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Expression of alpha-fetoprotein messenger RNA in BEL-7404 human hepatoma cells and effect of L-4-oxalysine on the expression 被引量:3
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作者 WANG XingWang and XU BinKeywords oxalysine liver neoplasms +5 位作者 fetoprotein tumor cell, cultured RNA, messenger gene expression in situ hybridization immunohistochemistry 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1998年第4期22-25,共4页
AIM To investigate alpha-fetoprotein (AFP) mRNA expression in BEL-7404 human hepatoma cells and the effect of L-4-oxalysine (OXL) on the expression.METHODS BEl-7404 human hepatoma cells were maintained in RPMI 1640 me... AIM To investigate alpha-fetoprotein (AFP) mRNA expression in BEL-7404 human hepatoma cells and the effect of L-4-oxalysine (OXL) on the expression.METHODS BEl-7404 human hepatoma cells were maintained in RPMI 1640 media. Human AFP cDNA probe was labelled with digoxigenin-11-dUTP by the random primer labelling method. The expression of AFP mRNA in Bel-7404 cells was determined by an in situ hybridization technique with digoxigenin-labelled human AFP cDNA probe. The positive intensities of AFP mRNA in cells were analyzed by microspectrophotometer and expressed as absorbance at 470nm. For the experiment with OXL, cells were incubated with various concentrations of the agent for 72h.RESULTS Essentially all the hepatoma cells contained AFP mRNA in the cytoplasm, although in various amounts. The specificity of the hybridization reaction was confirmed by control experiments in which the use of RNase-treated BEL-7404 cells, non-AFP-producing cells (HL-60 human leukemia cells) or a nonspecific cDNA probe resulted in negative hybridization. When the cells were treated with OXL (25, 50mg/L), the content of AFP mRNA in the cytoplasm was decreased with the inhibition percentages of 34.3% and 70.1%, respectively (P<0.05).CONCLUSION AFP mRNA was expressed in BEL-7404 human hepatoma cells and OXL suppressed AFP mRNA expression in the cells. 展开更多
关键词 fetoprotein HEPATOMA rna messenger
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基于RNA-seq不明原因复发性流产绒毛组织mRNA基因差异性表达研究
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作者 杨丽 杨静 +2 位作者 叶尔登切切克 韩锐 腊晓琳 《国际妇产科学杂志》 CAS 2024年第3期322-328,341,共8页
目的:构建不明原因复发性流产(unexplained recurrent spontaneous abortion,URSA)孕妇绒毛组织的mRNA差异性表达谱并进行功能分析,为阐明URSA的发生发展机制提供依据。方法:收集2022年3月于新疆医科大学第一附属医院妇科门诊收治的4例U... 目的:构建不明原因复发性流产(unexplained recurrent spontaneous abortion,URSA)孕妇绒毛组织的mRNA差异性表达谱并进行功能分析,为阐明URSA的发生发展机制提供依据。方法:收集2022年3月于新疆医科大学第一附属医院妇科门诊收治的4例URSA(试验组)和4例选择性终止妊娠孕妇(对照组)的绒毛组织样本。应用转录组测序技术(RNA-seq)筛选2组差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对其进行GO功能注释、KEGG通路分析及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,进一步研究差异表达mRNA的功能,并筛选出URSA的关键基因。结果:RNA-seq分析共筛选出3350个DEGs,其中上调基因2259个,下调基因1091个。通过PPI网络分析,筛选出与URSA有关的前10个关键基因:TYROBP、CD74、GH1、GH2、STAT5A、HLA-DRA、STAT5B、HLA-DRB1、CISH和HLA-A。通过GO和KEGG生物学功能分析,发现差异性表达的mRNA参与到多种白细胞分化相关免疫反应通路和同种异体免疫应答等生物学过程。结论:利用RNA-seq获得的URSA的mRNA差异性表达谱,筛选出可能与URSA有关的关键基因及生物学通路,为进一步研究URSA的发病机制和诊疗靶点提供了理论依据。 展开更多
关键词 流产 习惯性 绒毛组织 rna 信使 转录组测序 免疫调节
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参芪复方对糖尿病GK大鼠肝脏组织mRNA、lncRNA表达谱的影响
