基于网络药理学和分子对接探讨浙贝母-夏枯草药对治疗甲状腺结节的作用机制

目的:基于网络药理学探讨浙贝母-夏枯草治疗甲状腺结节(thyroid nodules)的作用机制。方法:在中药系统药理数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)检索浙贝母、夏枯草的化学成分,利用PharmMapper数据库获取化学成分靶点,并采用Cytoscape 3.7.1软件构建“药物-活性成分-靶点”网络。基于Genecards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库、治疗靶点数据库获得甲状腺结节相关靶点。将有效成分相关靶点与疾病靶点导入韦恩图网站进行在线分析,获得交集靶点,并利用STRING数据库构建蛋白互作网络(protein-protein interaction networks, PPI)模型,利用Cytoscape 3.7.1软件构建PPI网络并筛选核心靶点。将药物及其活性成分、交集靶点及疾病导入Cytoscape 3.7.1软件绘制成“药物-活性成分-交集靶点-疾病”网络图。利用Metascape数据库对交集靶点进行基因本体(gene ontology, GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)信号通路富集分析。采用AutoDock软件对关键靶点与活性成分进行分子对接。结果:浙贝母-夏枯草药对共15个活性成分,171个相关靶点。甲状腺结节疾病靶点1 563个。经韦恩图网站在线分析后得到浙贝母-夏枯草治疗甲状腺结节相关的靶点108个。交集靶点PPI网络分析得到AKT1、肿瘤蛋白P53(tumor protein P53,TP53)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)为核心靶点。GO富集分析得到生物过程1 705条、分子功能136条、细胞组分115条。KEGG富集分析获得202个信号通路。分子对接结果表明,浙贝母-夏枯草主要有效活性成分与靶点受体蛋白可以较好的结合。结论:浙贝母-夏枯草药对可通过多成分、多靶点、多通路治疗甲状腺结节。