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国产SW26010-Pro处理器上3级BLAS函数众核并行优化 被引量:1
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作者 胡怡 陈道琨 +5 位作者 杨超 马文静 刘芳芳 宋超博 孙强 史俊达 《软件学报》 EI CSCD 北大核心 2024年第3期1569-1584,共16页
BLAS(basic linear algebra subprograms)是最基本、最重要的底层数学库之一.在一个标准的BLAS库中,BLAS 3级函数涵盖的矩阵-矩阵运算尤为重要,在许多大规模科学与工程计算应用中被广泛调用.另外,BLAS 3级属于计算密集型函数,对充分发... BLAS(basic linear algebra subprograms)是最基本、最重要的底层数学库之一.在一个标准的BLAS库中,BLAS 3级函数涵盖的矩阵-矩阵运算尤为重要,在许多大规模科学与工程计算应用中被广泛调用.另外,BLAS 3级属于计算密集型函数,对充分发挥处理器的计算性能有至关重要的作用.针对国产SW26010-Pro处理器研究BLAS 3级函数的众核并行优化技术.具体而言,根据SW26010-Pro的存储层次结构,设计多级分块算法,挖掘矩阵运算的并行性.在此基础上,基于远程内存访问(remote memory access,RMA)机制设计数据共享策略,提高从核间的数据传输效率.进一步地,采用三缓冲、参数调优等方法对算法进行全面优化,隐藏直接内存访问(direct memory access,DMA)访存开销和RMA通信开销.此外,利用SW26010-Pro的两条硬件流水线和若干向量化计算/访存指令,还对BLAS 3级函数的矩阵-矩阵乘法、矩阵方程组求解、矩阵转置操作等若干运算进行手工汇编优化,提高了函数的浮点计算效率.实验结果显示,所提出的并行优化技术在SW26010-Pro处理器上为BLAS 3级函数带来了明显的性能提升,单核组BLAS 3级函数的浮点计算性能最高可达峰值性能的92%,多核组BLAS 3级函数的浮点计算性能最高可达峰值性能的88%. 展开更多
关键词 blaS 3级 SW26010-Pro众核处理器 直接内存访问 远程内存访问 浮点计算效率
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广东省腹泻仔猪大肠杆菌blaCTX-M-65与mcr-1基因共传播特征
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作者 张岩 曹孟涛 +3 位作者 卢跃溦 蒋红霞 王令 李斌 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期1286-1297,共12页
【目的】调查分析广东省某生猪养殖场腹泻仔猪的大肠杆菌耐药情况以及同时携带blaCTX-M-65与mcr-1两种耐药基因的阳性大肠杆菌的分子特征与其共同传播特征,为耐药性监测及风险防控提供科学依据。【方法】从广东省肇庆市某生猪养殖场采... 【目的】调查分析广东省某生猪养殖场腹泻仔猪的大肠杆菌耐药情况以及同时携带blaCTX-M-65与mcr-1两种耐药基因的阳性大肠杆菌的分子特征与其共同传播特征,为耐药性监测及风险防控提供科学依据。【方法】从广东省肇庆市某生猪养殖场采集腹泻仔猪直肠棉拭子样品90份,并进行大肠杆菌分离鉴定;采用PCR方法检测产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)与mcr-1基因,通过测序确定CTX-M亚型;采用琼脂二倍稀释法和微量肉汤稀释法测定分离菌对12种抗菌药物的最小抑菌浓度(MIC);使用脉冲场凝胶电泳(PFGE)及多位点序列分型(MLST)分析菌株间的遗传背景;通过接合转移方法确定质粒水平转移的能力;使用复制子分型、S1-PFGE、Southern blotting方法检测质粒类型、耐药基因的定位及定位质粒的大小;通过三代测序及序列分析确定质粒的重组过程。【结果】共分离鉴定86株大肠杆菌,检测到44株携带CTX-M型ESBLs基因,其中blaCTX-M-55基因最流行(n=16,36.4%),其次是blaCTX-M-65(n=10,22.7%)、blaCTX-M-27(n=8,18.2%)、blaCTX-M-15(n=5,11.4%),还检测出blaCTX-M-79(n=2,4.5%)、blaCTX-M-14(n=2,4.5%)和blaCTX-M-24(n=1,2.3%)。10株blaCTX-M-65基因阳性菌有8株同时携带mcr-1基因。这8株大肠杆菌均表现为多药耐药,包括氨苄西林、阿莫西林、头孢噻呋、头孢喹肟、黏菌素等多种抗生素。8株菌共分为6种ST型、7个PFGE谱型。接合转移试验发现,有6株菌的blaCTX-M-65和mcr-1基因发生了共转移,且blaCTX-M-65与mcr-1基因均位于IncHI2型(253 kb)质粒上。其中1株菌在接合转移的过程中,其所携带的一个253 kb IncHI2质粒与一个69 kb IncFⅡ质粒发生融合,形成一个大小323 kb的融合质粒。对融合质粒进行三代测序解析,结果表明,在接合转移的过程中IS26介导了两个不同大小质粒的重组。【结论】IncHI2质粒是介导blaCTX-M-65和mcr-1基因共同传播的主要媒介,IS26通过与靶位点GTTTCACT的整合导致IncHI2质粒与IncFⅡ质粒融合。质粒重组扩大了大肠杆菌的耐药谱,加速了耐药基因的传播,促使多药耐药现象更严重,对公共卫生安全构成威胁,本研究为阐明多重耐药大肠杆菌的传播机制提供了参考依据。 展开更多
关键词 大肠杆菌 blaCTX-M-65 mcr-1 IS26 质粒融合
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Increased excitatory amino acid transporter 2 levels in basolateral amygdala astrocytes mediate chronic stress–induced anxiety-like behavior
