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牦牛ZP3基因的克隆及蛋白质结构的预测
被引量:
5
1
作者
徐华伟
字向东
+3 位作者
黄磊
陈达文
穆晓琨
王红梅
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第10期156-161,167,共7页
本研究对牦牛ZP3基因的编码区进行了克隆,在此基础上对ZP3蛋白的分子结构预测,为研究牦牛受精生物学提供基础。根据GenBank中普通牛的ZP3核苷酸序列设计特异性引物,以牦牛卵巢组织总RNA为模板,通过RT-PCR技术扩增牦牛ZP3基因cDNA序列(Ge...
本研究对牦牛ZP3基因的编码区进行了克隆,在此基础上对ZP3蛋白的分子结构预测,为研究牦牛受精生物学提供基础。根据GenBank中普通牛的ZP3核苷酸序列设计特异性引物,以牦牛卵巢组织总RNA为模板,通过RT-PCR技术扩增牦牛ZP3基因cDNA序列(GenBank登录号为GQ856646),利用DNAMAN生物软件进行核苷酸和氨基酸序列分析、蛋白质专家系统ExPASy进行ZP3蛋白质分子结构预测。结果表明,扩增出的牦牛ZP3基因编码序列长1 266 bp,编码421个氨基酸。牦牛与牛、猪、狗、人、鼠和鸡ZP3基因核苷酸相应序列的同源性分别为98.42%、96.73%、79.67%、78.71%、69.15%和56.61%,氨基酸同源性分别为98.10%、83.85%、74.24%、70.26%、62.62%和46.12%,符合物种进化规律。预测的ZP3蛋白二级和三级结构显示它是一个具有22个氨基酸信号肽的亲水性β-桶状跨膜蛋白。牦牛ZP3基因编码区的成功克隆,为进一步研究该基因的结构与功能及其在受精过程中的作用提供了基础。
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关键词
牦牛
zp3基因
克隆
分子结构
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职称材料
GnRH-A及其配伍对鲤鱼ZP3基因表达的影响
被引量:
4
2
作者
宋艳
夏庆杰
+4 位作者
扬松沛
胡大芳
马世荣
张发强
闫乃红
《西南农业学报》
CSCD
2006年第1期149-151,共3页
运用逆转录实时荧光定量酶链反应(RT-FQ-PCR)技术,研究GnRH-A及其配伍对鱼卵成熟、受精相关基因ZP3的调控。结果显示:3种不同药物配伍分别使鲤鱼ZP3基因表达在给药处理后4、6和12 h达到峰值。提示:不同配伍药物对鱼卵成熟、受精产生影响...
运用逆转录实时荧光定量酶链反应(RT-FQ-PCR)技术,研究GnRH-A及其配伍对鱼卵成熟、受精相关基因ZP3的调控。结果显示:3种不同药物配伍分别使鲤鱼ZP3基因表达在给药处理后4、6和12 h达到峰值。提示:不同配伍药物对鱼卵成熟、受精产生影响。ZP3基因可作为促繁殖药筛选的重要指标。
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关键词
促繁殖药物
逆转录实时荧光定量酶链反应
鲤鱼
zp3基因
表达
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职称材料
人ZP3基因的RT-PCRcDNA克隆
被引量:
1
3
作者
叶志华
梁建庆
《生物技术》
CAS
CSCD
2005年第4期1-4,共4页
目的:研究人ZP3基因的结构及构建人ZP3基因原核表达系统。方法:从人卵巢组织中分离出mRNA并以此作为模版,通过RT-PCR扩增出人ZP3基因cDNA片段,然后将其克隆在pUC18质粒上,并对克隆片段进行序列分析。结果:共克隆到ZP3-A(1300bp)、ZP3-B(...
