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中华绒螯蟹蜕皮抑制激素1(MIH1)基因的cDNA片段克隆和Northern印迹分析 被引量:15
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作者 宋霞 周开亚 马长艳 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期353-358,共6页
根据其他蟹类蜕皮抑制激素的氨基酸序列设计了简并引物,运用RT PCR和RACE技术,从中华绒螯蟹(E riocheirjaponicasinensis)成体的蜕皮间期眼柄中,克隆了1条长1145bp的cDNA。该cDNA编码60个氨基酸,包括942bp的3′端非翻译区。同源性分析... 根据其他蟹类蜕皮抑制激素的氨基酸序列设计了简并引物,运用RT PCR和RACE技术,从中华绒螯蟹(E riocheirjaponicasinensis)成体的蜕皮间期眼柄中,克隆了1条长1145bp的cDNA。该cDNA编码60个氨基酸,包括942bp的3′端非翻译区。同源性分析结果表明,该cDNA编码的氨基酸序列和其他蟹类蜕皮抑制激素有较高的一致性,最高的一致性为64%,将获得的序列命名为中华绒螯蟹蜕皮抑制激素1基因(GenBank检索号:AY309062)。用Northern印迹分析的方法对处于各个发育阶段的胚胎及状幼体期该基因的表达进行了研究,结果表明,处于胚胎发育早期的卵裂期几乎没有检测到杂交信号,而胚胎发育的其他时期和状幼体期都检测到蜕皮抑制激素1基因的mRNA。中华绒螯蟹蜕皮抑制激素1基因部分cDNA序列的获得为进一步获得该基因的全长cDNA、研究其功能及阐明中华螯蟹蜕皮的分子机制奠定了基础。 展开更多
关键词 中华绒螯蟹 蜕皮抑制激素1 MIH1 基因 CDNA片段 northern印迹分析 克隆 蜕皮 测序 结构分析
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Study on the Specific Gene Expression during Spermatogenesis of Rat
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作者 吴燕婉 黄海燕 +3 位作者 邢志军 王春梅 石心泉 刘德瑜 《Journal of Reproduction and Contraception》 CAS 2001年第1期15-26,共12页
Objective To explore specific gene expression for regulating meiosis of germ cells during spermatogenesis of rat testis Materials & Methods Male SD rats, aged 1, 3 and 8 weeks, were observed in this study. The ... Objective To explore specific gene expression for regulating meiosis of germ cells during spermatogenesis of rat testis Materials & Methods Male SD rats, aged 1, 3 and 8 weeks, were observed in this study. The methods of morphological observation on testicular tissues embedded by resin and mRNA differential display (DDRT PCR) were combined to obtain specific mRNA expression gene fragments during the testicular development. Reverse dot blot hybridization was operated to further screen the positive differential DNA fragments. The positive DNA segments were sub cloned in pGEM T Easy vector and transformed into the competent E coli 109 straint. Northern blot analysis and in situ hybridization were also carried out for identifying tissue specific expression as well as cell specific expression DNA fragments. To screen λ ZAP II rat testicular gene library was searched for the original gene. Results Eighty two differential cDNA fragments were obtained through primary DDRT PCR, among which 40 differential cDNA fragments were selected for further screening with reverse dot blot hybridization. After the reverse dot blot hybridization, 12 