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作者 刘桠 张翕宇 +2 位作者 谢春光 徐刚 彭思涵 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2024年第1期46-51,I0008-I0012,共11页
目的应用全转录组测序与实时聚合酶链锁反应(Real-time polymerase chain reaction,RT-qPCR)技术,探索参芪复方调控糖尿病GK大鼠肝脏信使RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达谱的机制研究。方法采... 目的应用全转录组测序与实时聚合酶链锁反应(Real-time polymerase chain reaction,RT-qPCR)技术,探索参芪复方调控糖尿病GK大鼠肝脏信使RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达谱的机制研究。方法采用高脂高糖饲料建立2型糖尿病模型,将GK大鼠随机分为模型组、参芪复方组和西药组。另将10只Wistar大鼠设为空白组,予普通饲料喂养。参芪复方组大鼠予参芪复方浸膏灌胃,西药组予西格列汀混悬液灌胃,模型组及空白组灌服生理盐水。干预12周,每周检测空腹血糖(fasting blood glucose,FBG)。运用HE染色法观察大鼠肝脏组织病理形态,在空白组、模型组和参芪复方组中每组随机选取4只大鼠进行全转录组测序,构建mRNA、lncRNA差异表达谱,分析差异基因生物学功能,并进行RT-qPCR验证。结果与空白组相比,糖尿病GK大鼠FBG显著升高(P<0.05),模型组大鼠肝脏可见肝细胞排列紊乱,边界模糊,出现弥漫空泡状改变,呈中度脂肪变性,伴见炎性浸润、弥漫水肿;与模型组相比,参芪复方组大鼠FBG在12周时明显降低(P<0.05),肝脏组织排列较整齐,脂质沉积、细胞水肿及炎细胞浸润明显减轻。全转录组结果显示,与空白组相比,模型组大鼠mRNA、lncRNA表达谱存在显著差异,决定了糖尿病大鼠生理病理上的差异表现。参芪复方可广泛调控mRNA、lncRNA的差异表达,富集分析显示参芪复方通过调控多条内分泌系统及代谢过程相关信号通路改善糖尿病,包括胰岛素分泌、非酒精性脂肪性肝病、胆固醇代谢、鞘脂代谢、胰岛素抵抗等信号通路。RT-qPCR结果显示,基因Irf1、Trim30、Tmcc3、Insig1与转录组结果一致,转录组准确性较高。结论参芪复方发挥调节血糖及改善肝脏脂质沉积、水肿的作用,可能与广泛调控mRNA、lncRNA的差异表达有关。 展开更多
关键词 参芪复方 2型糖尿病 长链非编码rna(lncrna) 信使rna(mrna)
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弱精子症患者精子lncRNA与mRNA基因表达特征分析
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作者 石水波 罗龙华 +4 位作者 刘莲 黄学明 熊素萍 宋丹丹 李冬水 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 2024年第9期782-788,共7页
目的:通过DNBSEQ平台测序技术构建文库,并以此来确定人类正常与弱精子症精子中lncRNA和mRNA的表达差异,并通过生物信息学方法分析其在弱精子症中的生物学意义。方法:将9份正常精液样本及9份弱精子症精液样本分组后,分离精子,提取总RNA,... 目的:通过DNBSEQ平台测序技术构建文库,并以此来确定人类正常与弱精子症精子中lncRNA和mRNA的表达差异,并通过生物信息学方法分析其在弱精子症中的生物学意义。方法:将9份正常精液样本及9份弱精子症精液样本分组后,分离精子,提取总RNA,通过DNBSEQ测序平台检测得到RNA-seq在精子中的表达情况,通过GO富集分析和KEGG通路分析,进一步分析其相关功能情况。结果:使用DNBSEQ平台检测,每组平均产出10.64G数据,共检测到282185个RNA,包含有107009个lncRNA,其中15157个lncRNA具有表达差异,2190个lncRNA表达上调,12967个表达下调;共检测到19514个mRNA,其中13736个mRNA具有表达差异,4995个mRNA表达上调,8741个mRNA表达下调。差异基因主要富集在精子细胞膜、离子通道的功能以及精子发育、受精相关的通路上。结论:通过对弱精子症与正常精子的测序分析,鉴别出差异表达的lncRNA和mRNA,可通过胞膜离子通道对精子功能进行调控,进而导致弱精子症的发生,可为弱精子症的进一步研究提供分子基础。 展开更多
关键词 长链非编码rna 弱精子症 rna测序 差异表达分析
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Comparison of gene expression between normalcolon mucosa and colon carcinoma by means of messenger RNA differential display 被引量:4
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作者 Wang L Lu W +2 位作者 Chen YG Zhou XM Gu JR 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1999年第6期533-534,共2页
关键词 COLONIC MUCOSA COLONIC NEOPLASMS rna messenger gene expression
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Significance of vascular endothelial growth factor messenger RNA expression in gastric cancer 被引量:16
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作者 TAO Hou-Quan LIN Yan-Zhen WANG Rui-Nian 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1998年第1期15-18,共4页