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作者 Xirong Xu Shoumin Xuan +3 位作者 Shuai Chen Dan Liu Qian Xiao Jie Tu 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第6期1721-1734,共14页
The conventional perception of astrocytes as mere supportive cells within the brain has recently been called into question by empirical evidence, which has revealed their active involvement in regulating brain functio... The conventional perception of astrocytes as mere supportive cells within the brain has recently been called into question by empirical evidence, which has revealed their active involvement in regulating brain function and encoding behaviors associated with emotions.Specifically, astrocytes in the basolateral amygdala have been found to play a role in the modulation of anxiety-like behaviors triggered by chronic stress. Nevertheless, the precise molecular mechanisms by which basolateral amygdala astrocytes regulate chronic stress–induced anxiety-like behaviors remain to be fully elucidated. In this study, we found that in a mouse model of anxiety triggered by unpredictable chronic mild stress, the expression of excitatory amino acid transporter 2 was upregulated in the basolateral amygdala. Interestingly, our findings indicate that the targeted knockdown of excitatory amino acid transporter 2 specifically within the basolateral amygdala astrocytes was able to rescue the anxiety-like behavior in mice subjected to stress. Furthermore, we found that the overexpression of excitatory amino acid transporter 2 in the basolateral amygdala, whether achieved through intracranial administration of excitatory amino acid transporter 2agonists or through injection of excitatory amino acid transporter 2-overexpressing viruses with GfaABC1D promoters, evoked anxiety-like behavior in mice. Our single-nucleus RNA sequencing analysis further confirmed that chronic stress induced an upregulation of excitatory amino acid transporter 2 specifically in astrocytes in the basolateral amygdala. Moreover, through in vivo calcium signal recordings, we found that the frequency of calcium activity in the basolateral amygdala of mice subjected to chronic stress was higher compared with normal mice.After knocking down the expression of excitatory amino acid transporter 2 in the basolateral amygdala, the frequency of calcium activity was not significantly increased, and anxiety-like behavior was obviously mitigated. Additionally, administration of an excitatory amino acid transporter 2 inhibitor in the basolateral amygdala yielded a notable reduction in anxiety level among mice subjected to stress. These results suggest that basolateral amygdala astrocytic excitatory amino acid transporter 2 plays a role in in the regulation of unpredictable chronic mild stress-induced anxiety-like behavior by impacting the activity of local glutamatergic neurons, and targeting excitatory amino acid transporter 2 in the basolateral amygdala holds therapeutic promise for addressing anxiety disorders. 展开更多