primary differential DNA fragments were obtained. The size of DNA fragments ranged from 250 to 500 bp. The in situ hybridization of the testicular tissue showed that a specific DNA fragment derived from 8 week old rat testis, named CG14, was hybridized in adult rat testicular section, in which the positive nucleic acid signals were distributed specifically in the primary spermatocytes. Another DNA fragment derived from 1 week old rat testis, named AA11, was hybridized specifically in Sertoli cell of 1 week old rat testis. Northern blot hybridization with [α 32 P] dCTP labeled CG14 probe, including cardiac, liver, kidney, brain, testis, and epididymis tissue mRNAs of rat, showed that an mRNA specific hybridization band, size of 1.258 kb, was found in testis tissue and size of 1.531 kb of another hybridization band present in epididymis tissue. The CG14 DNA specific gene fragment existed in the λ ZAP II testis gene library. Conclusion 1. The DDRT PCR technique is a convenient tool to find the specific expression gene during spermatogenesis. 2. The CG14 DNA fragment was expressed significantly in rat testicular tissue, weakly expressed in the epididymis tissue of rat, but not found in cardiac, liver, kidney, and brain tissues. 3. The CG14 DNA fragment was specifically expressed in the primary spermatocytes and might be associated with the meiosis of the primary spermatocyte during spermatogenesis of rat. 4. The CG14 DNA fragment existed in the λ ZAP II testis gene library. 展开更多
关键词 rat spermatogenesis testicular specific gene DDRT PCR in situ hybridization northern blot analysis λ ZAP II library
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油菜油体钙蛋白基因BnClo1的克隆和表达 被引量:12
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作者 丁勇 陈庆波 +2 位作者 徐春雷 常玮 甘莉 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1921-1928,共8页
应用同源序列克隆法设计同源简并引物,结合RT-PCR和RACE-PCR技术,从甘蓝型油菜中分离克隆了编码28.1kD油体钙蛋白(caleosin)的基因BnClo1。其全长1058bp的BnClo1 mRNA(GenBank中序列号为AY966447)包含完整的开放阅读框和3′末端Poly(A)... 应用同源序列克隆法设计同源简并引物,结合RT-PCR和RACE-PCR技术,从甘蓝型油菜中分离克隆了编码28.1kD油体钙蛋白(caleosin)的基因BnClo1。其全长1058bp的BnClo1 mRNA(GenBank中序列号为AY966447)包含完整的开放阅读框和3′末端Poly(A)尾巴结构,染色体DNA结构上含6个外显子和5个内含子。Northern杂交结果表明,油菜中BnClo1在种子形成中期开始丰富表达,在种子形成后期,即种子开始脱水成熟时期,高量稳定地表达。半定量PCR结果显示,BnClo1在油菜种子吸水膨胀后前2d的茎中明显表达。证明在油菜种子发育期间,BnClo1对mRNA的转录表达是由胚胎发育来调控的,具有显著的时空特性,并与油体的形成和积累密切有关。推测的caleosin蛋白为245个氨基酸残基(GenBank中序列号为AAY40837)组成的两性蛋白质,主要含3个结构域即由N末端1~16位氨基酸残基组成的α-螺旋和17~61位氨基酸残基组成的强亲水性的随机卷曲构成的N-末端亲水性结构域;由80~120位氨基酸残基组成的中间疏水性结构域和C-末端亲水性结构域。N-末端亲水性结构域包含一个潜在的结合Ca2+的EF-手结构。中间疏水性结构域包含一个潜在的脯氨酸-结(proline-knot)模体,在92~114位氨基酸残基组成的α-螺旋跨膜区域,推测在caleosin蛋白与单层磷脂层和油体锚定结合上及增加种子油体的稳定性上起着重要的作用。 展开更多