IM To study VEGF mRNA expression in gastric carcinoma and to clarify the association of its expression with the clinicopathologic features of the disease.METHODS In situ hybridization (ISH) and histochemistry were u... IM To study VEGF mRNA expression in gastric carcinoma and to clarify the association of its expression with the clinicopathologic features of the disease.METHODS In situ hybridization (ISH) and histochemistry were used to examine and analyze the expression of VEGF mRNA and antigen, and microvessel count (MVC) in 28 cases of gastric carcinomatous tissue in combination with clinical materials.RESULTS Ninteen of 28 gastric carcinomas were positive for VEGF mRNA. VEGF mRNA was mainly expressed in malignant cells and not in normal epithelium of gastric mucosa. Its expression was further increased in tumor cells adjacent to tumor necrosis zones, where stromal cells expressed VEGF mRNA occasionally. There was a close correlation between MVC and VEGF mRNA positivity (P<0005). High VEGF mRNA levels were significantly associated with serosal invasion, lymph node metastasis and TNM staging (P<005, respectively).CONCLUSION VEGF mRNA expression is associated with tumor invasion and metastasis by stimulating angiogenesis in gastric carcinoma.expression; endothelial growth factor. 展开更多
关键词 stomach neoplasms rna messenger neoplasm metastasis GENE
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妊娠期高血压病患者血清DNMT1 mRNA和LncRNA UCA1水平表达与妊娠结局的关系
7
作者 侯书利 张金玲 +1 位作者 李燕 李晓晓 《现代检验医学杂志》 CAS 2024年第5期47-53,共7页
目的分析妊娠期高血压疾病(hypertensive disorder complicating pregnancy,HDCP)患者血清DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)信使RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码RNA(long non-codingRNA,LncRNA)尿路上皮癌胚抗原1(ur... 目的分析妊娠期高血压疾病(hypertensive disorder complicating pregnancy,HDCP)患者血清DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)信使RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码RNA(long non-codingRNA,LncRNA)尿路上皮癌胚抗原1(urothelial carcinoembryonic antigen 1,UCA1)水平与妊娠结局的关系。方法选取2021年3月~2023年8月在邯郸市妇幼保健院诊治的HDCP患者195例为病例组、健康妊娠孕妇195例为对照组。收集所有孕妇临床资料并检测分娩前1天生化指标;荧光定量PCR法检测血清DNMT1 mRNA,LncRNA UCA1水平;根据病情将病例组分为妊娠期高血压(pregnancy induced hypertension,PIH)组、轻度子痫前期(preeclampsia,PE)组、重度PE组;根据HDCP患者分娩时不良妊娠结局情况分为妊娠结局良好组和妊娠结局不良组;比较对照组和病例组临床资料和生化指标、血清DNMT1 mRNA,LncRNA UCA1水平;比较不同严重程度HDCP患者血清DNMT1mRNA和LncRNA UCA1水平;比较不同妊娠结局HDCP患者临床资料和生化指标、血清DNMT1 mRNA和LncRNAUCA1水平;分析HDCP患者血清DNMT1 mRNA与LncRNA UCA1的相关性,影响HDCP患者妊娠结局的因素,血清DNMT1 mRNA和LncRNA UCA1对HDCP患者发生不良妊娠结局的预测价值。结果与对照组比较,病例组收缩压、舒张压、白细胞计数水平明显升高,血清DNMT1 mRNA(0.72±0.18 vs 1.00±0.04),LncRNA UCA1(0.61±0.16vs 1.00±0.02)水平明显降低,差异具有统计学意义(t=40.651,32.595,7.837,21.205,33.775,均P<0.001);PIH组、轻度PE组、重度PE组血清DNMT1 mRNA(0.85±0.20,0.74±0.18,0.50±0.15),LncRNA UCA1(0.77±0.18,0.58±0.16,0.43±0.13)水平依次降低,差异具有统计学意义(F=52.687,64.030,均P<0.001);HDCP患者血清DNMT1 mRNA与LncRNA UCA1呈正相关(r=0.582,P<0.001);与妊娠结局良好组比较,妊娠结局不良组HDCP严重程度较高,收缩压、舒张压、白细胞计数水平明显升高,血清DNMT1 mRNA(0.80±0.20 vs 0.59±0.15),LncRNA UCA1(0.72±0.17 vs 0.43±0.14)水平明显降低,差异具有统计学意义(χ^(2)=18.386,t=2.615~12.290,均P<0.05);重度PE[OR(95%CI)=1.708(1.193~2.445)]、收缩压[OR(95%CI)=1.495(1.090~2.049)]、舒张压[OR(95%CI)=1.621(1.076~2.442)]是影响HDCP患者发生不良妊娠结局的危险因素,DNMT1 mRNA[OR(95%CI)=0.833(0.725~0.957)],LncRNA UCA1[OR(95%CI)=0.796(0.696~0.909)]是影响HDCP患者发生不良妊娠结局的保护因素(均P<0.05);DNMT1 mRNA和LncRNA UCA1二者联合预测HDCP患者发生不良妊娠结局的曲线下面积(area under curve,AUC)大于DNMT1 mRNA及LncRNA UCA1单独预测的AUC(0.926 vs 0.832,0.844),差异具有统计学意义(Z=2.932,2.345,均P<0.05)。结论HDCP患者血清DNMT1 mRNA和LncRNA UCA1水平均较低,与病情程度、妊娠结局相关,DNMT1 mRNA联合LncRNA UCA1检测对不良妊娠结局有较佳预测效能。 展开更多
关键词 妊娠期高血压疾病 DNA甲基转移酶1信使rna 长链非编码rna尿路上皮癌胚抗原1 妊娠结局
