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向日葵HaFATA基因的生物信息学和表达分析
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作者 周菲 《安徽农业科学》 CAS 2024年第7期96-98,共3页
FATA编码脂酰-酰基载体蛋白硫酯酶A,将质体中以脂酰-ACP形式存在的脂肪酸水解成游离的脂酰-CoA和酰基载体蛋白。为了解向日葵HaFATA基因编码蛋白的结构、功能及基因表达特性,对HaFATA编码蛋白进行生物信息学和基因表达分析。预测HaFATA... FATA编码脂酰-酰基载体蛋白硫酯酶A,将质体中以脂酰-ACP形式存在的脂肪酸水解成游离的脂酰-CoA和酰基载体蛋白。为了解向日葵HaFATA基因编码蛋白的结构、功能及基因表达特性,对HaFATA编码蛋白进行生物信息学和基因表达分析。预测HaFATA为碱性且为亲水性蛋白,二级结构主要是无规则卷曲,预测亚细胞定位于叶绿体。系统进化分析表明,HaFATA与同属菊科的莴苣(Lactuca sativa L.)和水飞蓟(Silybum marianum L.)FATA进化关系近,序列相似性分别为90%、87%。HaFATA表达分析结果显示,HaFATA在向日葵种子中表达最高,其次为在管状花和叶中,在茎、舌状花和根中不表达,在发育的种子中,HaFATA除在开花后12 d表达相对较低,在其他6个发育时期表达均较高,表明其对于种子发育和油脂积累可能具有重要作用。 展开更多
关键词 向日葵 脂酰-酰基载体蛋白硫酯酶 脂肪酸 生物信息学 表达分析
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谷氨酸棒状杆菌硫酯酶基因表达对脂肪酸合成的影响
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作者 王佳 刘瑾 +2 位作者 孙子羽 满都拉 陈忠军 《中国油脂》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期82-86,共5页
旨在为进一步构建脂肪酸高产菌株奠定基础,通过异源和同源表达,研究了谷氨酸棒状杆菌ATCC13032中硫酯酶的基因(NCgl2365和NCgl0090)对脂肪酸合成的影响。结果表明:硫酯酶的过表达对大肠杆菌和谷氨酸棒状杆菌中脂肪酸的种类和含量都产生... 旨在为进一步构建脂肪酸高产菌株奠定基础,通过异源和同源表达,研究了谷氨酸棒状杆菌ATCC13032中硫酯酶的基因(NCgl2365和NCgl0090)对脂肪酸合成的影响。结果表明:硫酯酶的过表达对大肠杆菌和谷氨酸棒状杆菌中脂肪酸的种类和含量都产生了影响;基因NCgl2365在大肠杆菌中过表达后脂肪酸产量增加了37.86%,且促进了饱和脂肪酸C16∶0、C18∶0和不饱和脂肪酸C17∶1和C20∶3的生成,在谷氨酸棒状杆菌中同源表达后脂肪酸产量提高了33.43%,C17∶0相对含量增加了51.82%,而C6∶0、C8∶0、C12∶0、C17∶1、C18∶0、C18∶1和C18∶3的相对含量显著减少;基因NCgl0090在大肠杆菌中过表达后脂肪酸产量增加了58.15%,促进了饱和脂肪酸C14∶0、C16∶0、C18∶0和不饱和脂肪酸C17∶1的生成,而在谷氨酸棒状杆菌中同源表达后脂肪酸产量提高了59.12%,其中C16∶0相对含量增加了40.18%,促进了C10∶0、C14∶0、C14∶1、C15∶0、C16∶1、C18∶2、C20∶1和C21∶0 8种新脂肪酸的合成。综上,基因NCgl2365和NCgl0090对宿主菌体中的脂肪酸代谢产生了重要的作用。 展开更多
关键词 硫酯酶 异源表达 同源表达 脂肪酸
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结肠癌组织中miR-183-5p和THEM4的表达水平及临床意义
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作者 王前进 董久兴 武振明 《中国现代普通外科进展》 CAS 2024年第1期42-46,共5页
