为了解我国鸡群中禽戊型肝炎病毒(avain hepatitis E virus,aHEV)的分子变异情况,对2018年从山东、河南、河北、辽宁、吉林、黑龙江、陕西、山西、江苏等地疑似aHEV感染鸡群中采集的679份肝脏、脾脏病料样品进行RT-PCR检测,从中选取PCR...为了解我国鸡群中禽戊型肝炎病毒(avain hepatitis E virus,aHEV)的分子变异情况,对2018年从山东、河南、河北、辽宁、吉林、黑龙江、陕西、山西、江苏等地疑似aHEV感染鸡群中采集的679份肝脏、脾脏病料样品进行RT-PCR检测,从中选取PCR阳性产物,对其ORF1基因进行序列测定与遗传进化分析。结果显示:从病料中检出阳性样品37份,阳性检出率为5.45%;选取的15个试验毒株之间的ORF1基因同源性为90.1%~100%,与目前报道的4种基因型同源性均小于90%,其中与基因1型的澳大利亚株和韩国株同源性为85.5%~89.0%,与基因2型的美国原型株和美国无毒株同源性为85.5%~88.2%,与基因3型的欧洲株和中国株同源性为86.3%~89.7%,与基因4型的匈牙利株和中国台湾株同源性为86.4%~88.5%。ORF1基因进化树分析发现,所分离的aHEV均属于戊型肝炎B种,不在目前所划分的基因型分支上,形成独立的基因分支,不属于已报道的4个基因型。结果表明,目前在我国流行的aHEV是一种新基因型病毒,这为我国aHEV分子流行病学分析提供了补充和依据。展开更多
文摘为了解我国鸡群中禽戊型肝炎病毒(avain hepatitis E virus,aHEV)的分子变异情况,对2018年从山东、河南、河北、辽宁、吉林、黑龙江、陕西、山西、江苏等地疑似aHEV感染鸡群中采集的679份肝脏、脾脏病料样品进行RT-PCR检测,从中选取PCR阳性产物,对其ORF1基因进行序列测定与遗传进化分析。结果显示:从病料中检出阳性样品37份,阳性检出率为5.45%;选取的15个试验毒株之间的ORF1基因同源性为90.1%~100%,与目前报道的4种基因型同源性均小于90%,其中与基因1型的澳大利亚株和韩国株同源性为85.5%~89.0%,与基因2型的美国原型株和美国无毒株同源性为85.5%~88.2%,与基因3型的欧洲株和中国株同源性为86.3%~89.7%,与基因4型的匈牙利株和中国台湾株同源性为86.4%~88.5%。ORF1基因进化树分析发现,所分离的aHEV均属于戊型肝炎B种,不在目前所划分的基因型分支上,形成独立的基因分支,不属于已报道的4个基因型。结果表明,目前在我国流行的aHEV是一种新基因型病毒,这为我国aHEV分子流行病学分析提供了补充和依据。
