Anal swab findings in an infant with COVID-19

Introduction: The transmission pathways of coronavirus disease 2019 (COVID-19) remain not completely clear. In this case study the test for the novel severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) in pharyngeal swab and anal swab were compared.Case presentation: A 3-month-old girl was admitted to our hospital with COVID-19. Her parents had both been diagnosed with COVID-19. The results of pharyngeal swab and anal swab of the little girl were recorded and compared during the course of the disease. The oropharyngeal specimen showed negative result for SARS-CoV-2 on the 14th day after onset of the illness. However, the anal swab was still positive for SARS-CoV-2 on the 28th day after the onset of the illness.Conclusion: The possibility of fecal-oral transmission of COVID-19 should be assessed. Personal hygiene during home quarantine merits considerable attention.

鸡传染性贫血(CIA)活疫苗免疫肛拭子排毒规律

为调查鸡传染性贫血(CIA)活疫苗免疫后的排毒规律,本研究在隔离器中免疫CIAV活疫苗,免疫后每隔一周采集肛拭子,持续采样至第7周,检测CIAV疫苗的排毒阳性率。结果显示:CIAV疫苗免疫后第10天排毒率为50%,免疫后第2周排毒率达到高峰为80%,免疫后第6周排毒率下降至27.27%,第7周不排毒,本研究为CIAV感染的监测提供了数据支持。

血液肿瘤患者肛拭子耐碳青霉烯类肠杆菌目主动筛查情况及继发血流感染的影响因素

目的 探讨血液肿瘤患者肛拭子耐碳青霉烯类肠杆菌(CRE)主动筛查情况及继发血流感染的影响因素。方法 选取2020年9月—2022年6月在苏州大学附属第一医院治疗的血液肿瘤患者1 258例,所有患者行肛拭子CRE主动筛查,分析CRE定植分布、血流感染情况及其影响因素。结果 共检出CRE 109株,以肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌为主;10例患者发生CRE血流感染;CRE酶型分布中,主要以NDM、KPC为主;有中性粒细胞缺乏患者CRE定植发生率高于无中性粒细胞缺乏患者(P<0.05);有消化道症状患者CRE定植发生率高于无消化道症状患者(P<0.05);多因素逐步Logistic回归分析结果显示,中性粒细胞缺乏■是血液肿瘤患者CRE定植发生的影响因素(P<0.05)。不同性别、年龄、疾病类型及有无中性粒细胞缺乏、消化道症状患者的血流感染发生率比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 血液肿瘤患者肛拭子CRE主动筛查能有效筛出CRE感染者,CRE定植感染与中性粒细胞缺乏有关,临床应加以重视。

咽拭子联合肛拭子作为ICU多重耐药菌入院筛查的有效性评估

目的评估咽拭子联合肛拭子作为重症监护室(ICU)患者多重耐药菌(MDRO)入院筛查的有效性,为医院感染防控策略提供参考依据。方法选取上海地区某院2022年8月1日—12月31日入住ICU 24 h内进行咽拭子联合肛拭子MDRO入院筛查的患者作为试验组,2021年8月1日—12月31日入住ICU 24 h内进行咽拭子MDRO入院筛查的患者作为对照组。比较两组MDRO的入院筛查阳性率、医院感染情况、菌株种类,以及试验组MDRO联合入院筛查的灵敏度及特异度。结果共纳入917例患者,其中试验组442例,对照组475例。试验组与对照组患者MDRO入院筛查阳性率分别为7.40%、3.37%,试验组与对照组患者MDRO医院感染发病率分别为2.71%、5.68%,试验组与对照组患者消化系统MDRO医院感染发病率分别为0.68%、2.32%,差异均有统计学意义(均P<0.05)。咽拭子联合肛拭子的入院筛查方式对预测患者MDRO医院感染的受试者工作特征(ROC)曲线下面积为0.897(P<0.01,95%CI:0.802~0.993);试验组咽拭子联合肛拭子MDRO入院筛查灵敏度为72.73%,特异度为97.65%。结论咽拭子联合肛拭子可以作为ICU MDRO的入院筛查手段,具有重要的临床应用价值。

