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Value of circulating cell-free DNA in diagnosis of hepatocelluar carcinoma 被引量:16
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作者 Ken Chen Hong Zhang +6 位作者 Li-Na Zhang Shao-Qing Ju Jing Qi Dong-Feng Huang Feng Li Qun Wei Jing Zhang 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2013年第20期3143-3149,共7页
AIM:To investigate the value of combined detection of circulating cell-free DNA(cfDNA),a-fetal protein(AFP) and a L-fucosidase(AFU) for diagnosis of hepatocellular carcinoma(HCC).METHODS:Serum samples from 39 HCC pati... AIM:To investigate the value of combined detection of circulating cell-free DNA(cfDNA),a-fetal protein(AFP) and a L-fucosidase(AFU) for diagnosis of hepatocellular carcinoma(HCC).METHODS:Serum samples from 39 HCC patients and 45 normal controls were collected.Branched DNA(bDNA) was used to detect the level of cfDNA,and a receiver operating characteristic curve was employed to evaluate the diagnostic sensitivity,specificity,accuracy,positive predictive value,negative predictive value,positive likelihood ratio,negative likelihood ratio and Youden index,and to assess the diagnostic efficiency and their correlations with the clinicopathological features.AFP and AFU were detected by chemiluminescence and colorimetry,respectively.The significance of combined detection of the three biomarkers was discussed.RESULTS:cfDNA level was increased in 22 of the 39 HCC samples and in 2 of the 45 normal controls.cfDNA level in HCC samples was significantly higher than that in normal controls(P < 0.05).There were significant differences in sex and extra-and intrahepatic metastasis(P < 0.05).There was no significant correlation between cfDNA,AFP and AFU in the detection of HCC.The sensitivity of combined detection of cfDNA with one marker(AFP or AFU) and cfDNA with two markers(AFP and AFU) was 71.8%,87.2% and 89.7% vs 56.4%,53.8% and 66.7% for cfDNA,AFP and AFU used alone,respectively,the difference being statistically significant(P < 0.05).CONCLUSION:Quantitative analysis of cfDNA is sensitive and feasible,and the combined detection of cfDNA with AFP or AFU or both could improve the diagnostic sensitivity for HCC. 展开更多
关键词 ALU BRANCHED DNA CIRCULATING cell free DNA DIAGNOSIS HEPATOCELLULAR carcinoma
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一例DMD基因Alu元件插入突变导致杜氏肌营养不良及其白发症状分析
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作者 李慧 张如意 +3 位作者 李长叶 张肖林 郑庆印 刘秀珍 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期570-580,共11页