目的:研究结肠癌组织中微小RNA-183-5p(miR-183-5p)和硫酯酶超家族成员4(THEM4)的表达水平及其临床意义。方法:收集河北中石油中心医院96例结肠癌患者为研究对象,在进行根治切除术过程中收集患者结肠癌组织及癌旁正常组织。检测结肠癌... 目的:研究结肠癌组织中微小RNA-183-5p(miR-183-5p)和硫酯酶超家族成员4(THEM4)的表达水平及其临床意义。方法:收集河北中石油中心医院96例结肠癌患者为研究对象,在进行根治切除术过程中收集患者结肠癌组织及癌旁正常组织。检测结肠癌组织及癌旁正常组织中miR-183-5p和THEM4 m RNA的相对表达水平。分析两者的相关性及其与预后的关系。Cox回归分析影响结肠癌患者预后的危险因素。结果:与癌旁正常组织相比,结肠癌组织中miR-183-5p表达水平升高(P<0.05),THEM4 m RNA表达水平降低(P<0.05)。结肠癌组织中miR-183-5p与THEM4 m RNA表达呈负相关(r=-0.529,P<0.05)。miR-183-5p高表达组生存率低于低表达组(P<0.05),THEM4高表达组生存率显著高于低表达组(P<0.05)。TNM分期(Ⅲ~Ⅳ)、miR-183-5p高表达、THEM4低表达是结肠癌患者不良预后的危险因素(P<0.05)。结论:结肠癌织中miR-183-5p表达水平升高,THEM4表达水平降低,两者均与患者临床病理特征及预后密切相关。 展开更多
关键词 结肠肿瘤 微小RNA-183-5p 硫酯酶超家族成员4 临床意义
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油棕乙酰基酰基载体蛋白硫酯酶EgFATA基因的克隆与功能分析 被引量:1
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作者 金柳 李萌晗 +1 位作者 郑育声 李东栋 《热带生物学报》 2023年第4期357-363,共7页
为了探索油棕(Elaeis guineensis Jacq.)EgFATA基因的生物学功能,解析EgFATA基因在油棕中与脂肪酸积累的对应关系,为进一步研究EgFATA作用机制奠定基础,从油棕果cDNA中克隆得到了EgFATA基因的全长序列,经生物信息学分析发现,EgFATA编码... 为了探索油棕(Elaeis guineensis Jacq.)EgFATA基因的生物学功能,解析EgFATA基因在油棕中与脂肪酸积累的对应关系,为进一步研究EgFATA作用机制奠定基础,从油棕果cDNA中克隆得到了EgFATA基因的全长序列,经生物信息学分析发现,EgFATA编码区由1155个碱基组成,可编码385个氨基酸,相对分子量为91.89 kDa,与海藻PdFATA亲缘关系最近。在此基础上,构建EgFATA的病毒沉默载体并侵染油棕胚状体,RT-qPCR结果表明,EgFATA的表达量被下调85%~90%。同时,对基因沉默胚状体进行脂肪酸气相色谱法分析,硬脂酸(C18:0)、油酸(C18:1)、亚油酸(C18:2)的含量均显著性降低。以上结果表明在油棕胚状体中,EgFATA对C18:0-ACP、C18:1-ACP、C18:2-ACP的水解具有催化作用,且对C18:1-ACP的催化活性最强。 展开更多
关键词 油棕 乙酰基酰基载体蛋白硫酯酶 油脂代谢调控
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响应面法优化玉米赤霉烯酮降解菌及其硫酯酶的发酵工艺
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作者 耿凯伟 李克克 +5 位作者 王俊峰 宫玉杰 田亚东 康相涛 王彦彬 孙向丽 《饲料工业》 北大核心 2023年第13期21-30,共10页
为提高解淀粉芽孢杆菌和硫酯酶的产量,试验以活菌量和芽孢量为指标,采用响应面分析方法对解淀粉芽孢杆菌H6的发酵工艺进行了优化,同时应用qPCR法对硫酯酶基因mRNA表达水平和蛋白质活性进行评估,并测定其对玉米赤霉烯酮的降解活性。结果... 为提高解淀粉芽孢杆菌和硫酯酶的产量,试验以活菌量和芽孢量为指标,采用响应面分析方法对解淀粉芽孢杆菌H6的发酵工艺进行了优化,同时应用qPCR法对硫酯酶基因mRNA表达水平和蛋白质活性进行评估,并测定其对玉米赤霉烯酮的降解活性。结果表明:通过单因素试验筛选出培养基组成的最优碳源、氮源、无机盐分别为可溶性淀粉、酵母浸粉、MgSO_(4)。可溶性淀粉浓度、酵母浸粉浓度、发酵时间是发酵的关键因素。培养基和发酵工艺的最优参数为可溶性淀粉32.16 g/L,酵母浸粉16.27 g/L,MgSO_(4) 10.00 g/L,发酵时间39.28 h,初始pH 5.0,接种量1%,摇床转速200 r/min,发酵温度37℃。在摇瓶中解淀粉芽孢杆菌H6活菌生物产量达到6.33×10^(9)CFU/mL,50 L发酵罐验证活菌产量达到1.09×10^(10)CFU/mL。通过响应面法优化了解淀粉芽孢杆菌H6的发酵工艺,与初始培养基相比,发酵水平显著提高(P<0.05),硫酯酶活性显著升高(P<0.05)。 展开更多
