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基因组时代的放线菌系统学及其研究进展
被引量:
15
1
作者
刘志恒
王剑
张立新
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期141-153,共13页
由于放线菌在生物技术、医药卫生和环境治理等领域中的实际重要性,已经成为人们研究得最为深入的微生物类群之一。现代放线菌分类学是建立在对16S rRNA基因保守分子序列的系统发育学分析基础上、综合利用多种微生物信息的多相分类学(pol...
由于放线菌在生物技术、医药卫生和环境治理等领域中的实际重要性,已经成为人们研究得最为深入的微生物类群之一。现代放线菌分类学是建立在对16S rRNA基因保守分子序列的系统发育学分析基础上、综合利用多种微生物信息的多相分类学(polyphasic taxonomy)。随着大规模基因测序技术的飞速发展,已经完成了超过100株放线菌的全基因组序列。近年来发展起来的"基因组系统发育学"有助让人们更加系统地理解放线菌类群的发生、演化,以及不同生境类群之间的相互关系。随着越来越多的以系统发育学为指导的基因组测序研究项目,例如"细菌和古菌基因组百科全书(Genomic Encyclopedia of Bacteria andArchaea,GEBA)计划"的出现,标志着放线菌系统学进入了基因组学研究时代。本文对基因组时代的放线菌系统学方法,以及国内外的相关研究成果进行综述。
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关键词
放线细菌
放线菌分类学
基因组系统发育学
GEBA计划
原文传递
题名
基因组时代的放线菌系统学及其研究进展
被引量:
15
1
作者
刘志恒
王剑
张立新
机构
中国科学院微生物研究所
中国科学院南海海洋研究所
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期141-153,共13页
基金
国家自然科学基金青年基金(31000004)~~
文摘
由于放线菌在生物技术、医药卫生和环境治理等领域中的实际重要性,已经成为人们研究得最为深入的微生物类群之一。现代放线菌分类学是建立在对16S rRNA基因保守分子序列的系统发育学分析基础上、综合利用多种微生物信息的多相分类学(polyphasic taxonomy)。随着大规模基因测序技术的飞速发展,已经完成了超过100株放线菌的全基因组序列。近年来发展起来的"基因组系统发育学"有助让人们更加系统地理解放线菌类群的发生、演化,以及不同生境类群之间的相互关系。随着越来越多的以系统发育学为指导的基因组测序研究项目,例如"细菌和古菌基因组百科全书(Genomic Encyclopedia of Bacteria andArchaea,GEBA)计划"的出现,标志着放线菌系统学进入了基因组学研究时代。本文对基因组时代的放线菌系统学方法,以及国内外的相关研究成果进行综述。
关键词
放线细菌
放线菌分类学
基因组系统发育学
GEBA计划
Keywords
actionbacteria
actinobacterial taxonomy
phylogenomics
GEBA(Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea) project
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基因组时代的放线菌系统学及其研究进展
刘志恒
王剑
张立新
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
15
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