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基于生物信息学构建膀胱尿路上皮癌的ceRNA网络以及关键mRNA与免疫功能分析
8
作者 邵波 汪进 +5 位作者 万水 吴开秀 田申 杜沂宸 陈丹霞 马园园 《现代检验医学杂志》 CAS 2024年第1期29-35,66,共8页
目的构建膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BLCA)具有预后价值的内源竞争性核糖核酸(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,分析关键信使RNA(messenger RNA,mRNA)与免疫功能的关系。方法UCSC Xena数据库下载404例BLCA... 目的构建膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BLCA)具有预后价值的内源竞争性核糖核酸(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,分析关键信使RNA(messenger RNA,mRNA)与免疫功能的关系。方法UCSC Xena数据库下载404例BLCA患者和28例正常人的mRNA表达数据,通过差异分析筛选关键mRNA。ENCORI数据库中查找与关键mRNA结合的微小核糖核酸(micro RNA,miRNA)以及与miRNA结合的长链非编码核糖核酸(long non-coding RNA,LncRNA)。TCGA数据库下载miRNA和LncRNA的表达数据,对关键mRNA与所有miRNA以及mi RNA与所有LncRNA进行共表达分析,筛选出关键的miRNA和LncRNA。根据关键mRNA,miRNA和LncRNA在肿瘤患者和正常人之间表达量的差异进行生存分析,最后构建了ceRNA调控网络。借助TIMER 2.0数据库,分析关键mRNA与免疫细胞、免疫检查点(CD274,PDCD1,CTLA4)以及免疫细胞标记基因(immunomarker genes,IG)的相关性。结果筛选出关键mRNA*共22个,其中差异显著性最高的是脯氨酸3-羟化酶4(proline3-hydroxylase 4,P3H4)。在BLCA中,P3H4表达高,在高表达组患者的生存时间较短。以关键mRNA为中心环节,共筛选出33个miRNA和14个LncRNA。经过共表达分析和生存分析后,筛选出具有预后价值的关键miRNA和关键LncRNA分别为hsa-miR-151a-3p和MIR100HG。上述分析结果差异具有统计学意义(均Ρ<0.05)。综合以上结果,构建了包含1个mRNA,1个miRNA和1个LncRNA的ceRNA调控网络。免疫分析首次在BLCA肿瘤微环境中发现了与P3H4表达量呈显著正相关的双阳性T细胞。此外还有3种免疫细胞(肿瘤相关性中性粒细胞、肿瘤相关巨噬细胞、树突状细胞)、3个免疫检查点(CD274,PDCD1,CTLA4)以及15个IG与P3H4相关度显著,这些差异具有统计学意义(均Ρ<0.01)。结论该研究有助于揭示BLCA的进展机制,构建的ceRNA网络及免疫分析,可为BLCA患者的诊断、治疗、预测提供新的生物学靶点和方向。 展开更多
关键词 膀胱尿路上皮癌 信使核糖核酸 内源竞争性rna 免疫功能
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IL-17 mRNA和PGE2 mRNA在口腔扁平苔藓患者中的表达水平及临床意义
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作者 李阳 王珑 《检验医学与临床》 CAS 2024年第8期1103-1106,共4页
目的探讨白细胞介素17(IL-17)信使RNA(mRNA)和前列腺素E2(PGE2)mRNA在口腔扁平苔藓(OLP)患者中的表达水平及临床意义。方法选取2020年3月至2021年3月宁夏医科大学总医院口腔医院收治的35例OLP患者作为试验组,另选取同期在宁夏医科大学... 目的探讨白细胞介素17(IL-17)信使RNA(mRNA)和前列腺素E2(PGE2)mRNA在口腔扁平苔藓(OLP)患者中的表达水平及临床意义。方法选取2020年3月至2021年3月宁夏医科大学总医院口腔医院收治的35例OLP患者作为试验组,另选取同期在宁夏医科大学总医院口腔医院进行阻生牙拔除的20例患者作为对照组,根据组织是否糜烂,将试验组患者分为糜烂型OLP组和非糜烂型OLP组。检测并比较糜烂型OLP组和非糜烂型OLP组患者口腔黏膜病损组织及对照组患者口腔黏膜组织的IL-17 mRNA和PGE2 mRNA表达水平,并通过视觉模拟评分法(VAS)评估OLP患者的疼痛程度,比较不同疼痛程度的OLP患者IL-17 mRNA和PGE2 mRNA表达水平。采用Pearson相关分析OLP患者IL-17 mRNA与PGE2 mRNA表达水平的相关性。采用Spearman相关分析OLP患者IL-17 mRNA和PGE2 mRNA表达水平与疼痛程度的相关性。结果非糜烂型OLP组有19例患者,糜烂型OLP组有16例患者。糜烂型OLP组IL-17 mRNA和PGE2 mRNA表达水平均高于非糜烂型OLP组和对照组,且非糜烂型OLP组均高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。试验组中无疼痛患者有5例,轻度疼痛患者有6例,中度疼痛患者有16例,重度疼痛患者有8例。无疼痛OLP患者IL-17 mRNA和PGE2 mRNA表达水平均低于轻度、中度、重度疼痛OLP患者,差异均有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关分析结果显示,OLP患者IL-17 mRNA表达水平与PGE2 mRNA表达水平呈正相关(r=0.505,P=0.002)。Spearman相关分析结果显示,OLP患者IL-17 mRNA、PGE2 mRNA表达水平与疼痛程度均呈正相关(r=0.710、0.570,P<0.05)。结论IL-17 mRNA和PGE2 mRNA参与了OLP的发生、发展过程,并且其表达水平与OLP患者疼痛程度呈正相关。 展开更多
关键词 口腔扁平苔藓 白细胞介素17 前列腺素2 疼痛程度 信使rna
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Heme status affects human hepatic messenger RNA and microRNA expression
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作者 Herbert L Bonkovsky Weihong Hou +6 位作者 Nury Steuerwald Qing Tian Ting Li Judy Parsons Alicia Hamilton Sunil Hwang Laura Schrum 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2013年第10期1593-1601,共9页