杜氏肌营养不良(Duchenne muscular dystrophy,DMD)是由DMD基因突变引起的抗肌萎缩蛋白缺乏的一种严重X连锁隐性遗传病,突变形式主要包括外显子缺失和重复、点突变、插入突变等,这些突变通过不同方式影响了抗肌萎缩蛋白的正常表达,最终... 杜氏肌营养不良(Duchenne muscular dystrophy,DMD)是由DMD基因突变引起的抗肌萎缩蛋白缺乏的一种严重X连锁隐性遗传病,突变形式主要包括外显子缺失和重复、点突变、插入突变等,这些突变通过不同方式影响了抗肌萎缩蛋白的正常表达,最终导致疾病的发生。本研究报告了1例DMD基因第59号外显子(exon 59,E59)插入突变引起的DMD,该患儿相关生化指标明显异常,表现较为明显的DMD早期症状,并出现了多处白发。其母亲和姐姐为携带者,生化指标轻微异常,母亲有轻微临床症状,姐姐无临床症状。其他成员基因和身体状况正常。经测序和序列比对发现,该插入片段为AluYa5亚家族的Alu元件,该片段插入可产生两个终止密码子,末端含一段多聚腺苷酸尾(polyA)。为了解该插入突变对于DMD基因的影响以及与临床症状的关联,通过外显子剪接增强子(exonic splicing enhancer,ESE)预测发现,该插入并不影响E59的剪接,由此推测该插入序列会最终出现在DMD基因的mRNA序列中,插入序列中的2个终止子和polyA很可能会在翻译过程中发挥终止作用,不能产生有功能的抗肌萎缩蛋白,这可能是导致DMD发生的机制。另外该患儿除了典型的DMD症状外,还出现了过早白发症状。本研究首次报道了1例DMD基因编码区插入Alu元件导致的DMD,为研究Alu序列逆转座引发基因突变提供线索,同时扩展了对DMD基因突变的认识。 展开更多
关键词 杜氏肌营养不良 DMD基因 Alu元件 插入突变 白发
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多发性骨髓瘤血浆循环游离DNA定量检测和完整性分析
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作者 张岚鑫 蒋艺枝 +1 位作者 邱丽君 黄东平 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1106-1111,共6页
目的:研究血浆循环游离DNA(cf-DNA)在初诊多发性骨髓瘤(MM)患者筛查诊断中的作用,并探讨经化疗后患者的cf-DNA含量和完整性的变化在疾病评估中的作用。方法:收集35例初诊MM患者和18例健康志愿者的外周血标本,另选取MM患者中完成规范诱... 目的:研究血浆循环游离DNA(cf-DNA)在初诊多发性骨髓瘤(MM)患者筛查诊断中的作用,并探讨经化疗后患者的cf-DNA含量和完整性的变化在疾病评估中的作用。方法:收集35例初诊MM患者和18例健康志愿者的外周血标本,另选取MM患者中完成规范诱导化疗3个疗程的13例患者作为随访组。以ALU247片段及ALU115片段为目的基因,用荧光定量PCR检测患者及健康志愿者血浆中的cf-DNA含量,并以ALU247/ALU115比值计算cf-DNA的完整性。结果:MM患者ALU247、ALU115片段浓度和cf-DNA完整性均显著高于健康志愿者(均P<0.05)。经3个疗程诱导化疗的患者治疗后的ALU247和ALU115片段浓度以及cf-DNA的完整性均较治疗前显著降低(均P<0.05),且治疗前后cf-DNA完整性与血清M蛋白含量及骨髓异常浆细胞比例之间均存在较强正相关关系(r_(M蛋白)=0.703,r_(骨髓浆细胞)=0.705)。结论:cf-DNA对于MM的筛查诊断具有一定的积极意义。cf-DNA或许可以协同或者替代血清M蛋白含量及骨髓异常浆细胞比例评估患者的病情、疗效及预后。 展开更多
关键词 初诊多发性骨髓瘤 循环游离DNA ALU247 ALU115 完整性
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Alu antisense RNA ameliorates methylglyoxal-induced human lens epithelial cell apoptosis by enhancing antioxidant defense 被引量:1
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作者 Pei-Yuan Wu Ning Ji +8 位作者 Chong-Guang Wu Xiao-Die Wang Xin Liu Zhi-Xue Song Murad Khan Suleman Shah Ying-Hua Du Xiu-Fang Wang Li-Fang Yan 《International Journal of Ophthalmology(English edition)》 SCIE CAS 2023年第2期178-190,共13页
