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NS5ATP9与HBx相互作用促进HBV cccDNA的形成与转录
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作者 袁晓雪 耿雯倩 +1 位作者 王钧 王阳 《中国肝脏病杂志(电子版)》 CAS 2024年第1期29-37,共9页
目的探讨丙型肝炎病毒NS5A反式调节蛋白9(hepatitis C virus NS5Atransactivated protein 9,NS5ATP9)在乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)共价闭合环状DNA(covalently closed circular DNA,cccDNA)形成与转录中的作用机制。方法利用... 目的探讨丙型肝炎病毒NS5A反式调节蛋白9(hepatitis C virus NS5Atransactivated protein 9,NS5ATP9)在乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)共价闭合环状DNA(covalently closed circular DNA,cccDNA)形成与转录中的作用机制。方法利用1.3拷贝HBV表达质粒转染Huh7和HepG2细胞、整合有4拷贝HBV基因组的HepG2.2.15细胞、在诱导型四环素启动子控制下表达HBV的HepAD38细胞构建NS5ATP9过表达或干扰的HBV细胞模型,收集样品和细胞上清液,提取RNA、HBV核心DNA(coreDNA)、cccDNA和蛋白,利用酶联免疫吸附试验、实时荧光定量聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)、Southern blot和Western blot技术检测HBV总RNA、前基因组RNA(pregenomic RNA,pgRNA)、乙型肝炎病毒s抗原(hepatitis B virus s antigene,HBsAg)、乙型肝炎病毒e抗原(hepatitis B virus e antigene,HBeAg)、松弛环状DNA(relax circular DNA,rcDNA)以及cccDNA水平。在HepG2细胞中转染乙型肝炎病毒x蛋白(hepatitis B virus x protein,HBx),通过免疫荧光成像及免疫共沉淀方法检测NS5ATP9与HBx的结合情况。双荧光素酶报告基因实验检测NS5ATP9对HBx启动子活性的影响。利用Huh7细胞转染HBV1.3及HBV稳定表达细胞株HepG2.2.15和HepAD38转染NS5ATP9过表达/干扰质粒,通过Western blot技术检测DDB1和SMC6的蛋白水平。结果在HBV病毒活跃的细胞中,NS5ATP9 mRNA水平[HepG2.2.15细胞:1.891±0.567比1.00±0.034,t=2.87,P=0.0351;HepAD38 tet+细胞:1.978±0.399比1.00±0.034,t=4.131,P=0.0091;HepAD38 tet-细胞:2.642±0.672比1.00±0.034,t=4.127,P=0.0091]和蛋白水平均显著增加。过表达NS5ATP9后可显著增加HBeAg[(5.402±0.327)S/COV比(2.68±0.552)S/COV,t=7.35,P=0.0018]、HBsAg[(2.846±0.185)S/COV比(1.512±0.221)S/COV,t=8.02,P=0.0013]、HBV pgRNA及rcDNA的表达水平,而干扰NS5ATP9后此增加作用消失[HBeAg:(2.029±0.09)S/COV比(3.733±0.445)S/COV,t=6.501,P=0.0029;HBsAg:(1.501±0.105)S/COV比(1.878±0.174)S/COV,t=3.216,P=0.0324)]。机制研究显示,NS5ATP9和HBx蛋白主要位于细胞核核仁内,并具有共定位信号,且NS5ATP9可显著提高HBx启动子(1071.06±79.44比488.47±40.12,t=13.09,P=0.00012)的转录活性。另外,过表达NS5ATP9可显著降低DDB1和SMC6的蛋白水平,而沉默NS5ATP9则可显著提高DDB1和SMC6的蛋白水平。结论HBV上调NS5ATP9的表达,形成HBV-NS5ATP9-HBV cccDNA-HBV的正反馈环路,NS5ATP9通过与HBx相互作用上调肝细胞中HBV cccDNA的形成与转录,进而促进慢性乙型肝炎的发生发展。 展开更多
关键词 NS5atp9 肝炎病毒 乙型 乙型肝炎病毒共价闭合环状DNA 乙型肝炎病毒X蛋白 转录调控