AIM:To assess effects of heme on messenger RNA(mRNA) and microRNA(miRNA) profiles of liver cells derived from humans.METHODS:We exposed human hepatoma cell line Huh-7 cells to excess iron protoporphyrin(heme)(10 μmol... AIM:To assess effects of heme on messenger RNA(mRNA) and microRNA(miRNA) profiles of liver cells derived from humans.METHODS:We exposed human hepatoma cell line Huh-7 cells to excess iron protoporphyrin(heme)(10 μmol/L) or induced heme deficiency by addition of 4,6-dioxoheptanoic acid(500 μmol/L),a potent inhibitor of aminolevulinic acid dehydratase,for 6 h or 24 h.We harvested total RNA from the cells and performed both mRNA and miRNA array analyses,with use of Affymetrix chips,reagents,and instruments(human genome U133 plus 2.0 and miRNA 2.0 arrays).We assessed changes and their significance and interrelationships with Target Scan,Pathway Studios,and Ingenuity software.RESULTS:Changes in mRNA levels were most numerous and striking at 6 h after heme treatment but were similar and still numerous at 24 h.After 6 h of heme exposure,the increase in heme oxygenase 1 gene expression was 60-fold by mRNA and 88-fold by quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction.We found striking changes,especially up-regulation by heme of nuclear erythroid-2 related factor-mediated oxidative stress responses,protein ubiquitination,glucocorticoid signaling,P53 signaling,and changes in RNAs that regulate intermediary metabolism.Fewer mRNAs were down-regulated by heme,and the fold decreases were less exuberant than were the increases.Notable decreases after 24 h of heme exposure were patatin-like phospholipase domain-containing protein 3(-6.5-fold),neuronal PAS domain protein 2(-1.93-fold),and protoporphyrinogen oxidase(-1.7-fold).CONCLUSION:Heme excess exhibits several toxic effects on liver and kidney,which deserve study in humans and in animal models of the human porphyrias or other disorders. 展开更多
关键词 Delta-aminolevulinic acid SYNTHASE HEME Heat shock proteins HEPATOTOXICITY messenger rna Microrna
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结核病mRNA疫苗的研制策略与展望
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作者 杨静 肖丽娟 方谭玮 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期590-595,共6页
应对危害全球人类健康的重大传染性疾病——结核病流行的严峻挑战,迫切需要研制出有效的新型结核病疫苗。虽然目前开展了多种类型的新型结核病疫苗的研制,且一些疫苗已进入临床试验研究,但至今仍未能获得可以替代传统卡介苗(BCG)的更为... 应对危害全球人类健康的重大传染性疾病——结核病流行的严峻挑战,迫切需要研制出有效的新型结核病疫苗。虽然目前开展了多种类型的新型结核病疫苗的研制,且一些疫苗已进入临床试验研究,但至今仍未能获得可以替代传统卡介苗(BCG)的更为有效的新型疫苗。随着mRNA疫苗研制技术的突破,其研发周期短、高效、安全和生产成本低等优点,使其成为一个非常有前景的疫苗研发新方向。笔者主要就mRNA疫苗的技术原理、优势、制备技术,以及结核病mRNA疫苗的研制策略和现状等方面的研究进展进行综述,以期为结核病mRNA疫苗的研制提供参考。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 rna 细菌 rna 信使 疫苗 灭活 策略 实验性 综述
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信使RNA N6-甲基腺嘌呤甲基化修饰在血管性痴呆中的作用机制研究进展
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作者 吴俏兰 高祖 +2 位作者 王嘉昀 欧春雪 于华芸 《安徽医药》 CAS 2024年第8期1490-1496,共7页
信使RNA(mRNA)中的腺苷酸可发生甲基化转化为N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m^(6)A)进而调节mRNA的功能和代谢,这是一种高度动态可逆的表观转录组修饰方式。血管性痴呆(vascular dementia,VD)是由多种脑血管原因(如动脉粥样硬化、... 信使RNA(mRNA)中的腺苷酸可发生甲基化转化为N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m^(6)A)进而调节mRNA的功能和代谢,这是一种高度动态可逆的表观转录组修饰方式。血管性痴呆(vascular dementia,VD)是由多种脑血管原因(如动脉粥样硬化、淀粉样改变等)引起的一种神经退行性疾病,近年来,有研究发现m^(6)A与VD的发病和进展密切相关,m^(6)A甲基化在调节神经元氧化应激、炎症反应、脑血管内皮损伤、线粒体功能障碍和突触可塑性等方面具有较大影响。文章对近几年关于m^(6)A甲基化修饰在VD中的潜在作用机制进行综述,以期为后续研究和靶向治疗VD提供新的科学思路。 展开更多
