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Quantitative trait loci identification reveals zinc finger protein CONSTANS-LIKE 4 as the key candidate gene of stigma color in watermelon(Citrullus lanatus)
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作者 Shuang Pei Zexu Wu +4 位作者 Ziqiao Ji Zheng Liu Zicheng Zhu Feishi Luan Shi Liu 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2024年第7期2292-2305,共14页
Stigma color is a critical agronomic trait in watermelon that plays an important role in pollination.However,there are few reports on the regulation of stigma color in watermelon.In this study,a genetic analysis of th... Stigma color is a critical agronomic trait in watermelon that plays an important role in pollination.However,there are few reports on the regulation of stigma color in watermelon.In this study,a genetic analysis of the F2 population derived from ZXG1553(P1,with orange stigma)and W1-17(P2,with yellow stigma)indicated that stigma color is a quantitative trait and the orange stigma is recessive compared with the yellow stigma.Bulk segregant analysis sequencing(BSA-seq)revealed a 3.75 Mb segment on chromosome 6 that is related to stigma color.Also,a major stable effective QTL Clqsc6.1(QTL stigma color)was detected in two years between cleaved amplified polymorphic sequencing(CAPS)markers Chr06_8338913 and Chr06_9344593 spanning a~1.01 Mb interval that harbors 51 annotated genes.Cla97C06G117020(annotated as zinc finger protein CONSTANS-LIKE 4)was identified as the best candidate gene for the stigma color trait through RNA-seq,quantitative real-time PCR(qRT-PCR),and gene structure alignment analysis among the natural watermelon panel.The expression level of Cla97C06G117020 in the orange stigma accession was lower than in the yellow stigma accessions with a significant difference.A nonsynonymous SNP site of the Cla97C06G117020 coding region that causes amino acid variation was related to the stigma color variation among nine watermelon accessions according to their re-sequencing data.Stigma color formation is often related to carotenoids,and we also found that the expression trend of ClCHYB(annotated asβ-carotene hydroxylase)in the carotenoid metabolic pathway was consistent with Cla97C06G117020,and it was expressed in low amounts in the orange stigma accession.These data indicated that Cla97C06G117020 and ClCHYB may interact to form the stigma color.This study provides a theoretical basis for gene fine mapping and mechanisms for the regulation of stigma color in watermelon. 展开更多
关键词 WATERMELON stigma color gene mapping zinc finger protein CONSTANS-LIKE 4
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Zinc finger protein 296 promotes hepatocellular carcinoma progression via intervening interaction between macrophages and B cells
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作者 Nan Xu Xiaonan Xiang +7 位作者 Huan Chen Yiyuan Chen Shuai Wang Haijun Guo Xuyong Wei Jun Chen Xiao Xu Qiang Wei 《Chinese Journal of Cancer Research》 SCIE CAS CSCD 2024年第5期517-529,共13页
Objective:Hepatocellular carcinoma(HCC)is a prevalent malignancy with poor survival.Different cell types in the tumor microenvironment participate in the tumorigenesis and progression of HCC.This study aimed to analyz... Objective:Hepatocellular carcinoma(HCC)is a prevalent malignancy with poor survival.Different cell types in the tumor microenvironment participate in the tumorigenesis and progression of HCC.This study aimed to analyze the immune microenvironment of HCC and its relationship with clinical outcomes.Methods:We analyzed HCC RNA-seq for cell type identification and prognosis by estimating relative subsets of RNA transcripts using CIBERSORTx.The interaction between B cells and macrophages in HCC was analyzed using a Hepa1-6 orthotopic transplantation mouse model and flow cytometry.The effect of Zinc finger protein 296(ZNF296)on the interaction of B cells and macrophages was verified using human HCC tissues analyzed through western blot,quantitative real-time polymerase chain reaction(qPCR),and multiplex immunofluorescence.A comparative analysis of immune cells associated with HCC prognosis was performed using RNA-seq data from The Cancer Genome Atlas(TCGA),bulk multimodal data,and single-cell transcriptomic data from existing HCC single-cell transcriptomic data employing the Single Cell Inferred Site Specific Omics Resource for Tumor Microenvironments(SCISSOR).Results:Liver hepatocellular carcinoma(LIHC)RNA-seq analysis of TCGA showed that high eosinophil infiltration promoted HCC progression.The proportion of B cells correlated with that of macrophages(r=−0.24)and affected the infiltration and programmed death ligand 1(PD-L1)expression of macrophages in HCC.ZNF296 may participate in the interaction between B cells and macrophages to accelerate the HCC progression by regulating PAFAH1B3 and H2AFX.Moreover,ZNF296 expression positively correlated with LAG3(r=0.27)and CTLA4(r=0.31)expression levels.Among the immune cell phenotypes related to survival and death identified by SCISSOR analysis,T cells correlated with an excellent prognosis of HCC.The normal function of liver and dendritic cells was also associated with a good prognosis in HCC.Conclusions:This study analyzed the interaction of the immune microenvironment with HCC prognosis,identifying ZNF296 as a promising diagnostic and therapeutic target for HCC. 展开更多
关键词 Hepatocellular carcinoma immune cells PROGNOSIS zinc finger protein 296
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Zinc finger E-box-binding homeobox 1 mediates aerobic glycolysis via suppression of sirtuin 3 in pancreatic cancer 被引量:4
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作者 Wen-Yan Xu Qiang-Sheng Hu +5 位作者 Yi Qin Bo Zhang Wen-Sheng Liu Quan-Xing Ni Jin Xu Xian-Jun Yu 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2018年第43期4893-4905,共13页