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苎麻atp6和atp9基因的克隆表达及与细胞质雄性不育的相关性 被引量:12
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作者 段继强 杜光辉 +2 位作者 李建永 梁雪妮 刘飞虎 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1487-1498,共12页
根据GenBank报道的双子叶植物线粒体atp6和atp9基因编码区保守序列设计简并引物,通过PCR技术从苎麻细胞质雄性不育系、保持系和恢复系(简称"三系")mtDNA中扩增目的基因片段,发现所得序列开放阅读框虽不完整,但与GenBank报道... 根据GenBank报道的双子叶植物线粒体atp6和atp9基因编码区保守序列设计简并引物,通过PCR技术从苎麻细胞质雄性不育系、保持系和恢复系(简称"三系")mtDNA中扩增目的基因片段,发现所得序列开放阅读框虽不完整,但与GenBank报道的其他植物线粒体atp6和atp9基因同源性分别高于94%和85%。采用DNA Walking步移法分别从3′端和5′端扩增两个基因片段的未知侧翼序列,分离出完整的苎麻线粒体atp6和atp9基因,包含了完整的开放阅读框。其中"三系"的atp6基因在mtDNA水平、转录和翻译调控水平、蛋白质水平上均无差异。不育系atp9基因在编码区3′端与保持系和恢复系相比存在若干个碱基的差异和缺失;RT-PCR分析还表明,不育系atp9基因在现蕾期和盛花期的表达量很高。推测不育系atp9基因的结构变异和/或异常表达与苎麻细胞质雄性不育(CMS)的关系密切。 展开更多
关键词 苎麻 细胞质雄性不育 atp6基因 atp9基因 DNA WALKING RT-PCR
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与烟草细胞质雄性不育相关的线粒体基因atp9的mRNA研究 被引量:9
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作者 周玮 刘齐元 +3 位作者 陈雪峰 刘飞虎 曹槐 刘次全 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期114-120,39,共8页
已知导入未编辑atp9 mRNA的烟草表现细胞质雄性不育(CMS),因此认为线粒体基因atp9是引起高等植物CMS的主要基因。为了解atp9在CMS中的作用机制,从3对烟草不育系及其同型保持系中提取atp9,利用实验与理论结合来分析其mRNA在编辑前后以及... 已知导入未编辑atp9 mRNA的烟草表现细胞质雄性不育(CMS),因此认为线粒体基因atp9是引起高等植物CMS的主要基因。为了解atp9在CMS中的作用机制,从3对烟草不育系及其同型保持系中提取atp9,利用实验与理论结合来分析其mRNA在编辑前后以及在不育系及其同型保持系中的一维、三维信息差别。结果表明,atp9mRNA一维信息方面的差异,更重要的是二级结构的差异和稳定性,可能是影响ATP合成而导致CMS的根本原因。 展开更多
关键词 atp9 细胞质雄性不育 MRNA二级结构 烟草
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红麻线粒体基因atp9克隆及不育细胞质分子标签的利用 被引量:3
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作者 赵艳红 廖小芳 +4 位作者 赵洪涛 黄其椿 唐兴富 李初英 周瑞阳 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期964-970,共7页
【目的】快速克隆红麻线粒体atp9基因编码区(CDS)序列并分析其系统进化关系,为atp9基因功能验证奠定基础;利用基于atp9基因开发的不育细胞质分子标签MM556检测红麻种质资源的细胞质育性,为鉴定红麻不育细胞质种质资源提供参考。【方法... 【目的】快速克隆红麻线粒体atp9基因编码区(CDS)序列并分析其系统进化关系,为atp9基因功能验证奠定基础;利用基于atp9基因开发的不育细胞质分子标签MM556检测红麻种质资源的细胞质育性,为鉴定红麻不育细胞质种质资源提供参考。【方法】以红麻细胞质雄性不育系P3A及保持系P3B为材料,采用同源克隆方法克隆线粒体基因atp9的CDS区并进行序列比对和进化分析。利用分子标签MM556对84份未知细胞质育性的红麻种质资源进行不育细胞质材料筛选,并利用6个金钱吊芙蓉品种进行验证。【结果】红麻细胞质雄性不育系与保持系的CDS区碱基均为339 bp,两者间存在4个碱基的差异,推导编码112个氨基酸。