基于癌症基因组图集数据库分析锌指蛋白580 mRNA在肝细胞癌中的表达及意义

目的研究锌指蛋白580(ZNF580)mRNA在肝细胞癌中的表达以及临床价值,预测ZNF580mRNA在肝细胞癌发生发展中的作用。方法从癌症基因组图集(TCGA)数据库下载肝细胞癌数据集,获得ZNF580mRNA基因表达谱和临床信息。利用相关生物信息学方法,分析ZNF580mRNA在肝细胞癌中表达的情况与临床病理指标的相关性以及对预后的影响。用基因富集化分析预测ZNF580mRNA在肝细胞癌中调控的可能通路。计量资料2组间比较采用t检验,计数资料组间比较采用χ^2检验,并运用Cox比例风险回归模型分析影响患者预后的危险因素,计算风险比(HR)及95%可信区间(95%CI)。结果在TCGA数据库中,ZNF580mRNA的表达水平在肝癌组织中明显高于癌旁组织(8.440±0.705vs7.736±0.387,P<0.05),其表达水平在不同肿瘤分级的患者中差异有统计学意义(t=-2.068,P<0.05)。ZNF580mRNA高表达患者的总体生存期明显低于ZNF580mRNA低表达患者(χ^2=5.456,P<0.05)。多因素Cox回归分析提示ZNF580mRNA的表达水平[HR(95%CI):1.600(1.079~2.372)]和TNM分期[HR(95%CI):2.006(1.394~2.888)]是影响肝细胞癌患者总体生存期的独立危险因素(P值均<0.05)。ZNF580mRNA高表达的样本存在核糖体、亨廷顿病两个通路基因集的富集(P值均<0.05,错误发现率分别为0.198、0.243)。结论ZNF580mRNA可能作为促癌基因在肝细胞癌中发挥作用,有望成为判断肝细胞癌预后的指标和潜在的新治疗靶点。