AIM:To determine whether an antisense RNA corresponding to the human Alu transposable element(Aluas RNA)can protect human lens epithelial cells(HLECs)from methylglyoxal-induced apoptosis.METHODS:Cell counting kit-8(CC... AIM:To determine whether an antisense RNA corresponding to the human Alu transposable element(Aluas RNA)can protect human lens epithelial cells(HLECs)from methylglyoxal-induced apoptosis.METHODS:Cell counting kit-8(CCK-8)and 3-(4,5-Dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide(MTT)assays were used to assess HLEC viability.HLEC viability/death was detected using a Calcein-AM/PI double staining kit;the annexin V-FITC method was used to detect HLEC apoptosis.The cytosolic reactive oxygen species(ROS)levels in HLECs were determined using a reactive species assay kit.The levels of malondialdehyde(MDA)and the antioxidant activities of total-superoxide dismutase(T-SOD)and glutathione peroxidase(GSH-Px)were assessed in HLECs using their respective kits.RT-q PCR and Western blotting were used to measure m RNA and protein expression levels of the genes.RESULTS:Aluas RNA rescued methylglyoxal-induced apoptosis in HLECs and ameliorated both the methylglyoxalinduced decrease in Bcl-2 m RNA and the methylglyoxalinduced increase in Bax m RNA.In addition,Aluas RNA inhibited the methylglyoxal-induced increase in Alu sense RNA expression.Aluas RNA inhibited the production of ROS induced by methylglyoxal,restored T-SOD and GSHPx activity,and moderated the increase in MDA content after treatment with methylglyoxal.Aluas RNA significantly restored the methylglyoxal-induced down-regulation of Nrf2 gene and antioxidant defense genes,including glutathione peroxidase,heme oxygenase 1,γ-glutamylcysteine synthetase and quinone oxidoreductase 1.Aluas RNA ameliorated methylglyoxal-induced increases of the m RNA and protein expression of Keap1 that is the negative regulator of Nrf2.CONCLUSION:Aluas RNA reduces apoptosis induced by methylglyoxal by enhancing antioxidant defense. 展开更多
关键词 human Alu antisense RNA human lens epithelial cells methylglyoxal toxicity antioxidant defense apoptosis
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Anti-aging Effects of Alu Antisense RNA on Human Fibroblast Senescence Through the MEK-ERK Pathway Mediated by KIF15
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作者 Ning JI Chong-guang WU +7 位作者 Xiao-die WANG Zhi-xue SONG Pei-yuan WU Xin LIU Xu FENG Xiang-mei ZHANG Xiu-fang WANG Zhan-jun LV 《Current Medical Science》 SCIE CAS 2023年第1期35-47,共13页