红麻atp9基因与葡萄的亲缘关系最近,其节点支持率为72,其次为十字花科的油菜和拟南芥,与韭菜亲缘关系最远。MM556分子标签鉴定结果表明,84份红麻种质资源中,UG93-2ms-1、UG93-2ms-2、UG93-2ms-3、UG93-2ms-4、UG93-2-22、KN250、KN250-1、KN142、ZB90和09-7等10份材料具有不育细胞质,其中UG93-2ms-1、UG93-2ms-2、UG93-2ms-3和UG93-2ms-4均为红麻野败型UG93雄性不育突变体的衍生株系。经对金钱吊芙蓉品种的分子检测和田间育性验证,发现MM556分子标签同样适用于金钱吊芙蓉材料育性的辨别。【结论】克隆获得的红麻atp9基因编码区序列及筛选获得的不育细胞质种质资源可用于进一步研究红麻细胞质雄性不育分子机理;基于atp9基因开发的分子标签MM556可用于红麻不育细胞质的鉴定。 展开更多
关键词 红麻 不育细胞质 atp9 分子标签 育性检测
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紫稻(Oryza sativa L.)线粒体ATP酶atp9基因转录本RNA编辑 被引量:5
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作者 魏磊 严志祥 +1 位作者 余金洪 丁毅 《武汉植物学研究》 CSCD 北大核心 2008年第6期567-572,共6页
紫稻(Oryza sativa L.)细胞质雄性不育系是本实验室新构建的新型细胞质雄性不育系。本研究使用PCR、RT-PCR等技术,得到了紫稻不育系(樱香A)及其保持系(樱香B)线粒体atp9基因的基因组序列和cDNA序列。通过对这些序列的分析发现:樱香Aatp9... 紫稻(Oryza sativa L.)细胞质雄性不育系是本实验室新构建的新型细胞质雄性不育系。本研究使用PCR、RT-PCR等技术,得到了紫稻不育系(樱香A)及其保持系(樱香B)线粒体atp9基因的基因组序列和cDNA序列。通过对这些序列的分析发现:樱香Aatp9cDNA序列中,没有发生RNA编辑;而樱香Batp9cDNA序列中有2个编辑位点,在樱香B cDNA序列2个编辑位点中,223位点由C替换为T,导致原来编码精氨酸密码子成为终止密码子,保证atp9mRNA编码一个"正常长度"的ATP9多肽。而由于没有终止密码子,樱香A mRNA就不能翻译成正常的多肽。上述研究表明,RNA编辑在生成正常的ATP9多肽的过程中发挥了重要作用,同时也说明RNA编辑可能与细胞质雄性不育相关。 展开更多
关键词 atp9基因 RNA编辑 细胞质雄性不育 樱香A 樱香B
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丙型肝炎病毒非结构蛋白NS5A反式激活基因NS5ATP9的克隆化研究 被引量:9
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作者 李强 梁耀东 +2 位作者 成军 王琳 程明亮 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2003年第3期254-256,共3页
目的 筛选并克隆丙型肝炎病毒 (HCV)非结构蛋白 5A(NS5A)反式激活新型靶基因 ,研究HCVNS5A反式激活作用的分子生物学机制。方法 应用抑制性消减杂交技术 (SSH)及生物信息学技术 ,以HCVNS5A表达质粒pcDNA3 1(-) -NS5A转染HepG2细胞 ,... 目的 筛选并克隆丙型肝炎病毒 (HCV)非结构蛋白 5A(NS5A)反式激活新型靶基因 ,研究HCVNS5A反式激活作用的分子生物学机制。方法 应用抑制性消减杂交技术 (SSH)及生物信息学技术 ,以HCVNS5A表达质粒pcDNA3 1(-) -NS5A转染HepG2细胞 ,以空载体pcDNA3 1(-)为平行对照 ,提取mRNA并进行抑制性消减杂交分析。对于所获基因片段序列分析表明 ,其中之一为新型基因片段 ,与GenBank中注册的已知功能基因序列没有同源性 ,利用表达序列标签 (EST)序列数据库的搜索和比对 ,进行电子拼接 ,根据基因起始密码子的Kozak规则和终止密码子下游保守的多聚腺苷酸信号序列 ,确定新型基因序列。从HepG2细胞提取总RNA ,以逆转录多聚酶链反应 (RT -PCR)技术扩增获得该新基因的全长序列 ,并测序证实 ,命名为NS5ATP9,在GenBank中注册 ,注册号为AF5 2 93 70。结果 NS5ATP9基因的编码序列全长为 3 3 6个核苷酸 (nt) ,编码产物由 111个氨基酸残基 (aa)组成 ,并成功的克隆化。结论 HCVNS5A反式激活新型靶基因NS5ATP9的筛选与克隆 。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 非结构蛋白NS5A 反式激活 NS5atp9 基因克隆化 分子生物学机制