AIM TO uncover the roles of tumor-promoting gene ZEB1 in aerobic glycolysis regulation and shed light on the underlying molecular mechanism.METHODS Endogenous zinc finger E-box binding homeobox-1 (ZEB1) was silenced... AIM TO uncover the roles of tumor-promoting gene ZEB1 in aerobic glycolysis regulation and shed light on the underlying molecular mechanism.METHODS Endogenous zinc finger E-box binding homeobox-1 (ZEB1) was silenced using a and the impact of ZEB1 and lentivirus-mediated method, methyI-CpG binding domain protein 1 (MBD1) on aerobic glycolysis was measured using seahorse cellular flux analyzers, reactive oxygen species quantification, and mitochondrial membrane potential measurement. The interaction between ZEB1 and MBD1 was assessed by co-immunoprecipitation and immunofluorescence assays. The impact of ZEB1 and MBD1 interaction on sirtuin 3 (SIRT3) expression was confirmed by quantitative polymerase chain reaction, western blotting, and dual-luciferase and chromatinimmunoprecipitation assays.RESULTS ZEB1 was a positive regulator of aerobic glycolysis in pancreatic cancer. ZEB1 transcriptionally silenced expression of SIRT3, a mitochondrial-localized tumor suppressor, through interaction with MBD1.CONCLUSION ZEB1 silenced SIRT3 expression via interaction with MBD1 to promote aerobic glycolysis in pancreatic cancer. 展开更多
关键词 Pancreatic cancer zinc finger E-box binding homeobox-1 Sirtuin 3 Methyl-CpG binding domain protein 1 Glycolysis
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Zinc finger protein A20 protects rats against chronic liver allograft dysfunction 被引量:6
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作者 Jie Yang Ming-Qing Xu Lu-Nan Yan Xiao-Bo Chen Jiao Liu 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2012年第27期3537-3550,共14页
AIM: To investigate the effect of zinc finger protein A20 on chronic liver allograft dysfunction in rats. METHODS: AIIogeneic liver transplantation from DA rats to Lewis rats was performed. Chronic liver allograft d... AIM: To investigate the effect of zinc finger protein A20 on chronic liver allograft dysfunction in rats. METHODS: AIIogeneic liver transplantation from DA rats to Lewis rats was performed. Chronic liver allograft dysfunction was induced in the rats by administering low-dose tacrolimus at postoperative day (POD) 5. Hepatic overexpression of A20 was achieved by recom- binant adenovirus (rAd.)-mediated gene transfer ad- ministered intravenously every 10 d starting from POD 10. The recipient rats were injected with physiologi- cal saline, rAdEasy-A20 (1 × 109 pfu/30 g weight) or rAdEasy (1 × 109 pfu/30 g weight) every 10 d through the tail vein for 3 mo starting from POD 10. Liver tissue samples were harvested on POD 30 and POD 60. RESULTS: Liver-transplanted rats treated with only tacrolimus showed chronic allograft dysfunction with severe hepatic fibrosis. A20 overexpression ameliorated the effects on liver function, attenuated liver allograft fibrosis and prolonged the survival of the recipient rats. Treatment with A20 suppressed hepatic protein pro- duction of tumor growth factor (TGF)-β1, interleukin- 113, caspase-8, CD40, CD40L, intercellular adhesion molecule-i, vascular cell adhesion molecule-1 and E-selectin. A20 treatment suppressed liver cell apopto- sis and inhibited nuclear factor-KB activation of Kupffer cells (KCs), liver sinusoidal endothelial cells (LSECs) and hepatic stellate cells (HSCs), and it subsequently decreased cytokine mRNA expression in KCs and LSECs and reduced the production of TGF-β1 in HSCs. CONCLUSION: A20 might prevent chronic liver allogra- ft dysfunction by re-establishing functional homeostasis of KCs, LSECs and HSCs. 展开更多
关键词 Chronic allograft dysfunction Liver trans-plantation zinc finger protein A20 Rat
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Expression Pattern Analysis of Zinc Finger Protein Genes in Wheat(Triticum aestivum L.) Under Phosphorus Deprivation 被引量:2
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作者 LI Xiao-juan GUO Cheng-jin +5 位作者 LU Wen-jing DUAN Wei-wei ZHAO Miao MA Chun-ying GU Jun-tao XIAO Kai 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2014年第8期1621-1633,共13页
Zinc finger protein(ZFP) genes comprise a large and diverse gene family, and are involved in biotic and abiotic stress responses in plants. In this study, a total of 126 ZFP genes classified into various types in wh... Zinc finger protein(ZFP) genes comprise a large and diverse gene family, and are involved in biotic and abiotic stress responses in plants. In this study, a total of 126 ZFP genes classified into various types in wheat were characterized and subjected to expression pattern analysis under inorganic phosphate(Pi) deprivation. The wheat ZFP genes and their corresponding GenBank numbers were obtained from the information of a 4×44K wheat gene expression microarray chip. They were confirmed by sequence similarity analysis and named based on their homologs in Brachypodium distachyon or Oriza sativa. Expression analysis based on the microarray chip revealed that these ZFP genes are categorized into 11 classes according to their gene expression patterns in a 24-h of Pi deprivation regime. Among them, ten genes were differentially up-regulated, ten genes differentially downregulated, and two genes both differentially up- and down-regulated by Pi deprivation. The differentially up- or down-regulated genes exhibited significantly more or less transcripts at one, two, or all of the checking time points(1, 6, and 24 h) of Pi stress in comparison with those of normal growth, respectively. The both differentially up- and down-regulated genes exhibited contrasting expression patterns, of these, TaWRKY70;5 showed significantly up-regulated at 1 and 6 h and down-regulated at 24 h whereas TaAN1AN20-8;2 displayed significantly upregulated at 1 h and downregulated at 6 h under deprivation Pi condition. Real time PCR analysis confirmed the expression patterns of the differentially expressed genes obtained by the microarray chip. Our results indicate that numerous ZFP genes in wheat respond to Pi deprivation and have provided further insight into the molecular basis that plants respond to Pi deprivation mediated by the ZFP gene family. 展开更多
关键词 wheat(Triticum aestivum L.) zinc finger protein Pi deprivation gene expression
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Zinc finger protein 139 expression in gastric cancer and its clinical significance 被引量:2
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作者 Yong Li Qun Zhao +5 位作者 Li-Qiao Fan Li-Li Wang Bi-Bo Tan Yan-Li Leng Yu Liu Dong Wang 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2014年第48期18346-18353,共8页
AIM: To investigate the expression of zinc finger protein 139 (ZNF139) in gastric cancer (GC), and to analyze its clinical significance.