目的:研究人ZP3基因的结构及构建人ZP3基因原核表达系统。方法:从人卵巢组织中分离出mRNA并以此作为模版,通过RT-PCR扩增出人ZP3基因cDNA片段,然后将其克隆在pUC18质粒上,并对克隆片段进行序列分析。结果:共克隆到ZP3-A(1300bp)、ZP3-B(1180bp)、ZP3-C(1200bp)和ZP3-D(1080bp)4种不同长度的人ZP3基因cDNA片段,对其中最长的ZP3-A片段的测序结果表明,它包含了人ZP3基因阅读框内的全部序列,与NCBISequenceViewer中公布的人ZP3mRNA序列(NM-007155)相比较,在1275bp长的编码区内只有一个碱基不同,两者同源性达到99.92%。结论:本研究克隆到的ZP3-AcDNA片段确是人ZP3基因无疑。
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关键词
人
zp3基因
CDNA克隆
序列
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职称材料
草原兔尾鼠透明带3(lZP3)基因序列同源性比较
被引量:
2
4
作者
李涛
张富春
《新疆大学学报(自然科学版)》
CAS
2003年第3期269-271,276,共4页
透明带3作为精子的初级受体是透明带的一种主要糖蛋白,而抗ZP3抗体能够阻止精卵结合.因此,ZP3被认为是避孕疫苗的候选免疫原.草原兔尾鼠是新疆的重要害鼠,将它的ZP3基因序列与GenBank上已发表的几种鼠的ZP3基因序列进行同源性比较,将有...
透明带3作为精子的初级受体是透明带的一种主要糖蛋白,而抗ZP3抗体能够阻止精卵结合.因此,ZP3被认为是避孕疫苗的候选免疫原.草原兔尾鼠是新疆的重要害鼠,将它的ZP3基因序列与GenBank上已发表的几种鼠的ZP3基因序列进行同源性比较,将有助于哺乳动物受精机理的阐明与免疫不育疫苗的设计,同时也有助于了解这些鼠在系统进化中的相对地位.
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关键词
草原兔尾鼠
透明带
3
zp3基因
基因
序列
同源性分析
精子
糖蛋白
受精机理
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职称材料
密码子植物化的小鼠ZP3蛋白基因人工合成
被引量:
1
5
作者
芦春斌
《种子》
CSCD
北大核心
2009年第5期21-23,共3页
对小鼠ZP 3蛋白基因cDNA序列进行生物信息学分析,并将其核心区分成两部分进行分部合成。设计了多对特异性的重叠引物,采用多步PCR方法合成了植物化的小鼠ZP 3蛋白基因的不同片段。再经重叠PCR技术将这两段DNA连接在一起,构成完整的ZP 3...
对小鼠ZP 3蛋白基因cDNA序列进行生物信息学分析,并将其核心区分成两部分进行分部合成。设计了多对特异性的重叠引物,采用多步PCR方法合成了植物化的小鼠ZP 3蛋白基因的不同片段。再经重叠PCR技术将这两段DNA连接在一起,构成完整的ZP 3基因的编码区。DNA序列测定人工合成的基因为植物化的ZP 3基因。
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关键词
小鼠
zp
3
蛋白
基因
重叠PCR
合成
植物反应器
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职称材料
海兰褐蛋鸡ZP 3基因结构及其在卵泡中表达规律分析
6
作者
朱帅鹏
王东雪
+4 位作者
刘聪
孙君卫
杜振伟
孙桂荣
李文婷
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期3366-3374,共9页
旨在探讨ZP 3基因在海兰褐蛋鸡中的表达特性,为后期研究ZP3基因在蛋鸡卵泡发育中的作用提供理论支撑。本研究以产蛋期50周龄(50 W)海兰褐蛋鸡为试验对象,利用RACE技术克隆ZP 3基因全长,并对编码区进行生物信息学分析。选择健康、体重相...