Objective:To investigate whether human short interspersed nuclear element antisense RNA(Alu antisense RNA;Alu asRNA)could delay human fibroblast senescence and explore the underlying mechanisms.Methods:We transfected ... Objective:To investigate whether human short interspersed nuclear element antisense RNA(Alu antisense RNA;Alu asRNA)could delay human fibroblast senescence and explore the underlying mechanisms.Methods:We transfected Alu asRNA into senescent human fibroblasts and used cell counting kit-8(CCK-8),reactive oxygen species(ROS),and senescence-associated beta-galactosidase(SA-β-gal)staining methods to analyze the anti-aging effects of Alu asRNA on the fibroblasts.We also used an RNA-sequencing(RNA-seq)method to investigate the Alu asRNA-specific mechanisms of anti-aging.We examined the effects of KIF15 on the anti-aging role induced by Alu asRNA.We also investigated the mechanisms underlying a KIF15-induced proliferation of senescent human fibroblasts.Results:The CCK-8,ROS and SA-β-gal results showed that Alu asRNA could delay fibroblast aging.RNA-seq showed 183 differentially expressed genes(DEGs)in Alu asRNA transfected fibroblasts compared with fibroblasts transfected with the calcium phosphate transfection(CPT)reagent.The KEGG analysis showed that the cell cycle pathway was significantly enriched in the DEGs in fibroblasts transfected with Alu asRNA compared with fibroblasts transfected with the CPT reagent.Notably,Alu asRNA promoted the KIF15 expression and activated the MEK-ERK signaling pathway.Conclusion:Our results suggest that Alu asRNA could promote senescent fibroblast proliferation via activation of the KIF15-mediated MEK-ERK signaling pathway. 展开更多
关键词 senescent fibroblast cell proliferation Alu antisense RNA KIF15 gene expression MEK-ERK signaling pathway cell cycle
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猪FSHβ亚基基因结构区Alu序列插入突变的研究 被引量:23
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作者 杜立新 柳淑芳 +1 位作者 闫艳春 姜运良 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第11期977-982,共6页
通过聚合酶链式反应 (PCR)对中国华北型优良地方猪种莱芜猪及杜里猪、长白猪的卵泡刺激素 (FSH) β亚基基因结构区插入片段进行扩增 ,并对 0 .5kb扩增产物进行克隆和测序。序列分析表明 ,在已发表的猪FSHβ亚基基因全序列的 +80 9与 +81... 通过聚合酶链式反应 (PCR)对中国华北型优良地方猪种莱芜猪及杜里猪、长白猪的卵泡刺激素 (FSH) β亚基基因结构区插入片段进行扩增 ,并对 0 .5kb扩增产物进行克隆和测序。序列分析表明 ,在已发表的猪FSHβ亚基基因全序列的 +80 9与 +810碱基之间 ,莱芜猪、杜里猪和长白猪分别存在一个长度为 2 75、2 77和 2 74bp的插入片段 ,插入片段末端的poly(A)分别为 17、19和 16个腺苷酸 ,均显著短于高产猪种太湖猪 (2 92bp和 32个腺苷酸 )。对FSHβ亚基基因插入片段进行BamHⅠ多态性分析 ,发现本研究所检测样品中不存在BamHⅠ多态性。插入片段中存在一个RNA聚合酶Ⅲ启动子及AluⅠ内切酶识别位点 ,所以该片段可能为Alu成分。因RNA聚合酶Ⅲ这种有功能的内部启动子能够转录相邻的染色体序列 ,该插入片段可能影响FSHβ亚基基因或其他基因的表达调控。把FSHβ亚基基因作为控制猪产仔数主效基因的候选基因与产仔数进行连锁分析 ,证明FSHβ基因座位在莱芜猪种中与控制猪产仔数的主效基因紧密连锁 ,优势基因AA纯合子比BB纯合子母猪平均每胎多产仔 1.2头。因不同品种猪插入序列的主要差异是末端的poly(A)长短不同 ,推测该插入片段末端的poly(A)结构亦可能影响猪的产仔数。 展开更多
关键词 FSHΒ亚基 基因结构区 Alu序列 插入突变 品种
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斑茅蔗后代杂种的分子标记分析 被引量:8