细菌性食物中毒的微生物学检验结果分析

目的分析细菌性食物中毒的微生物学检验结果。方法选择102例细菌性食物中毒患者为对象,收集患者呕吐物、肛拭子、粪便、可疑剩余食物等标本检测致病菌,分析各致病菌的检出情况。结果102例细菌性食物中毒患者的主要致病菌为副溶血性弧菌,占32.35%,其次为中毒致泻性大肠细菌,占20.59%。患者多见于农村宴席,占37.25%,其次为集体食堂,占30.39%;送检样本中肛拭子致病菌检出率最高,占91.18%。结论细菌性食物中毒主要致病菌为副溶血性弧菌、中毒致泻性大肠细菌,农村宴席为好发地,且肛拭子致病菌检出率最高。

显色培养基与SS培养基对从业人员肛拭标本及食品中沙门菌检测的对比分析

目的对比分析显色培养基与SS培养基对从业人员肛拭标本及食品中沙门菌检测的灵敏性和特异性。方法将2 739份从业人员肛拭样品及297份食品增菌后分别接种显色培养基和SS培养基分离培养,结果进行对比分析。结果 2 739份肛拭样品中,显色培养基挑选紫色疑似菌落72株,检出沙门菌15株,SS培养基挑选疑似菌落43株,检出沙门菌17株,敏感性分别为88.24%和100.00%,特异性分别为97.91%和99.04%;297份食品中,显色培养基挑选紫色疑似菌落44株,检出沙门菌36株,SS培养基挑选疑似菌落42株,检出沙门菌36株,敏感性均为100.00﹪,特异性分别为96.93%和97.70%。结论 SS培养适用于从业人员肛拭标本及基层大量的日常检测工作;显色培养基适用于食品及突发公共卫生事件的快速检测。实验室检测中,培养基的应用应根据检测样品的种类来选择。

东莞市新型冠状病毒肺炎患者不同部位标本病毒核酸检测阳性率比较

目的比较新型冠状病毒肺炎患者咽拭子和肛拭子标本病毒核酸检测阳性率。方法采集东莞市确诊新型冠状病毒肺炎患者的咽拭子标本408份,肛拭子标本128份,其中同一患者、同一时间咽拭子、肛拭子各87人份,用实时荧光RT-PCR进行病毒核酸检测,采用χ^2检验比较两种不同采集部位标本的阳性率。结果 87人份的咽拭子标本和肛拭子标本的病毒核酸检测阳性数分别为18份和27份,阳性率分别为20.7%和31.0%,阳性率比较差异无统计学意义(χ^2=2.428,P>0.05)。结论采集新型冠状病毒肺炎患者咽拭子或者肛拭子标本对新型冠状病毒检测阳性率无明显影响。

奥密克戎BA.2变异株感染者不同部位样本核酸阴转时间及影响因素分析

目的分析严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)奥密克戎BA.2变异株感染者不同部位样本的核酸阴转时间及其影响因素。方法采用实时荧光PCR序贯检测海军军医大学(第二军医大学)第一附属医院217例确诊为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)且基因测序确认病毒株为奥密克戎BA.2变异株患者的鼻咽拭子、痰液和肛拭子SARS-CoV-2核酸,比较不同部位样本核酸阴转时间。采用分层分析及多元线性回归分析法探讨不同部位样本核酸阴转时间的影响因素。结果217例COVID-19确诊患者的年龄为32.0(24.0,50.5)岁,男128例(59.0%)、女89例(41.0%);无症状感染者8例(3.7%)、轻型184例(84.8%)、普通型21例(9.7%)、重型3例(1.4%)、危重型1例(0.5%);接受莫努匹韦抗病毒治疗者70例(32.3%)。鼻咽拭子、痰液和肛拭子的SARS-CoV-2核酸阴转时间分别是13.0(11.0,17.0)、16.5(13.0,21.0)、10.0(5.3,11.0)d,两两比较差异均有统计学意义(P均<0.001)。年龄≥60岁、合并基础疾病尤其是高血压、冠状动脉疾病或神经系统疾病、临床分型为普通型是鼻咽拭子标本核酸阴转时间延长的危险因素;男性、合并基础疾病是痰液标本核酸阴转时间延长的危险因素;男性是肛拭子标本核酸阴转时间延长的危险因素。多元线性回归分析显示,临床分型为危重型是鼻咽拭子SARS-CoV-2核酸阴转时间延长的独立危险因素(P<0.05),男性和合并基础疾病是痰液核酸阴转时间延长的独立危险因素(P均<0.05)。结论在奥密克戎BA.2变异株感染患者中,痰液标本核酸阳性持续时间最长、肛拭子最短;男性、合并基础疾病患者痰液标本核酸阴转时间较长。

