目的:运用网络药理学和分子对接探讨安度更年丸治疗围绝经期综合征(perimenopausal syndrome,PMS)的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systemspharmacology database and analysis platfo...目的:运用网络药理学和分子对接探讨安度更年丸治疗围绝经期综合征(perimenopausal syndrome,PMS)的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systemspharmacology database and analysis platform,TCMSP)和BATMAN-TCM数据库获取安度更年丸组方中药的活性成分及相关靶点。通过GeneCards数据库和Drugbank数据库检索PMS疾病靶点。将安度更年丸组方中药活性成分相关靶点与PMS疾病靶点导入韦恩图制作平台,取交集即为安度更年丸治疗PMS的潜在靶点。将潜在靶点及其对应的活性成分、中药及疾病输入Cytoscape3.7.2软件构建“安度更年丸-活性成分-潜在靶点-PMS”网络图并进行拓扑分析筛选主要活性成分及核心靶点。将潜在靶点导入STRING网站获得蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并采用Cytoscape3.7.2软件进行可视化。将潜在靶点导入DAVID数据库进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析。利用Autodock Tools 1.5.6软件将小分子关键成分与靶点蛋白大分子进行对接。结果:安度更年丸活性成分83个,相关靶点586个,PMS相关靶点215个,安度更年丸治疗PMS的潜在靶点71个。“安度更年丸-活性成分-潜在靶点-PMS”网络拓扑分析发现槲皮素、山柰酚及前列腺素G/H合成酶1(prostaglandin G/H synthase 1,PGR)、雌激素受体1(Estrogen receptor 1,ESR1)等为主要活性成分与核心靶点。PPI网络拓扑分析发现17个关键靶点。GO功能富集分析得到433个生物学过程,60个分子功能,42个细胞组分;KEGG信号通路富集分析筛选出100条信号通路。分子对接显示靶蛋白与化合物结合活性良好。结论:安度更年丸可能从多成分、多靶点、多通路来治疗围绝经期综合征。展开更多
文摘目的:运用网络药理学和分子对接探讨安度更年丸治疗围绝经期综合征(perimenopausal syndrome,PMS)的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systemspharmacology database and analysis platform,TCMSP)和BATMAN-TCM数据库获取安度更年丸组方中药的活性成分及相关靶点。通过GeneCards数据库和Drugbank数据库检索PMS疾病靶点。将安度更年丸组方中药活性成分相关靶点与PMS疾病靶点导入韦恩图制作平台,取交集即为安度更年丸治疗PMS的潜在靶点。将潜在靶点及其对应的活性成分、中药及疾病输入Cytoscape3.7.2软件构建“安度更年丸-活性成分-潜在靶点-PMS”网络图并进行拓扑分析筛选主要活性成分及核心靶点。将潜在靶点导入STRING网站获得蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并采用Cytoscape3.7.2软件进行可视化。将潜在靶点导入DAVID数据库进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析。利用Autodock Tools 1.5.6软件将小分子关键成分与靶点蛋白大分子进行对接。结果:安度更年丸活性成分83个,相关靶点586个,PMS相关靶点215个,安度更年丸治疗PMS的潜在靶点71个。“安度更年丸-活性成分-潜在靶点-PMS”网络拓扑分析发现槲皮素、山柰酚及前列腺素G/H合成酶1(prostaglandin G/H synthase 1,PGR)、雌激素受体1(Estrogen receptor 1,ESR1)等为主要活性成分与核心靶点。PPI网络拓扑分析发现17个关键靶点。GO功能富集分析得到433个生物学过程,60个分子功能,42个细胞组分;KEGG信号通路富集分析筛选出100条信号通路。分子对接显示靶蛋白与化合物结合活性良好。结论:安度更年丸可能从多成分、多靶点、多通路来治疗围绝经期综合征。