关键词 APOPTOSIS Clinicopathologic characteristics Gastric cancer PROGNOSIS zinc finger protein 139
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Molecular Cloning and Expression Analysis of a Cys2/His2 Type Zinc Finger Protein Gene in Upland Cotton
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作者 YANG Yu-wen,NI Wan-chao,ZHANG Bao-long,SHEN Xin-lian(Jiangsu Academy of Agriculture Sciences,48 Zhonglinjie Street,Nanjing,Jiangsu 210014,China) 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期73-,共1页
The zinc finger proteins belong to the largest family of transcription factors.But there is little research of Cys2/His2 type zinc finger proteins in cotton,and there is no submission of correlating
关键词 CYS Molecular Cloning and Expression Analysis of a Cys2/His2 Type zinc finger protein Gene in Upland Cotton
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Zinc finger structure-function in Ikaros 被引量:2
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作者 Marvin A Payne 《World Journal of Biological Chemistry》 CAS 2011年第6期161-166,共6页
The zinc finger motif was used as a vehicle for the initial discovery of Ikaros in the context of T-cell differentiation and has been central to all subsequent analyses of Ikaros function.The Ikaros gene is alternatel... The zinc finger motif was used as a vehicle for the initial discovery of Ikaros in the context of T-cell differentiation and has been central to all subsequent analyses of Ikaros function.The Ikaros gene is alternately spliced to produce several isoforms that confer diversity of function and consequently have complicated analysis of the function of Ikaros in vivo.Key features of Ikaros in vivo function are associated with six C2H2 zinc fingers;four of which are alternately incorporated in the production of the various Ikaros isoforms.Although no complete structures are available for the Ikaros protein or any of its family members,considerable evidence has accumulated about the structure of zinc fingers and the role that this structure plays in the functions of the Ikaros family of proteins.This review summarizes the structural aspects of Ikaros zinc fingers,individually,and in tandem to provide a structural context for Ikaros function and to provide a structural basis to inform the design of future experiments with Ikaros and its family members. 展开更多
关键词 IKAROS zinc finger DNA binding protein TRANSCRIPTION factor ⅢA C2H2 TANDEM
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LncRNA ZEB1-AS1和LncRNA SOX2OT在糖尿病肾病患者中的表达及与肾功能的相关性研究 被引量:1
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作者 何德娇 凌娜 +3 位作者 李正翔 乔玲 张淼淼 夏露 《疑难病杂志》 CAS 2024年第7期809-813,共5页