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胡萝卜atp9基因的克隆表达及细胞质雄性不育的相关性研究 被引量:5
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作者 张智 梁毅 +1 位作者 丁海凤 张洪伟 《北方园艺》 CAS 北大核心 2012年第24期140-144,共5页
以胡萝卜及其它植物atp9基因序列信息设计引物,分离并克隆了胡萝卜细胞质雄性不育相关的线粒体基因片段,并利用半定量RT-PCR和Real-time PCR技术研究了该基因在不育系和相应保持系中的表达情况。结果表明:与保持系相比,atp9基因在不育... 以胡萝卜及其它植物atp9基因序列信息设计引物,分离并克隆了胡萝卜细胞质雄性不育相关的线粒体基因片段,并利用半定量RT-PCR和Real-time PCR技术研究了该基因在不育系和相应保持系中的表达情况。结果表明:与保持系相比,atp9基因在不育系中发生了若干碱基的置换及缺失;基因表达分析表明,不育系atp9基因在花蕾的前3个发育时期表达量明显较低,并在大花蕾期超过了保持系,但是在盛花期其表达量又低于保持系。推测atp9基因的结构变异和异常表达与胡萝卜细胞质雄性不育有着密切关系。 展开更多
关键词 胡萝卜 atp9基因细胞质雄性不育RT-PCR实时荧光定量PCR
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烟草atp9基因RNAi表达载体的构建及遗传转化 被引量:1
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作者 谢丽娟 陶瑶 +6 位作者 钟思荣 吴凌敏 聂亚平 周玮 刘栋 王建革 刘齐元 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期28-36,共9页
atp9基因是烟草的雄性不育相关基因。为研究atp9基因的功能及其在烟草雄性不育形成中的作用,根据atp9基因全长序列,设计特异性引物,扩增正、反义干扰片段,将长度为239bp的atp9基因的正、反向干扰片段分别连接到linker片段的两侧,最后插... atp9基因是烟草的雄性不育相关基因。为研究atp9基因的功能及其在烟草雄性不育形成中的作用,根据atp9基因全长序列,设计特异性引物,扩增正、反义干扰片段,将长度为239bp的atp9基因的正、反向干扰片段分别连接到linker片段的两侧,最后插入到植物表达载体pCAMBIA1301中,成功地构建了atp9基因的RNAi表达载体。利用农杆菌介导法将其转化烟草保持系品种中烟90,结果证明atp9基因的RNAi表达载体已整合到中烟90基因组中。经抗性筛选以及分子检测最终获得41株转pCAMBIA1301-atp9-RNAi烟草植株,其中阳性烟草有20株,转化率为48.8%。研究结果为下一步验证atp9基因的功能及其在烟草雄性不育形成中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 烟草 atp9基因 RNAI 表达载体构建 遗传转化
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应用酵母双杂交技术筛选人白细胞中与NS5ATP9蛋白结合蛋白的编码基因 被引量:2
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作者 李强 梁耀东 +5 位作者 成军 王琳 张建 邵清 刘敏 程明亮 《世界华人消化杂志》 CAS 2004年第4期828-831,共4页
目的:我们在以往的研究中,应用抑制性消减杂交技术(SSH)筛选得到了丙型肝炎病毒非结构蛋白5A反式激活蛋白9(NS5ATP9),NS5ATP9是一种未知功能新基因.为了进一步研究NS5ATP9的生物学功能,应用酵母双杂交技术, 筛选并克隆人白细胞中与NS5A... 目的:我们在以往的研究中,应用抑制性消减杂交技术(SSH)筛选得到了丙型肝炎病毒非结构蛋白5A反式激活蛋白9(NS5ATP9),NS5ATP9是一种未知功能新基因.为了进一步研究NS5ATP9的生物学功能,应用酵母双杂交技术, 筛选并克隆人白细胞中与NS5ATP9蛋白相互作用蛋白的基因,进一步阐明NS5ATP9的生物学功能及其作用途径. 方法:用多聚酶链反应(PCR)法扩增NS5ATP9基因,连接入酵母表达载体pGBKT7中构建诱饵质粒,转化酵母细胞AH109并在其内表达,然后与转化了人白细胞cDNA文库质粒pACT2的酵母细胞Y187进行配合,在营养缺陷型培养基和X-α-半乳糖(X-α-gal)上进行双重筛选阳性菌落并测序,进行生物信息学分析. 