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作者 何慧怡 劳方业 +1 位作者 刘睿 陈健文 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期573-577,共5页
对斑茅蔗BC1和BC2两个群体的397个无性系进行SSR和Alu-like分子标记分析,发现其中23个品系疑为假杂种,5个品系不具有斑茅血缘。结果表明SSR分子标记是鉴定杂交后代真实性的较好的方法,而引物SC597CS、SMC1527cl、SSCIR36鉴定出疑似假杂... 对斑茅蔗BC1和BC2两个群体的397个无性系进行SSR和Alu-like分子标记分析,发现其中23个品系疑为假杂种,5个品系不具有斑茅血缘。结果表明SSR分子标记是鉴定杂交后代真实性的较好的方法,而引物SC597CS、SMC1527cl、SSCIR36鉴定出疑似假杂种总个数较多且互补性好,是鉴定斑茅蔗后代杂种真假的一组较好的引物。与Alu-like标记结合使用能较好地检测杂交后代是否含有斑茅血缘。 展开更多
关键词 甘蔗 斑茅 杂种鉴定 SSR Alu—like
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L1-ORF2不同片段对报告基因表达产生不同影响 被引量:7
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作者 段肖翠 靳霞 +4 位作者 谢英 焦宁 刘静 王晓燕 吕占军 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期50-56,共7页
长散布重复序列-1(Line-1,LI)是重要的人类基因组成分,完整的LI有6kb,在基因组中存在的L,多数是不完整序列,有必要研究LI片段对基因表达的调控作用。PCR扩增LI第二读码框(LI-ORF2)不同位置的280bp片段,共7段,同向8串联按正... 长散布重复序列-1(Line-1,LI)是重要的人类基因组成分,完整的LI有6kb,在基因组中存在的L,多数是不完整序列,有必要研究LI片段对基因表达的调控作用。PCR扩增LI第二读码框(LI-ORF2)不同位置的280bp片段,共7段,同向8串联按正、反方向分别插入pEGFP质粒GFP基因下游,观察插入序列对GFP报告基因表达的影响。构建的质粒瞬时转染HeLa细胞,经荧光显微镜和Northern检测,不同片段对转录量和终止影响不同。7个片段正序对GFP报告基因的抑制均高于其反序,在正序串联表达载体p280—1*8和p280—9*8的GFP基因转录量超过其他280正序插入片段,在反序串联表达载体p280—1*8as和p280.9*8as的G即基因转录量超过其他280反序片段。280.1。8、280—9*8、280—1*8as和280—9*8as属于转录终止性序列。Alu在基因组的多数区段与L,分布呈反比,Alu正、反序均对GFP表达有抑制作用,但反序抑制作用高于正序,Alu正序属于转录延伸性序列。280bp片段反序插入的所有质粒荧光阳性细胞均高于正序插入质粒。经碱基分析,L1-ORF2各段均存在A碱基含量多,T碱基含量少的现象,这可能是其正、反序对基因表达影响不同的原因。 展开更多
关键词 L1 ALU PEGFP-C1 ORF2 GFP
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中国东北汉族及3个少数民族DYS19和DYS287多态性研究 被引量:8
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作者 张勇 张贵寅 +4 位作者 孙艳阳 薛雅丽 杨焕杰 陈白滨 李璞 《人类学学报》 CSCD 北大核心 1998年第3期237-241,共5页
本文以中国东北汉族(69例)和鄂温克、鄂伦春、达斡尔3个少数民族人群(108例)为研究对象,采用PCR产物变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法分析了Y染色体特异性微卫星DYS19的等位基因分布规律。结果显示:东北汉族人群中各... 本文以中国东北汉族(69例)和鄂温克、鄂伦春、达斡尔3个少数民族人群(108例)为研究对象,采用PCR产物变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法分析了Y染色体特异性微卫星DYS19的等位基因分布规律。结果显示:东北汉族人群中各等位基因分布较分散A2.9%,B26.09%,C26.09%,D28.98%,E15.94%;东北汉族和3个少数民族人群的等位基因频率有显著性差异(P<0.05)。我们还通过PCR方法调查了以上4个人群中Y染色体特异的Alu序列插入位点DYS287的多态性,在所研究4个人群中没有发现Alu序列的插入,即均为YAP-的个体。 展开更多
关键词 Y染色体 多态 微卫星 Alu序列 汉族 少数民族
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中国海南岛三个黎族支系DYS287、DYS19的多态性研究 被引量:6
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作者 李冬娜 应大君 +4 位作者 区采莹 陈路 符生苗 谢协驹 陈峰 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期5-8,共4页
