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拟南芥ago1-27突变体的RNA-seq分析
被引量:
4
1
作者
马轩
李盛本
+2 位作者
莫蓓莘
曹晓风
陈雪梅
《深圳大学学报(理工版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期27-32,共6页
miRNA在植物生长发育和环境适应等方面起着极为重要的作用.本研究对拟南芥ago1-27突变体进行了RNA-seq,鉴定到几千个差异表达基因,并且miRNA靶基因倾向于在ago1-27中表达上调.ago1-27 RNA-seq结合降解组分析鉴定到新的miRNA靶基因,如miR...
miRNA在植物生长发育和环境适应等方面起着极为重要的作用.本研究对拟南芥ago1-27突变体进行了RNA-seq,鉴定到几千个差异表达基因,并且miRNA靶基因倾向于在ago1-27中表达上调.ago1-27 RNA-seq结合降解组分析鉴定到新的miRNA靶基因,如miR396靶向半胱氨酸蛋白酶基因和miR167靶向编码AT-hook DNA结合蛋白的基因等.
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关键词
植物生物化学
MIRNA
ago1-27基因
RNA
-
SEQ
降解组
靶
基因
拟南芥
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职称材料
题名
拟南芥ago1-27突变体的RNA-seq分析
被引量:
4
1
作者
马轩
李盛本
莫蓓莘
曹晓风
陈雪梅
机构
深圳大学生命与海洋科学学院
中国科学院遗传与发育生物学研究所
中国农业科学院深圳农业基因组研究所
美国加利福尼亚大学河滨分校植物科学系
出处
《深圳大学学报(理工版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期27-32,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(31571332
31210103901
91440105)~~
文摘
miRNA在植物生长发育和环境适应等方面起着极为重要的作用.本研究对拟南芥ago1-27突变体进行了RNA-seq,鉴定到几千个差异表达基因,并且miRNA靶基因倾向于在ago1-27中表达上调.ago1-27 RNA-seq结合降解组分析鉴定到新的miRNA靶基因,如miR396靶向半胱氨酸蛋白酶基因和miR167靶向编码AT-hook DNA结合蛋白的基因等.
关键词
植物生物化学
MIRNA
ago1-27基因
RNA
-
SEQ
降解组
靶
基因
拟南芥
Keywords
phytobiochemistry
microribonucleic acid (miRNA)
ago
l
-
27
RNA
-
seq
degradome
target genes
Arabidopsis
分类号
Q946.2 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
拟南芥ago1-27突变体的RNA-seq分析
马轩
李盛本
莫蓓莘
曹晓风
陈雪梅
《深圳大学学报(理工版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2017
4
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