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基于紫娟茶叶片转录组的SSR引物开发
被引量:
3
1
作者
周萌
宋维希
+5 位作者
鄢文光
李晓霞
陈继伟
夏丽飞
梁家斌
陈林波
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2016年第S1期140-145,共6页
以稀有茶树品种紫娟茶为研究对象,进行SSR引物开发的研究,从紫娟茶叶片转录组中筛选重复基元最多的SSR,设计并筛选紫娟茶的SSR引物。通过从已测序的紫娟茶叶片转录组中设计SSR引物共87对,通过对紫娟茶以及随机采摘的3份不同品种茶树提取...
以稀有茶树品种紫娟茶为研究对象,进行SSR引物开发的研究,从紫娟茶叶片转录组中筛选重复基元最多的SSR,设计并筛选紫娟茶的SSR引物。通过从已测序的紫娟茶叶片转录组中设计SSR引物共87对,通过对紫娟茶以及随机采摘的3份不同品种茶树提取DNA后进行PCR扩增,1%琼脂糖凝胶电泳分析,在紫外凝胶成像仪中观察拍照,判断是否扩增出目标条带。通过试验筛选出可以扩增出清晰目标条带的引物63对,有效率达72.4%,其中有33对表现出多态性,占有效SSR引物的52.4%。结果表明,从紫娟茶叶片转录组中设计引物是可行的。下一步研究将从这63对引物中开发紫娟茶的特异引物。
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关键词
紫娟茶
SSR
引物开发
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职称材料
题名
基于紫娟茶叶片转录组的SSR引物开发
被引量:
3
1
作者
周萌
宋维希
鄢文光
李晓霞
陈继伟
夏丽飞
梁家斌
陈林波
机构
云南省农业科学院茶叶研究所
云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2016年第S1期140-145,共6页
基金
云南科技厅重大专项(2013BB006)
国家自然科学基金项目(31460216
+2 种基金
31560200)
云南省农业科学院专项基金项目(YAAS2014JC012)
云南省人才培养计划项目(2015HB105)
文摘
以稀有茶树品种紫娟茶为研究对象,进行SSR引物开发的研究,从紫娟茶叶片转录组中筛选重复基元最多的SSR,设计并筛选紫娟茶的SSR引物。通过从已测序的紫娟茶叶片转录组中设计SSR引物共87对,通过对紫娟茶以及随机采摘的3份不同品种茶树提取DNA后进行PCR扩增,1%琼脂糖凝胶电泳分析,在紫外凝胶成像仪中观察拍照,判断是否扩增出目标条带。通过试验筛选出可以扩增出清晰目标条带的引物63对,有效率达72.4%,其中有33对表现出多态性,占有效SSR引物的52.4%。结果表明,从紫娟茶叶片转录组中设计引物是可行的。下一步研究将从这63对引物中开发紫娟茶的特异引物。
关键词
紫娟茶
SSR
引物开发
Keywords
zijuancha
SSR
Primer development
分类号
S571.1 [农业科学—茶叶生产加工]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于紫娟茶叶片转录组的SSR引物开发
周萌
宋维希
鄢文光
李晓霞
陈继伟
夏丽飞
梁家斌
陈林波
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2016
3
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职称材料
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参考文献
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