以中国海南岛(289例)本地黎(97例)、杞黎(96例)和黎(96例)人群为研究对象,采用PCR技术及变性聚丙烯酰胺凝胶电泳方法分析了Y染色体特异性微卫星DYS19的等位基因分布规律。本地黎群体检出4种等位基因,杞黎和黎群体均检出3种。在3个... 以中国海南岛(289例)本地黎(97例)、杞黎(96例)和黎(96例)人群为研究对象,采用PCR技术及变性聚丙烯酰胺凝胶电泳方法分析了Y染色体特异性微卫星DYS19的等位基因分布规律。本地黎群体检出4种等位基因,杞黎和黎群体均检出3种。在3个支系的等位基因中均以194bp的频率为最高,分别是0.711、0.855和0.667。杞黎与黎人群DYS19基因座的等位基因频率有极显著差异(P<0.01)。我们还通过PCR方法调查了3个黎族支系的Alu序列插入基因座DYS287的多态性,结果显示:3个人群均未发生Alu序列插入。 展开更多
关键词 中国海南岛 黎族支系 DYS287 DYS19 Y染色体 多态性 微卫星 Alu序列
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猪催乳素受体(PRLR)基因AluⅠ多态性与产仔数关系的研究 被引量:27
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作者 曹果清 李步高 +1 位作者 刘建华 杨文平 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 2004年第3期253-255,共3页
研究采用PCR-RFLP方法检测了猪PRLR基因exon10多态性,结果显示,除马身猪中只有A基因存在外,其他品种中,均有A和B两个等位基因存在。利用最小二乘分析研究了该多态位点对猪初产和经产的总产仔数和活产仔数的影响,结果表明不同基因型母猪... 研究采用PCR-RFLP方法检测了猪PRLR基因exon10多态性,结果显示,除马身猪中只有A基因存在外,其他品种中,均有A和B两个等位基因存在。利用最小二乘分析研究了该多态位点对猪初产和经产的总产仔数和活产仔数的影响,结果表明不同基因型母猪的总产仔数和活产仔数的差异均未达到显著水平,但呈现出AA>AB>BB的趋势。对于头胎总产仔数、经产总产仔数和活产仔数,A基因的加性效应分别为0 29头/胎、0 38头/胎和0 39头/胎,显性效应分别为0 21头/胎、0 19头/胎和0 19头/胎,对于头胎活产仔数来说,A基因的加性效应和显性效应分别为-0 4头/胎和0 2头/胎。 展开更多
关键词 催乳素受体 PRLR 受体基因 AluⅠ多态性 产仔数
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中国28个民族群体Y染色体DYS287位点的遗传多态性 被引量:8
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作者 陈阳 褚嘉祐 +8 位作者 俞建昆 于亮 孙浩 林克勤 陶玉芬 史磊 黄小琴 石铁流 傅松滨 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期196-201,共6页
目的研究我国9个省28个民族群体Y染色体DYS287位点的遗传多态性。方法应用Touchdown PCR技术扩增1006个DNA样品的Y染色体Alu序列多态性(YAP)+片断,琼脂糖凝胶电泳分离检测。结果藏族YAP+频率为36·7%,土族23·8%,彝族18·4%... 目的研究我国9个省28个民族群体Y染色体DYS287位点的遗传多态性。方法应用Touchdown PCR技术扩增1006个DNA样品的Y染色体Alu序列多态性(YAP)+片断,琼脂糖凝胶电泳分离检测。结果藏族YAP+频率为36·7%,土族23·8%,彝族18·4%,普米族11·3%,塔吉克族7·4%,白族6·7%,基诺族5·1%,山东汉族4%,仫佬族2·7%,毛南族1·3%,甘肃汉族、云南汉族、壮族、傣族、黎族、怒族、傈僳族、纳西族、拉祜族、独龙族、哈尼族、畲族、维吾尔族、撒拉族、柯尔克孜族、东乡族、佤族及朝鲜族的YAP+频率均为0。结论YAP+频率在部分汉藏语系民族(藏、彝、普米、基诺、白族)中频率较高。在历史学、语言学上被认为来源于中亚的民族(土族、塔吉克族)中YAP+频率也较高。而起源于百越民族的少数民族(仫佬族、毛南族)YAP+频率值得进一步探讨。 展开更多
关键词 Y染色体 Y染色体Alu序列多态性 遗传多态性
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Alu家族及其生物学意义 被引量:5
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作者 罗迪贤 李凯 +1 位作者 何淑雅 廖端芳 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期284-288,共5页
Alu 家族是灵长类基因组特有的含量丰富的短散在重复序列,在基因组中的拷贝数已经超过了 100 万,每个拷贝长度约300 bp。目前,对于Alu 序列的功能了解得还不透彻,据推测主要与基因调控有关,如基因重排、CpG甲基化、hnRNA选择性剪切、结... Alu 家族是灵长类基因组特有的含量丰富的短散在重复序列,在基因组中的拷贝数已经超过了 100 万,每个拷贝长度约300 bp。目前,对于Alu 序列的功能了解得还不透彻,据推测主要与基因调控有关,如基因重排、CpG甲基化、hnRNA选择性剪切、结合转录因子和激素等。同时,Alu 家族是人类群体遗传学、法医学、肿瘤学等的重要研究手段。Alu 元件的插入、删除和重组导致了许多先天性遗传疾病和癌症。 展开更多
关键词 Alu家族 基因调控 疾病 生物进化
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猪FSHβ和GDF9基因中Alu插入序列多态性 被引量:5