新型冠状病毒肺炎患者恢复期肛拭子中SARS-CoV-2核酸检测结果评价

目的分析新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者在恢复期肛拭子标本中新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸的检出率及其临床价值。方法对我院确诊的COVID-19患者痰液、咽拭子和肛拭子3种来源的标本同期进行SARS-CoV-2核酸检测。分析3种标本类型的病毒核酸阳性率及肛拭子病毒核酸阳性时痰液标本和咽拭子标本中病毒核酸检出情况。结果共收集50例COVID-19患者的156份样本,其中痰液标本41份,检出SARS-CoV-2阳性8份(19.5%);咽拭子标本55份,检出SARS-CoV-2阳性6份(10.9%);肛拭子标本60份,检出SARS-CoV-2阳性11份(18.3%)。50例COVID-19患者在恢复期出现病毒核酸阳性者痰液、咽拭子和肛拭子样本核酸检测阳性分别有8例(19.5%)、6例(12.0%)和10例(20.0%)。10例肛拭子核酸检测阳性患者的呼吸道标本核酸检测显示9例为阴性。结论COVID-19患者恢复期肛拭子SARS-CoV-2核酸阳性检出率较咽拭子和痰液标本检出率稍高。患者恢复期的呼吸道标本SARS-CoV-2核酸连续检测阴性时,应考虑添加肛拭子检测作为出院或者隔离标准。

酶免法检测从业人员伤寒杆菌抗原及临床意义

目的:探讨伤寒杆菌抗原酶免法(ELISA)在伤寒早期诊断中的应用价值。方法:抽取检测对象静脉血,用酶免法检测血清中伤寒杆菌抗原,同时运用肛拭采便作增菌培养,参照GB16001-1995《伤寒、副伤寒诊断标准及处理原则》方法进行伤寒杆菌分离与生化鉴定。结果:酶免法检测从业人员5819人份血清,检出伤寒杆菌抗原阳性205份,检出率为3.5%;肛拭培养5819人份,检出11株伤寒杆菌,检出率为0.2%;ELISA法检出率显著高于肛拭培养(P<0.01)。结论:伤寒杆菌抗原酶免法特异性较差,阳性结果提示可能存在伤寒杆菌或伤寒抗原,但敏感性高,阴性结果可靠,可作为伤寒杆菌带菌者的监测方法,在早期发现带菌者上具有一定的临床意义。

沙门氏菌优化检测方法在预防性体检肛拭子检验中的应用

目的探析沙门氏菌的优化检测方法对于预防性体检流程中的肛拭子检验项目的应用价值。方法方便选取2016年4—9月于该中心接受预防性体检的500名食品卫生业从业者的肛拭子标本为研究对象,在相同环境下进行常规SF+SS检验及优化SBG+XLD检验,对比常规检验的检出率和优化检验的检出率。结果 SBG联合XLD优化检测法检出率为2.60%(13/500),SF联合SS常规检测法的检出率为0.80%(4/500),优化检测法检验效果优于常规检测法,同时组间对比差异有统计学意义(P<0.05)。结论相较于SF联合SS常规检测法,SBG联合XLD优化检测法在沙门氏菌预防性体检肛拭子检验中具有显著优良性,更值得应用,可予以推广。

泉州市50家蛋糕店从业人员肛拭子标本沙门氏菌携带现况及菌型分析

目的:通过研究深入了解蛋糕店工作人员沙门氏菌携带状况,并对相关菌型加以分析,严格把关食品安全,从源头上切断病菌传播链,保障公共卫生安全。方法:采集6783份2019年1月-2021年12月泉州市50家蛋糕店从业人员预防性健康体检肛拭子标本,结合传统培养法、荧光PCR法检测所选标本。结果:50家蛋糕店检测6783份沙门氏菌肛拭子标本,测得阳性标本28株,检出率为0.41%,其中男15例,检出率0.50%,女13例,检出率0.34%;不同性别检出率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。从年龄分布上看,从业人员主要是青年,其次为中年,青年与中年沙门氏菌检出率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。从事不同工种的从业人员,沙门氏菌检出率略有不同,且差异无统计学意义(P>0.05)。从全年检测结果来看,阳性菌株主要集中在7月、5月、8月和10月,其中10月份最高,阳性检出率为0.87%。检出的28份标本中,包含5个菌群,8个血清型;在5个菌群中,其中B群9株(32.14%),D群8株(28.57%),E4群6株(21.43%),E1群4株(14.29%),C1群1株(3.57%)。在8个血清型中,肠炎沙门氏菌有8株,占比最高,为28.57%,随后依次是山夫登堡沙门氏菌、阿贡纳沙门氏菌、德尔卑沙门氏菌、火鸡沙门氏菌、伦敦沙门氏菌、乙型副伤寒沙门氏菌,纳米比亚沙门氏菌占比最低。结论:50家蛋糕店从业人员沙门氏菌携带率比较高,食品安全隐患仍然存在,需要加强从业人员健康检查和店铺日常卫生监管,规范操作流程,确保食品安全,保障大众健康。

