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A novel mutation, Y255X, of the ARSB gene in a Chinese family with mucopolysaccharidosis type Ⅵ 被引量:1
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作者 林青雲 陳安琪 +4 位作者 赖志刚 陳偉雄 陳恩和 石志忠 湯瑞芬 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2004年第12期1850-1852,共3页
关键词 mucopolysaccharidosis · arsb gene · mutation analysis
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Maroteaux-Lamy综合征的ARSB基因分析及新突变的致病性鉴定
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作者 郭东炜 谢杰 +5 位作者 潘伟绵 唐佳 艾阳 李荣 杜敏联 郭奕斌 《中山大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期844-853,共10页
【目的】对7家拟诊为Maroteaux_Lamy综合征(MPSⅥ)的患儿及其父母进行ARSB基因的突变检测和新突变的致病性鉴定,以揭示其分子发病机制,为将来的产前/植入前基因诊断等创造前提条件。【方法】在临床初诊及GAG尿检和MPS酶检的基础上,抽取... 【目的】对7家拟诊为Maroteaux_Lamy综合征(MPSⅥ)的患儿及其父母进行ARSB基因的突变检测和新突变的致病性鉴定,以揭示其分子发病机制,为将来的产前/植入前基因诊断等创造前提条件。【方法】在临床初诊及GAG尿检和MPS酶检的基础上,抽取患儿及其父母EDTA抗凝血,进行ARSB基因的PCR扩增和Sanger测序。对所发现的新突变,在经HGMD、1000G和ExAC等数据库核实排查后,首先用SWISS-MODEL软件分析、比对突变蛋白和正常蛋白的空间构象,然后用Clustal X软件分析跨物种氨基酸的保守性,用PROVEAN、SIFT、PolyPhen-2软件预测新突变的致病性,最后用ACMG标准对新突变的致病性进行综合分析鉴定。【结果】1)7个家系先证者的基因检测结果分别为:No1:c.574T> C,p.C192R纯合错义突变;No2:c.160G> A/p.D54N(来自其母)和c.1197C> G/p.F399L(来自其父)的复合杂合子;No3:仅检出c.1072G> A/p.V358M和IVS5 as(-27)A>C变异,但酶检和临床表型符合Ⅵ型;No4:为c.281C> T,p.S94L(新突变,来自其母)和IVS5 as(-27)A> C(来自其父)的复合杂合子;No5:为c.1197 C> G,p.F399L纯合错义突变;No6:为c.1197 C> G,p.F399L(来自其母)和c.1379 C> T,p.S460F(新突变,来自其父)的复合杂合子;No7:为c.499 G> A,p.G167R(来自其父)和c.1325C>T,p.T442M(来自其母)的复合杂合子。2)新突变鉴定结果:对正常ARSB酶蛋白和p.S94L突变酶蛋白的空间构象的预测比对结果显示,两者有明显区别;跨物种保守性分析结果显示,p.94突变点所在氨基酸(S)在物种进化过程中具有高度保守性;PROVEAN、SIFT和PolyPhen-2软件对p.S94L预测结果分别为:Deleterious、Damaging和Probably damaging。用上述方法对p.S460F的预测结果及ACMG的综合分析结果也显示该突变可能是致病性的。【结论】1)家系4的p.S94L和家系6的p.S460F新突变可能都是新的致病性突变,有可能都是引起患儿发病的内在原因之一。2)家系1,2,5,6,7可以确诊为MPS Ⅵ型,其基因型和表现型具有显著的相关性,家系3虽经酶检确诊,临床症状和尿检结果也都与MPS Ⅵ型符合,但却未能在DNA水平查到明确的突变类型,其表现型与基因型的相关性还有待进一步证实。 展开更多
关键词 Maroteaux_Lamy综合征 arsb基因 新突变 致病性鉴定
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土壤中耐砷细菌的筛选和砷还原基因多样性分析 被引量:8
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作者 陈倩 苏建强 叶军 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2011年第12期1919-1926,共8页
采用琼脂平板培养法从湖南富砷土壤中筛选出43株耐砷细菌。16S rRNA序列分析结果表明所筛选菌分属于四个门:Actinobacteria、Proteobacteria、Firmicutes、Bacteroidetes,其中71.1%为革兰氏阳性菌。通过PCR和克隆测序等方法检测耐砷菌... 采用琼脂平板培养法从湖南富砷土壤中筛选出43株耐砷细菌。16S rRNA序列分析结果表明所筛选菌分属于四个门:Actinobacteria、Proteobacteria、Firmicutes、Bacteroidetes,其中71.1%为革兰氏阳性菌。通过PCR和克隆测序等方法检测耐砷菌的砷还原相关基因(arrA、arsC、arsB/ACR3)及其基因多样性。检测结果显示:43株菌中,6.9%含异化砷还原基因arrA,30.2%含细胞质砷还原基因arsC,27.9%含As(III)运载蛋白基因arsB/ACR3,这些基因在细菌中的出现频率较低。通过Mega软件构建系统发育树发现arrA基因的多样性可能受一定的地域差异影响,arsC基因在一些菌株中存在着基因水平转移现象,同时表明α变形菌可能更倾向于拥有Acr3型As(III)载体蛋白,而arsB则多出现在芽孢杆菌中。 展开更多
关键词 耐砷菌 异化砷还原基因arrA 细胞质砷还原基因arsC As(III)运载蛋白基因arsb/ACR3 基因多样性
