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牦牛ATF4基因组织表达与雌性生殖器官中定位分析 被引量:2
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作者 蒋旭东 邬建飞 +5 位作者 刘宇 胡双阁 马瑶 龚三你 卢建远 字向东 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2022年第2期125-134,共10页
旨在克隆牦牛转录激活因子4(ATF4)基因,并检测其在不同组织的表达及雌性生殖器官中定位分析,探索ATF4在母牦牛繁殖的影响.以牦牛为实验对象,利用RT-PCR克隆得到牦牛ATF4基因CDS序列,生物信息学分析牦牛CDS区,RT-qPCR检测ATF4基因在牦牛... 旨在克隆牦牛转录激活因子4(ATF4)基因,并检测其在不同组织的表达及雌性生殖器官中定位分析,探索ATF4在母牦牛繁殖的影响.以牦牛为实验对象,利用RT-PCR克隆得到牦牛ATF4基因CDS序列,生物信息学分析牦牛CDS区,RT-qPCR检测ATF4基因在牦牛不同组织中的表达模式,免疫组化(IHC)分析ATF4蛋白在雌性生殖器官中定位.结果表明,获得到牦牛ATF4基因cDNA序列,编码区全长1 047 bp,编码348个氨基酸,ATF4蛋白属于酸性亲水不稳定蛋白.RT-qPCR显示,ATF4基因在检测的8个组织中均有表达,在子宫和卵巢的表达量显著高于其它组织(P<0.05);妊娠期子宫、卵巢和输卵管中ATF4基因的表达量显著高于空怀期(P<0.05).IHC显示ATF4蛋白主要在牦牛卵巢的颗粒细胞、卵泡液、输卵管黏膜上皮、子宫内膜和子宫基质细胞中表达.这些结果说明ATF4基因在动物进化中比较保守,组织表达广泛,并在子宫和卵巢高表达,可能在牦牛繁殖调控中发挥重要作用. 展开更多
关键词 牦牛 atf4基因 基因克隆 实时定量PCR 免疫组化
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三穗鸭ATF4基因多态性鉴定及其与蛋壳品质的关联分析 被引量:3
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作者 谭光辉 李杰章 +2 位作者 覃媛钰 吴磊 张依裕 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期652-658,共7页
【目的】探讨三穗鸭转录激活子4基因(ATF4)多态性与蛋壳品质的相关性,揭示禽类ATF4的生物学功能及其遗传特性,为进一步研究蛋壳品质的调控机制打下基础。【方法】以三穗鸭为研究对象,经PCR扩增获得ATF4基因后采用直接测序法检查三穗鸭A... 【目的】探讨三穗鸭转录激活子4基因(ATF4)多态性与蛋壳品质的相关性,揭示禽类ATF4的生物学功能及其遗传特性,为进一步研究蛋壳品质的调控机制打下基础。【方法】以三穗鸭为研究对象,经PCR扩增获得ATF4基因后采用直接测序法检查三穗鸭ATF4基因全部编码区的变异位点,运用SHEsis计算基因型频率、等位基因频率、单倍型频率及基因型分布卡方值(c2)等,利用PopGen32计算各SNP位点的观察杂合度(He)、有效等位基因(Ne)及多态信息量(PIC),并以SPSS 18.0中的一般线性模型(GLM)分析SNP位点对蛋壳品质的遗传效应。【结果】在三穗鸭ATF4基因第3外显子(Exon-3)上发现3个SNPs位点(g.2394G>A、g.2571A>G和g.2667A>G),均属于同义突变。3个SNPs位点在三穗鸭群体中均呈中度多态性(0.25<PIC<0.50),其基因型分布均未偏离Hardy-Weinberg平衡,联合产生4种单倍型和9种双倍型。关联分析结果表明,g.2571A>G位点对三穗鸭蛋重和蛋壳重的影响达显著水平(P<0.05,下同),g.2667A>G位点对蛋壳厚度的影响达显著水平,g.2394G>A位点对蛋壳品质性状指标的影响不显著(P>0.05);双倍型H2H2(AAGGGG)的蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数均最高,是对三穗鸭蛋壳品质最有利的基因型,且3个SNPs位点共同对蛋壳品质的影响效应明显大于单个SNP位点。【结论】三穗鸭ATF4基因存在3个SNPs位点(g.2394G>A、g.2571 A>G和g.2667A>G),均属于同义突变,其中g.2571A>G和g.2667A>G位点对蛋壳品质有显著影响,3个SNPs位点组合基因型对蛋壳品质也产生显著影响,可作为鸭蛋蛋壳品质选择的分子遗传标记。 展开更多
关键词 三穗鸭 atf4基因 SNP位点 多态性 蛋壳品质
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Over-expression of atf4 in Xenopus embryos interferes with neurogenesis and eye formation
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作者 刘建桃 杨勇 +4 位作者 郭晓刚 陈淼 丁焕中 陈永龙 王敏儒 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期485-491,共7页
Accumulated evidence indicates that the activating transcription factor 4(atf4) is a developmentally relevant gene.Here,we report on the characterization of atf4 in Xenopus embryos,which is differentially expressed ... Accumulated evidence indicates that the activating transcription factor 4(atf4) is a developmentally relevant gene.Here,we report on the characterization of atf4 in Xenopus embryos,which is differentially expressed in the central nervous system,eyes,blood,and the pronephros,as well as in developing endodermal organs such as the stomach,duodenum,liver,and pancreas.Ectopic expression of atf4 in the animal hemisphere of Xenopus embryos had no obvious effects on the induction of neural progenitors,but suppressed neurogenesis and eye formation without promoting apoptosis.Our data suggest that tightly controlled atf4 activities may be crucial for normal neurogenesis and early eye patterning. 展开更多
关键词 XENOPUS atf4 Eye NEUROGENESIS APOPTOSIS
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