关键词 解淀粉芽孢杆菌H6 硫酯酶 发酵 响应面法优化 玉米赤霉烯酮
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Bacillomycin D合成酶系NRPS硫酯酶结构域位移对脂肽合成的影响
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作者 张平 陈美容 +5 位作者 马文杰 陆兆新 吕紫岩 吕凤霞 赵海珍 别小妹 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期169-178,共10页
[目的]本文旨在研究解淀粉芽胞杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)fmbJ菌株中Bacillomycin D合成酶系非核糖体肽合成酶(NRPS)硫酯酶TE结构域位移对脂肽合成的影响。[方法]通过温敏型质粒pKS2介导的同源重组将fmbJ菌株中Bacillomycin D合... [目的]本文旨在研究解淀粉芽胞杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)fmbJ菌株中Bacillomycin D合成酶系非核糖体肽合成酶(NRPS)硫酯酶TE结构域位移对脂肽合成的影响。[方法]通过温敏型质粒pKS2介导的同源重组将fmbJ菌株中Bacillomycin D合成酶系NRPS硫酯酶TE结构域分别前移至模块5和模块6末端,然后对fmbJ突变菌株的发酵产物进行高效液相色谱(HPLC)、液相质谱(LC-MS)以及黄曲霉菌抑菌试验分析,并且使用AlphaFold蛋白结构数据库预测NRPS合成酶系末端PCP-TE双结构域的三维结构,以及分析双结构与两者之间的相互作用关系。[结果]在突变菌株fmbJ-M5-TELong的发酵液中检测出线性脂五肽(C14-15β-NH2FA-Asn-Tyr-Asn-Pro-Glu)和环状脂五肽[C14-15β-NH2FA(Asn-Tyr-Asn-Pro-Glu)],在突变菌株fmbJ-M6-TELong的发酵液中检测出线性脂六肽(C14-17β-NH2FA-Asn-Tyr-Asn-Pro-Glu-Ser)和环状脂六肽[C12-14,16-17β-NH2FA(Asn-Tyr-Asn-Pro-Glu-Ser)]等新型脂肽。此外,NRPS硫酯酶TE结构域易位前移后,PCP-TE双结构域蛋白的构象和相对作用力发生变化,疏水相互作用界面缩小。[结论]fmbJ菌株中Bacillomycin D合成酶系NRPS硫酯酶TE结构域位移导致发酵产物提前环化和水解,合成了截短的新型线性脂五肽、环状脂五肽、线性脂六肽和环状脂六肽等脂肽,为新型脂肽的开发提供了思路。 展开更多
关键词 Bacilomycin D 硫酯酶 同源重组 液相质谱(LC-MS) 蛋白三维结构
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蛋白质棕榈酰化修饰与心血管疾病
7
作者 范思思 王丽雯 +2 位作者 李琴 李兰芳 姜志胜 《中国动脉硬化杂志》 CAS 2023年第8期645-653,共9页
蛋白质棕榈酰化修饰是一种广泛存在于生物体内的蛋白质翻译后脂质修饰。在大多数情况下,棕榈酸主要通过不稳定的硫酯键共价结合到蛋白质底物特定的半胱氨酸残基上,从而发生S-棕榈酰化修饰。由于硫酯键在一定的条件下会水解,引起蛋白质... 蛋白质棕榈酰化修饰是一种广泛存在于生物体内的蛋白质翻译后脂质修饰。在大多数情况下,棕榈酸主要通过不稳定的硫酯键共价结合到蛋白质底物特定的半胱氨酸残基上,从而发生S-棕榈酰化修饰。由于硫酯键在一定的条件下会水解,引起蛋白质底物发生去棕榈酰化修饰,因此S-棕榈酰化修饰通常是可逆的。S-棕榈酰化修饰也与许多心血管疾病的发生和发展密切相关。本文综述了蛋白质棕榈酰化修饰和去棕榈酰化修饰过程,以及蛋白质棕榈酰化修饰与心律失常、动脉粥样硬化、肺动脉高压、心力衰竭和血栓性疾病等心血管疾病之间的关系,为心血管疾病的治疗提供新的方向。 展开更多
关键词 蛋白质棕榈酰化修饰 蛋白质酰基转移酶 酰基蛋白硫酯酶 棕榈酰基蛋白硫酯酶 心血管疾病
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Investigation of GhFAT Genes Related to Seed Oil Content and Fatty Acid Composition in Gossypium hirsutum L.