关键词 油体钙蛋白 RACE 基因克隆 同源简并引物 序列分析 northern杂交
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利用差异显示技术克隆小麦抗白粉病相关基因的研究 被引量:2
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作者 孔凡晶 陈孝 +1 位作者 马有志 辛志勇 《麦类作物学报》 CAS CSCD 2004年第1期11-14,共4页
对小麦—簇毛麦抗病易位系进行差异显示分析,以期获得小麦抗白粉病基因的分子克隆。根据已克隆植物抗病基因的保守域,设计了简并引物,与锚定引物组合,对抗病诱导的小麦抗白粉病易位系进行了差异显示分析,共获得10个差异片段,其中两个片... 对小麦—簇毛麦抗病易位系进行差异显示分析,以期获得小麦抗白粉病基因的分子克隆。根据已克隆植物抗病基因的保守域,设计了简并引物,与锚定引物组合,对抗病诱导的小麦抗白粉病易位系进行了差异显示分析,共获得10个差异片段,其中两个片段R3-1和8C1.3-6Northern杂交为阳性。将这两个片段克隆后进行了测序,序列分析结果为两个新序列,GenBank登录号分别为AF498271和AF498272。R3-1没有发现同源性较高的植物基因序列,发现8C1.3-6与Sphenostylisstenocarpa 类几丁质酶基因有同源性。 展开更多
关键词 小麦 白粉病 抗病基因 差异显示技术 分子克隆 简并引物
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ARG1基因的生物信息学和基因表达谱分析 被引量:4
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作者 顾永清 杨磊 +2 位作者 潘泽民 袁红琳 谢毅 《农垦医学》 2003年第2期81-83,共3页
目的 :对ARG1进行生物信息学和基因表达谱分析 ,并对其可能的抗砷机理进行探讨。方法 :对砷相关基因ARG1作进一步的生物信息学分析 ,用不同浓度砷染毒L - 0 2细胞两周以上 ,抽RNA转膜作Northern杂交 ,以及人类多组织膜的Northern杂交。... 目的 :对ARG1进行生物信息学和基因表达谱分析 ,并对其可能的抗砷机理进行探讨。方法 :对砷相关基因ARG1作进一步的生物信息学分析 ,用不同浓度砷染毒L - 0 2细胞两周以上 ,抽RNA转膜作Northern杂交 ,以及人类多组织膜的Northern杂交。结果 :Northern杂交结果显示该基因在未染毒L - 0 2细胞中几乎不表达 ,在砷染毒细胞中该基因的表达量明显增加 ,在 2 .3Kb处有一个单一的条带 ,且随剂量增加表达量亦增加。生物信息学分析显示ARG1具有一个液泡 -ATP酶 (Vacuolar -ATPase ,V -ATPase)样的功能域。结论 :ARG1是一条新的全长抗砷相关基因 ,其抗砷机理可能是通过液泡 展开更多
关键词 ARGl基因 生物信息学 基因表达谱 分析 northern杂交 致癌 致畸 致突变
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双拷贝v-cath基因的重组HaNPV的构建及毒力分析 被引量:2
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作者 刘德立 段媛媛 齐义鹏 《中国病毒学》 CSCD 2003年第3期254-258,共5页
利用HaNPV的Bac-to-Bac系统(Hanpvid)构建了双拷贝v-cath基因的重组HaNPV,即:除病毒自身的v-cath基因外,还带有由ie1启动子控制的早期表达v-cath基因的重组病毒dciHaNPV.Dotblot和Northernblot分析证明:重组病毒构建正确.用重组病毒感染... 利用HaNPV的Bac-to-Bac系统(Hanpvid)构建了双拷贝v-cath基因的重组HaNPV,即:除病毒自身的v-cath基因外,还带有由ie1启动子控制的早期表达v-cath基因的重组病毒dciHaNPV.Dotblot和Northernblot分析证明:重组病毒构建正确.用重组病毒感染Hz-AM1细胞,测定了dciHaNPV的TCID5o为3.16×107 TCID50/mL. 展开更多
关键词 双拷贝v-cath基因 重组HaNPV 构建 毒力 棉铃虫核型多角体病毒 生物杀虫剂
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干旱胁迫下小麦TaMyb2-Ⅱ基因的表达水平变化研究
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作者 王爱萍 梁素明 +2 位作者 宋长水 董琦 杨武德 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 2008年第3期255-256,共2页