结果:成功克隆出NS5ATP9基因并在酵母细胞中表达,配合后选出既能在四重缺陷(SD/-Trp-Leu-Ade-His)培养基上生长,又能在铺有C-α-gal的四缺培养基上变蓝的真阳性菌落46个,其中含人类免疫球蛋白轻链13个,核小体表面蛋白10个,铁蛋白重链2个,人类重组免疫球蛋白λ轻链11个,14-3-3家族蛋白1个,脑膜炎球菌PorA蛋白1 个,RNA多聚酶Ⅲ3个,烟草有丝分裂原激活蛋白激酶1 个,细胞色素P450Ⅱ2个,SLIT2蛋白1个,DNA依赖蛋白激酶催化亚基1个. 结论:成功克隆出丙型肝炎病毒NS5ATP9蛋白的结合蛋白,为进一步研究NS5ATP9的生物学作用提供了新的线索. 展开更多
关键词 酵母双杂交技术 白细胞 NS5atp9蛋白 抑制性消减杂交技术 SSH 编码基因 酵母细胞
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应用表达谱芯片技术筛选NS5ATP9反式调节基因的研究 被引量:2
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作者 李强 梁耀东 +5 位作者 成军 王琳 王建军 张健 刘妍 程明亮 《世界华人消化杂志》 CAS 2004年第2期323-326,共4页
目的:应用基因表达谱芯片技术研究丙型肝炎病毒非结构蛋白5A反式激活蛋白9(NS5ATP9)的反式调节基因.方法:构建NS5ATP9基因的真核表达载体pcDNA3.1(-)-NS5ATP9,应用基因表达谱芯片技术对pcDNA3.1(-)-NSSATP9转染的HepG2(人肝母细胞瘤细胞... 目的:应用基因表达谱芯片技术研究丙型肝炎病毒非结构蛋白5A反式激活蛋白9(NS5ATP9)的反式调节基因.方法:构建NS5ATP9基因的真核表达载体pcDNA3.1(-)-NS5ATP9,应用基因表达谱芯片技术对pcDNA3.1(-)-NSSATP9转染的HepG2(人肝母细胞瘤细胞系)细胞和转染空载体pcDNA3.1(-)的相同细胞的差异表达mRNA进行检测和分析.结果:HepG2细胞经转染NS5ATP9后,有16条差异基因表达水平发生显著改变,其中3条基因表达增强,13条基因表达降低.这些差异表达的基因与细胞的增生、分化、凋亡及细胞的信号转导密切相关.结论:应用基因表达谱芯片成功筛选了丙型肝炎病毒NS5ATP9作用HepG2细胞后差异表达基因,为阐明NS5ATP9的作用提供了新的依据. 展开更多
关键词 表达谱芯片技术 NS5atp9反式调节基因 肝炎病毒 HCV 基因功能 丙型肝炎
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苎麻雄性不育相关基因atp6和atp9 RNA干扰载体的构建 被引量:1
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作者 杨飞 朱睿 +1 位作者 林娜 刘飞虎 《中国农学通报》 CSCD 2013年第21期137-143,共7页
植物线粒体基因缺陷是细胞质雄性不育的主要原因。为了获得苎麻atp6和atp9基因RNA干扰(RNAi)表达载体,根据已报道的苎麻atp6和atp9基因序列设计引物,利用RT-PCR克隆了atp6和atp9基因的部分cDNA片段,将目的基因正反向片段连接入RNAi载体p... 植物线粒体基因缺陷是细胞质雄性不育的主要原因。为了获得苎麻atp6和atp9基因RNA干扰(RNAi)表达载体,根据已报道的苎麻atp6和atp9基因序列设计引物,利用RT-PCR克隆了atp6和atp9基因的部分cDNA片段,将目的基因正反向片段连接入RNAi载体pHANNIBAL,再将其表达框连入表达载体pCAMBIA1300。结果表明,所克隆的cDNA片段经序列比对后确认为目的基因片段,经酶切和测序验证确认完成了atp6和atp9基因RNAi载体pCAM-6SR和pCAM-9SR的构建。atp6和atp9基因RNAi载体是验证苎麻雄性不育的基础,也为苎麻遗传工程改良奠定了技术基础。 展开更多
关键词 苎麻 雄性不育 ATP6 atp9 RNA干扰
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NS5ATP9对饥饿诱导的肝母细胞瘤HepG2细胞凋亡的作用 被引量:1
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作者 全敏 刘顺爱 成军 《中国肝脏病杂志(电子版)》 CAS 2016年第4期52-56,共5页
