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日本结缕草ZjERF2基因的克隆、转录激活活性、亚细胞定位和表达分析
被引量:
1
1
作者
张蕊
姜红岩
+4 位作者
滕珂
檀鹏辉
汪呈
刘凌云
常智慧
《草业科学》
CAS
CSCD
2019年第5期1255-1265,共11页
采用RACE的方法,克隆了日本结缕草(Zoysia japonica)ZjERF2基因(GenBank登录号为MH479420)。其开放阅读框为825 bp,编码274个氨基酸,含有一个高度保守的AP2结构域,具有典型的ERF转录因子特征。遗传进化分析表明其与黍(Panicum hallii)ER...
采用RACE的方法,克隆了日本结缕草(Zoysia japonica)ZjERF2基因(GenBank登录号为MH479420)。其开放阅读框为825 bp,编码274个氨基酸,含有一个高度保守的AP2结构域,具有典型的ERF转录因子特征。遗传进化分析表明其与黍(Panicum hallii)ERF亲缘关系最近。利用染色体步移的方法克隆ATG上游1 549 bp的启动子序列,PLACE预测其含有多个响应激素和胁迫处理的作用元件。构建了pGBKT7-ZjERF2载体,转化Y2HGold酵母感受态细胞,结果表明其具有较强的转录激活活性。为探析其亚细胞定位情况,成功构建35S??ZjERF2?YFP载体,本生烟草(Nicotiana tabacum)瞬时表达结果证明ZjERF2定位于细胞核。利用实时荧光定量的方法分析了ZjERF2的表达特征,结果表明ZjERF2基因在日本结缕草不同部位及不同发育时期表达量均有差异,在成熟叶片表达量最高。此外ZjERF2表达受ET、MeJA的诱导,但受ABA、PEG和NaCl的抑制。本研究表明ZjERF2是一个参与多种信号转导途径的转录因子。
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关键词
日本结缕草
zjerf
2转录因子
转录激活活性
亚细胞定位
表达分析
下载PDF
职称材料
日本结缕草ZjERF2转录激活验证及互作蛋白的初步筛选
2
作者
张蕊
刘凌云
+3 位作者
范希峰
滕珂
常智慧
武菊英
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期3937-3943,共7页
为了研究ZjERF2转录因子在日本结缕草(Zoysia japonica)生长发育和环境胁迫中的调控通路,筛选与ZjERF2转录调控过程中互作的蛋白。本研究采用酵母双杂的方法,通过构建“诱饵”载体pGBKT7-ZjERF2,并转化酵母感受态细胞,表明“诱饵”载体...
为了研究ZjERF2转录因子在日本结缕草(Zoysia japonica)生长发育和环境胁迫中的调控通路,筛选与ZjERF2转录调控过程中互作的蛋白。本研究采用酵母双杂的方法,通过构建“诱饵”载体pGBKT7-ZjERF2,并转化酵母感受态细胞,表明“诱饵”载体在酵母细胞中无毒且不能自激活。将pGBKT7-ZjERF2和日本结缕草全长cDNA文库共转化酵母感受态细胞,经SD/-Leu-Trp-His-Ade/X-α-Gal培养基筛选获得29个菌落,通过PCR扩增获得23个条带,进一步筛选到18个与ZjERF2互作的候选蛋白。对候选蛋白进行生物信息学分析,初步筛选到5个参与植物的生长发育、抗病原菌及环境胁迫调节的互作蛋白。本研究为探索ZjERF2在植物生长发育和环境胁迫应答的调控机制提供帮助。
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关键词
日本结缕草
zjerf
2
转录因子
转录激活
酵母双杂
互作蛋白
原文传递
枣转录因子ERF 3′端序列克隆及生物信息学分析
3
作者
陈莹莹
苑赞
+1 位作者
赵锦
刘孟军
《北方园艺》
CAS
北大核心
2014年第22期93-97,共5页
以枣为试材,根据GenBank中登录的苹果、拟南芥等植物EFR保守序列设计引物,采用同源克隆法克隆出该基因3′端序列并对其编码的蛋白进行了生物信息学分析。结果表明:该试验克隆获得1条长度为959bp的条带;经过序列分析,该序列包含典型的AP2...
