ZNF568基因表达联合DNA甲基化分析与食管癌预后的关联

目的探讨ZNF568基因表达和DNA甲基化与食管癌预后的关联。方法采用R软件中的edgeR包、limma包对食管癌癌组织与癌旁组织ZNF568基因表达、DNA甲基化进行差异分析。使用Spearman秩相关分析ZNF568基因表达水平与DNA甲基化的关联。通过癌细胞系百科全书(CCLE)数据库中的食管癌数据,验证ZNF568基因表达水平与DNA甲基化的关联。使用Cox比例风险回归模型分析ZNF568基因表达联合DNA甲基化与食管癌患者预后的关联,进而构建预后生存风险的列线图模型。结果ZNF568基因在癌组织中的甲基化程度高于癌旁组织(FDR<0.001),而ZNF568基因在癌旁组织中的表达水平高于癌组织(FDR<0.001);ZNF568基因表达水平与DNA甲基化存在负相关(P<0.001);在CCLE数据库中也发现ZNF568基因表达水平与DNA甲基化存在关联(P=0.002)。多因素Cox回归分析发现,ZNF568基因高表达、DNA低甲基化能改善食管癌预后(HR=0.70,95%CI:0.51~0.96,P=0.043);ZNF568基因表达与DNA甲基化联合分析能很好地预测食管癌的预后,C指数为0.697。结论ZNF568基因高表达、DNA低甲基化与食管癌预后相关,检测食管癌ZNF568基因表达水平与DNA甲基化有助于判断食管癌的预后。