目的观察NS5ATP9对饥饿诱导肝母细胞瘤HepG2细胞凋亡的作用随时间的变化。方法将NS5ATP9的表达载体、siRNA小分子干扰及其各自的对照分别转染HepG2细胞48小时后,分别用EBSS饥饿细胞12小时、24小时、36小时和48小时后,利用Annexin V/7-AA... 目的观察NS5ATP9对饥饿诱导肝母细胞瘤HepG2细胞凋亡的作用随时间的变化。方法将NS5ATP9的表达载体、siRNA小分子干扰及其各自的对照分别转染HepG2细胞48小时后,分别用EBSS饥饿细胞12小时、24小时、36小时和48小时后,利用Annexin V/7-AAD流式细胞术检测细胞凋亡率的变化。同时利用化学发光法检测胱冬肽酶-3/7(caspase-3/7)的活性变化,观察饥饿不同时间点NS5ATP9对细胞凋亡的作用变化。结果①与对照组相比,NS5ATP9过表达组在HepG2饥饿24小时、36小时和48小时后,总凋亡率显著减低(t=17.132、9.138、17.318,P=0.003、0.012、0.003);12小时、36小时和48小时caspase-3/7酶活性显著减低(t=7.637、6.944、13.490,P=0.017、0.02、0.005),二者均以48小时最显著。②与对照组相比,si-NS5APT9转染组在HepG2饥饿36小时和48小时总凋亡率显著增加(t=-5.064、-4.342,P=0.034、0.049),12小时、36小时和48小时caspase-3/7酶活性显著增加(t=-8.837、-7.469、-18.630,P=0.013、0.017、0.003),二者均以48小时最显著。结论在HepG2细胞中NS5ATP9能显著抑制饥饿诱导的细胞凋亡,随着饥饿时间的延长,NS5ATP9对细胞凋亡率的抑制越明显,以48小时最为显著。 展开更多
关键词 NS5atp9 饥饿 细胞凋亡
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棉花线粒体atp9基因的克隆和转录研究获取渠道分析
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作者 史计 张锐 +2 位作者 石庆华 张晓 郭三堆 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期25-32,共8页
以三系杂交棉胞质雄性不育系P30A、保持系P30B和恢复系Y18为材料,通过Tail-PCR从可育胞质获得线粒体atp9基因序列,并利用Northern blot分析了atp9基因在棉花幼蕾的的转录情况。结果显示:在三系中atp9基因均存一个0.5 kb的强杂交带和一个... 以三系杂交棉胞质雄性不育系P30A、保持系P30B和恢复系Y18为材料,通过Tail-PCR从可育胞质获得线粒体atp9基因序列,并利用Northern blot分析了atp9基因在棉花幼蕾的的转录情况。结果显示:在三系中atp9基因均存一个0.5 kb的强杂交带和一个1.0 kb的弱杂交带,杂交结果无明显差异;三系中atp9基因编码区共有7个编辑位点,第7个编辑位点密码子由于编辑转变为终止密码子使翻译提前终止;atp9基因在保持系中幼蕾的编辑频率要明显低于不育系和恢复系;发现atp9基因的编辑与棉花胞质形式相关,而且不同的核背景也会影响编辑率,推测线粒体atp9基因与棉花的胞质雄性不育具有一定的相关性,但有待更进一步分析。 展开更多
关键词 棉花 线粒体 atp9基因 TAIL-PCR Northernblot RNA编辑
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粗毛栓菌atp9基因的克隆、表达及序列分析
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作者 雍彬 司文杰 +1 位作者 陶宗娅 严伟 《四川师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期884-888,共5页
ATP合酶是生物体内能量代谢的关键酶,参与多种氧化磷酸化和光合磷酸化反应.atp9基因是ATP合酶的重要组成部分,其编码了ATP合酶A亚基上第9亚单位,与呼吸作用和光合作用密切相关.本研究利用atp9基因在进化过程中高度保守的特点,据已知近... ATP合酶是生物体内能量代谢的关键酶,参与多种氧化磷酸化和光合磷酸化反应.atp9基因是ATP合酶的重要组成部分,其编码了ATP合酶A亚基上第9亚单位,与呼吸作用和光合作用密切相关.本研究利用atp9基因在进化过程中高度保守的特点,据已知近缘真菌基因序列,设计并合成了一对引物,以粗毛栓菌mRNA反转录得到的cDNA第一链为模板,PCR扩增得到atp9基因完整序列,并连接于原核表达载体pET32a(+)上.测序与序列分析表明:该克隆片段全长222 bp,共编码73个氨基酸,翻译的蛋白质分子量是7.35 kDa.转化大肠杆菌后经IPTG诱导,可高效表达外源融合蛋白,分子量大小与预测结果一致.经过同源比对和进化树分析,该克隆基因编码的氨基酸序列与可可丛枝病菌(Crinipellis perniciosa)和瓣环栓菌(Trametes cingulata strain ATCC 26747)中相对应的氨基酸序列相似度最高.本实验为未来进一步研究粗毛栓菌atp9基因和其蛋白功能,阐明其调控和作用机制奠定了基础. 展开更多