旨在探讨ZP 3基因在海兰褐蛋鸡中的表达特性,为后期研究ZP3基因在蛋鸡卵泡发育中的作用提供理论支撑。本研究以产蛋期50周龄(50 W)海兰褐蛋鸡为试验对象,利用RACE技术克隆ZP 3基因全长,并对编码区进行生物信息学分析。选择健康、体重相近的海兰褐蛋鸡6只,分别取心、肝、肺、肾、卵巢、胸肌、腿肌和不同等级卵泡构建表达谱。卵巢颗粒细胞经不同浓度(PBS、5 ng·mL^(-1)、10 ng·mL^(-1)、20 ng·mL^(-1))促卵泡素(follicle-stimulating hormone,FSH)处理后,提取总RNA,采用实时荧光定量检测ZP 3基因在各个样品的表达水平。结果表明,鸡ZP 3基因全长1415 bp,其中编码区1341 bp,共编码446个氨基酸,位于10号染色体上,包含9个外显子;其亲缘关系与猪最远;跨膜结构预测表示,其含有一个跨膜结构域和一个信号肽区域;对其亲疏水性进行分析,预测该蛋白为弱的疏水性蛋白,蛋白质结构主要由无规则卷曲构成。组织表达谱显示,ZP 3基因在鸡的卵巢中相对表达量最高。各等级卵泡ZP3表达分析显示,随着卵泡发育,ZP 3基因在成熟卵泡(F1)颗粒细胞层表达量最高;在使用FSH处理等级颗粒细胞后,发现ZP3表达量显著上调(P<0.05),暗示ZP3基因在颗粒细胞中受到FSH激素调节。本试验对ZP 3基因的结构进行了分析并预测该基因存在跨膜结构和信号肽区域。基因表达谱分析结果显示,ZP 3基因在卵泡发育过程中表达量逐渐升高且主要在颗粒细胞中表达,可能受到FSH的调节作用,因此预测,ZP 3基因可能与海兰褐蛋鸡繁殖功能相关。
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关键词
海兰褐蛋鸡
zp
3
基因
基因
克隆
生物信息学
组织表达谱
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职称材料
水牛透明带3基因启动子克隆及转录活性检测
被引量:
1
7
作者
庞春英
陆杏蓉
+5 位作者
朱鹏
邓廷贤
段安琴
陈明棠
杨炳壮
梁贤威
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2015年第6期1350-1356,共7页
为了阐明水牛透明带3基因(ZP3)表达调控机理,通过PCR技术、载体构建和细胞转染等技术,对其转录活性进行了研究。结果表明:成功克隆得到广西本地水牛ZP3基因5'侧翼序列及部分编码区序列(CDS)区序列,共3 081 bp;广西本地水牛ZP3核苷...
为了阐明水牛透明带3基因(ZP3)表达调控机理,通过PCR技术、载体构建和细胞转染等技术,对其转录活性进行了研究。结果表明:成功克隆得到广西本地水牛ZP3基因5'侧翼序列及部分编码区序列(CDS)区序列,共3 081 bp;广西本地水牛ZP3核苷酸序列与河流型水牛、黄牛、绵羊和山羊的相似性分别为99%、96%、92%和92%;在ZP3翻译起始位点上游-147 bp至-196 bp处存在TATA box,启动子区存在GATAs、Foxo3、Nobox、Stat3、Stat4、Stat5a、Stat5b、Stat6和YY1等反式作用因子结合位点,其中Stats家族在ZP3启动子区存在多个结合位点,且同一位点又存在多个Stats结合的情况;水牛ZP3启动子不能启动绿色荧光蛋白(Enhanced green fluorescent protein,EGFP)在HEK-293T细胞中的表达,但能启动其在CHO细胞中的表达,且启动子活性比CMV启动子弱。
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关键词
水牛
zp3基因
克隆分析
转录活性
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职称材料
题名
牦牛ZP3基因的克隆及蛋白质结构的预测
被引量:
5
1
作者
徐华伟
字向东
黄磊
陈达文
穆晓琨
王红梅
机构
西南民族大学高原动物遗传育种与繁殖教育部共建重点实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第10期156-161,167,共7页
基金
四川省科技厅应用基础项目(07JY029-128)
文摘