目的探究长链非编码RNA锌指E盒结合同源盒蛋白1反义链1(LncRNA ZEB1-AS1)和长链非编码RNA性别决定相关基因簇2重叠转录本(LncRNA SOX2OT)在糖尿病肾病(DN)患者中的表达及与肾功能的相关性。方法选取于2021年11月—2023年12月在武汉大学... 目的探究长链非编码RNA锌指E盒结合同源盒蛋白1反义链1(LncRNA ZEB1-AS1)和长链非编码RNA性别决定相关基因簇2重叠转录本(LncRNA SOX2OT)在糖尿病肾病(DN)患者中的表达及与肾功能的相关性。方法选取于2021年11月—2023年12月在武汉大学人民医院肾内科收治的DN患者106例为DN组,并根据24 h尿蛋白定量(24 h Upro)水平分为正常蛋白尿亚组43例(<30 mg)、微量蛋白尿亚组39例(30~<300 mg)、大量蛋白尿亚组24例(≥300 mg),另选取同期医院单纯糖尿病患者106例作对照组,检测患者血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT水平;Pearson法分析LncRNA ZEB1-AS1和LncRNA SOX2OT与肾功能指标的相关性;Logistic分析影响DN患者肾功能损伤的因素。结果DN组血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT水平低于对照组(t=11.471、10.257,P均<0.001)。血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT比较,正常尿蛋白亚组>微量尿蛋白亚组>大量尿蛋白亚组(F=58.720、117.722,P均<0.001),BUN、SCr、UA水平比较,正常尿蛋白亚组<微量尿蛋白亚组<大量尿蛋白亚组,差异均有统计学意义(F=122.493、595.589、53.178,P均<0.001);LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT分别与BUN、SCr、UA呈负相关(r=-0.487、-0.498、-0.521,-0.527、-0.515、-0.534,P均<0.001);Logistic回归分析显示,糖尿病病程长及高BUN、SCr、UA水平是影响DN患者肾功能损伤的危险因素[OR(95%CI)=1.672(1.128~2.479)、2.839(1.534~5.253)、2.754(1.512~5.017)、2.693(1.464~4.954)],高LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT是保护因素[OR(95%CI)=0.875(0.798~0.959)、0.898(0.832~0.969)]。结论血清LncRNA ZEB1-AS1、LncRNA SOX2OT水平与DN患者肾功能有关,可能是评估DN患者肾功能的潜在指标。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 长链非编码RNA锌指E盒结合同源盒蛋白1反义链1 长链非编码RNA性别决定相关基因簇2重叠转录本 肾功能 相关性
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斑点叉尾鮰ZBTB38的原核表达、多克隆抗体制备及应用
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作者 张世勇 刘洪岩 +3 位作者 钟立强 赵彦华 王明华 陈校辉 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期654-661,共8页
为获得斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus)ZBTB38的多克隆抗体,并研究其在性腺中的表达情况,将斑点叉尾鮰zbtb38基因部分序列经密码子优化后连接至pET32a(+)载体,构建重组质粒pET32a(+)-zbtb38,再转入大肠杆菌(Escherichia coli)感受态细... 为获得斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus)ZBTB38的多克隆抗体,并研究其在性腺中的表达情况,将斑点叉尾鮰zbtb38基因部分序列经密码子优化后连接至pET32a(+)载体,构建重组质粒pET32a(+)-zbtb38,再转入大肠杆菌(Escherichia coli)感受态细胞BL21(DE3)中诱导表达,通过十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)、免疫印迹(Western blot)和液相色谱-质谱联用(LC-MS)等技术进行鉴定。用纯化后的重组蛋白制备兔抗斑点叉尾鮰ZBTB38多克隆抗体,通过酶联免疫吸附(ELISA)和Western blot技术检测抗体效价及其特异性,最后采用Western blot方法检测ZBTB38在性腺中的表达情况,并使用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对检测结果进行验证。结果表明,制备的兔抗斑点叉尾鮰ZBTB38多克隆抗体效价可达1:(5.12×10^(5)),能够特异性识别斑点叉尾鮰性腺组织中表达的ZBTB38蛋白,其中精巢组织中的表达水平显著高于卵巢,Western blot与qRT-PCR检测结果较为一致。综上所述,研究成功制备了斑点叉尾鮰ZBTB38的多克隆抗体,为下一步深入研究斑点叉尾鮰zbtb38基因的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 斑点叉尾鮰 锌指蛋白 原核表达 多克隆抗体 性腺
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高糖通过调控miR-429/ZEB1轴对胰腺癌细胞免疫逃逸的影响
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作者 张志超 李光辉 +3 位作者 朱学河 魏强 王飞 赵海平 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第7期1166-1174,共9页
目的探究高糖干预对胰腺癌细胞免疫逃逸的影响及作用分子机制。方法采用不同浓度葡萄糖(0、7.5、15、30 mmol/L)处理PANC-1细胞24 h构建高糖干预的PANC-1细胞。将miR-429 mimics及其阴性对照(mimics NC)转染至PANC-1细胞,分为对照组、H... 目的探究高糖干预对胰腺癌细胞免疫逃逸的影响及作用分子机制。方法采用不同浓度葡萄糖(0、7.5、15、30 mmol/L)处理PANC-1细胞24 h构建高糖干预的PANC-1细胞。将miR-429 mimics及其阴性对照(mimics NC)转染至PANC-1细胞,分为对照组、HG组、HG+mimics NC组、HG+mimics组、HG+mimics+oe-NC组和HG+mimics+oe-ZEB1组。流式细胞术检测细胞表面分子细胞程序性死亡-配体1(PD-L1)表达水平;qRT-PCR检测细胞miR-429和锌指E-盒结合同源盒蛋白1(ZEB1)mRNA表达水平;Western blot检测细胞ZEB1蛋白表达水平。将以上各组PANC-1细胞与CD8^(+)T细胞建立共培养体系,CCK-8检测细胞增殖活性;流式细胞术检测细胞凋亡水平;乳酸脱氢酶(LDH)释放法检测CD8^(+)T细胞对PANC-1细胞的杀伤作用;采用双荧光素酶报告系统验证miR-429和ZEB1的靶向调控关系。结果HG可促进PANC-1细胞表面分子PD-L1及ZEB1表达(P<0.05),抑制miR-429表达,且呈浓度依赖性。miR-429过表达可显著抑制HG诱导的PANC-1细胞表面分子PD-L1表达,而过表达ZEB1可逆转miR-429过表达对HG诱导PANC-1细胞表面分子PD-L1表达的抑制作用。建立与CD8^(+)T细胞共培养体系后,与对照组比较,HG组PANC-1细胞增殖活性明显增加,细胞凋亡率和杀伤活性明显降低(P<0.05);与HG+mimics NC组比较,HG+mimics组PANC-1细胞增殖活性明显降低,细胞凋亡水平和杀伤活性明显升高(P<0.05)。与HG+mimics+oe-NC组比较,HG+mimics+oe-ZEB1组PANC-1细胞增殖活性明显增加,细胞凋亡率和杀伤活性明显降低(P<0.05)。双荧光素酶报告基因实验证实,miR-429靶向负调控ZEB1。结论高糖通过下调miR-429表达水平,靶向负调控ZEB1 mRNA的表达,提高PANC-1细胞表面分子PD-L1表达水平,进而促进PANC-1细胞免疫逃逸。 展开更多