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作者 Ziyang Feng Xinqi Cheng +6 位作者 Tianwen Wang Yongchao Han Haihong Chen Xinyu Zhang Jie Sun Wei Zhang Feng Liu 《Phyton-International Journal of Experimental Botany》 SCIE 2023年第5期1633-1647,共15页
Fatty Acyl-ACP thioesterase(FAT)is a key enzyme controlling oil biosynthesis in plant seeds.FATs can be divided into two subfamilies,FATA and FATB according to their amino acid sequences and substrate specificity.The ... Fatty Acyl-ACP thioesterase(FAT)is a key enzyme controlling oil biosynthesis in plant seeds.FATs can be divided into two subfamilies,FATA and FATB according to their amino acid sequences and substrate specificity.The Upland cotton genome contains 20 GhFAT genes,amongst which 6 genes were of the GhFATA subfamily and 14 of the GhFATB subfamily.The 20 GhFAT genes are unevenly distributed on 14 chromosomes.The GhFATA genes have 5 or 7 exons and the GhFATB genes have 6 or 7 exons.All GhFAT proteins have the conserved Acyl-ACP_TE domain and PLN02370 super family,the typical characteristics of plant thioesterases.Analyses of the expression level of GhFATs and the compositions of fatty acid in 5-60 days-post-anthesis seeds showed that the ratio of saturated fatty acids to unsaturated fatty acids was consistent with the expression profile of GhFATB12,GhFATB3,and GhFATB10;the ratio of monounsaturated fatty acid to polyunsaturated fatty acids was consistent with the expression profile of GhFATA3.The oil contents of mature cottonseeds were positively correlated with the contents of palmitic acid and linolenic acid as well as seed vigor.These results provide essential information for further exploring the role(s)of the specific GhFATs in determining oil biosynthesis and cottonseed compositions. 展开更多
关键词 Gossypium hirsutum fatty Acyl-ACP thioesterase biological information expression profile seed vigor
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溶酶体酶PPT1介导的细胞稳态调控及疾病发生的研究进展
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作者 周欣怡 常栋 +4 位作者 徐黄莹 关瑞琪 严程浩 尹秋媛 孙建伟 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期874-886,共13页
棕榈酰蛋白质硫酯酶1(palmitoyl protein thioesterase 1,PPT1)是一种溶酶体酶,具有对蛋白质行使去棕榈酰化修饰的功能,在调控细胞器(如溶酶体、线粒体)功能、脂质代谢和Ca2+转运等方面具有重要作用。PPT1在神经系统疾病和癌症的发生发... 棕榈酰蛋白质硫酯酶1(palmitoyl protein thioesterase 1,PPT1)是一种溶酶体酶,具有对蛋白质行使去棕榈酰化修饰的功能,在调控细胞器(如溶酶体、线粒体)功能、脂质代谢和Ca2+转运等方面具有重要作用。PPT1在神经系统疾病和癌症的发生发展中发挥了重要的作用,然而其调控作用机制仍未被完全阐明。本文综述了目前PPT1在脂质代谢调控、物质转运调控、钙稳态调控过程中的作用及最新研究进展,总结并探讨了PPT1在神经系统疾病及肿瘤发生发展中作用及调控机制,为将来更深层次研究PPT1的功能及调控机制并开发相关疾病治疗的新药物提供借鉴和参考。 展开更多