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Interaction of arylsulfatases A and B with maspin: A possible explanation for dysregulation of tumor cell metabolism and invasive potential of colorectal cancer 被引量:1
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作者 Zsolt Kovacs Ioan Jung +3 位作者 Krisztina Szalman Laura Banias Tivadar Jr Bara Simona Gurzu 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2019年第23期3990-4003,共14页
BACKGROUND Although it has been shown that arylsulfatases are lost in colorectal cancer(CRC)cell lines,their exact role in the carcinogenesis and behavior of this cancer was not elucidated.No data about the correlatio... BACKGROUND Although it has been shown that arylsulfatases are lost in colorectal cancer(CRC)cell lines,their exact role in the carcinogenesis and behavior of this cancer was not elucidated.No data about the correlation between serum and immunohistochemical(IHC)level of arylsulfatases(ARSA,ARSB)in patients with CRC were published yet.AIM To evaluate the possible prognostic value of ARSA and/or ARSB in CRC,at circulating and protein levels.METHODS The present study included 45 consecutive patients who were prospectively diagnosed with CRC.For IHC stains(protein expression)ARSA,ARSB and maspin expression were quantified.For these markers,cytoplasmic expression was taken into account.For gene expression study,circulating mRNA was isolated from all patients,before surgery.A group of 45 healthy patients without inflammatory or tumor pathologies was used as control group.Reverse transcription and Taqman Gene Expression Array were used for ARSB gene expression.RESULTS The preoperative circulating RNA level of the ARSB gene was significantly decreased in patients with CRC(RQ<1),compared with the control group(RQ>1).A more significant decrease(RQ<0.5)occurred in ulcero-infiltrative maspinpositive adenocarcinomas,with a higher degree of tumor budding,diagnosed in locally advanced stages(pT3/4).ARSA/maspin immunopositivity indicated a higher risk for lymph node metastasis,while triple positivity for maspin/ARSA/ARSB and ARSB gene expression level<0.5 were indicators of CRC aggressive behavior,independent of lymph node status.CONCLUSION The significant independent negative prognostic factors of CRC are the ulceroinfiltrative aspect,high budding degree,triple positivity for maspin,ARSA and ARSB,and low ARSB gene expression. 展开更多
关键词 ARYLSULFATASE MASPIN COLORECTAL cancer arsb gene Blood Tissue
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溶氧浓度调控嗜水气单胞菌的砷还原:效应与机制
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作者 尹浩均 龙明亮 +3 位作者 刘维 倪春林 李芳柏 吴云当 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2023年第2期381-387,共7页