关键词 miR-429 胰腺癌 锌指E-盒结合同源盒蛋白1 高糖 免疫逃逸
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脓毒症并发急性肾损伤患者血清HDAC4和KLF5的表达及其临床价值
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作者 李玉伟 王瑾 +1 位作者 乔薇 王助衡 《中国急救复苏与灾害医学杂志》 2024年第3期359-363,共5页
目的探究脓毒症并发急性肾损伤(AKI)患者血清组蛋白去乙酰基转移酶4(HDAC4)和锌指蛋白转录因子5(KLF5)表达及临床价值。方法选取2020年9月—2022年9月本院收治的60例脓毒症并发AKI患者作为AKI组,选取同期北京市大兴区人民医院收治的75... 目的探究脓毒症并发急性肾损伤(AKI)患者血清组蛋白去乙酰基转移酶4(HDAC4)和锌指蛋白转录因子5(KLF5)表达及临床价值。方法选取2020年9月—2022年9月本院收治的60例脓毒症并发AKI患者作为AKI组,选取同期北京市大兴区人民医院收治的75例脓毒症未发生AKI患者作为非AKI组。比较两组的临床资料、血清HDAC4和KLF5水平。ROC分析血清HDAC4和KLF5对脓毒症患者并发AKI的诊断价值。Logistic回归分析影响脓毒症患者并发AKI的因素。结果与非AKI组相比,AKI组患者血清HDAC4、KLF5、降钙素原(PCT)、肌酐(Cr)、序贯性器官衰竭(SOFA)、急性生理学及慢性健康状况评分系统Ⅱ(APACHEⅡ)评分较高,AKI组血小板计数(PLT)较低,差异有统计学意义(P<0.05)。随着AKI组患者分期升高,血清HDAC4和KLF5水平依次升高,差异有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线分析显示,血清HDAC4、KLF5可辅助诊断脓毒症患者是否并发AKI的曲线下面积(AUC)是0.800(95%CI:0.723~0.876)、0.810(95%CI:0.735~0.886);二者联合诊断的AUC为0.908(95%CI:0.856~0.961),均优于各自单独检测(Z=2.277、2.102,P<0.05)。Logistic回归分析显示,APACHEⅡ评分、SOFA评分、HDAC4、KLF5是影响脓毒症患者是否并发AKI的危险因素(P<0.05)。结论脓毒症并发AKI患者血清HDAC4、KLF5水平升高,且二者联合检测对脓毒症并发AKI的诊断效能较高,对评估脓毒症并发AKI有较好的临床诊断价值。 展开更多
关键词 脓毒症并发肾损伤 组蛋白去乙酰基转移酶4 锌指蛋白转录因子5 临床价值
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ZNF772甲基化及HR-HPV检测在意义不明的非典型鳞状细胞病人分流中的意义
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作者 孙晓娟 周高英 王羽 《蚌埠医学院学报》 CAS 2024年第4期497-500,505,共5页
目的:探讨锌指蛋白(ZNF)772甲基化及高危型人乳头瘤病毒(HR-HPV)检测在意义不明的非典型鳞状细胞(ASCUS)病人分流中的意义。方法:选取初筛ASCUS病人195例,均接受HC2-HPV-DNA检测及ZNF772基因DNA甲基化检测;比较宫颈上皮内瘤样变(CIN)Ⅱ... 目的:探讨锌指蛋白(ZNF)772甲基化及高危型人乳头瘤病毒(HR-HPV)检测在意义不明的非典型鳞状细胞(ASCUS)病人分流中的意义。方法:选取初筛ASCUS病人195例,均接受HC2-HPV-DNA检测及ZNF772基因DNA甲基化检测;比较宫颈上皮内瘤样变(CIN)Ⅱ及以上与CINⅡ以下、CINⅢ及以上及CINⅢ以下病人ZNF772基因位点甲基化水平的差异,并评估ZNF772甲基化水平及HR-HPV对ASCUS病人CINⅡ及以上、CINⅢ及以上的分流价值。结果:病理学检查显示,195例ASCUS病人中炎症80例(41.03%)、CINⅠ64例(32.82%)、CINⅡ29例(14.87%)、CINⅢ/CIS/AIS 18例(9.23%)、SCC/AC 4例(2.05%)。HR-HPV(HC2)阳性141例(72.31%)、HR-HPV(HC2)阴性54例(27.69%);CINⅡ及以上病人HR-HPV(HC2)阳性检出率高于CINⅡ以下(P<0.05);CINⅢ及以上病人HR-HPV(HC2)阳性检出率高于CINⅢ以下(P<0.05)。CINⅡ及以上、CINⅢ及以上病人ZNF772基因-420、-422位点甲基化水平分别高于CINⅡ以下、CINⅢ以下病人(P<0.05)。ZNF772基因-420、-422位点甲基化水平及HR-HPV诊断CINⅡ及以上的AUC(95%CI)分别为0.867(0.811~0.911)、0.806(0.743~0.859)、0.777(0.712~0.834),诊断CINⅢ及以上的AUC(95%CI)分别为0.891(0.838~0.931)、0.868(0.813~0.912)、0.780(0.716~0.836)。ZNF772基因-420位点甲基化水平诊断CINⅡ及以上、CINⅢ及以上的AUC面积最大。结论:相较于HC2-HPV-DNA检测,ZNF772甲基化检测更能准确地识别ASCUS中CINⅡ及以上、CINⅢ及以上病变病人,有望成为分流ASCUS的有效替代手段。 展开更多
关键词 意义不明的非典型鳞状细胞 锌指蛋白772 高危型人乳头瘤病毒
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miR-592靶向调控PRDM5影响肾细胞癌侵袭转移及自噬的机制研究
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作者 李顺来 宋晓琳 +1 位作者 姜亭起 王文祯 《医学分子生物学杂志》 CAS 2024年第3期239-246,共8页