关键词 rna 信使 N6-甲基腺嘌呤 甲基化修饰 血管性痴呆 机制
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基于GEO数据库联合分析高原病患者外周血差异表达miRNA及其上游转录因子和下游mRNA
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作者 伊力亚斯·艾萨 阿米娜·苏建和 付瑾 《广西医学》 CAS 2024年第2期284-291,共8页
目的基于GEO数据库联合分析高原病患者外周血差异表达miRNA及其上游转录因子和下游mRNA,从而基于分子层面探讨高原病潜在的发病机制。方法(1)在GEO数据库获取与高原病相关的miRNA表达谱芯片(GSE90500数据集)和mRNA表达谱芯片(GSE29977... 目的基于GEO数据库联合分析高原病患者外周血差异表达miRNA及其上游转录因子和下游mRNA,从而基于分子层面探讨高原病潜在的发病机制。方法(1)在GEO数据库获取与高原病相关的miRNA表达谱芯片(GSE90500数据集)和mRNA表达谱芯片(GSE29977数据集),再采用R语言3.6软件limma程序包筛选差异表达miRNA和差异表达mRNA。(2)利用FunRich软件预测差异表达miRNA的下游靶基因(mRNA)和上游转录因子,并对上游转录因子进行功能富集分析。使用R语言3.6软件、DAVID数据库对下游靶基因分别进行功能和通路富集分析。(3)对GSE29977数据集的差异表达mRNA与差异表达miRNA下游靶基因取交集,并根据miRNA及其靶基因的表达关系,筛选miRNA-mRNA调控轴。结果(1)共筛选出14个差异表达miRNA及其385个下游靶基因、123个上游转录因子。差异表达miRNA主要富集的转录因子包括EGR1、RREB1、MYF5和MEF2A。(2)上游转录因子涉及的生物学过程主要包括信号转导、核酸代谢的调节、脂肪酸代谢、糖代谢、细胞因子和趋化因子介导的信号通路、细胞周期等。下游靶基因富集的生物学过程主要包括转录调控、心肌细胞增殖、血管生成和染色质重塑等,富集的信号通路主要包括PD-L1表达和PD-1免疫检查点通路、细胞衰老、MTOR信号通路、MAPK信号通路及PI3K/AKT信号通路等。(3)共筛选得到443个差异表达mRNA,与差异表达miRNA的下游靶基因取交集后获得与高原病相关的5个核心mRNA,并构建出hsa-miR-155-5p-MYO1D调控轴。结论高原病中存在多个差异表达的miRNA,其上游转录因子EGR1、RREB1、MYF5、MEF2A可能是参与调控下游靶基因转录的核心因子;差异表达miRNA的上游转录因子和下游靶基因可能通过调控基因转录、细胞增殖与凋亡、炎症过程等生物学过程,共同参与高原病的发生、发展。hsa-miR-155-5p与下游靶基因MYO1D之间的调控关系可能在高原病的发生、发展中发挥重要的作用。 展开更多
关键词 高原病 微小rna 信使rna 转录因子 调控轴 分子机制
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mRNA疫苗制备技术在甲型流感病毒疫苗研究中的应用
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作者 张民秀 谢芝勋 +6 位作者 李孟 罗思思 谢丽基 谢志勤 李丹 阮志华 王粲 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第12期16-22,28,共8页
禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)、H1N1和H3N2亚型人流感病毒(Influenza virus,IV)均属于甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)。IAV含有多种亚型,毒株变异快,因此IAV疫苗株需要根据当年的优势毒株进行相应的调整,这给疫苗的研... 禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)、H1N1和H3N2亚型人流感病毒(Influenza virus,IV)均属于甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)。IAV含有多种亚型,毒株变异快,因此IAV疫苗株需要根据当年的优势毒株进行相应的调整,这给疫苗的研制和生产带来巨大挑战。信使核糖核酸(messenger RNA,mRNA)疫苗制备工艺简单、生产时间短且容易规模化生产,在疾病预防方面具有广阔的应用前景。笔者对mRNA疫苗的种类、优化策略和IAV mRNA疫苗的研究现状进行了综述,旨在为IAV mRNA疫苗的研发提供理论参考。 展开更多
关键词 甲型流感病毒(IAV) 禽流感病毒(AIV) 信使核糖核酸(mrna) 非复制型mrna(Nr mrna) 自我扩增型mrna(Sa mrna) 疫苗
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基于微小RNA-信使RNA互作在畸形精子症中的潜在发生机制研究
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作者 艾丹 钟丽珍 +2 位作者 蒋庄亮 陈厚仰 汪利群 《当代医学》 2023年第29期1-6,共6页
目的探讨微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)互作在畸形精子症中的潜在作用及机制。方法选取2018年1—12月于江西省妇幼保健院就诊的30例畸精症患者作为观察组,另选取同期于江西省妇幼保健院工作的30名正常男性作为对照组。构建mRNA和miRNA... 目的探讨微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)互作在畸形精子症中的潜在作用及机制。方法选取2018年1—12月于江西省妇幼保健院就诊的30例畸精症患者作为观察组,另选取同期于江西省妇幼保健院工作的30名正常男性作为对照组。构建mRNA和miRNA基因表达谱,并通过京都基因和基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)富集分析后进行反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)进一步验证。结果通过miRNA测序研究畸精症中miRNA的影响,共发现23个差异表达miRNA,同时满足log2FC|>0.585和P<0.05。23个差异表达miRNA的表达,有17个上调miRNA来自9个miRNA家族和6个下调的miRNA来自5个miRNA家族。使用KEGG和GO分析差异表达miRNA的2022个差异表达靶mRNA,共获得10条通路和9个注释簇。10条通路包括果糖和甘露糖代谢、磷酸戊糖通路、酵解/糖异生、碳代谢、氨基酸生物合成、核因子κB(NF-κB)信号通路、信号转导子和转录激活子(STATs)、丝裂原激活蛋白激酶(MAP)信号通路、Th1和Th2细胞分化、Toll样受体信号通路。