关键词 ANXIETY ASTROCYTES basolateral amygdala behavior dihydrokainic acid excitatory amino acid transporter 2 fiber photometry GLUTAMATE LDN-212320 TRANSPORTER
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Dip2a regulates stress susceptibility in the basolateral amygdala
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作者 Jing Li Zixuan He +4 位作者 Weitai Chai Meng Tian Huali Yu Xiaoxiao He Xiaojuan Zhu 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第6期1735-1748,共14页
Dysregulation of neurotransmitter metabolism in the central nervous system contributes to mood disorders such as depression, anxiety, and post–traumatic stress disorder. Monoamines and amino acids are important types... Dysregulation of neurotransmitter metabolism in the central nervous system contributes to mood disorders such as depression, anxiety, and post–traumatic stress disorder. Monoamines and amino acids are important types of neurotransmitters. Our previous results have shown that disco-interacting protein 2 homolog A(Dip2a) knockout mice exhibit brain development disorders and abnormal amino acid metabolism in serum. This suggests that DIP2A is involved in the metabolism of amino acid–associated neurotransmitters. Therefore, we performed targeted neurotransmitter metabolomics analysis and found that Dip2a deficiency caused abnormal metabolism of tryptophan and thyroxine in the basolateral amygdala and medial prefrontal cortex. In addition, acute restraint stress induced a decrease in 5-hydroxytryptamine in the basolateral amygdala. Additionally, Dip2a was abundantly expressed in excitatory neurons of the basolateral amygdala, and deletion of Dip2a in these neurons resulted in hopelessness-like behavior in the tail suspension test. Altogether, these findings demonstrate that DIP2A in the basolateral amygdala may be involved in the regulation of stress susceptibility. This provides critical evidence implicating a role of DIP2A in affective disorders. 展开更多
关键词 5-HYDROXYTRYPTAMINE acute restraint stress basolateral amygdala CaMKII neurons DIP2A metabolomics NEUROTRANSMITTERS principal component analysis stress susceptibility TRYPTOPHAN
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面向SW26010-Pro的1、2级BLAS函数众核并行优化技术
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作者 胡怡 陈道琨 +5 位作者 杨超 刘芳芳 马文静 尹万旺 袁欣辉 林蓉芬 《软件学报》 EI CSCD 北大核心 2023年第9期4421-4436,共16页