目的探究miR-592靶向调控PR结构域锌指蛋白5(PR domain zinc finger protein 5,PRDM5)影响肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)侵袭转移及自噬的机制。方法RT-qPCR、蛋白质印迹检测RCC组织和细胞中miR-592、PRDM5 mRNA和蛋白水平。A498... 目的探究miR-592靶向调控PR结构域锌指蛋白5(PR domain zinc finger protein 5,PRDM5)影响肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)侵袭转移及自噬的机制。方法RT-qPCR、蛋白质印迹检测RCC组织和细胞中miR-592、PRDM5 mRNA和蛋白水平。A498、786-O细胞分为anti-miR-NC组、anti-miR-592组、anti-miR-592+si-NC组、anti-miR-592+si-PRDM5组。RNA免疫共沉淀(RIP)检测miR-592和PRDM5的结合;CCK-8、Transwell实验检测细胞增殖、迁移和侵袭能力;透射电镜观察自噬小体形成;蛋白质印迹检测细胞PRDM5、基质金属蛋白酶(MMP)-2、MMP-9、Beclin1、微管相关蛋白1轻链3(LC3)Ⅱ/Ⅰ水平。建立移植瘤裸鼠模型,分析敲低miR-592表达对移植瘤生长的影响。结果RCC组织和细胞中PRDM5 mRNA和蛋白水平降低,miR-592水平增加(P<0.05)。敲低miR-592表达后,细胞A_(450 nm)、迁移和侵袭细胞数、MMP-2、MMP-9水平降低,自噬小体数量、Beclin1、LC3Ⅱ/Ⅰ水平增加(P<0.05)。敲低PRDM5表达能部分逆转敲低miR-592对细胞增殖、侵袭及自噬的影响(P<0.05)。敲低miR-592表达能够抑制裸鼠移植瘤生长(P<0.05)。结论miR-592通过靶向抑制PRDM5表达,促进RCC细胞增殖、侵袭转移能力,并抑制自噬能力。 展开更多
关键词 miR-592 PR结构域锌指蛋白5 肾细胞癌 侵袭转移 自噬
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食管癌组织微RNA-634、锌指蛋白ZBTB20表达与食管癌临床特征及预后的关系
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作者 姜明泽 王磊 杨树博 《安徽医药》 CAS 2024年第2期321-325,共5页
目的 分析食管癌组织中微RNA-634(miR-634)和锌指蛋白ZBTB20的表达水平,并分析二者是否与食管癌发生发展及预后相关。方法 选取2018年1月至2019年4月湖北医药学院附属国药东风总医院接受手术的食管癌病人102例,从病人根治切除术手术标... 目的 分析食管癌组织中微RNA-634(miR-634)和锌指蛋白ZBTB20的表达水平,并分析二者是否与食管癌发生发展及预后相关。方法 选取2018年1月至2019年4月湖北医药学院附属国药东风总医院接受手术的食管癌病人102例,从病人根治切除术手术标本切取癌组织及癌旁正常组织。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测miR-634、ZBTB20 mRNA相对表达水平。Pearson相关性分析食管癌组织中miR-634与ZBTB20 mRNA表达水平的相关性。Kaplan-Meier生存曲线分析miR-634、ZBTB20与预后的关系。Cox回归分析食管癌病人预后危险因素。结果 与癌旁正常组织(1.02±0.06、1.01±0.05)相比,食管癌组织中miR-634低表达(0.69±0.15)(P<0.05),ZBTB20 mRNA高表达(1.64±0.26)(P<0.05)。Pearson相关性分析显示,miR-634、ZBTB20 mRNA在食管癌病人的组织样本中表达水平负相关(r=-0.65,P<0.05);两者均与TNM分期、淋巴结转移、组织分化程度相关(P<0.05)。Kaplan-Meier法显示,miR-634高表达组(64.71%)无进展生存率较低表达(29.41%)高(χ^(2)=14.41,P<0.001),ZBTB20低表达组(62.75%)无进展生存率较高表达组(31.37%)高(χ^(2)=9.48,P=0.002)。多因素Cox回归分析表明,TNM分期(Ⅲ)、淋巴结转移、miR-634低表达、ZBTB20高表达是影响食管癌病人不良预后的危险因素(P<0.05)。结论 食管癌病人癌组织中miR-634表达水平降低,ZBTB20表达水平升高,两者与TNM分期、淋巴结转移、组织分化程度及预后密切相关。 展开更多
关键词 食管肿瘤 微RNA-634 锌指蛋白ZBTB20 临床特征 预后
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miR-150-5p靶向ZEB1调控EMT对子宫内膜癌细胞恶性生物学行为的影响
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作者 张桂萍 韩立 彭丽 《实用癌症杂志》 2024年第6期878-882,890,共6页
目的探讨微小RNA-150-5p(miR-150-5p)是否可靶向锌指E盒结合蛋白1(ZEB1)调控子宫内膜癌(EC)细胞上皮间质转化(EMT)进而影响癌细胞的恶性生物学行为。方法RT-qPCR技术检测正常子宫内膜和EC组织中、子宫内膜上皮细胞系hEEC及EC细胞系Ishik... 目的探讨微小RNA-150-5p(miR-150-5p)是否可靶向锌指E盒结合蛋白1(ZEB1)调控子宫内膜癌(EC)细胞上皮间质转化(EMT)进而影响癌细胞的恶性生物学行为。方法RT-qPCR技术检测正常子宫内膜和EC组织中、子宫内膜上皮细胞系hEEC及EC细胞系Ishikawa和HEC-1-A中miR-150-5p相对表达量。过表达miR-150-5p,MTT法、菌落形成实验、伤口愈合实验和Transwell实验分别评估Ishikawa细胞活力、克隆形成、迁移及侵袭能力;双荧光素酶报告基因实验验证miR-150-5p与ZEB1的靶向关系;RT-qPCR检测miR-150-5p及ZEB1 mRNA相对表达量;Western blot技术检测ZEB1、E-钙黏蛋白(E-cadherin)、N-钙黏蛋白(N-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)及基质金属蛋白酶9(MMP-9)蛋白表达量。结果与正常子宫内膜组织比较,EC组织中miR-150-5p相对表达量降低(P<0.05);与hEEC细胞比较,HEC-1-A细胞和Ishikawa细胞中miR-150-5p相对表达量降低(P<0.05),Ishikawa细胞中最低(P<0.05)。与空白组比较,miR-150-5p mimics组细胞490 nm处吸光度值、细胞菌落数、迁移数和侵袭数、ZEB1 mRNA和蛋白相对表达量及N-cadherin、Vimentin和MMP-9蛋白相对表达量显著降低,miR-150-5p相对表达量、E-cadherin蛋白相对表达量显著升高(P<0.05)。经生物信息学分析,ZEB1被预测为miR-150-5p的潜在靶基因。结论miR-150-5p可靶向ZEB1抑制癌细胞的恶性生物学行为,其作用机制可能与调控EC细胞EMT进展有关。 展开更多