关键词 棕榈酰蛋白质硫酯酶 1 去棕榈酰化 溶酶体 疾病发生
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m6Am修饰酶PCIF1调控靶基因ACOT8参与胃癌进展的机制研究
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作者 彭进 王伟宁 +2 位作者 谭智 叶冠男 周震 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期368-376,共9页
背景与目的:最新证据显示N6, 2’-O-二甲基腺苷(N6, 2’-O-dimethyladenosine,m6Am)修饰酶磷酸化C末端结构域相互作用因子1(phosphorylated c-terminal domain-interacting factor 1,PCIF1)可能是胃癌的重要生物标志物及治疗靶点。然而... 背景与目的:最新证据显示N6, 2’-O-二甲基腺苷(N6, 2’-O-dimethyladenosine,m6Am)修饰酶磷酸化C末端结构域相互作用因子1(phosphorylated c-terminal domain-interacting factor 1,PCIF1)可能是胃癌的重要生物标志物及治疗靶点。然而,这种新的PCIF1分子机制与胃癌进展的关系仍有待进一步探索。本研究分析PCIF1对胃癌细胞增殖、迁移和侵袭的调控作用及其调控靶基因酰基辅酶A硫代酯酶8(acyl-CoA thioesterase 8,ACOT8)在胃癌进展中的机制。方法:使用基因表达谱交互分析(gene expression profiling interactive analysis,GEPIA)分析胃癌患者的胃癌组织和非胃癌组织中的PCIF1表达,并分析了PCIF1表达与胃癌患者总生存率的相关性。收集2019年——2021年长沙市第一医院消化内科就诊患者的89对胃癌组织和匹配的癌旁组织。通过实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)和蛋白质印迹法(Western blot)分析PCIF1表达。在体外实验中,将SNU5细胞分为PCIF1敲低(shPCIF1)组和相应对照(sh-NC)组,将AGS细胞分为载体对照组(normal control,NC)组和PCIF1过表达(PCIF1)组。使用细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)、5-乙炔基-2’-脱氧尿苷(5-ethynyl-2’-deoxyuridine,EdU)和transwell法分析了PCIF1对胃癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响。此外,在PCIF1过表达的AGS细胞中敲低ACOT8并进行了拯救实验。采用皮下异种移植瘤模型来测定PCIF1在胃癌中的生物学效应。结果:PCIF1在胃癌组织和细胞系中呈高表达,并且PCIF1高表达胃癌患者的预后较差。与sh-NC组相比,sh-PCIF1组的细胞活力、EdU阳性细胞、迁移和侵袭细胞数均显著降低(P<0.05)。与NC组相比,PCIF1组的细胞活力、EdU阳性细胞、迁移和侵袭细胞数均显著增加(P<0.05)。在PCIF1过表达的AGS细胞中,敲低ACOT8的表达可降低细胞活力、EdU阳性细胞、迁移和侵袭细胞数。在体内实验中,与NC组相比,PCIF1过表达组裸鼠的移植瘤体积和重量均显著增加(P<0.05)。结论:PCIF1在胃癌细胞系和组织中上调。此外,PCIF1/ACOT8轴参与介导胃癌细胞的恶性行为产生。 展开更多
关键词 N6 2’-O-二甲基腺苷 磷酸化C末端结构域相互作用因子1 酰基辅酶A硫代酯酶8 胃癌 增殖 转移
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椰子Acyl-ACP硫酯酶相关基因的克隆及其表达分析 被引量:8
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作者 肖勇 杨耀东 +3 位作者 夏薇 范海阔 赵松林 马子龙 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期149-152,共4页
椰子是一种重要的热带油料作物,椰子果成熟后,椰子果肉脂肪酸的主要成分为C12的月桂酸。应用椰子转录组测序的结果,从中挖掘了11个脂酰-ACP硫脂酶基因,分别是2个FatA基因、4个FatB1基因、3个FatB2以及2个FatB3基因。应用荧光定量PCR检测... 椰子是一种重要的热带油料作物,椰子果成熟后,椰子果肉脂肪酸的主要成分为C12的月桂酸。应用椰子转录组测序的结果,从中挖掘了11个脂酰-ACP硫脂酶基因,分别是2个FatA基因、4个FatB1基因、3个FatB2以及2个FatB3基因。应用荧光定量PCR检测了Unigene9211、Unigene19303、Unigene45926、Unigene27250以及Unigene22278在果肉形成的3个阶段的表达变化,结果显示,这些基因在果肉形成的3个阶段持续表达。同时,对3个时期的果肉的脂肪酸成分也进行了测定,结果显示,在椰果发育7个月时,中低碳链的脂肪酸含量较低,但随着椰果的发育,中低碳链的脂肪酸逐步增加。 展开更多
关键词 椰子 Acyl-ACP硫酯酶 脂肪酸 椰果 椰肉
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高等植物的酰基-ACP硫酯酶研究进展 被引量:8