BLAS (basic linear algebra subprograms)是高性能扩展数学库的一个重要模块,广泛应用于科学与工程计算领域. BLAS 1级提供向量-向量运算, BLAS 2级提供矩阵-向量运算.针对国产SW26010-Pro众核处理器设计并实现了高性能BLAS 1、2级函数... BLAS (basic linear algebra subprograms)是高性能扩展数学库的一个重要模块,广泛应用于科学与工程计算领域. BLAS 1级提供向量-向量运算, BLAS 2级提供矩阵-向量运算.针对国产SW26010-Pro众核处理器设计并实现了高性能BLAS 1、2级函数.基于RMA通信机制设计了从核归约策略,提升了BLAS 1、2级若干函数的归约效率.针对TRSV、TPSV等存在数据依赖关系的函数,提出了一套高效并行算法,该算法通过点对点同步维持数据依赖关系,设计了适用于三角矩阵的高效任务映射机制,有效减少了从核点对点同步的次数,提高了函数的执行效率.通过自适应优化、向量压缩、数据复用等技术,进一步提升了BLAS 1、2级函数的访存带宽利用率.实验结果显示, BLAS 1级函数的访存带宽利用率最高可达95%,平均可达90%以上, BLAS 2级函数的访存带宽利用率最高可达98%,平均可达80%以上.与广泛使用的开源数学库GotoBLAS相比, BLAS 1、2级函数分别取得了平均18.78倍和25.96倍的加速效果. LU分解、QR分解以及对称特征值问题通过调用所提出的高性能BLAS 1、2级函数取得了平均10.99倍的加速效果. 展开更多
关键词 blaS 1级 blaS 2级 访存带宽 SW26010-Pro众核处理器 RMA通信 点对点同步 自适应优化
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奶牛养殖场环境中耐药基因bla_(NDM)的分布和传播特性分析
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作者 马妍 陈帅印 +2 位作者 丁冬 王亚 朱静媛 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2023年第6期828-835,共8页
目的:了解奶牛养殖场环境中耐药基因bla_(NDM)的分布情况及传播特性。方法:采用PCR法从河南省焦作市某地2个奶牛养殖场的奶牛养殖场饲养环境、动物(鼻拭子、粪便)和工人(咽拭子、粪便)样本中检测并分离bla_(NDM)阳性菌株,对bla_(NDM)基... 目的:了解奶牛养殖场环境中耐药基因bla_(NDM)的分布情况及传播特性。方法:采用PCR法从河南省焦作市某地2个奶牛养殖场的奶牛养殖场饲养环境、动物(鼻拭子、粪便)和工人(咽拭子、粪便)样本中检测并分离bla_(NDM)阳性菌株,对bla_(NDM)基因阳性大肠杆菌进行系统进化群、多位点序列分型、耐药表型和耐药基因分析;通过接合试验验证bla_(NDM)基因的可转移性;质粒稳定性试验分析携带bla_(NDM)基因的质粒在宿主细菌中的稳定性。结果:bla_(NDM)基因在奶牛场的总检出率为35.5%,成年母牛中bla_(NDM)基因的阳性检出率高于犊牛(P<0.001),从动物和工人粪便共分离出17株bla_(NDM-5)阳性大肠杆菌,bla_(NDM-5)阳性大肠杆菌属于系统进化群A群(11.8%)和B1群(88.2%),存在3种不同ST型(ST_(48)、ST_(n-1)、ST_(n-2))。17株bla_(NDM-5)阳性大肠杆菌均是多耐药菌株。所有菌株的bla_(NDM)基因位于接合性质粒,可以通过质粒接合转移至受体菌株中,且经过36代无抗培养后仍能在宿主细菌中稳定存在。结论:bla_(NDM)基因在奶牛养殖场流行率较高,主要的细菌宿主是大肠杆菌,且bla_(NDM)基因可通过质粒的接合转移进行水平传播。 展开更多
关键词 奶牛养殖场 大肠杆菌 bla_(NDM)基因 多位点序列分型 药敏试验
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Resistance of Klebsiella to Imipenem by Production of Carbapenemase Gene blaIMP at Centre Hospitalier Universitaire Pédiatrique Charles de Gaulle, Ouagadougou, Burkina Faso
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作者 Blandine Ouédraogo Abdoul Karim Ouattara +3 位作者 Amana Mètuor Dabiré Rahimatou Yasmine Wendkuni Tiemtoré Serge Sougé Jacques Simporé 《International Journal of Clinical Medicine》 2023年第8期347-356,共9页
Objective: Class B carbapenemases are bacterial enzymes that catalyze the hydrolysis of β-lactam core antibiotics, except for monobactams. The objective of this study was to identify the carbapenemase gene bla<sub... Objective: Class B carbapenemases are bacterial enzymes that catalyze the hydrolysis of β-lactam core antibiotics, except for monobactams. The objective of this study was to identify the carbapenemase gene bla<sub>IMP</sub> in the genus Klebsiella at the Charles De Gaulle Pediatric University Hospital (CHUP-CDG) of Ouagadougou, Burkina Faso. Methods: The study involved 17 bacterial strains responsible for human infection and isolated from various biological samples during the period from 2009 to 