砷是一种强致癌有毒类金属元素,广泛存在于自然水体环境之中。微生物还原As(Ⅴ)产生As(Ⅲ),可致使砷移动性增强,毒性升高,环境风险增加。前期有氧条件下的报道中,研究者更多关注微生物砷氧化,但对于溶氧浓度如何影响砷抗性微生物的砷还... 砷是一种强致癌有毒类金属元素,广泛存在于自然水体环境之中。微生物还原As(Ⅴ)产生As(Ⅲ),可致使砷移动性增强,毒性升高,环境风险增加。前期有氧条件下的报道中,研究者更多关注微生物砷氧化,但对于溶氧浓度如何影响砷抗性微生物的砷还原缺乏定量研究。嗜水气单胞菌HS01(Aeromonas hydrophila HS01)为该文研究团队分离得到的一株具有系列环境功能的菌种,前期已证明其包含厌氧铁还原、硝酸盐还原、偶氮染料还原脱色、DDT生物转化等能力。选取其为研究对象,通过基因组测序分析,确定了该菌具有arsB砷载体蛋白基因和arsC胞内砷还原基因,明确了它的砷还原功能;通过构建砷还原微宇宙反应体系,解析了不同电子供体、不同氧气浓度条件下嗜水气单胞菌HS01的砷还原动力学,发现其砷还原能力受氧气调控显著。在该研究使用的多种电子供体条件下,嗜水气单胞菌HS01均不能在厌氧环境中还原产生As(Ⅲ)。而微氧(297μg·L^(−1))条件下,砷还原速率常数达到0.09/d,反应速率约25.3μmol·L^(−1)·d^(−1);随溶氧浓度增加,砷还原速率在氧含量为414μg·L^(−1)的体系中达到最大值,速率常数达到1.46/d。功能基因RNA定量结果显示,砷还原基因的表达量随溶氧浓度升高而先增后降,其趋势与砷还原速率一致,基因表达与速率常数之间呈显著正相关关系,预示着氧气调控了功能基因的表达进而影响砷的还原速率。该研究确定了嗜水气单胞菌HS01的砷还原功能,明确了氧气对其砷还原能力的调控规律,可为理解有氧与微氧水体环境中砷的转化提供理论依据,也将为砷的风险防控提供理论支持。 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌 砷抗性 氧气 基因表达 arsC arsb
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构建一种检测水中As^(3+)的敏感型大肠杆菌
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作者 王伍 纪松军 +2 位作者 黄招竹 卢彬彬 吕建新 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期1081-1092,共12页
为构建一种敏感性强、特异性好的检测砷离子的大肠杆菌荧光报告菌株,本研究利用基因敲除技术,敲除了大肠杆菌中负责向胞外转运砷离子的ars B基因,构建对As^(3+)敏感的菌株;利用egfp基因作为报告基因,构建融合检测载体p ET28b-Pars-ars R... 为构建一种敏感性强、特异性好的检测砷离子的大肠杆菌荧光报告菌株,本研究利用基因敲除技术,敲除了大肠杆菌中负责向胞外转运砷离子的ars B基因,构建对As^(3+)敏感的菌株;利用egfp基因作为报告基因,构建融合检测载体p ET28b-Pars-ars R-egfp。然后将检测载体p ET28b-Pars-ars R-egfp转化至ars B基因敲除菌中完成敏感型As^(3+)检测菌株的构建。接着对此微生物传感器进行了检测条件的优化,以及线性检测范围、最低检出限、特异性等性能的确定。研究结果表明,与利用野生大肠杆菌作为检测宿主相比,此敏感型砷检测菌株对检测As^(3+)的灵敏度有显著提高,最适检测As^(3+)浓度范围为0.013-42.71μmol/L,最低检出下限为5.13 nmol/L。因此,本研究利用基因敲除技术对大肠杆菌进行改造,成功地提高了砷检测微生物传感器的灵敏度,为重金属微生物传感器的优化研究工作提供了有用方案。 展开更多
关键词 As3+检测 大肠杆菌 arsb基因 基因敲除 敏感性
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黏多糖贮积症Ⅵ型表现型和基因型的相关性研究 被引量:3
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作者 姜煜 郭源平 +4 位作者 艾阳 唐佳 方子水 杜敏联 郭奕斌 《热带医学杂志》 CAS 2017年第2期142-147,F0002,共7页
目的对3家拟诊为黏多糖贮积症Ⅵ型(MPSⅥ)的患儿及其父母进行芳香基硫酸酯酶B(ARSB)基因的突变检测,以阐明其分子发病机制并揭示MPSⅥ表现型和基因型的相关性。方法尿糖胺聚糖(GAG)定性检测后对患儿及其父母的DNA进行ARSB基因的PCR扩增... 目的对3家拟诊为黏多糖贮积症Ⅵ型(MPSⅥ)的患儿及其父母进行芳香基硫酸酯酶B(ARSB)基因的突变检测,以阐明其分子发病机制并揭示MPSⅥ表现型和基因型的相关性。方法尿糖胺聚糖(GAG)定性检测后对患儿及其父母的DNA进行ARSB基因的PCR扩增及Sanger测序。对所发现的新突变,用变性高效液相色谱(DHPLC)法进行快速筛检,用多种生物信息学方法对新突变的致病性进行系列鉴定。结果家系1先证者为c.943C>T和c.1197C>G的复合杂合子;家系2先证者为c.523T>G/p.Y175D(新突变,父源)和c.1197C>G/p.F399L(母源)的复合杂合子;家系3先证者的E2和E3无扩增产物,而其父母均有400 bp和459 bp特异带。DHPLC结果显示,正常对照组和患儿母亲为正常单峰,而患儿及其父为异常双峰。正常和突变的ARSB蛋白的高级结构存在明显差异;突变点所在氨基酸在物种进化过程中具有高度保守性;Poly Phen-2和SIFT软件预测结果:Probably damaging(很可能有害)和Damaging(有害的)。结论家系2的p.Y175D是一新的致病性突变,为患儿发病的内在原因之一。家系1和2可确诊为MPSⅥ型,其表现型和基因型有显著的相关性;家系3虽经酶检确诊,临床症状、尿检结果也均与MPSⅥ型符合,但DNA水平未查到明确突变类型,其表现型与基因型的相关性有待进一步证实。 展开更多
关键词 黏多糖贮积症Ⅵ型 arsb基因 新突变 鉴定 相关性
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