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薄荷McZFP1基因克隆及表达分析
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作者 郑晓薇 柏杨 +5 位作者 亓希武 于盱 房海灵 李莉 刘冬梅 梁呈元 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期35-46,58,共13页
根据前期茉莉酸甲酯处理的薄荷(Mentha canadensis Linn.)转录组数据分析结果,从薄荷中克隆到McZFP1,并进行了基因和蛋白质特性、组织表达、非生物胁迫处理下的表达、亚细胞定位以及转录自激活活性分析。结果显示:薄荷McZFP1的开放阅读... 根据前期茉莉酸甲酯处理的薄荷(Mentha canadensis Linn.)转录组数据分析结果,从薄荷中克隆到McZFP1,并进行了基因和蛋白质特性、组织表达、非生物胁迫处理下的表达、亚细胞定位以及转录自激活活性分析。结果显示:薄荷McZFP1的开放阅读框长度为558 bp,编码185个氨基酸。McZFP1具亲水性,无跨膜结构域,属于不稳定蛋白,包含C2H2保守结构域,含有13个丝氨酸、3个酪氨酸和3个苏氨酸的磷酸化位点。进化树分析结果表明McZFP1与一串红(Salvia splendens Ker-Gawler)SsZFP7的亲缘关系最近。实时荧光定量PCR结果表明:McZFP1在薄荷不定根、茎、根状茎、幼叶、成熟叶和花中均有表达,在根状茎中的相对表达量最高,且受150 mmol·L^(-1)NaCl、300 mmol·L^(-1)甘露醇、200μmol·L^(-1)脱落酸和200μmol·L^(-1)茉莉酸甲酯处理诱导表达。McZFP1定位于细胞核,无转录自激活活性。综上所述,薄荷McZFP1在不同组织中存在表达差异,参与调节激素和非生物胁迫响应过程。 展开更多
关键词 薄荷 锌指蛋白(zfp)转录因子 生物信息学 亚细胞定位 表达
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油菜转录因子BnZFP基因的分离及其功能初步分析 被引量:2
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作者 张兰 王磊 +1 位作者 涂金星 范云六 《中国农学通报》 CSCD 2007年第2期45-49,共5页
为克隆油菜ZFP类转录因子基因,初步阐明其功能。采用RT-PCR的方法克隆基因和体内检测;花沾法转化拟南芥,Northernblotting检测转基因后的表达。从甘蓝型油菜中分离了一个新的ZFP类转录因子,它编码377个氨基酸,与拟南芥AtZFP基因(At2g296... 为克隆油菜ZFP类转录因子基因,初步阐明其功能。采用RT-PCR的方法克隆基因和体内检测;花沾法转化拟南芥,Northernblotting检测转基因后的表达。从甘蓝型油菜中分离了一个新的ZFP类转录因子,它编码377个氨基酸,与拟南芥AtZFP基因(At2g29660)的碱基序列相似性最高,为76.2%,命名为BnZFP。该基因在父本、母本和F1代不同发育时期中均能较稳定的表达;该基因转化拟南芥,对获得的转BnZFP基因拟南芥进行了NorthernBlotting分析,表明该基因在拟南芥中得到过表达;与野生型拟南芥相比较,过表达BnZFP的转基因拟南芥在萌发、营养生长及生殖生长过程中没有表现出明显的表型变化,该基因的功能有待进一步研究。 展开更多
关键词 油菜 拟南芥 转录因子 锌指蛋白 Bnzfp
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A zinc finger protein, interacted with cyclophilin,affects root development via IAA pathway in rice 被引量:4
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作者 Peng Cui Hongbo Liu +5 位作者 Songlin Ruan Basharat Ali Rafaqat Ali Gill Huasheng Ma Zhifu Zheng Weijun Zhou 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2017年第7期496-505,共10页
The plant hormone auxin plays a crucial role in lateral root development. To better understand the rnolecular mechanisms underlying lateral root formation, an auxin-responsive gene OsCYP2 (Oso2g0121300) was characte... The plant hormone auxin plays a crucial role in lateral root development. To better understand the rnolecular mechanisms underlying lateral root formation, an auxin-responsive gene OsCYP2 (Oso2g0121300) was characterized from rice. Compared to the wild type, OsCYP2-RNAi (RNA interference) lines exhibited distinctive defects in lateral root development. Yeast two-hybrid and glutathione S-transferase puIl-down results confirmed that OsCYP2 interacted with a C2HC-type zinc finger protein (OsZFP, O501g0252900) which is located in the rice nucleus. T2OsZFP-RNAi lines had significantly fewer lateral roots than did wild-type plants, which suggests a role for OsCYP2 and OsZFP in regulating lateral root development.Quantitative real-time polymerase chain reaction showed that the expression of certain Aux/IAA (auxin/indole-3- acetic acid) genes was altered in OsCYP2- and OsZFP-RNAi lines in response to IAA. These findings imply that OsCYP2 and OsZFP participate in IAA signal pathways controlling lateral root development. More importantly, OslAA11 showed functional redundancy not only in OsCYP2-RNAi lines but also in OsZFP-RNAi lines, which provides important clues for the elucidation of mechanisms controlling lateral root development in response to auxin. 展开更多