2013. The strains were tested for antimicrobial susceptibility to cefotaxime, ceftazidime and imipenem using the Mueller-Hinton agar diffusion method. The carbapenemases resistance genes were detected by conventional PCR using specific primers at the molecular biology laboratory of CERBA/LABIOGENE, Ouagadougou, Burkina Faso. Results: The antibiotic susceptibility test showed high resistance of the 17 Klebsiella isolates tested to cephalosporins. A high cefotaxime-resistance rate (82.35%) and ceftazidime-resistance rate (88.23%) was found among the strains tested against 11.76% resistance rate for imipenem. Analysis of PCR products by gel electrophoresis revealed 4 strains (23.53%) with bla<sub>IMP</sub>-type gene. Conclusion: Klebsiella is a well-known bacterium in clinical practice. The present study demonstrated the bla<sub>IMP</sub>-type gene in cephalosporin-resistant strains of Klebsiella at CHUP-CDG. More effective monitoring and treatment solutions are needed to prevent the spread of these resistant strains. 展开更多
关键词 KLEBSIELLA RESISTANCE blaIMPGenes Β-LACTAM Burkina Faso
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文本解读与历史研究——以古藏文中的词语chu Gang、lta zhig、rje blas为例
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作者 南吉加 《青海民族大学学报(藏文版)》 2023年第1期84-100,共17页
古藏文中的chu Gang、lta zhig、rje blas等三个词语,屡次出现在吐蕃时期的石碑文、敦煌文、简牍文等中,在后期的部分《甘珠尔》《丹珠尔》文献中,也以变异或拆解的形式出现多次。通过古藏文学者对此类词语的解读和辨认,解答了chu Gang... 古藏文中的chu Gang、lta zhig、rje blas等三个词语,屡次出现在吐蕃时期的石碑文、敦煌文、简牍文等中,在后期的部分《甘珠尔》《丹珠尔》文献中,也以变异或拆解的形式出现多次。通过古藏文学者对此类词语的解读和辨认,解答了chu Gang、lta zhig、rje blas等三个词语的部分含义。但随着文字考古研究的不断深入,古藏文的文化及阐释语境有了更大的拓展,也给研究古藏文的学者们提供了更全面的阐释空间。比如:古藏文chu Gang一词,在吐蕃时期仅用来表达君臣之间的忠信关系,至后宏时期其意义逐渐延伸,可以指称婚姻里的忠诚与信任,因此不能将其单纯地理解为英勇忠良之意;而lta zhi一词的语义不断虚化,逐渐具有了介词和虚词的功能,其所指也因语句搭配而发生变化,一味地将其解释为“他”或“他本人”是不准确的;通过词语考究和语素分析发现,rje dlas一词中的“rje”指的是君王,而“dlas”(藏文dlas后来作slas)则指帐中亲信,因此,rje dlas一词可以用来表达忠诚侍奉君王的一种责任和义务,rje dlas一词的这一含义也被后来的历史叙事所继承,部分教法史在叙述“六大决议法”(bkav gros chen mo)时,常以“保护赞普,不遗余力地侍奉”(rjevi sku vtsho zhing zho sha blar dbul)来扩解rje dlas一词。 展开更多
关键词 古藏文 解读 chu Gang lta zhig rje blas
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真核表达与原核表达的德国小蠊变应原Bla g 2蛋白结构的光谱学研究 被引量:12
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作者 刘志刚 朱健琦 +1 位作者 黄海珍 徐宏 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2006年第5期879-883,共5页
在基因工程技术中,采用原核表达系统获得的重组蛋白是以包涵体的形式存在,在细胞内聚集成无生物活性的不溶性颗粒,而采用真核表达系统收获的蛋白已经是经过正确的体内折叠的活性蛋白。文章分别用真核与原核表达系统表达重组变应原,通过... 在基因工程技术中,采用原核表达系统获得的重组蛋白是以包涵体的形式存在,在细胞内聚集成无生物活性的不溶性颗粒,而采用真核表达系统收获的蛋白已经是经过正确的体内折叠的活性蛋白。文章分别用真核与原核表达系统表达重组变应原,通过对不同来源目的蛋白的荧光光谱和CD谱的比较和分析,对真核系统与原核系统表达出的Bla g2蛋白的高级构象进行研究,阐明了Bla g2在溶液中的二级结构,并推断出其三级结构组成类型。 展开更多
关键词 德国小蠊 变应原 bla g 2 真核表达 原核表达 荧光光谱 CD谱
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德国小蠊变应原Bla g 2蛋白变复性的荧光光谱研究 被引量:2