以枣为试材,根据GenBank中登录的苹果、拟南芥等植物EFR保守序列设计引物,采用同源克隆法克隆出该基因3′端序列并对其编码的蛋白进行了生物信息学分析。结果表明:该试验克隆获得1条长度为959bp的条带;经过序列分析,该序列包含典型的AP2/EREBP保守结构域,与桑树、欧洲山毛榉和欧洲栗ERF基因序列相似度分别为79%、78%、77%;系统进化树分析显示,枣的ZjERF与可可树、陆地棉和海岛棉的AP2/EREBP亲缘关系较近,属于ERF家族的B2亚群;此外,还用Swiss Model程序(http://au.expasy.org/tools/)预测了ZjERF基因编码蛋白的三维结构。
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关键词
枣
zjerf
3′端序列克隆
生物信息学分析
原文传递
题名
日本结缕草ZjERF2基因的克隆、转录激活活性、亚细胞定位和表达分析
被引量:
1
1
作者
张蕊
姜红岩
滕珂
檀鹏辉
汪呈
刘凌云
常智慧
机构
北京林业大学草坪研究所
北京草业与环境研究发展中心
出处
《草业科学》
CAS
CSCD
2019年第5期1255-1265,共11页
基金
北京市科技计划项目(171100007217001)
北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20170110)
文摘
采用RACE的方法,克隆了日本结缕草(Zoysia japonica)ZjERF2基因(GenBank登录号为MH479420)。其开放阅读框为825 bp,编码274个氨基酸,含有一个高度保守的AP2结构域,具有典型的ERF转录因子特征。遗传进化分析表明其与黍(Panicum hallii)ERF亲缘关系最近。利用染色体步移的方法克隆ATG上游1 549 bp的启动子序列,PLACE预测其含有多个响应激素和胁迫处理的作用元件。构建了pGBKT7-ZjERF2载体,转化Y2HGold酵母感受态细胞,结果表明其具有较强的转录激活活性。为探析其亚细胞定位情况,成功构建35S??ZjERF2?YFP载体,本生烟草(Nicotiana tabacum)瞬时表达结果证明ZjERF2定位于细胞核。利用实时荧光定量的方法分析了ZjERF2的表达特征,结果表明ZjERF2基因在日本结缕草不同部位及不同发育时期表达量均有差异,在成熟叶片表达量最高。此外ZjERF2表达受ET、MeJA的诱导,但受ABA、PEG和NaCl的抑制。本研究表明ZjERF2是一个参与多种信号转导途径的转录因子。
关键词
日本结缕草
zjerf
2转录因子
转录激活活性
亚细胞定位
表达分析
Keywords
Zoysia japonica
zjerf
2 transcription factor
transcriptional activation activity
subcellular localization
expression character
分类号
S543.9 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
日本结缕草ZjERF2转录激活验证及互作蛋白的初步筛选
2
作者
张蕊
刘凌云
范希峰
滕珂
常智慧
武菊英
机构
北京林业大学
北京草业与环境研究发展中心
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期3937-3943,共7页
基金
北京市科技计划项目(171100007217001)
北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20170110)共同资助。
文摘
为了研究ZjERF2转录因子在日本结缕草(Zoysia japonica)生长发育和环境胁迫中的调控通路,筛选与ZjERF2转录调控过程中互作的蛋白。本研究采用酵母双杂的方法,通过构建“诱饵”载体pGBKT7-ZjERF2,并转化酵母感受态细胞,表明“诱饵”载体在酵母细胞中无毒且不能自激活。将pGBKT7-ZjERF2和日本结缕草全长cDNA文库共转化酵母感受态细胞,经SD/-Leu-Trp-His-Ade/X-α-Gal培养基筛选获得29个菌落,通过PCR扩增获得23个条带,进一步筛选到18个与ZjERF2互作的候选蛋白。对候选蛋白进行生物信息学分析,初步筛选到5个参与植物的生长发育、抗病原菌及环境胁迫调节的互作蛋白。本研究为探索ZjERF2在植物生长发育和环境胁迫应答的调控机制提供帮助。
关键词
日本结缕草
zjerf
2
转录因子
转录激活
酵母双杂
互作蛋白
Keywords
Zoysia japonica
zjerf
2 transcription factor
Transcriptional activation
Yeast two-hybrid
Interaction protein
分类号
S688.4 [农业科学—观赏园艺]
原文传递
题名
枣转录因子ERF 3′端序列克隆及生物信息学分析
3
作者
陈莹莹
苑赞
赵锦
刘孟军
机构
河北农业大学中国枣研究中心
河北农业大学生命科学学院
出处
《北方园艺》
CAS
北大核心
2014年第22期93-97,共5页
基金
国家科技支撑计划资助项目(2013BAD14B030106)
河北省科技支撑计划资助项目(11230606D-6)
文摘
以枣为试材,根据GenBank中登录的苹果、拟南芥等植物EFR保守序列设计引物,采用同源克隆法克隆出该基因3′端序列并对其编码的蛋白进行了生物信息学分析。结果表明:该试验克隆获得1条长度为959bp的条带;经过序列分析,该序列包含典型的AP2/EREBP保守结构域,与桑树、欧洲山毛榉和欧洲栗ERF基因序列相似度分别为79%、78%、77%;系统进化树分析显示,枣的ZjERF与可可树、陆地棉和海岛棉的AP2/EREBP亲缘关系较近,属于ERF家族的B2亚群;此外,还用Swiss Model程序(http://au.expasy.org/tools/)预测了ZjERF基因编码蛋白的三维结构。
关键词
枣
zjerf
3′端序列克隆
生物信息学分析
Keywords
Ziziphus jujuba
zjerf
the 3′-end of
zjerf
cloning
bioinformatic analysis
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
S665 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
日本结缕草ZjERF2基因的克隆、转录激活活性、亚细胞定位和表达分析
张蕊
姜红岩
滕珂
檀鹏辉
汪呈
刘凌云
常智慧
《草业科学》
CAS
CSCD
2019
1
下载PDF
职称材料
2
日本结缕草ZjERF2转录激活验证及互作蛋白的初步筛选
张蕊
刘凌云
范希峰
滕珂
常智慧
武菊英
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
原文传递
3
枣转录因子ERF 3′端序列克隆及生物信息学分析
陈莹莹
苑赞
赵锦
刘孟军
《北方园艺》
CAS
北大核心
2014
0
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
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