注释簇1总结了3个GO术语;注释簇2总结了41个GO术语;注释簇3总结了3个GO术语;注释簇4总结了3个GO术语;注释簇5总结了3个GO术语;注释簇6总结了3个GO术语;注释集群7总结了38个GO术语;注释簇8总结了4个GO术语;注释簇9总结了10个GO术语。使用RT-PCR检测注释簇9中的3个miRNA和8个mRNA。miR-375-4-3p是上调的miRNA,而miR-31-12-5p和miR-9-6-5p是下调的miRNA。在4个GO术语中检测NF-κB、环氧合酶-2(COX-2)、前列腺素E合酶(PTGES)和基质金属蛋白酶9(MMP9)表达。在3个GO术语中检测白细胞介素(IL)-11、Spi-B转录因子(SPI1)、T细胞中表达的T-box转录因子(T-Bet)和IL-4/13A表达。RT-PCR的结果与miRNA和mRNA测序的结果一致,观察组miR-375-4-3p、NF-κB、COX-2、PTGES和IL-4/13A mRNA表达高于对照组,而miR-31-12-5p、miR-9-6-5p、MMP9、IL-11、SPI1和T-Bet mRNA表达低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论畸精症中有23个差异表达的miRNA和2022个目标mRNAs,可使用KEGG和GO富集分析获得5条通路和7个目标mRNA炎症免疫抑制损伤相关的GO术语,miRNAs可通过miRNA-mRNA网络分析介导炎症免疫抑制损伤相关机制参与畸精症进展,但具体机制需进一步研究。 展开更多
关键词 微小rna 信使rna 畸形精子症 炎症 免疫
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慢性镉暴露下食管鳞状细胞癌细胞的lncRNA-mRNA共表达网络分析
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作者 彭琳 曾明钦 +3 位作者 陈炯玉 张厦蓉 朱芮 黄裔腾 《癌变.畸变.突变》 CAS 2023年第4期266-272,278,共8页
目的:构建食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞在慢性低浓度镉暴露诱导下的长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA的共表达网络,探讨关键lncRNA和mRNA在镉促ESCC演进及放化疗抵抗中的潜在功能及分子机制。方法:EC109细胞持续暴露于5μmol/L氯化镉培养12周,... 目的:构建食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞在慢性低浓度镉暴露诱导下的长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA的共表达网络,探讨关键lncRNA和mRNA在镉促ESCC演进及放化疗抵抗中的潜在功能及分子机制。方法:EC109细胞持续暴露于5μmol/L氯化镉培养12周,构建慢性镉暴露ESCC细胞模型CCT-EC109。采用Illumina NovaSeq 6000系统对暴露株CCT-EC109和亲本株EC109细胞进行全转录组测序,运用生物信息学方法分析差异lncRNA和mRNA表达谱,利用基因本体(GO)和京都基因与基因组大百科全书(KEGG)对差异lncRNA的靶基因进行功能分析,根据Pearson相关系数利用Cytoscape软件构建lncRNA-mRNA共表达网络,并对筛选的lncRNA和mRNA进行实时荧光定量PCR(qPCR)验证。结果:EC109细胞与CCT-EC109细胞存在差异表达lncRNA(DE-lncRNA) 2 794个,差异mRNA(DE-mRNA) 4 267个;DE-lncRNA的靶基因与DE-mRNA取交集,获得1 546个DE-lncRNA调控的镉暴露相关mRNA;GO分析显示这些基因主要富集在代谢过程、膜与膜封闭腔部分及催化反应等功能;KEGG分析提示Hippo信号通路是最显著富集项之一。差异表达最显著的前10个lncRNA的38个共表达mRNA构建共表达网络,经qPCR验证,与mRNA关联最多的lncRNA NONHSAT097388.2以及ECE1、EMP2、ORAT1、ZNF713在CCT-EC109中表达均下调(均为P<0.01),而MFAP5和PGF表达均升高(均为P<0.05)。结论:lncRNA-mRNA共表达网络可能在慢性镉暴露诱导ESCC细胞演进和治疗抵抗机制中发挥重要作用,相关基因有望成为镉暴露ESCC患者预后判断的潜在生物标志物和治疗靶点。 展开更多
关键词 食管鳞状细胞癌 长链非编码rna 信使rna 共表达网络
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基于circRNA-miRNA-mRNA三元转录网络探讨糖尿病动脉粥样硬化小鼠模型舌象形成的机制 被引量:1
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作者 王瑾茜 喻嵘 +5 位作者 刘秀 邹婷 王存福 王霞 史留阳 陈亚 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期647-655,共9页
目的:探讨糖尿病动脉粥样硬化模型小鼠与美国癌症研究所(ICR)小鼠舌组织中差异表达的环状RNA(circRNA)、微小RNA(miRNA)及信使RNA(mRNA),构建circRNA-miRNA-mRNA三元转录网络。方法:9只ICR小鼠为对照组,9只MKR小鼠(骨骼肌特异性胰岛素... 目的:探讨糖尿病动脉粥样硬化模型小鼠与美国癌症研究所(ICR)小鼠舌组织中差异表达的环状RNA(circRNA)、微小RNA(miRNA)及信使RNA(mRNA),构建circRNA-miRNA-mRNA三元转录网络。方法:9只ICR小鼠为对照组,9只MKR小鼠(骨骼肌特异性胰岛素样生长因子1受体功能缺失)为模型组。各组用于组织病理染色6只,基因测序3只。模型组小鼠采用N-硝基-L-精氨酸甲酯(L-NAME)腹腔注射+高脂饲料饲养。29 d后检测心电图改变、主动脉改变(HE染色)、舌面丝状乳头高度变化(HE染色)及舌面丝状乳头白细胞介素1β(IL-1β)、IL-6和IL-8的蛋白表达。使用微阵列技术筛选舌组织中差异表达的基因,进行基因本体(GO)功能分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,采用qRT-PCR验证基因芯片结果,构建circRNA-miRNA-mRNA转录网络。结果:与对照组相比,模型组心电图出现“红旗飘飘”样改变,病理染色提示主动脉有脂质突出,舌组织出现炎症浸润,IL-1β、IL-6及IL-8蛋白表达均明显增高(P<0.01),舌面丝状乳头角化层和上皮层高度显著降低(P<0.01)。Tox2、Ncor2、Paqr6和R3hdm1基因表达的变化与微阵列结果一致(P<0.01),这些差异表达基因主要通过AGERAGE、TRP及GnRH等通路参与炎症反应、糖脂代谢紊乱及免疫细胞招募趋化等过程,由此构建28个circRNA、23个miRNA和46个mRNA组成的三元转录网络。结论:糖尿病动脉粥样硬化模型小鼠舌组织存在差异表达的circRNA和miRNA,这些差异基因可能通过circRNA-miRNA-mRNA三元转录网络系统调控糖尿病动脉粥样硬化的舌象形成。 展开更多