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作者 朱健琦 刘志刚 +2 位作者 黄海珍 朱永烽 徐宏 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2006年第12期2254-2257,共4页
包涵体中的重组蛋白经抽提后可以在变性状态下纯化,而纯化后的复性过程是基因工程下游处理的重要环节。通过对变应原Bla g 2蛋白复性前后荧光光谱的比较和分析、变性剂(尿素和SDS)对复性后Blag 2蛋白的荧光滴定实验、以及复性后Bla g 2... 包涵体中的重组蛋白经抽提后可以在变性状态下纯化,而纯化后的复性过程是基因工程下游处理的重要环节。通过对变应原Bla g 2蛋白复性前后荧光光谱的比较和分析、变性剂(尿素和SDS)对复性后Blag 2蛋白的荧光滴定实验、以及复性后Bla g 2在不同pH下的荧光光谱分析,推断出Bla g 2蛋白分子在不同环境下构象的变化及其光谱学特征,初步建立了一种新的检测重组变应原蛋白变复性的光谱实验方法。 展开更多
关键词 德国小蠊 变应原 bla g 2 变性 复性 荧光光谱
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海马-杏仁核脑深部电刺激术治疗难治性内侧颞叶癫痫长期疗效及其对认知功能的影响
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作者 苏乐 王健 +3 位作者 赵虎林 凌至培 王湘庆 崔志强 《中国现代神经疾病杂志》 CAS 北大核心 2024年第7期540-546,共7页
目的 探讨海马-杏仁核脑深部电刺激术(AH-DBS)治疗难治性内侧颞叶癫痫的长期疗效及其对认知功能的影响。方法 共纳入2014年1月至2018年12月解放军总医院第一医学中心收治的7例难治性内侧颞叶癫痫患者,均行AH-DBS,对比手术前后癫痫发作... 目的 探讨海马-杏仁核脑深部电刺激术(AH-DBS)治疗难治性内侧颞叶癫痫的长期疗效及其对认知功能的影响。方法 共纳入2014年1月至2018年12月解放军总医院第一医学中心收治的7例难治性内侧颞叶癫痫患者,均行AH-DBS,对比手术前后癫痫发作形式、发作频率和抗癫痫发作药物应用情况,采用韦氏成人智力量表修订版(WAIS-R)评估认知功能;术后记录刺激参数以及手术相关并发症。结果 共7例患者行双侧AH-DBS 4例,左侧AH-DBS 2例,左侧AH-DBS联合右侧颞前叶切除术1例;经枕部入路6例,经额部入路1例;仅1例患者术后出现头皮切口愈合不良,经局部植皮后痊愈。术后平均随访(73.00±8.98)个月,随访期间复杂部分性发作频率[1.00(0.00,31.00)次/月对2.00(1.50,60.00)次/月;Z=-2.207,P=0.027]、继发性全面性强直-阵挛发作频率[0.00(0.00,1.00)次/月对2.00(1.00,3.00)次/月;Z=-2.428,P=0.015]和总发作频率[1.00(0.50,31.00)次/月对5.00(2.50,64.00)次/月;Z=-2.366,P=0.018]均较术前减少,而手术前后抗癫痫发作药物种类[1.00(1.00,2.00)种对1.00(1.00,3.00)种;Z=-1.633,P=0.102]和WAIS-R评分[(85.50±7.09)分对(89.00±9.47)分;t=-1.761,P=0.078]差异无统计学意义。结论 AH-DBS作为一种新型抗癫痫治疗方法,可以减少难治性内侧颞叶癫痫发作频率,无严重不良事件,且对认知功能无明显影响。 展开更多
关键词 癫痫 颞叶 深部脑刺激法 海马 杏仁核 认知
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穴位灸法对运动时机体血清CK、BLA及运动能力的影响 被引量:33
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作者 史曙生 《南京师大学报(自然科学版)》 CAS CSCD 2002年第1期103-107,共5页
通过对运动员进行穴位施灸处理 ,并以西洋参作为对照 ,观察定量运动时血清CK(肌酸激酶 )及BLA(血乳酸 )含量的变化以及台阶指数的变化 .经过 2个月的施灸处理 ,结果表明艾灸可以明显降低运动时机体血清肌酸激酶 (CK)的活性及血乳酸的含... 通过对运动员进行穴位施灸处理 ,并以西洋参作为对照 ,观察定量运动时血清CK(肌酸激酶 )及BLA(血乳酸 )含量的变化以及台阶指数的变化 .经过 2个月的施灸处理 ,结果表明艾灸可以明显降低运动时机体血清肌酸激酶 (CK)的活性及血乳酸的含量 ,能明显提高机体的台阶指数 .本研究提示 :灸法可以减轻运动性疲劳 ,提高机体的运动能力 . 展开更多
关键词 穴位灸法 机体血清 CK bla 运动能力 艾灸 肌酸激酶 血乳酸 台阶指数 运动性疲劳
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利用交叉组装噬菌体示踪水环境中人源粪便来源的耐药细菌
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作者 段连瑞 段宇婧 +3 位作者 李镇镇 苗泽丰 佘慧 杨涛 《生态毒理学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期100-111,共12页