食源性疾病诺如病毒检测情况分析

目的分析食源性疾病肛拭子样品诺如病毒检出情况。方法食源性疾病事件发生后,经疾控中心食品安全风险科流调人员调查,发病人员怀疑诺如病毒感染。2021年1—12月,检验科采样人员对患者及相关人员进行肛拭子样品采集,进行实时荧光PCR检测诺如病毒。对检测结果进行分析。结果在食源性疾病暴发事件中共调查出怀疑诺如病毒感染事件12起,有7起事件检出诺如病毒。结论食源性疾病暴发事件中,人员多聚集发病后,排除食物中毒,症状、体征符合诺如病毒感染的病例,要尽快采集相关人员肛拭子样品进行诺如病毒检测,早发现、早治疗、早控制、早处置,控制疫情发展。

2014-2017年百色市田林县手足口病流行病学分析

目的:探讨田林县小儿手足口病流行情况。方法:分析2014-2017年田林县手足口病患儿的临床诊治资料,总结流行病学特点及病原学。结果:患儿平均年龄(2.41±0.34)岁,重症94例(1.68%),死亡3例(0.537%)。COXA16病毒55例(21.5%),EV71病毒67例(26.2%),其他肠道病毒84例(32.9%)。死亡3例,全为EV71型。结论:手足口病的发病与患儿年龄、性别、季节等因素有关。重症、死亡病例与病原学相关。

护理干预对从业人员肛拭采样检验结果的影响研究

目的 探讨人性化护理对从业人员体检肛拭采样结果的影响.方法 选择2012年1至12月份在我所门诊进行体检的39874例从业人员为研究对象,分为常规对照组19899例和人性化护理干预组19975例,常规对照组进行肛拭采样时给予常规护理,人性化护理干预组体检人员则在常规护理的基础上进行人性化护理干预,比较两组肛拭采样结果.结果 常规对照组肛拭采样一次成功率98.86％,阳性检出率为1.01‰,而人性化护理干预组肛拭采样一次成功率99.65％,阳性检出率为2.53‰.经统计分析,护理干预组的肛拭采样一次成功率明显比常规护理高,其差异有统计学意义（P＜0.05）.采样成功率以及阳性检出率在不同性别的变量上没有统计学意义,在不同年龄阶段的变量上有统计学意义（P＜0.01）.结论 人性化护理干预有利于提高肛拭采样成功率,提高阳性检出率,提高体检人员满意度,保障从业人员及公众健康.

2010年江苏省肉鸡沙门菌污染专项监测分析

目的了解肉鸡养殖和屠宰过程中沙门菌的污染状况,为确定从生产到销售各环节沙门菌分布和疾病可能传染源、制定公共卫生措施并评价其有效性提供科学依据。方法按照《全国食源性致病菌监测工作手册》中专项监测的采样和实验室检测要求,2010年共采集活体肉鸡肛拭样本210份,胴体样本204份,监测沙门菌污染情况。结果肛拭样本检出沙门菌23份,检出率10.95%;胴体样本检出沙门菌71份,检出率34.80%。两类样本的血清学分型构成比不同(χ2=15.7,P<0.001),肛拭样本检出的23株沙门菌中有22株印第安纳沙门菌,胴体样本中检出的71株沙门菌中有35株为印第安纳沙门菌,22株为奥尔巴尼沙门菌。结论肉鸡活体肛拭和胴体样本沙门菌检出率差异有统计学意义(χ2=33.5,P<0.001),胴体高于活体检出率,活体和胴体的沙门菌来源不同,胴体可能存在交叉污染。