本研究对牦牛ZP3基因的编码区进行了克隆,在此基础上对ZP3蛋白的分子结构预测,为研究牦牛受精生物学提供基础。根据GenBank中普通牛的ZP3核苷酸序列设计特异性引物,以牦牛卵巢组织总RNA为模板,通过RT-PCR技术扩增牦牛ZP3基因cDNA序列(GenBank登录号为GQ856646),利用DNAMAN生物软件进行核苷酸和氨基酸序列分析、蛋白质专家系统ExPASy进行ZP3蛋白质分子结构预测。结果表明,扩增出的牦牛ZP3基因编码序列长1 266 bp,编码421个氨基酸。牦牛与牛、猪、狗、人、鼠和鸡ZP3基因核苷酸相应序列的同源性分别为98.42%、96.73%、79.67%、78.71%、69.15%和56.61%,氨基酸同源性分别为98.10%、83.85%、74.24%、70.26%、62.62%和46.12%,符合物种进化规律。预测的ZP3蛋白二级和三级结构显示它是一个具有22个氨基酸信号肽的亲水性β-桶状跨膜蛋白。牦牛ZP3基因编码区的成功克隆,为进一步研究该基因的结构与功能及其在受精过程中的作用提供了基础。
关键词
牦牛
zp3基因
克隆
分子结构
Keywords
Yak
zp
3
gene Clone Molecular structures
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
GnRH-A及其配伍对鲤鱼ZP3基因表达的影响
被引量:
4
2
作者
宋艳
夏庆杰
扬松沛
胡大芳
马世荣
张发强
闫乃红
机构
四川省农业科学院
四川大学华西医院眼疾病分子遗传研究室
四川省兽药监察所
出处
《西南农业学报》
CSCD
2006年第1期149-151,共3页
基金
国家农业成果转化资金(2002510060549)
文摘
运用逆转录实时荧光定量酶链反应(RT-FQ-PCR)技术,研究GnRH-A及其配伍对鱼卵成熟、受精相关基因ZP3的调控。结果显示:3种不同药物配伍分别使鲤鱼ZP3基因表达在给药处理后4、6和12 h达到峰值。提示:不同配伍药物对鱼卵成熟、受精产生影响。ZP3基因可作为促繁殖药筛选的重要指标。
关键词
促繁殖药物
逆转录实时荧光定量酶链反应
鲤鱼
zp3基因
表达
Keywords
reproduetion-improving drugs
RT-FQ-PC
zp
3
gene expression of carp
分类号
S188 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
人ZP3基因的RT-PCRcDNA克隆
被引量:
1
3
作者
叶志华
梁建庆
机构
广东省微生物研究所
出处
《生物技术》
CAS
CSCD
2005年第4期1-4,共4页
基金
广东省科技攻关项目("重组人卵透明带-3蛋白的高效表达及其分离制备的研究"
编号:2004B10401004)
文摘
目的:研究人ZP3基因的结构及构建人ZP3基因原核表达系统。方法:从人卵巢组织中分离出mRNA并以此作为模版,通过RT-PCR扩增出人ZP3基因cDNA片段,然后将其克隆在pUC18质粒上,并对克隆片段进行序列分析。结果:共克隆到ZP3-A(1300bp)、ZP3-B(1180bp)、ZP3-C(1200bp)和ZP3-D(1080bp)4种不同长度的人ZP3基因cDNA片段,对其中最长的ZP3-A片段的测序结果表明,它包含了人ZP3基因阅读框内的全部序列,与NCBISequenceViewer中公布的人ZP3mRNA序列(NM-007155)相比较,在1275bp长的编码区内只有一个碱基不同,两者同源性达到99.92%。结论:本研究克隆到的ZP3-AcDNA片段确是人ZP3基因无疑。
关键词
人
zp3基因
CDNA克隆
序列
Keywords
human
zp
3
gene
cDNA clone
sequences
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
草原兔尾鼠透明带3(lZP3)基因序列同源性比较
被引量:
2
4
作者
李涛
张富春
机构
新疆大学生命科学与技术学院分子生物学重点实验室新疆生物资源基因工程重点实验室
出处
《新疆大学学报(自然科学版)》
CAS
2003年第3期269-271,276,共4页
基金
中国科学院西部之光项目
国家自然科学基金项目(39960047)
教育部骨干教师项目资助
文摘
透明带3作为精子的初级受体是透明带的一种主要糖蛋白,而抗ZP3抗体能够阻止精卵结合.因此,ZP3被认为是避孕疫苗的候选免疫原.草原兔尾鼠是新疆的重要害鼠,将它的ZP3基因序列与GenBank上已发表的几种鼠的ZP3基因序列进行同源性比较,将有助于哺乳动物受精机理的阐明与免疫不育疫苗的设计,同时也有助于了解这些鼠在系统进化中的相对地位.