人类粪便中的耐药细菌(antibiotic resistant bacteria,ARB)及其携带的耐药基因(antibiotic resistance genes,ARGs)可以通过城市污水处理系统排放进入当地水环境,因此,快速准确地探明水环境中粪便污染及ARB情况对于保护生态系统和居民... 人类粪便中的耐药细菌(antibiotic resistant bacteria,ARB)及其携带的耐药基因(antibiotic resistance genes,ARGs)可以通过城市污水处理系统排放进入当地水环境,因此,快速准确地探明水环境中粪便污染及ARB情况对于保护生态系统和居民健康具有重要意义。本研究借助噬菌体crAssphage作为新型人类粪便污染特异性指示标记,采集太原市健康人群粪便、晋阳湖、汾河水库、自来水和污水处理厂的样品,首先采用实时荧光定量PCR技术检测样品中人类粪便污染指示标记crAssphage、细菌核糖体16S rRNA基因与耐药基因bla TEM-1的存在情况;其次针对各类样品进行细菌分离培养与鉴定,完成样品中bla TEM-1耐药菌株及多重耐药细菌的筛选;最后通过构建系统发育树分析菌株的进化关系,探究不同环境介质中细菌之间的相互影响。结果显示crAssphage在晋阳湖、汾河水库和污水处理厂样品中被检出,证明太原市区水环境存在人类粪便污染。本研究共分离鉴定出254株细菌,氨苄青霉素耐药细菌占比最高(74.41%),环丙沙星耐药细菌占比最低(1.97%);耐药基因bla TEM-1在各类样品的菌株中都有检出(22.83%),多重耐药细菌共有79株(31.10%)。进化关系分析表明人体肠道与水环境中的耐药细菌具有亲缘关系。上述结果表明太原市水环境受到人类粪便污染的影响,并且可能促进了ARGs和ARB的传播扩散,对人体健康产生威胁。该研究为评估太原市水环境粪便污染情况及ARB分布提供基础数据,为水环境监测保护给出科学依据。 展开更多
关键词 人类粪便污染 bla TEM-1 crAssphage 多重耐药菌 系统发育树
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面向龙芯3A体系结构的BLAS库优化 被引量:8
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作者 何颂颂 顾乃杰 +1 位作者 朱海涛 刘燕君 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2012年第3期571-575,共5页
双精度普通矩阵乘法DGEMM是BLAS库中最核心的函数之一,大部分三级BLAS库函数的核心计算都是通过调用DGEM M来实现的.该文针对龙芯3A具有128位访存指令的特点,通过理论分析,找到了最佳的循环展开方式;针对龙芯3A的Cache替换策略(随机替... 双精度普通矩阵乘法DGEMM是BLAS库中最核心的函数之一,大部分三级BLAS库函数的核心计算都是通过调用DGEM M来实现的.该文针对龙芯3A具有128位访存指令的特点,通过理论分析,找到了最佳的循环展开方式;针对龙芯3A的Cache替换策略(随机替换),通过使用地址交错技术,减少了Cache的冲突失效;针对龙芯3A访存带宽有限的问题,通过使用共享数据的任务划分方式,减少了数据访存量.优化后的DGEMM单核和多核运算速度均是性能最高的开源BLAS库(Goto-BLAS)的2倍多. 展开更多
关键词 矩阵乘法 blaS 任务划分 LINPACK
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蟑螂主要过敏原Bla g7单克隆抗体的制备与鉴定 被引量:2
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作者 马文静 张伟 +3 位作者 魏继福 张浩 刘成成 何韶衡 《中华临床免疫和变态反应杂志》 2011年第4期253-257,共5页
目的制备蟑螂主要过敏原Blag7的单克隆抗体(mAb)。方法用含编码Blag7基因的大肠杆菌菌株Origami/pGS21a,诱导表达并纯化出Bla g7蛋白,以该蛋白为抗原免疫BALB/c小鼠,运用杂交瘤技术制备抗Bla g7 mAb;通过ELISA、Western blot技术鉴定mA... 目的制备蟑螂主要过敏原Blag7的单克隆抗体(mAb)。方法用含编码Blag7基因的大肠杆菌菌株Origami/pGS21a,诱导表达并纯化出Bla g7蛋白,以该蛋白为抗原免疫BALB/c小鼠,运用杂交瘤技术制备抗Bla g7 mAb;通过ELISA、Western blot技术鉴定mAb的特异性。结果获得2株可稳定分泌抗Bla g7 mAb的杂交瘤细胞,分别命名为Bla g7-1和Bla g7-2;2株单克隆抗体的免疫球蛋白亚类均为IgG1;经间接ELISA法测定,杂交瘤细胞Bla g7培养上清中mAb的效价分别为1:16000和1:8000;Western blot结果表明Bla g7单抗对Bla g7蛋白具有高度特异性。结论成功地诱导表达Bla g7蛋白,并制备出抗Blag7 mAb,为进一步研究蟑螂过敏提供了有用的实验工具。 展开更多
关键词 过敏原 蟑螂(bla g7) 单克隆抗体 免疫印迹
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敦煌古藏文医算卷“人神”喇(bla)禁忌研究 被引量:4
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作者 刘英华 甄艳 银巴 《西北民族大学学报(哲学社会科学版)》 CSSCI 2019年第5期57-67,共11页
敦煌出土的藏文文献涉及医算的写卷Pel.Tib.1044和Pel.Chin.3288中都载有'人神'喇(bla)禁忌的内容。前者只是原则性地提到人神禁忌,后者不仅讲了原则,还罗列了每月30日的人神禁忌。对这两个写本做转录、翻译和必要说明,并与敦... 敦煌出土的藏文文献涉及医算的写卷Pel.Tib.1044和Pel.Chin.3288中都载有'人神'喇(bla)禁忌的内容。前者只是原则性地提到人神禁忌,后者不仅讲了原则,还罗列了每月30日的人神禁忌。对这两个写本做转录、翻译和必要说明,并与敦煌汉文写卷中的人神禁忌内容做比较,对汉、藏文人神禁忌的异同、藏文人神禁忌学说的可能来源以及藏文写卷的历史年代等问题进行研究很有价值。 展开更多
关键词 敦煌藏文写卷 藏传医算 人神喇(bla)禁忌 藏医古籍 外治疗法
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河南省人源和食源多重耐药致泻大肠埃希氏菌耐药特征与基因组分析
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作者 戚浩彧 李艳芬 +5 位作者 王钰 邱正勇 崔莹 吴玲玲 张濛 李永利 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期723-731,共9页