关键词 微小RNA-150-5p 锌指E盒结合蛋白1 子宫内膜癌 上皮间质转化 恶性生物学行为
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KLF10在多发性骨髓瘤患者中的表达及与预后的关系
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作者 李慧 张吴霞 熊烨 《西部医学》 2024年第4期549-553,共5页
目的探究多发性骨髓瘤患者中锌指蛋白转录因子10(KLF10)的表达及其与预后的关系。方法选取2015年1月—2017年1月我院收治的多发性骨髓瘤患者126例作为观察组,选取同期在我院健康体检的健康者120例作为对照组。采用酶联免疫吸附法(ELISA... 目的探究多发性骨髓瘤患者中锌指蛋白转录因子10(KLF10)的表达及其与预后的关系。方法选取2015年1月—2017年1月我院收治的多发性骨髓瘤患者126例作为观察组,选取同期在我院健康体检的健康者120例作为对照组。采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测受试者血清KLF10水平;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测受试者血清miR-21表达水平;采用Pearson相关性分析法进行多发性骨髓瘤患者血清KLF10、miR-21水平的相关性分析;采用Kaplan-Meier法分析患者血清KLF10、miR-21水平与多发性骨髓瘤患者预后的关系;采用多因素COX回归分析影响多发性骨髓瘤患者预后的危险因素。结果观察组血清KLF10水平低于对照组,血清miR-21水平高于对照组,差异均具有统计学意义(P<0.05);Pearson相关性分析显示,观察组血清KLF10、miR-21水平呈负相关(r=-0.447,P<0.05);多发性骨髓瘤患者血清KLF10、miR-21水平与患者性别、年龄、免疫球蛋白分型无关(P>0.05),与患者DS分期、是否重度贫血、ECOG评分以及骨髓浆细胞比例有关(P<0.05);Kaplan-Meier生存曲线分析表明,多发性骨髓瘤患者血清KLF10低表达组生存率低于高表达组(χ^(2)=9.651,P=0.032);血清miR-21高表达组生存率低于低表达组(χ^(2)=12.056,P=0.0024);多因素COX回归分析显示,血清KLF10低表达、血清miR-21高表达、DS分期Ⅲ期、重度贫血、ECOG评分>3分和骨髓浆细胞比例>30%是影响多发性骨髓瘤患者发生不良预后的危险因素(P<0.05)。结论多发性骨髓瘤患者血清KLF10表达下调,其表达水平与患者临床病理特征相关,是多发性骨髓瘤患者发生不良预后的危险因素。 展开更多
关键词 多发性骨髓瘤 锌指蛋白转录因子10 预后 MIR-21
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肉桂醛调节Shh/Gli1信号通路对幽门螺旋杆菌胃炎大鼠胃黏膜损伤的影响 被引量:1
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作者 黄方 黄莉璇 +2 位作者 吴彬 李名福 卢长江 《安徽医学》 2024年第2期135-141,共7页
目的 探讨肉桂醛调节音猬因子(Shh)/Gli家族锌指蛋白1(Gli1)信号通路对幽门螺旋杆菌(Hp)胃炎大鼠胃黏膜损伤的影响。方法 将大鼠随机分为对照组、模型组、肉桂醛低剂量组、肉桂醛中剂量组、肉桂醛高剂量组、替普瑞酮组、肉桂醛高剂量+Sh... 目的 探讨肉桂醛调节音猬因子(Shh)/Gli家族锌指蛋白1(Gli1)信号通路对幽门螺旋杆菌(Hp)胃炎大鼠胃黏膜损伤的影响。方法 将大鼠随机分为对照组、模型组、肉桂醛低剂量组、肉桂醛中剂量组、肉桂醛高剂量组、替普瑞酮组、肉桂醛高剂量+Shh激活剂Purmorphamine(PUR)组,每组18只。通过灌胃Hp的方法构建胃炎大鼠模型。建模成功后,肉桂醛低、中、高剂量组大鼠分别灌胃12.5 mg/kg、25 mg/kg、50 mg/kg肉桂醛,替普瑞酮组大鼠灌胃0.13 g/kg替普瑞酮,肉桂醛高剂量+PUR组大鼠给予50 mg/kg肉桂醛灌胃和6.67 mg/kg PUR腹腔注射,每天给药1次,持续2周。HE染色检测大鼠胃黏膜组织病理变化;透射电镜观察大鼠胃黏膜细胞形态。将GES-1细胞分为vitro-对照组、vitro-模型组、vitro-肉桂醛低剂量组、vitro-肉桂醛中剂量组、vitro-肉桂醛高剂量组、vitro-替普瑞酮组、vitro-肉桂醛高剂量+PUR组。除vitro-对照组外,其他组GES-1细胞均需被Hp感染,感染结束后,vitro-肉桂醛低剂量组、vitro-肉桂醛中剂量组、vitro-肉桂醛高剂量组分别用5μmol/L、10μmol/L、20μmol/L肉桂醛处理24 h;vitro-替普瑞酮组用1μmol/L替普瑞酮处理24 h;vitro-肉桂醛高剂量+PUR组用20μmol/L肉桂醛和1μmol/L PUR共同处理24 h,CCK-8法检测GES-1细胞增殖抑制率;ELISA法检测大鼠胃黏膜组织及GES-1细胞上清中白细胞介素1β (IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平;Western blot检测大鼠胃黏膜组织及GES-1细胞中Shh、Gli1蛋白表达。结果 与对照组比较,模型组大鼠胃黏膜组织病理损伤严重,胃黏膜表面上皮细胞固缩,细胞膜破损,IL-1β、TNF-α水平及Shh、Gli1蛋白表达升高(P<0.05);与模型组比较,肉桂醛低剂量组、肉桂醛中剂量组、肉桂醛高剂量组、替普瑞酮组大鼠胃黏膜组织病理损伤、胃黏膜表面上皮细胞结构及形态有所改善,IL-1β、TNF-α水平及Shh、Gli1蛋白表达降低(P<0.05);与肉桂醛高剂量组比较,肉桂醛高剂量+PUR组大鼠胃黏膜组织病理损伤加剧,胃黏膜表面上皮细胞结构及形态破环严重,IL-1β、TNF-α水平及Shh、Gli1蛋白表达升高(P<0.05)。与vitro-对照组比较,vitro-模型组GES-1细胞增殖抑制率、细胞上清中IL-1β、TNF-α水平及细胞中Shh、Gli1蛋白表达升高(P<0.05);与vitro-模型组比较,vitro-肉桂醛低剂量组、vitro-肉桂醛中剂量组、vitro-肉桂醛高剂量组、vitro-替普瑞酮组GES-1细胞增殖抑制率、细胞上清中IL-1β、TNF-α水平及细胞中Shh、Gli1蛋白表达降低(P<0.05);与vitro-肉桂醛高剂量组比较,vitro-肉桂醛高剂量+PUR组GES-1细胞增殖抑制率、细胞上清中IL-1β、TNF-α水平及细胞中Shh、Gli1蛋白表达升高(P<0.05)。结论 肉桂醛可能通过抑制Shh/Gli1通路减轻Hp诱导的胃炎大鼠胃黏膜损伤。 展开更多