关键词
草原兔尾鼠
透明带
3
zp3基因
基因
序列
同源性分析
精子
糖蛋白
受精机理
Keywords
Lagurus lagurus
zp
3
gene sequence
homologous analysis
分类号
Q959.837 [生物学—动物学]
Q954.434 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
密码子植物化的小鼠ZP3蛋白基因人工合成
被引量:
1
5
作者
芦春斌
机构
暨南大学生殖免疫研究所
出处
《种子》
CSCD
北大核心
2009年第5期21-23,共3页
基金
教育部留学回国人员科研启动基金资助
广东省科技攻关项目(2007B020709003)资助
文摘
对小鼠ZP 3蛋白基因cDNA序列进行生物信息学分析,并将其核心区分成两部分进行分部合成。设计了多对特异性的重叠引物,采用多步PCR方法合成了植物化的小鼠ZP 3蛋白基因的不同片段。再经重叠PCR技术将这两段DNA连接在一起,构成完整的ZP 3基因的编码区。DNA序列测定人工合成的基因为植物化的ZP 3基因。
关键词
小鼠
zp
3
蛋白
基因
重叠PCR
合成
植物反应器
Keywords
mouse zonapellucida(
zp
)
overlapping PCR
synthesis
plant reactor
分类号
Q945.6 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
海兰褐蛋鸡ZP 3基因结构及其在卵泡中表达规律分析
6
作者
朱帅鹏
王东雪
刘聪
孙君卫
杜振伟
孙桂荣
李文婷
机构
河南农业大学动物科技学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期3366-3374,共9页
基金
中原学者康相涛科学家工作室(30601985)
国家自然科学基金(31902144)。
文摘
旨在探讨ZP 3基因在海兰褐蛋鸡中的表达特性,为后期研究ZP3基因在蛋鸡卵泡发育中的作用提供理论支撑。本研究以产蛋期50周龄(50 W)海兰褐蛋鸡为试验对象,利用RACE技术克隆ZP 3基因全长,并对编码区进行生物信息学分析。选择健康、体重相近的海兰褐蛋鸡6只,分别取心、肝、肺、肾、卵巢、胸肌、腿肌和不同等级卵泡构建表达谱。卵巢颗粒细胞经不同浓度(PBS、5 ng·mL^(-1)、10 ng·mL^(-1)、20 ng·mL^(-1))促卵泡素(follicle-stimulating hormone,FSH)处理后,提取总RNA,采用实时荧光定量检测ZP 3基因在各个样品的表达水平。结果表明,鸡ZP 3基因全长1415 bp,其中编码区1341 bp,共编码446个氨基酸,位于10号染色体上,包含9个外显子;其亲缘关系与猪最远;跨膜结构预测表示,其含有一个跨膜结构域和一个信号肽区域;对其亲疏水性进行分析,预测该蛋白为弱的疏水性蛋白,蛋白质结构主要由无规则卷曲构成。组织表达谱显示,ZP 3基因在鸡的卵巢中相对表达量最高。各等级卵泡ZP3表达分析显示,随着卵泡发育,ZP 3基因在成熟卵泡(F1)颗粒细胞层表达量最高;在使用FSH处理等级颗粒细胞后,发现ZP3表达量显著上调(P<0.05),暗示ZP3基因在颗粒细胞中受到FSH激素调节。本试验对ZP 3基因的结构进行了分析并预测该基因存在跨膜结构和信号肽区域。基因表达谱分析结果显示,ZP 3基因在卵泡发育过程中表达量逐渐升高且主要在颗粒细胞中表达,可能受到FSH的调节作用,因此预测,ZP 3基因可能与海兰褐蛋鸡繁殖功能相关。
关键词
海兰褐蛋鸡
zp
3
基因
基因
克隆
生物信息学
组织表达谱
Keywords
Hailan brown laying hens
zp
3
gene
gene cloning
bioinformatics