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作者 张璐 曹洪战 +1 位作者 芦春莲 胡成波 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期481-486,共6页
使用聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)技术,对辽宁黑猪、长白猪、大约克猪、丹育猪和杜洛克猪的FSHβ亚基基因和GDF9基因的插入片段扩增后进行多态性和生物信息学分析,并对产仔数建立GLM模型,探讨2个基因插入序列Alu的多... 使用聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)技术,对辽宁黑猪、长白猪、大约克猪、丹育猪和杜洛克猪的FSHβ亚基基因和GDF9基因的插入片段扩增后进行多态性和生物信息学分析,并对产仔数建立GLM模型,探讨2个基因插入序列Alu的多态性与猪产仔数的关系。研究表明:优势基因型BBDD纯合子比AACC型纯合子母猪平均每胎多产仔1.5头(P<0.01)。研究结果表明,FSHβ亚基基因和GDF9基因与控制猪产仔数的主效基因密切相关,这可能会作为猪产仔数性状的遗传标记,而其优势基因型BBDD可以进一步改良猪的产仔数性状。 展开更多
关键词 FSHΒ亚基基因 GDF9基因 Alu序列 多态性
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不同氧化态叶酸对人成淋巴细胞系基因组DNA甲基化水平的影响 被引量:4
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作者 倪娟 陈海燕 +3 位作者 曹能 周滔 薛京伦 汪旭 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期256-259,共4页
目的比较最高氧化态叶酸(folic acid,FA)与还原态5-甲基四氢叶酸(5-methyltetrahydrofolate,5-MeTHF)对人成淋巴细胞LINE-1和Alu的甲基化效应,从而评价受试物对全基因组DNA甲基化的影响。方法以含30、60和120 nmol/L FA或5-MeTHF的改良R... 目的比较最高氧化态叶酸(folic acid,FA)与还原态5-甲基四氢叶酸(5-methyltetrahydrofolate,5-MeTHF)对人成淋巴细胞LINE-1和Alu的甲基化效应,从而评价受试物对全基因组DNA甲基化的影响。方法以含30、60和120 nmol/L FA或5-MeTHF的改良RPMI1640培养液干预培养人成淋巴细胞系GM12593,20 d后提取基因组DNA,用亚硫酸盐修饰测序法(BSP)比较不同浓度和氧化态叶酸对受试细胞Alu和LINE-1甲基化水平的影响。结果基因组Alu和LINE-1甲基化水平均随FA或5-MeTHF浓度的升高而增加,两目标序列的甲基化水平在120 nmol/L FA或5-MeTHF浓度下显著高于30和60 nmol/L组(P【0.01~0.05),60和120 nmol/L的5-MeTHF提高LINE-1甲基化水平的能力显著高于同等浓度的FA(P【0.01~0.05)。结论 FA和5-MeTHF浓度与人成淋巴细胞基因组DNA甲基化水平显著正相关,5-MeTHF的基因组甲基化维护效应强于FA。 展开更多
关键词 叶酸 基因组DNA甲基化 ALU LINE-1
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在载脂蛋白E基因敲除小鼠和人脐静脉平滑肌细胞中同型半胱氨酸对B1和Alu重复序列甲基化的影响 被引量:9
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作者 吴凯 马胜超 +5 位作者 孙炜炜 王菊 曹成建 马长剑 杨安宁 姜怡邓 《中国动脉硬化杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期785-790,共6页
目的观察同型半胱氨酸对载脂蛋白E基因敲除小鼠不同组织和人脐静脉平滑肌细胞中B1和Alu序列甲基化水平的影响,为进一步阐明同型半胱氨酸致动脉粥样硬化形成的分子机制提供理论和实验依据。方法复制高同型半胱氨酸血症载脂蛋白E基因敲除... 目的观察同型半胱氨酸对载脂蛋白E基因敲除小鼠不同组织和人脐静脉平滑肌细胞中B1和Alu序列甲基化水平的影响,为进一步阐明同型半胱氨酸致动脉粥样硬化形成的分子机制提供理论和实验依据。方法复制高同型半胱氨酸血症载脂蛋白E基因敲除小鼠模型,给予不同饮食14周后,分别取小鼠心脏组织、血管及白细胞;原代培养人脐静脉平滑肌细胞,用50、100、200及500μmol/L同型半胱氨酸干预培养72 h后,抽提组织、白细胞及平滑肌细胞的基因组DNA,采用巢式降落式甲基化特异性PCR法分别检测不同组织和细胞中B1和Alu序列甲基化水平的变化。结果饲以高蛋氨酸饮食的载脂蛋白E基因敲除小鼠心脏组织、血管和白细胞中B1重复序列甲基化水平下降明显,与正常对照组比较有显著性差异(P<0.05和P<0.01);在同型半胱氨酸干预的平滑肌细胞中Alu序列甲基化水平下降显著(P<0.05和P<0.01)。结论同型半胱氨酸引起B1和Alu序列低甲基化改变可能是其导致动脉粥样硬化发生发展的重要机制之一。 展开更多
关键词 B1和Alu重复序列 甲基化 同型半胱氨酸 载脂蛋白E基因敲除小鼠 血管平滑肌细胞
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西藏牦牛和黑白花奶牛生长激素基因AluⅠ多态性的比较研究 被引量:13