关键词 IAA of gene ROOT A zinc finger protein zfp RNAI with
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The roles of zinc finger proteins in non-alcoholic fatty liver disease
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作者 Guoqiang Li Xinran Ma Lingyan Xu 《Liver Research》 2020年第1期35-39,共5页
Non-alcoholic fatty liver disease(NAFLD)is a common chronic disease characterized by excessive fat accumulation in hepatocytes in the absence of alcohol consumption.Modern trends towards excessive calorie intake and s... Non-alcoholic fatty liver disease(NAFLD)is a common chronic disease characterized by excessive fat accumulation in hepatocytes in the absence of alcohol consumption.Modern trends towards excessive calorie intake and sedentary life styles have increased the prevalence of NAFLD accompanied by obesity and type 2 diabetes.However,the molecular mechanisms underlying the initiation and progression of NAFLD are not clear.Zinc finger proteins(ZFPs)are a superfamily of metalloproteins that contain zinc finger motifs.ZFPs play diverse physiological roles in tissue homeostasis and also contribute to many pathological conditions,including metabolic,cardiovascular,and neurodegenerative diseases and various types of cancer.In this review,we highlight our current knowledge of several ZFPs that play critical roles in the progression of NAFLD,describe their mechanistic functional networks,and discuss the potential for ZFPs as therapeutic targets for NAFLD. 展开更多
关键词 Non-alcoholic fatty liver disease(NAFLD) Hepatic steatosis zinc finger proteins(zfps) Glioma-associated oncogene(GLI) Krüppel-like factor(KLF) Yin Yang 1(YY1) Mechanistic network
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肌内脂肪细胞生长及调控因子的研究进展 被引量:4
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作者 李博 李伟 王恬 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2013年第22期363-366,共4页
肌内脂肪沉积是决定肉质风味、嫩度等的关键因素。一般认为,肌内脂肪细胞与肌细胞在发育中相互作用,并且肌内脂肪的生长与肌肉的生长速率和肌纤维类型密切相关。近年来,Wnt蛋白、HSPB1和Zfp423被认为是影响肌内脂肪沉积、肌内脂肪细胞... 肌内脂肪沉积是决定肉质风味、嫩度等的关键因素。一般认为,肌内脂肪细胞与肌细胞在发育中相互作用,并且肌内脂肪的生长与肌肉的生长速率和肌纤维类型密切相关。近年来,Wnt蛋白、HSPB1和Zfp423被认为是影响肌内脂肪沉积、肌内脂肪细胞和肌细胞相互作用的关键因子,对肌内脂肪细胞的生长及改善肉品质有重要作用。本文主要探讨了肌内脂肪与肉品质的关系,对肌内脂肪细胞与肌细胞相互作用进行阐述,并对影响肌内脂肪沉积的关键因子作一简要综述,为改善肉品提供理论依据。 展开更多
关键词 肌内脂肪细胞 肌细胞 Wnt蛋白 热休克蛋白β1 锌指蛋白423
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新疆无苞芥锌指蛋白基因的克隆及表达分析 被引量:5
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作者 郭丹丽 王崎崎 +2 位作者 吴晓庆 费春艳 黄先忠 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期243-250,共8页
利用同源克隆法从新疆无苞芥中克隆获得1个锌指蛋白基因(OpZFP)。序列分析表明,OpZFP基因的开放阅读框为684bp,推测编码含227个氨基酸的蛋白质。生物信息学分析显示,OpZFP蛋白含有1个典型的C2H2型锌指结构,在C端含有一个可能具有转录抑... 利用同源克隆法从新疆无苞芥中克隆获得1个锌指蛋白基因(OpZFP)。序列分析表明,OpZFP基因的开放阅读框为684bp,推测编码含227个氨基酸的蛋白质。生物信息学分析显示,OpZFP蛋白含有1个典型的C2H2型锌指结构,在C端含有一个可能具有转录抑制功能的EAR结构域。系统进化树分析表明OpZFP编码产物与拟南芥AtZFP1、琴叶拟南芥AlZFP1的进化关系较近。分离了OpZFP基因2 095bp的启动子序列,发现该启动子与拟南芥AtZFP1基因的启动子序列只有84.4%的相似性,启动子分析表明二者存在多处不同的顺式作用元件。半定量RT-PCR分析表明,OpZFP在根、茎、叶、花和果荚中均有表达,在根中的表达量最高。OpZFP基因受高盐、干旱和低温等胁迫的诱导表达,表明该蛋白涉及多种胁迫相关的信号传导途径。 展开更多
关键词 无苞芥 锌指蛋白 zfp基因 逆境
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