tissue expression profile
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
水牛透明带3基因启动子克隆及转录活性检测
被引量:
1
7
作者
庞春英
陆杏蓉
朱鹏
邓廷贤
段安琴
陈明棠
杨炳壮
梁贤威
机构
中国农业科学院广西水牛研究所广西水牛遗传繁育重点实验室
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2015年第6期1350-1356,共7页
基金
农业部转基因重点项目(2014ZX08010-012B)
国际先进技术引进与合作研究开发项目(14123001-5)
文摘
为了阐明水牛透明带3基因(ZP3)表达调控机理,通过PCR技术、载体构建和细胞转染等技术,对其转录活性进行了研究。结果表明:成功克隆得到广西本地水牛ZP3基因5'侧翼序列及部分编码区序列(CDS)区序列,共3 081 bp;广西本地水牛ZP3核苷酸序列与河流型水牛、黄牛、绵羊和山羊的相似性分别为99%、96%、92%和92%;在ZP3翻译起始位点上游-147 bp至-196 bp处存在TATA box,启动子区存在GATAs、Foxo3、Nobox、Stat3、Stat4、Stat5a、Stat5b、Stat6和YY1等反式作用因子结合位点,其中Stats家族在ZP3启动子区存在多个结合位点,且同一位点又存在多个Stats结合的情况;水牛ZP3启动子不能启动绿色荧光蛋白(Enhanced green fluorescent protein,EGFP)在HEK-293T细胞中的表达,但能启动其在CHO细胞中的表达,且启动子活性比CMV启动子弱。
关键词
水牛
zp3基因
克隆分析
转录活性
Keywords
buffalo
zp
3
(zone pellucide
3
) gene
cloning and bio-informatics analysis
transcriptional activity
分类号
S823.83 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
牦牛ZP3基因的克隆及蛋白质结构的预测
徐华伟
字向东
黄磊
陈达文
穆晓琨
王红梅
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
5
下载PDF
职称材料
2
GnRH-A及其配伍对鲤鱼ZP3基因表达的影响
宋艳
夏庆杰
扬松沛
胡大芳
马世荣
张发强
闫乃红
《西南农业学报》
CSCD
2006
4
下载PDF
职称材料
3
人ZP3基因的RT-PCRcDNA克隆
叶志华
梁建庆
《生物技术》
CAS
CSCD
2005
1
下载PDF
职称材料
4
草原兔尾鼠透明带3(lZP3)基因序列同源性比较
李涛
张富春
《新疆大学学报(自然科学版)》
CAS
2003
2
下载PDF
职称材料
5
密码子植物化的小鼠ZP3蛋白基因人工合成
芦春斌
《种子》
CSCD
北大核心
2009
1
下载PDF
职称材料
6
海兰褐蛋鸡ZP 3基因结构及其在卵泡中表达规律分析
朱帅鹏
王东雪
刘聪
孙君卫
杜振伟
孙桂荣
李文婷
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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职称材料
7
水牛透明带3基因启动子克隆及转录活性检测
庞春英
陆杏蓉
朱鹏
邓廷贤
段安琴
陈明棠
杨炳壮
梁贤威
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2015
1
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