目的了解河南省临床和食品来源中多重耐药的致泻大肠埃希氏菌的耐药性和基因组特征.方法对2017-2022年河南省分离的101株多重耐药致泻大肠埃希氏菌,通过微量肉汤稀释法进行抗生素敏感性实验.基于全基因组测序结果分析其耐药基因、多位... 目的了解河南省临床和食品来源中多重耐药的致泻大肠埃希氏菌的耐药性和基因组特征.方法对2017-2022年河南省分离的101株多重耐药致泻大肠埃希氏菌,通过微量肉汤稀释法进行抗生素敏感性实验.基于全基因组测序结果分析其耐药基因、多位点序列分型、质粒类型并基于核心基因组单核苷酸多态性位点(cgSNPs)构建系统发育树.结果101株多重耐药的致泻大肠埃希氏菌对氨苄西林、四环素、萘啶酸的耐药率最高,分别为87.1%、79.2%、64.4%;对头孢噻肟的耐药率为38.6%.全基因组测序数据表明:101株分离株可被分为60种ST型,其中ST10、ST1491、ST38是优势型别;101株分离株共预测出23种质粒类型,其中携带率最高的类型为IncFIB.分离株携带喹诺酮类、氨基糖苷类、βG内酰胺酶类、四环素类等多种耐药基因,其中超广谱βG内酰胺酶基因bla_(CTX-M-14)和bla_(CTX-M-55)上下游遗传环境中均存在插入序列(IS26、IS903B、ISECP1).结论河南省人源和食源多重耐药的致泻大肠埃希氏菌具有较高的遗传多样性,整体耐药水平较高,其bla_(CTX-M)基因的传播可能与插入序列(IS)有关. 展开更多
关键词 多重耐药致泻大肠埃希氏菌 全基因组测序 耐药性 bla_(CTX-M)
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基于龙芯2F体系结构的BLAS库优化 被引量:13
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作者 顾乃杰 李凯 +1 位作者 陈国良 吴超 《中国科学技术大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期854-859,共6页
在KD-50-I平台上,基于常用优化技术,根据龙芯2F体系结构的特点,在数据预取、指令调度方面,针对高性能计算机系统中能有效解决线性代数问题的子程序集合BLAS,提出了新的优化技术,充分发挥龙芯2F处理器的性能,实现了高性能的BLAS.实际测... 在KD-50-I平台上,基于常用优化技术,根据龙芯2F体系结构的特点,在数据预取、指令调度方面,针对高性能计算机系统中能有效解决线性代数问题的子程序集合BLAS,提出了新的优化技术,充分发挥龙芯2F处理器的性能,实现了高性能的BLAS.实际测试表明,高性能BLAS在750 MHz的龙芯2F处理器(双精度浮点峰值3 Gflops)上HPL实测峰值达到1.47 GHz,比原始BLAS提高了6倍以上,比ATLAS提高了45%. 展开更多
关键词 blaS 龙芯2F KD-50-Ⅰ 数据预取 指令调度
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麻旺鸭源大肠杆菌耐药表型分析及β-内酰胺酶、PMQR基因检测
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作者 金睿妍 张阳 +2 位作者 黄仲舜 冉维 丁红雷 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1738-1746,共9页
本研究旨在了解麻旺鸭源大肠杆菌对β-内酰胺类、氨基糖苷类、四环素类、酰氨醇类、氟喹诺酮类和磺胺类药物的耐药情况以及β-内酰胺酶基因和质粒介导的喹诺酮耐药(plasmid-mediated quinolone resistance, PMQR)基因流行情况。从重庆... 本研究旨在了解麻旺鸭源大肠杆菌对β-内酰胺类、氨基糖苷类、四环素类、酰氨醇类、氟喹诺酮类和磺胺类药物的耐药情况以及β-内酰胺酶基因和质粒介导的喹诺酮耐药(plasmid-mediated quinolone resistance, PMQR)基因流行情况。从重庆市酉阳县4个麻旺鸭养殖场采集146份泄殖腔拭子样品,经选择性增菌和PCR扩增大肠杆菌特异性phoA基因分离鉴定大肠杆菌。采用纸片扩散法测定分离菌对25种抗菌药物的耐药性并检测分离菌株中的β-内酰胺酶基因和PMQR基因。结果显示:共分离到大肠杆菌146株。这些菌株对氨苄西林、头孢唑啉耐药严重,耐药率超过50%;对庆大霉素、阿米卡星、氧氟沙星完全敏感。分别有111株(76.0%)和83株(56.8%)菌携带至少1种β-内酰胺酶基因和PMQR基因,其中bla_(TEM)(74.0%,108/146)和qnrS(54.8%,80/146)基因最为流行。63株菌同时携带β-内酰胺酶基因和PMQR基因。麻旺鸭源大肠杆菌对常用抗菌药物存在耐药,且广泛携带β-内酰胺酶基因和PMQR基因。 展开更多
关键词 大肠杆菌 麻旺鸭 药物敏感性 PCR bla_(TEM) qnrS
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慢性内脏痛及诱发负性情绪的神经回路研究进展
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作者 常晓丽 张海燕 +1 位作者 张丽丽 陈少宗 《中国疼痛医学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第1期57-62,共6页
慢性内脏痛及其诱发的负性情绪严重影响了病人的生活质量,并产生巨大的社会经济负担。然而,与其相关的神经回路和机制仍是尚未解决的生命科学难题。前扣带回和杏仁核是处理啮齿类动物和人类慢性疼痛感觉和情绪成分的核心脑区,因此,本文... 慢性内脏痛及其诱发的负性情绪严重影响了病人的生活质量,并产生巨大的社会经济负担。然而,与其相关的神经回路和机制仍是尚未解决的生命科学难题。前扣带回和杏仁核是处理啮齿类动物和人类慢性疼痛感觉和情绪成分的核心脑区,因此,本文以慢性内脏痛中功能性胃肠疾病(肠易激综合征)为例,重点围绕上述核团,从神经回路水平,总结并分析肠易激综合征啮齿类动物模型内脏痛及诱发负性情绪脑回路的最新发现。同时还讨论了今后该研究领域相关的重要研究方向,为揭示慢性内脏痛及诱发负性情绪的机制研究提供新线索。 展开更多
关键词 慢性内脏痛 负性情绪 前扣带回 杏仁核
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