为了研究TaMyb2-Ⅱ基因的功能,将不同时间段PEG处理和未进行胁迫处理(CK)小麦叶片总RNA进行了Northern杂交分析。结果表明,TaMyb2-Ⅱ参与了对水分胁迫的应答过程,水分胁迫1 h时,其表达水平较对照有明显提高,水分胁迫12 h到24 h的表达量... 为了研究TaMyb2-Ⅱ基因的功能,将不同时间段PEG处理和未进行胁迫处理(CK)小麦叶片总RNA进行了Northern杂交分析。结果表明,TaMyb2-Ⅱ参与了对水分胁迫的应答过程,水分胁迫1 h时,其表达水平较对照有明显提高,水分胁迫12 h到24 h的表达量达到最高,在48 h时其表达量下降到与对照相当的水平。 展开更多
关键词 小麦 TaMyb2-Ⅱ northern杂交分析
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维氏气单胞菌TH0426株rpoN蛋白的生物学特性分析及原核表达 被引量:1
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作者 王冬雪 夏明 +2 位作者 姚贵哲 孟庆峰 单晓枫 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第1期17-21,26,154,共7页
为了深入研究维氏气单胞菌毒力蛋白rpoN的功能,试验采用邻近法构建rpoN基因的系统进化树,对rpoN蛋白进行生物学特性分析,PCR法扩增rpoN基因,将其与表达载体pET-32a(+)连接,再将连接产物转化至大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞中进行诱导表... 为了深入研究维氏气单胞菌毒力蛋白rpoN的功能,试验采用邻近法构建rpoN基因的系统进化树,对rpoN蛋白进行生物学特性分析,PCR法扩增rpoN基因,将其与表达载体pET-32a(+)连接,再将连接产物转化至大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞中进行诱导表达和制备抗体,测定抗体效价并进行Western-blot检测。结果表明:rpoN蛋白稳定,属于胞内蛋白,是全α型蛋白。重组表达质粒pET-32a-rpoN在大肠杆菌中成功表达,在约58 ku处可见明亮条带,rpoN多克隆抗体效价为1∶279 000,具有特异性。说明表达的rpoN蛋白具有一定的免疫原性。 展开更多
关键词 维氏气单胞菌 rpoN基因 生物信息学分析 Western-blot检测 原核表达 免疫反应
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HL-60细胞内一种新的全反式维甲酸应答基因的克隆 被引量:2
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作者 王吉伟 王顺伟 +3 位作者 田菁燕 陈汉春 罗志勇 曾海涛 《湖南医科大学学报》 CSCD 1999年第6期501-503,共3页
利用差示PCR 技术从HL60 细胞内克隆出一个新的、差异表达的cDNA 片段,并将其命名为W1 基因。Northern 印迹杂交证实,用全反式维甲酸(ATRA) 诱导HL60 细胞分化时,W1 基因的转录水平在诱导早期增加而在诱导24 h 后关闭。推测W1... 利用差示PCR 技术从HL60 细胞内克隆出一个新的、差异表达的cDNA 片段,并将其命名为W1 基因。Northern 印迹杂交证实,用全反式维甲酸(ATRA) 诱导HL60 细胞分化时,W1 基因的转录水平在诱导早期增加而在诱导24 h 后关闭。推测W1 基因可能在HL60 展开更多
关键词 白血病 HL-60细胞 全反式维甲酸 基因克隆
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水牛PHB基因克隆与表达模式 被引量:2
10
作者 熊炤成 屈春凤 +4 位作者 沈开元 刘庆友 王英群 石德顺 李湘萍 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期1422-1428,共7页
本研究克隆水牛PHB(prohibitin)基因并运用生物信息学方法对其进行分析,同时初步探索其表达模式。首先应用RT-PCR技术扩增获得水牛PHB基因片段,应用生物信息学方法分析和预测了其理化性质、蛋白质二级及三级结构。测序结果表明,水牛PHB... 本研究克隆水牛PHB(prohibitin)基因并运用生物信息学方法对其进行分析,同时初步探索其表达模式。首先应用RT-PCR技术扩增获得水牛PHB基因片段,应用生物信息学方法分析和预测了其理化性质、蛋白质二级及三级结构。测序结果表明,水牛PHB基因编码区全长948bp,推测编码272个氨基酸,理论蛋白质相对分子质量29 830,等电点为5.58。多重序列比较分析显示,水牛PHB基因核苷酸序列与牛、野猪、羊、黑猩猩、人、小鼠等相应序列相似性分别为99.4%,94.3%,97.8%,92.8%,92.9%,89.6%;系统进化树分析结果推测,PHB基因在不同物种以及进化过程中具有高度的保守性。QRT-PCR分析结果显示,水牛PHB基因在垂体、大脑、肝脏、卵巢、肌肉、肾脏和睾丸组织具有不同程度的表达,其中在肾脏表达量最高,肝脏、睾丸、卵巢和垂体次之,肌肉表达最低。对高、低活率水牛精子样本PHB基因表达进行了定量检测,结果显示高活率精子中PHB基因表达显著高于低活率精子(P<0.05)。Western blot分析结果发现,高、低活率精子样品的β-actin蛋白条带清晰一致,PHB蛋白在高、低活率精子样品的表达差异显著,低活率精子样品的PHB蛋白表达下调,这与mRNA水平的检测结果一致。本研究为阐明PHB基因在水牛精子发生过程中的作用及其对水牛精子活率的影响奠定了基础。 展开更多
关键词 水牛PHB基因 生物信息学分析 QRT-PCR Western blot
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