肉鸡饲养加工过程中沙门菌污染环节的探讨与分析

目的探讨开封市肉鸡从孵化、养殖,到屠宰、加工、运输和销售各环节样品沙门菌污染状况。方法采集2012年4个季度开封地区种鸡养殖场、肉鸡孵化场、养殖场、屠宰场和大型超市中土壤、饲料、鸡粪、鸡肉、屠宰工具、工人手等18个环节共802份样品。按照GB 4789.4—2010进行沙门菌鉴定和血清学分型,用SPSS 17.0软件对数据进行统计分析。结果脱毛池水中沙门菌检出率最高为75%,其次成鸡粪便、鸡肉、刀具案板、肛拭子中沙门菌检出率分别为58.3%、49.4%、33.3%、5.6%,鸡胚和运输车辆中未检出沙门菌。本研究共检出6个血清型,以肠炎沙门菌和印第安纳沙门菌检出率最高;第二季度沙门菌菌型数最多。结论鸡肉屠宰加工过程使沙门菌污染扩大,脱毛机及脱毛池水是沙门菌交叉污染的关键点,不同季节的检出率差异无统计学意义(P>0.05)。

常州市51例新型冠状病毒肺炎病例咽拭子和肛拭子标本核酸检测结果比较

目的分析新型冠状病毒肺炎(Corona virus disease 2019,COVID-19)患者不同标本类型核酸检测结果。方法以常州市第三人民医院2020年1月30日-2020年2月23日51例临床诊断为COVID-19患者为研究对象,收集采集的肛拭子及咽拭子标本,采用双重实时荧光定量多聚酶链反应(Dual Quantitative real-time polymerase chain reaction,Dual qPCR)检测新型冠状病毒(SARS-CoV-2),比较两种标本类型病毒核酸检出率。结果51例患者中,咽拭子标本检出率为56.86%,肛拭子标本检出率为21.57%,两种样本检出率差异具有统计学意义(P<0.05)。咽、肛拭子同时检出者与咽拭子检出、肛拭子未检出者ORFlab基因及N基因核酸扩增Ct值比较差异均无统计学意义。观察咽拭子和肛拭子同时检出SARS-CoV-2的患者,发现有7例病例是首先在咽拭子中检出SARS-CoV-2,数天后(6.44±5.68,中位数7天)在肛拭子中检出。结论咽拭子标本与肛拭子标本均可有效检测SARS-CoV-2,两者同时检测可提高SARS-CoV-2病原学诊断率,建议同时采集咽拭子和肛拭子;通过分析咽拭子、肛拭子标本检出时间差,为实验室采集SARS-CoV-2标本时机提供参考。

不同严重程度新型冠状病毒肺炎患者肛拭子核酸检测阳性率及临床特点分析

目的分析不同病情严重程度新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)患者肛拭子标本2019新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测阳性率及临床特点。方法回顾性分析2020年2月至3月连云港市第一人民医院收治的18例新冠肺炎确诊患者临床资料,按病情严重程度分为普通型组(11例)和危重症组(7例)。分析并比较两组性别、年龄、流行病学特点、入院后发热时间、有无基础疾病、入院及2次咽拭子2019-nCoV核酸检测阴性后肛拭子阳性率的差异。结果两组性别、年龄和入院后发热时间及有无基础疾病等差异均无统计学意义。危重症组入院时肛拭子2019-nCoV核酸阳性例数明显多于普通型组(例:4比1,P=0.047),2次咽拭子核酸检测阴性后,危重症组肛拭子阳性例数仍多于普通型组(例:2比0),但差异无统计学意义(P=0.137);危重症组非本地感染者较普通型组明显增多(例:4比0,P=0.011),4例非本地感染者均有武汉旅居史。结论肛拭子2019-nCoV核酸阳性可能预示更严重的病情,仅仅以两次咽拭子核酸阴性作为危重症患者转出隔离病房标准可能有风险;在武汉感染后返回当地的患者病情可能更严重。

肉猪养殖和屠宰环节沙门菌污染状况监测分析

目的了解开封市肉猪养殖屠宰加工过程中沙门菌的污染状况。方法采集不同来源的养殖场猪混合粪便、成年猪肛拭子、胴体涂抹物、肠系膜淋巴结样本,共187份,按照GB 4789.4—2010进行沙门菌的分离和鉴定。结果猪混合粪便沙门菌检出率为4.5%,肛拭子沙门菌的检出率为16.4%,胴体涂抹物沙门菌检出率为34.5%,肠系膜淋巴结沙门菌检出率为27.3%。不同季节的检出率差异有统计学意义(P<0.05)。阳性分离株分布于沙门菌的5个群,共14个血清型,以阿贡纳沙门菌和德尔卑沙门菌为主。结论屠宰环节是沙门菌交叉污染的关键点,应采取综合措施,有效控制猪肉沙门菌污染。