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作者 元冬娟 吴湃 江黎明 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期103-108,F0003,共7页
在高等植物质体游离脂肪酸的生物合成过程中,酰基-ACP硫酯酶能催化脂酰-ACP脱去ACP,产生游离的脂肪酸。因此,酰基-ACP硫酯酶对植物种子中贮存态的脂肪酸种类和含量,植株中从质体输出脂肪酸的链长和饱和性都起着关键的作用。本文就酰基-... 在高等植物质体游离脂肪酸的生物合成过程中,酰基-ACP硫酯酶能催化脂酰-ACP脱去ACP,产生游离的脂肪酸。因此,酰基-ACP硫酯酶对植物种子中贮存态的脂肪酸种类和含量,植株中从质体输出脂肪酸的链长和饱和性都起着关键的作用。本文就酰基-ACP硫酯酶结构、功能特征与分类的研究进展进行了简单的介绍,为油料作物的基因工程改造和研究提供指导,有利于植物油的工业化生产应用。 展开更多
关键词 酰基-ACP硫酯酶 结构 基因工程 系统进化
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代谢工程改造大肠杆菌对中碳脂肪酸生产的加强作用 被引量:4
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作者 刘强 郑艳宁 +3 位作者 姜兴林 刘东杰 秦文 咸漠 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第21期131-135,共5页
通过在大肠杆菌(Escherichia coli)中过量表达来自加州月桂(Umbellulana california)的硫酯酶基因BTE,极大地加强了大肠杆菌中碳脂肪酸(MCFAs)的生产。并对MCFAs在大肠杆菌胞内外的分布,以及是否对大肠杆菌细胞膜磷脂组成产生影响等进... 通过在大肠杆菌(Escherichia coli)中过量表达来自加州月桂(Umbellulana california)的硫酯酶基因BTE,极大地加强了大肠杆菌中碳脂肪酸(MCFAs)的生产。并对MCFAs在大肠杆菌胞内外的分布,以及是否对大肠杆菌细胞膜磷脂组成产生影响等进行了系统的分析。结果发现,产生的MCFAs绝大部分存在于大肠杆菌细胞内,且未对其细胞膜磷脂组成产生明显影响。为了继续提高MCFAs的产量,又进一步对大肠杆菌进行了代谢工程改造,通过结合表达乙酰-CoA羧化酶(ACCase),优化硫酯酶的表达水平等,最终获得了188.9mg/L的总MCFAs产量,并且产生的MCFAs的比例高达85%以上,实现了MCFAs的高特异性生产。 展开更多
关键词 中碳脂肪酸 大肠杆菌 硫酯酶 代谢工程
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非核糖体肽合成酶的末端硫酯酶与多肽环化 被引量:8
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作者 方剑 朱鹏 严小军 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期612-618,共7页
非核糖体肽合成酶(nonribosomal peptide synthetases,NRPSs)能以多载体巯基化模板机制合成各种结构复杂、种类繁多的次生代谢非核糖体环肽.根据环肽末端环化的方式,可分为两大类:大环内酯型和内酰胺型.负责非核糖体环肽最终环化的硫酯... 非核糖体肽合成酶(nonribosomal peptide synthetases,NRPSs)能以多载体巯基化模板机制合成各种结构复杂、种类繁多的次生代谢非核糖体环肽.根据环肽末端环化的方式,可分为两大类:大环内酯型和内酰胺型.负责非核糖体环肽最终环化的硫酯酶(thioesterase,TE)属于α/β水解酶超家族.该家族包括:脂酶、蛋白酶、酯酶等,其共有特征是含有保守的催化三元件(Ser-His-Asp),起到终止反应和释放产物的功能.TE具有区域定向性(regiospecific)、化学定向性(chemospecific)及立体定向性(stereospecific)的特点,在非核糖体肽(nonribosomal peptide,NRP)的合成反应中具有决定性作用,直接影响到最终环肽的生成.同时,TE由于其特有的环化和水解的双重活性,在体外的线性多肽环化中越来越受到众多学者的关注.综合国内外相关文献,本文着重从TE介导下的产物释放机制和影响因素两个方面综述非核糖体末端硫酯酶的研究进展及其应用. 展开更多
关键词 非核糖体肽合成酶 硫酯酶 环肽
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紫苏脂肪酸硫酯酶基因PfFatA生物信息学及其表达特性分析 被引量:3
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作者 李璐 梁倩 +2 位作者 安茜 周雅莉 王计平 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2017年第2期104-108,共5页
为研究脂肪酸硫酯酶A(FatA)在紫苏脂肪酸合成机制中发挥的作用,对紫苏FatA基因及其编码的蛋白质进行生物信息学分析。结果表明,PfFatA基因cDNA全长1 652 bp,开放阅读框1 119 bp,编码372个氨基酸;紫苏FatA基因编码的蛋白质为亲水性不稳... 为研究脂肪酸硫酯酶A(FatA)在紫苏脂肪酸合成机制中发挥的作用,对紫苏FatA基因及其编码的蛋白质进行生物信息学分析。结果表明,PfFatA基因cDNA全长1 652 bp,开放阅读框1 119 bp,编码372个氨基酸;紫苏FatA基因编码的蛋白质为亲水性不稳定蛋白,无跨膜区域;含Acyl-ACP_TE保守结构域,属于Hotdog fold超蛋白家族;多序列比对结果发现,序列C端含有保守的三联肽AKL和SKV结构;系统进化树分析表明,紫苏与丹参亲缘关系较近。通过Real-time PCR分析得知,PfFatA在紫苏根、茎、叶、花和种子不同发育时期均有表达,其中,在种子发育初期表达量最高。该研究结果可为进一步阐明PfFatA基因的功能及作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 紫苏 脂肪酸硫酯酶基因(FatA) 生物信息学 表达分析