关键词 肉桂醛 幽门螺旋杆菌 Shh/Gli家族锌指蛋白1信号通路 胃炎 炎症
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miR-200c联合MORC2检测在卵巢癌病情及预后评估中的临床价值 被引量:1
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作者 洪佳 黄金玲 +2 位作者 杨琼琼 汪晶 李晶 《疑难病杂志》 CAS 2024年第4期407-411,共5页
目的研究微小核糖核酸-200c(miR-200c)联合MORC家族CW型锌指蛋白2(MORC2)检测在卵巢癌病情及预后评估中的临床价值。方法选择2017年1月—2019年12月武汉大学人民医院妇产科诊治的卵巢癌患者103例(卵巢癌组)及卵巢良性疾病患者60例(对照... 目的研究微小核糖核酸-200c(miR-200c)联合MORC家族CW型锌指蛋白2(MORC2)检测在卵巢癌病情及预后评估中的临床价值。方法选择2017年1月—2019年12月武汉大学人民医院妇产科诊治的卵巢癌患者103例(卵巢癌组)及卵巢良性疾病患者60例(对照组)为研究对象,采用实时荧光定量PCR检测miR-200c及MORC2表达并分析其与临床病理因素的关系;受试者工作特征(ROC)曲线分析miR-200c联合MORC2预测卵巢癌2年预后不良的效能;多因素Logistic回归分析卵巢癌患者死亡的危险因素;Kaplan-Meier法分析miR-200c和MORC2表达与生存期的关系。结果卵巢癌组患者肿瘤组织miR-200c、MORC2表达高于癌旁组织和对照组(F=1926.617、1832.415,P均<0.001)。低分化、有恶性腹水、肿瘤最大径≥5 cm、有淋巴结转移、有远处转移及Ⅲ~Ⅳ期卵巢癌患者miR-200c、MORC2表达高于中-高分化、无恶性腹水、肿瘤最大径<5 cm、无淋巴结转移、无远处转移及Ⅰ~Ⅱ期患者(t=14.067、12.451、12.871、11.523、16.298、18.351,11.745、10.893、10.462、9.893、14.617、13.269,P均<0.001)。miR-200c、MORC2及二者联合预测卵巢癌患者2年预后不良的AUC分别为0.786、0.792、0.901,二者联合优于各自单独预测效能(Z=8.239、8.025,P均<0.001)。miR-200c≥0.78、MORC2≥0.65、低分化、有恶性腹水、肿瘤最大径≥5 cm、有淋巴结转移、有远处转移、FIGO分期Ⅲ~Ⅳ期为卵巢癌死亡的独立危险因素[OR(95%CI)=5.323(1.812~8.834)、4.802(1.141~8.463)、2.065(1.068~3.062)、2.252(1.145~3.359)、2.140(1.216~3.064)、2.012(1.005~3.019)、2.522(1.625~3.419)、2.186(1.134~3.238)];卵巢癌组中miR-200c≥0.78且MORC2≥0.65卵巢癌患者中位生存期显著低于其他患者(miR-200c<0.78或MORC2<0.65)(Log-Rankχ^(2)=16.371,P<0.05)。结论卵巢癌患者miR-200c及MORC2表达显著升高,在卵巢癌病情及预后评估中具有重要临床价值,两者联合检测时可显著提高预测卵巢癌预后不良的敏感度及特异度。 展开更多
关键词 卵巢癌 微小核糖核酸-200c MORC家族CW型锌指蛋白2 临床价值 预后
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ZFP36L1对胰腺癌细胞生长调控的机制研究
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作者 杨洋 黄小勇 +4 位作者 赵文雪 高宁 樊欣悦 张静 杜娟 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期1815-1825,共11页
目的:探究锌指蛋白36样蛋白1(ZFP36L1)对胰腺癌细胞生长的影响及其调控机制。方法:在线网站UALCAN和GEPIA分析ZFP36L1在胰腺癌中的表达及其表达变化与胰腺癌患者不良预后的相关性。Western blot检测ZFP36L1在胰腺导管细胞(HPNE)和3种不... 目的:探究锌指蛋白36样蛋白1(ZFP36L1)对胰腺癌细胞生长的影响及其调控机制。方法:在线网站UALCAN和GEPIA分析ZFP36L1在胰腺癌中的表达及其表达变化与胰腺癌患者不良预后的相关性。Western blot检测ZFP36L1在胰腺导管细胞(HPNE)和3种不同胰腺癌细胞中的蛋白表达情况。CCK-8和集落形成实验检测ZFP36L1过表达及干扰对胰腺癌细胞增殖的影响;细胞划痕和Transwell实验检测ZFP36L1表达变化对胰腺癌细胞迁移和侵袭能力的影响;流式细胞术分析ZFP36L1表达变化对胰腺癌细胞周期的影响。生物信息学分析ZFP36L1的互作蛋白;Co-IP检测ZFP36L1与丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)间的相互作用;Western blot检测过表达ZFP36L1对p38 MAPK信号通路相关蛋白表达及磷酸化的影响;回复实验检测过表达MAPK14在ZFP36L1调控胰腺癌细胞功能中的影响。结果:(1)ZFP36L1在胰腺癌中高表达,与胰腺癌患者不良预后正相关;与HPNE相比,ZFP36L1在MIA PaCa-2和ASPC-1胰腺癌细胞中的表达水平较高,在PANC-1胰腺癌细胞中的表达水平相对较低;(2)过表达ZFP36L1后,PANC-1和MIA PaCa-2细胞活力、集落形成、迁移和侵袭能力显著增加,干扰ZFP36L1表达则获得相反的结果;(3)细胞生长调控过程中ZFP36L1可促进胰腺癌细胞进入S期;(4)ZFP36L1可与MAPK14相互作用调控胰腺癌细胞生长,过表达MAPK14可逆转ZFP36L1过表达诱导的胰腺癌细胞活力和细胞迁移能力增加,使ZFP36L1敲降胰腺癌细胞的活力和迁移能力进一步下降。结论:ZFP36L1是潜在的胰腺癌促进蛋白,可通过细胞周期调控及与MAPK14互作调控胰腺癌细胞的生长。 展开更多
关键词 锌指蛋白36样蛋白1 胰腺癌 丝裂原活化蛋白激酶14 生物信息学 细胞生长
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