关键词 atp9基因 原核表达 序列分析 粗毛栓菌
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Beclin 1介导NS5ATP9对饥饿诱导的HepG2细胞凋亡的作用 被引量:1
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作者 全敏 邢卉春 《肝脏》 2022年第7期782-784,788,共4页
目的探讨Beclin 1在NS5ATP9抑制饥饿诱导肝母细胞瘤HepG2细胞凋亡中的作用。方法将HepG2细胞用EBSS饥饿不同时间点,通过蛋白质印迹法检测NS5ATP9、Beclin1及bax蛋白的表达变化;将NS5ATP9的siRNA及过表达载体分别转染HepG2细胞48 h后,用E... 目的探讨Beclin 1在NS5ATP9抑制饥饿诱导肝母细胞瘤HepG2细胞凋亡中的作用。方法将HepG2细胞用EBSS饥饿不同时间点,通过蛋白质印迹法检测NS5ATP9、Beclin1及bax蛋白的表达变化;将NS5ATP9的siRNA及过表达载体分别转染HepG2细胞48 h后,用EBSS饥饿细胞24 h,通过蛋白质印迹检测bax的变化;应用Beclin 1siRNA抑制Beclin 1表达后,转染NS5ATP9过表达载体,EBSS饥饿细胞24 h,利用化学发光法检测胱冬肽酶-3/7(caspase-3/7)的活性变化,同时用蛋白质印迹法检测NS5ATP9、Beclin1,bax蛋白的表达变化。结果饥饿HepG2细胞0、6、12、18、24 h后,NS5ATP9及bax的蛋白表达量相应升高。NS5ATP9表达被抑制后,bax蛋白表达量增加。饥饿HepG2细胞24 h后,Beclin 1表达被抑制,caspase-3/7的活性增加(P=0.001),NS5ATP9抑制caspase-3/7活性的作用减弱(P<0.01)。NS5ATP9对bax的负性调控作用减弱。结论Beclin 1通过下调bax的表达部分参与了NS5ATP9抑制饥饿诱导HepG2细胞凋亡的作用。 展开更多
关键词 NS5atp9 饥饿 细胞凋亡 Beclin 1 bax
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NS5 ATP9抑制血清饥饿诱导的HepG2细胞凋亡 被引量:2
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作者 赵崇山 刘顺爱 +3 位作者 王琦 张锦前 赵龙凤 成军 《中华实验和临床感染病杂志(电子版)》 CAS 2012年第2期1-4,共4页
目的探讨HCV NS5A反式激活基因NS5ATP9对肝癌细胞系HepG2细胞凋亡的影响。方法将NS5ATP9基因表达质粒、NS5ATP9干扰RNA质粒及各自的对照空质粒转染到HepG2细胞中,48h后换无血清培养基培养24h诱导细胞凋亡,采用实时荧光定量PCR验证转染后... 目的探讨HCV NS5A反式激活基因NS5ATP9对肝癌细胞系HepG2细胞凋亡的影响。方法将NS5ATP9基因表达质粒、NS5ATP9干扰RNA质粒及各自的对照空质粒转染到HepG2细胞中,48h后换无血清培养基培养24h诱导细胞凋亡,采用实时荧光定量PCR验证转染后NS5ATP9mRNA表达水平的变化,采用Annexin V/7-AAD流式细胞术检测细胞凋亡情况,JC-1检测线粒体膜电位,Western blot检测Bax蛋白表达,综合观察NS5ATP9对HepG2细胞血清饥饿诱导凋亡的影响。结果 Annexin V/7-AAD检测结果显示,和对照组细胞相比NS5ATP9过表达组早期凋亡和总凋亡率显著减少(P<0.05);而NS5ATP9干扰RNA组细胞的早期凋亡、晚期凋亡和总凋亡率均显著增加(P<0.05)。JC-1检测结果显示,和对照组相比NS5ATP9过表达组细胞线粒体膜电位保持正常形式的比例增加,而出现去极化电位形式的比例显著减少(P<0.05);而NS5ATP9干扰RNA组线粒体膜电位保持正常形式的比例显著减少(P<0.05)。Western blot检测结果显示,NS5ATP9干扰RNA组促凋亡分子Bax表达量显著升高(P<0.05),NS5ATP9过表达组Bax表达量则有下降趋势。结论 NS5ATP9基因抑制血清饥饿诱导的HepG2细胞凋亡,其机制可能是通过线粒体途径实现。 展开更多