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大豆酰基载体蛋白硫酯酶基因及其启动子表达方式的初步分析 被引量:2
16
作者 赵艳 杨晓杰 +1 位作者 范震宇 祁宏英 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期714-717,共4页
利用实时定量PCR方法,检测大豆酰基载体蛋白硫酯酶(acyl-ACP thioesterase)基因在大豆各组织中的表达方式,结果显示该基因在大豆根、茎、叶、花中的表达活性低,而种子中的表达活性较高。利用PCR方法,克隆大豆acyl-ACP thioesterase基因5... 利用实时定量PCR方法,检测大豆酰基载体蛋白硫酯酶(acyl-ACP thioesterase)基因在大豆各组织中的表达方式,结果显示该基因在大豆根、茎、叶、花中的表达活性低,而种子中的表达活性较高。利用PCR方法,克隆大豆acyl-ACP thioesterase基因5'端上游2 057 bp序列,命名为AP。在线启动子预测软件分析结果表明AP序列中含有多种典型的种子特异表达元件,如RY repeat、SEF1 motif、SEF3 motif、SEF4 motif、E-box、ACGT等顺式作用元件,推测大豆acyl-ACP thioesterase基因启动子具有种子特异表达活性。 展开更多
关键词 大豆 酰基载体蛋白硫酯酶基因 启动子 克隆
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可可FAT基因家族进化及表达模式分析 被引量:2
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作者 李付鹏 邓云梅 +3 位作者 伍宝朵 秦晓威 闫林 赖剑雄 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2020年第5期947-954,共8页
在植物中,酰基-ACP硫酯酶(fatty acyl-ACP thioesterase, FAT)是调控脂肪酸合成的关键酶。为解析可可FAT基因家族成员的特点与功能,本研究从可可基因组中筛选鉴定出FAT基因家族的6个成员,分别命名为TcFATA、TcFATB1、TcFATB2、TcFATB3、... 在植物中,酰基-ACP硫酯酶(fatty acyl-ACP thioesterase, FAT)是调控脂肪酸合成的关键酶。为解析可可FAT基因家族成员的特点与功能,本研究从可可基因组中筛选鉴定出FAT基因家族的6个成员,分别命名为TcFATA、TcFATB1、TcFATB2、TcFATB3、TcFATB4、TcFATB5。6个基因外显子数目为6~7个,编码区(CDS)长度介于1128~1263 bp,预测蛋白分子量介于42.72~46.47 kDa,等电点介于6.57~9.10。进化分析结果表明可可FAT基因家族分成FATA与FATB亚群,FATA亚群包含1个可可TcFATA成员,FATB亚群包含5个可可TcFATBs成员。不同可可种子发育时期表达分析结果表明:TcFATA和TcFATB1伴随果实发育成熟,表达量呈下降趋势,TcFATA和TcFATB1在不同种质中表达量与油酸(C18:1)和棕榈酸(C16:0)比例呈正相关,表明其与脂肪酸组分比例调控有紧密关联。 展开更多
关键词 可可 酰基载体蛋白硫酯酶(FAT) 系统进化 表达模式
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过表达THEM4对糖尿病小鼠肾脏细胞外基质沉积的影响 被引量:1
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作者 陈宁 郝军 +4 位作者 朱桂云 安晓颖 孙精晶 欧阳琴 杨永辉 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期112-117,共6页
目的观察过表达硫酯酶超家族成员4(thioesterase superfamily member 4,THEM4)对糖尿病(diabetes mellitus,DM)小鼠肾脏细胞外基质(extracellular matrix,ECM)沉积的影响。方法将♂CD1小鼠随机分为4组:分别为正常对照组(Control组)、糖... 目的观察过表达硫酯酶超家族成员4(thioesterase superfamily member 4,THEM4)对糖尿病(diabetes mellitus,DM)小鼠肾脏细胞外基质(extracellular matrix,ECM)沉积的影响。方法将♂CD1小鼠随机分为4组:分别为正常对照组(Control组)、糖尿病组(DM组)、糖尿病+THEM4质粒组(DM+THEM4)、糖尿病+空质粒组(DM+V)。后3组腹腔注射链脲佐菌素(streptozotocin,STZ)诱发糖尿病小鼠模型,质粒注射组小鼠在成模4周后,分别给予尾静脉快速注射p Yr-ads-4-THEM4质粒或p Yr-adshuttle-4质粒(1 mg·kg^(-1))。