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ZNF568基因表达联合DNA甲基化分析与食管癌预后的关联
被引量:
1
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作者
刘双
林征
+3 位作者
俞凯莉
陈辉林
饶雯清
胡志坚
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期890-893,898,共5页
目的探讨ZNF568基因表达和DNA甲基化与食管癌预后的关联。方法采用R软件中的edgeR包、limma包对食管癌癌组织与癌旁组织ZNF568基因表达、DNA甲基化进行差异分析。使用Spearman秩相关分析ZNF568基因表达水平与DNA甲基化的关联。通过癌细...
目的探讨ZNF568基因表达和DNA甲基化与食管癌预后的关联。方法采用R软件中的edgeR包、limma包对食管癌癌组织与癌旁组织ZNF568基因表达、DNA甲基化进行差异分析。使用Spearman秩相关分析ZNF568基因表达水平与DNA甲基化的关联。通过癌细胞系百科全书(CCLE)数据库中的食管癌数据,验证ZNF568基因表达水平与DNA甲基化的关联。使用Cox比例风险回归模型分析ZNF568基因表达联合DNA甲基化与食管癌患者预后的关联,进而构建预后生存风险的列线图模型。结果ZNF568基因在癌组织中的甲基化程度高于癌旁组织(FDR<0.001),而ZNF568基因在癌旁组织中的表达水平高于癌组织(FDR<0.001);ZNF568基因表达水平与DNA甲基化存在负相关(P<0.001);在CCLE数据库中也发现ZNF568基因表达水平与DNA甲基化存在关联(P=0.002)。多因素Cox回归分析发现,ZNF568基因高表达、DNA低甲基化能改善食管癌预后(HR=0.70,95%CI:0.51~0.96,P=0.043);ZNF568基因表达与DNA甲基化联合分析能很好地预测食管癌的预后,C指数为0.697。结论ZNF568基因高表达、DNA低甲基化与食管癌预后相关,检测食管癌ZNF568基因表达水平与DNA甲基化有助于判断食管癌的预后。
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关键词
食管癌
znf568基因
甲基化
基因
表达
预后
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题名
ZNF568基因表达联合DNA甲基化分析与食管癌预后的关联
被引量:
1
1
作者
刘双
林征
俞凯莉
陈辉林
饶雯清
胡志坚
机构
福建医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系
泉州市安溪县医院放疗科
出处
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期890-893,898,共5页
基金
国家重点研发计划精准医学研究重点专项2017年度项目(2017YFC0907100)
2018年福建省医学创新课题(2018-CX-38)
福建医科大学启航基金(2018QH2012)。
文摘
目的探讨ZNF568基因表达和DNA甲基化与食管癌预后的关联。方法采用R软件中的edgeR包、limma包对食管癌癌组织与癌旁组织ZNF568基因表达、DNA甲基化进行差异分析。使用Spearman秩相关分析ZNF568基因表达水平与DNA甲基化的关联。通过癌细胞系百科全书(CCLE)数据库中的食管癌数据,验证ZNF568基因表达水平与DNA甲基化的关联。使用Cox比例风险回归模型分析ZNF568基因表达联合DNA甲基化与食管癌患者预后的关联,进而构建预后生存风险的列线图模型。结果ZNF568基因在癌组织中的甲基化程度高于癌旁组织(FDR<0.001),而ZNF568基因在癌旁组织中的表达水平高于癌组织(FDR<0.001);ZNF568基因表达水平与DNA甲基化存在负相关(P<0.001);在CCLE数据库中也发现ZNF568基因表达水平与DNA甲基化存在关联(P=0.002)。多因素Cox回归分析发现,ZNF568基因高表达、DNA低甲基化能改善食管癌预后(HR=0.70,95%CI:0.51~0.96,P=0.043);ZNF568基因表达与DNA甲基化联合分析能很好地预测食管癌的预后,C指数为0.697。结论ZNF568基因高表达、DNA低甲基化与食管癌预后相关,检测食管癌ZNF568基因表达水平与DNA甲基化有助于判断食管癌的预后。
关键词
食管癌
znf568基因
甲基化
基因
表达
预后
Keywords
esophageal cancer
znf
568
gene
methylation
gene expression
prognosis
分类号
R735.1 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
ZNF568基因表达联合DNA甲基化分析与食管癌预后的关联
刘双
林征
俞凯莉
陈辉林
饶雯清
胡志坚
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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