关键词 环状rna 微小rna 信使rna 糖尿病动脉粥样硬化 舌象 微阵列
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基于lncRNA/mRNA表达谱探讨百事乐胶囊调控慢性应激抑郁症模型大鼠海马损伤的机制 被引量:1
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作者 刘彤彤 侯光菡 +7 位作者 蔺晓源 杨蕙 刘检 张熙 王枭冶 王宇红 葛金文 孟盼 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期312-321,共10页
目的基于长链非编码RNA(lncRNA)/信使RNA(mRNA)表达谱探讨百事乐胶囊(贯叶金丝桃、人参、姜黄)调控慢性应激抑郁症模型大鼠海马损伤的可能机制。方法将SD大鼠随机分为空白组、模型组及百事乐胶囊高、低剂量组(2.88、0.72 g·kg^(-1... 目的基于长链非编码RNA(lncRNA)/信使RNA(mRNA)表达谱探讨百事乐胶囊(贯叶金丝桃、人参、姜黄)调控慢性应激抑郁症模型大鼠海马损伤的可能机制。方法将SD大鼠随机分为空白组、模型组及百事乐胶囊高、低剂量组(2.88、0.72 g·kg^(-1)),每组8只;采用28 d慢性温和不可预测性应激联合孤养的方式构建抑郁症大鼠模型,造模同时灌胃给药,每日1次。采用开野试验和新奇摄食试验评价大鼠模型的抑郁样行为;采用ELISA法检测血清中肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素6(IL-6)的水平;采用高通量芯片测序筛选出组间差异的海马组织lncRNA/mRNA表达谱,预测差异表达的lncRNA靶基因,并取lncRNA、mRNA的差异共集基因;对差异共集基因进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;采用Western Blot法验证差异性蛋白胰岛素生长因子2(Igf2)、核糖体蛋白L36(Rpl36)的表达情况。结果(1)与空白组比较,模型组大鼠4 min内的水平、垂直活动量均显著降低(P<0.01),摄食潜伏期显著延长(P<0.01),血清TNF-α、IL-6水平显著升高(P<0.01)。与模型组比较,百事乐胶囊高剂量组大鼠的水平、垂直活动量明显增加(P<0.05,P<0.01),摄食潜伏期显著缩短(P<0.01),血清TNF-α、IL-6水平明显降低(P<0.05,P<0.01)。(2)模型组与空白组比较,差异共集基因有152个,其中上调100个,下调52个;百事乐胶囊高剂量组与模型组比较,差异共集基因有150个,其中上调88个,下调62个;百事乐胶囊低剂量组与模型组比较,差异共集基因有119个,其中上调58个,下调61个。Igf2、Rpl36为百事乐胶囊高剂量组的主要逆向调节基因。百事乐胶囊主要调控与生物学过程(突触化学传递)和细胞组分(细胞连接)密切相关的差异共集基因的表达,可能通过影响MAPK信号转导通路、胰岛素信号改善抑郁症模型大鼠的海马损伤。(3)与空白组比较,模型组大鼠海马组织Igf2、Rpl36蛋白表达显著下调(P<0.01)。与模型组比较,百事乐胶囊高剂量组大鼠海马组织Igf2、Rpl36蛋白表达显著上调(P<0.01)。结论百事乐胶囊可能通过影响差异共集基因Igf2介导的MAPK信号途径和胰岛素信号途径,调控神经元的存活及突触可塑性,以及可能通过Rpl36减少神经元凋亡,从而发挥抗抑郁作用。 展开更多
关键词 百事乐胶囊 抑郁症 长链非编码rna/信使rna表达谱 海马损伤 胰岛素生长因子2 核糖体蛋白L36 大鼠
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治疗遗传病的RNA药物研究进展 被引量:2
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作者 罗婷 霍春晓 +1 位作者 周天华 谢珊珊 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期406-416,共11页
RNA药物能够通过识别互补序列靶向对应基因以抑制特定蛋白或RNA的表达,或通过翻译合成目的基因编码的蛋白来发挥遗传性疾病治疗作用。RNA药物主要分为寡核苷酸药物(包括反义寡核苷酸、小干扰RNA和RNA适配体)和信使RNA药物等。其中,反义... RNA药物能够通过识别互补序列靶向对应基因以抑制特定蛋白或RNA的表达,或通过翻译合成目的基因编码的蛋白来发挥遗传性疾病治疗作用。RNA药物主要分为寡核苷酸药物(包括反义寡核苷酸、小干扰RNA和RNA适配体)和信使RNA药物等。其中,反义寡核苷酸和小干扰RNA已用于临床治疗遗传病,而RNA适配体和信使RNA药物目前还处于临床试验阶段。当前主要通过对RNA药物进行化学修饰(如对信使RNA进行假尿嘧啶修饰)来降低免疫原性和提升药物疗效,以及开发纳米粒载体、细胞外囊泡和类病毒载体等递送载体来解决RNA药物的稳定性、特异靶向性和安全性等问题。本文概述了目前用于治疗遗传病的11种RNA药物的具体作用分子机制,并简单讨论了RNA药物的化学修饰及递送载体的研究现状。 展开更多
关键词 rna 药物 rna 医学 反义寡核苷酸 小干扰rna rna适配体 信使rna药物 遗传病 综述
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信使RNA药物修饰及其递送系统研究进展 被引量:3
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作者 周正杰 李鑫 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期439-450,共12页
信使RNA(mRNA)药物在多种疾病的预防和治疗中展现了巨大的应用价值。最大程度提高mRNA的稳定性和翻译效率,保证mRNA免受核酸酶的降解并靶向特定组织和细胞是临床转化的要求。通过修饰核苷酸降低mRNA免疫原性,密码子优化增加mRNA翻译效率... 信使RNA(mRNA)药物在多种疾病的预防和治疗中展现了巨大的应用价值。最大程度提高mRNA的稳定性和翻译效率,保证mRNA免受核酸酶的降解并靶向特定组织和细胞是临床转化的要求。通过修饰核苷酸降低mRNA免疫原性,密码子优化增加mRNA翻译效率,5'帽结构和3'多聚腺苷酸尾结构增加mRNA稳定性,以及添加5'和3'非翻译区功能调控mRNA稳定性和翻译效率。通过纳米粒递送系统保护mRNA不被核酸酶降解,增加mRNA血液循环,并帮助mRNA进入细胞质发挥治疗和预防作用。本文综述了mRNA药物的制剂工程技术进展,讨论了提高mRNA稳定性和翻译效率的方法及设计原理,总结了具有产业转换潜力的mRNA递送系统的设计要求及其临床应用,并展望了mRNA药物未来可能的研究方向,以满足实现个性化精准医疗的需求。 展开更多
关键词 信使rna 核酸 化学修饰 药物递送系统 纳米给药系统 rna靶向 综述
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