此后每隔7 d注射1次,共注射4次,之后处死小鼠并收集保存标本,Western blot检测THEM4、phospho-Akt(Ser 473)、TGF-β1、α-SMA的表达;免疫组化检测THEM4、phospho-Akt(Ser 473)、纤维黏连蛋白(fibronectin,FN)及Ⅲ型胶原(collagenⅢ,ColⅢ)蛋白表达和定位。结果DM小鼠肾脏THEM4 mRNA和蛋白均呈低表达,而phospho-Akt(Ser 473)、TGF-β1、α-SMA蛋白的表达明显增强,并出现ECM沉积。过表达的THEM4能够逆转DM小鼠肾脏phospho-Akt(Ser 473)蛋白活化,并下调α-SMA、TGF-β1的表达,减轻DM小鼠肾脏ECM的沉积,降低小鼠尿蛋白水平。结论过表达THEM4能够减轻DM小鼠肾脏ECM的沉积,可能是通过抑制phospho-Akt(Ser 473)蛋白的活化,下调α-SMA、TGF-β1表达而实现的。 展开更多
关键词 硫酯酶超家族成员4 PI3K/AKT 糖尿病小鼠 细胞外基质 转化生长因子β1 纤维黏连蛋白
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THEM4与高糖诱导的人胚肾上皮细胞胶原分泌的关系 被引量:1
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作者 陈宁 杨永辉 +3 位作者 安晓颖 朱桂云 康丽菲 郝军 《河北医科大学学报》 CAS 2017年第12期1434-1438,共5页
目的探讨硫酯酶超家族成员4(thioesterase superfamily member 4,THEM4)在高糖刺激的人胚肾上皮细胞(human embryo kidney epithelial cells,HKC)内的表达以及与胶原分泌的关系。方法体外培养HKC,分别给予高糖(30mmol/L)刺激0、6、12、2... 目的探讨硫酯酶超家族成员4(thioesterase superfamily member 4,THEM4)在高糖刺激的人胚肾上皮细胞(human embryo kidney epithelial cells,HKC)内的表达以及与胶原分泌的关系。方法体外培养HKC,分别给予高糖(30mmol/L)刺激0、6、12、24和48h后,收集细胞。提取RNA,Real-time PCR检测THEM4mRNA的表达;提取总蛋白,Western blot检测THEM4、phospho-Akt(Ser 473)、转化生长因子β1(transforming growth factorβ1,TGF-β1)、平滑肌肌动蛋白(α-smooth muscle actin,α-SMA)的表达;免疫细胞荧光检测THEM4蛋白表达和定位;ELISA方法检测细胞上清液中Ⅰ型胶原(collagenⅠ,ColⅠ)、Ⅲ型胶原(collagenⅢ,ColⅢ)分泌情况。结果(1)高糖培养HKC内THEM4表达明显降低,伴随phospho-Akt(Ser 473)、TGF-β1和α-SMA表达上调;THEM4与TGF-β1和α-SMA表达呈负相关(分别为:y=-5.100 9x+1.178,R^2=0.971 1;y=-3.803 3x+1.408,R^2=0.893 9)。(2)高糖可刺激HKC分泌ColⅠ、ColⅢ。结论高糖诱导的HKC胶原的分泌可能是通过抑制THEM4表达,上调phospho-Akt(Ser 473)、TGF-β1和α-SMA蛋白表达而实现的。 展开更多
关键词 肾小管 上皮细胞 胶原分泌 硫酸酶超家族成员4
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THEM4/Akt在糖尿病小鼠肾脏细胞外基质沉积中的作用 被引量:1
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作者 陈宁 郝军 +4 位作者 安晓颖 朱桂云 康丽菲 李晓霞 杨永辉 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期173-177,182,共6页
目的探讨硫酯酶超家族成员4(thioesterase superfamily member 4,THEM4)/Akt在糖尿病小鼠肾脏中的表达以及与细胞外基质沉积的关系。方法采用链脲佐菌素(streptozotocin,STZ)腹腔注射复制糖尿病小鼠模型,饲养8周后处死小鼠,应用Western ... 目的探讨硫酯酶超家族成员4(thioesterase superfamily member 4,THEM4)/Akt在糖尿病小鼠肾脏中的表达以及与细胞外基质沉积的关系。方法采用链脲佐菌素(streptozotocin,STZ)腹腔注射复制糖尿病小鼠模型,饲养8周后处死小鼠,应用Western blot、免疫组化及RT-PCR技术检测糖尿病小鼠肾脏中THEM4/Akt、phospho-Akt(Ser 473)、TGF-β1、α-SMA、ColⅢ、FN蛋白及THEM4 mRNA的表达。结果与对照组小鼠相比,糖尿病小鼠肾脏中THEM4蛋白低表达,相对于对照组下降了37.7%;同时伴随phospho-Akt(Ser 473)、TGF-β1、α-SMA、ColⅢ及FN蛋白表达升高,较对照组分别上调了3.66、1.29、2.33、1.99及2.82倍;糖尿病小鼠肾小管间质可见细胞外基质沉积。结论糖尿病小鼠肾小管间质细胞外基质沉积可能是由于THEM4的低表达进而激活Akt,上调TGF-β1和α-SMA蛋白的表达而实现的。 展开更多
关键词 糖尿病 肾小管上皮细胞 细胞外基质沉积 硫酯酶超家族成员4 P13K/AKT
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