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作者 陈桂芳 李齐发 +2 位作者 强巴央宗 土登 谢庄 《畜牧与兽医》 北大核心 2002年第11期15-16,共2页
利用聚合酶链式反应 (PCR)技术 ,测定了西藏牦牛和黑白花奶牛生长激素基因的AluⅠ RFLP (限制性内切酶片段长度多态性 ) ,并比较了2牛群的基因频率。在西藏牦牛和黑白花奶牛中 ,等位基因A的频率分别为 0 935和 0 90 5 ,等位基因B的... 利用聚合酶链式反应 (PCR)技术 ,测定了西藏牦牛和黑白花奶牛生长激素基因的AluⅠ RFLP (限制性内切酶片段长度多态性 ) ,并比较了2牛群的基因频率。在西藏牦牛和黑白花奶牛中 ,等位基因A的频率分别为 0 935和 0 90 5 ,等位基因B的频率分别为 0 0 65和 0 0 65 ,卡方检验差异不显著 (P >0 0 5)。 展开更多
关键词 西藏牦牛 黑白花奶牛 生长激素基因 ALU I多态性
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分支链DNA Alu技术定量检测败血症患者血浆循环DNA的表达 被引量:3
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作者 侯彦强 梁冬雨 +3 位作者 彭亮 娄晓丽 刘涛 陈洪卫 《检验医学》 CAS 2012年第12期1050-1053,共4页
目的探讨血浆循环DNA(cf-DNA)水平定量检测在败血症诊断和败血症与全身炎症反应综合征(SIRS)鉴别诊断中的价值。方法利用分支链DNA Alu技术定量检测24例败血症患者、43例SIRS患者和73名健康人血浆cf-DNA的表达水平;绘制受试者工作特征(R... 目的探讨血浆循环DNA(cf-DNA)水平定量检测在败血症诊断和败血症与全身炎症反应综合征(SIRS)鉴别诊断中的价值。方法利用分支链DNA Alu技术定量检测24例败血症患者、43例SIRS患者和73名健康人血浆cf-DNA的表达水平;绘制受试者工作特征(ROC)曲线评估血浆cf-DNA的临床价值。结果正常对照组血浆cf-DNA表达水平为68.56(12.56~309.78)ng/mL,SIRS组为609.67(15.98~2 596.87)ng/mL,败血症组为1 398.96(19.28~2 987.56)ng/mL,败血症组明显高于正常对照组(P<0.001)和SIRS组(P<0.001)。SIRS组与正常对照组、败血症组与正常对照组、败血症组与SIRS组的曲线下面积(AUC)分别为0.763(0.661~0.865)、0.955(0.884~1.025)和0.777(0.663~0.891)。结论血浆cf-DNA具有作为新的败血症诊断标志物的临床应用价值。 展开更多
关键词 循环DNA 分支链DNA Alu技术 标记物 败血症 诊断
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基于资源共享的ALU设计 被引量:5
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作者 孙海平 李伟 +1 位作者 王锐 高明伦 《微电子学与计算机》 CSCD 北大核心 2001年第5期16-20,共5页
文章结合ALU设计,提出了基于等价变换的资源共享设计方法。在分析了ALU功能的基础上,给出了一个资源共享型ALU设计实例。与基于指令功能设计方法相比,资源共享设计方法在节省资源方面有独到的优势。该设计方法不仅适用于基于HDL描述的... 文章结合ALU设计,提出了基于等价变换的资源共享设计方法。在分析了ALU功能的基础上,给出了一个资源共享型ALU设计实例。与基于指令功能设计方法相比,资源共享设计方法在节省资源方面有独到的优势。该设计方法不仅适用于基于HDL描述的现代设计方法,而且也适用于传统的原理图设计方法。 展开更多
关键词 ALU 资源共享 等价变换 超大规模集成电路 算术逻辑单元
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良恶性胸腹水中游离DNA含量及完整性比较 被引量:3
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作者 殷霞丽 谢丽 +2 位作者 禹立霞 钱晓萍 刘宝瑞 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期516-519,共4页
目的:探讨细胞游离DNA含量及DNA完整性在良恶性胸腹水中的临床意义。方法:应用实时ALU-qPCR(115bp、247bp)方法分析28例良性胸腹水患者和38例恶性胸腹水患者的胸腹水中细胞游离DNA含量以及DNA完整性的情况。结果:ALU247片段含量在良恶... 目的:探讨细胞游离DNA含量及DNA完整性在良恶性胸腹水中的临床意义。方法:应用实时ALU-qPCR(115bp、247bp)方法分析28例良性胸腹水患者和38例恶性胸腹水患者的胸腹水中细胞游离DNA含量以及DNA完整性的情况。结果:ALU247片段含量在良恶性胸腹水组中有统计学差异(P<0.05),但ALU115片段在两组中并无统计学差异(P>0.05);恶性胸腹水中DNA完整性明显高于良性对照组(P<0.05)。DNA完整性的ROC曲线下面积为0.716(P<0.01)。结论:恶性胸腹水有较高的ALU247片度含量以及DNA完整性,其中DNA完整性可能是一个很有价值的诊断指标。 展开更多
关键词 胸腹水 DNA完整性 ALU序列
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