关键词 NS5atp9基因 细胞凋亡 线粒体
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Alterations of RNA Editing for the Mitochondrial ATP9 Gene in a New orf220-type Cytoplasmic Male-sterile Line of Stem Mustard (Brassica juncea var. tumida) 被引量:8
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作者 Jing-Hua Yang 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2007年第5期672-677,共6页
RNA editing for the mitochondrlal ATP9 gene of encoding regions has been observed in both cytoplasmic malesterile and maintainer lines of stem mustard, where its editing capacity varied spatially and temporally in the... RNA editing for the mitochondrlal ATP9 gene of encoding regions has been observed in both cytoplasmic malesterile and maintainer lines of stem mustard, where its editing capacity varied spatially and temporally in the cytoplasmic male sterility (CMS) line. There were four RNA editing sites for the mitochondrial ATP9 gene according to Its normal editing sites in mustard, of which three sites occurred as C-to-U changes and one as a U-to-C change. As a result, the hydrophobicity of deduced ATP9 protein was reduced due to the conversions at its 17th, 45th and 64th positions. Meanwhile, the conservation of deduced ATP9 protein was enhanced by changes at the 56th position. Loss of a specific editing site for ATP9 was observed in juvenile roots, senile roots, senile leaves and floret buds of the CMS line. Comparatively, complete RNA editing for ATP9 gene was retained in juvenile roots, juvenile leaves and floret buds of its maintainer line; however, the loss of a specific editing site for ATP9 gene occurred at senile roots and senile leaves in its maintainer line. These observations allow us to produce a hypothesis that the dysfunction of a specific mitochondrial gene arising from RNA editing could probably be a factor triggering CMS and organ senescence through unknown cross-talk pathways during development. 展开更多
关键词 atp9 Brassica juncea cytoplasmic male sterility RNA editing.
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