2蛋白可以被3C切割:这一切割效应是依赖3C蛋白酶活性的特异性切割,无需RNA介导.上述发现为进一步揭示EV71致病机制提供了线索. 展开更多
关键词 肠道病毒71型 3C蛋白 zmym2蛋白
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