黄岩凤仙花叶绿体atpB-rbcL序列的克隆与分析

【目的】探明黄岩凤仙花(Impatiens huangyanensis)atpB-rbcL序列的特征及其分类地位,为后续开展遗传结构和遗传多样性研究奠定基础。【方法】在野外采样后利用PCR方法克隆黄岩凤仙花的atpB-rbcL全长,借助生物信息学手段进行序列分析,并构建系统发育树。【结果】黄岩凤仙花atpB-rbcL序列的全长为764 bp,GC值为27.5%;与淡黄绿凤仙花(I.chloroxantha)、阔萼凤仙花(I.platysepala)和武夷凤仙花(I.wuyiensis)的相似性最高,达98%以上;经多重比对,凤仙花属植物atpB-rbcL存在较多的插入、缺失、转换和颠换现象;经系统发育分析,黄岩凤仙花与淡黄绿凤仙花、阔萼凤仙花和武夷凤仙花处于同一组,亲缘关系最接近。【结论】叶绿体atpB-rbcL具有较高的变异,可用于黄岩凤仙花的分子鉴定。

基于叶绿体atpB-rbcL序列探讨猬草属和赖草属植物的系统发育和母系起源

对小麦族猬草属、赖草属(NsXm)、披碱草属(StH)及含不同染色体组(St、H、Ns、Eb、Ee、P、F、V、W)的近缘二倍体属共46个类群的叶绿体基因间隔区atpB-rbcL序列进行系统发育分析,探讨猬草属和赖草属植物系统发育关系及母系起源。结果显示,1)猬草属模式种H.patula与拟鹅观草属和披碱草属物种聚为一支,表明H.patula与披碱草属植物亲缘关系近,其母本来源为含St染色体组的拟鹅观草属物种;2)猬草、长芒猬草、4个新麦草属物种及滨麦和所有欧亚分布的赖草属物种聚在一支,说明猬草、长芒猬草与欧亚赖草亲缘关系较近,其母本供体来自含Ns染色体组的新麦草属物种;3)高丽猬草和东北猬草与北美赖草及冰草属、旱麦草属、大麦属物种处于同一分支,表明高丽猬草和东北猬草与北美赖草具有较近亲缘关系,其母本供体为未知来源的Xm染色体组。研究结果支持将H.patula组合到披碱草属中,猬草、长芒猬草、高丽猬草和东北猬草应组合到赖草属中。

基于cpDNA atpB-rbcL非编码序列分析桫椤种群遗传结构和遗传多样性,以贵州赤水桫椤国家级自然保护区为例

以PCR产物克隆后测序的方法测定了贵州赤水桫椤国家级自然保护区3个种群59个个体的叶绿体DNA（cpDNA）atpB—rbcL非编码区序列。序列长度介于727～732bp之间，具长度多态性，A＋T百分比含量较高，介于63．27％～63．89％之间。遗传多样性水平较低，表现出较高的单倍型多样（h=0．639）和低的核苷酸多样性（Dij=0．00028）并存的特征，提示现有种群可能源自一个有效群体规模较小的种群的快速扩张，扩张时间尚短，不足以形成更为复杂的遗传结构。种群间的高基因流Nm、低遗传分化度峙、AMOVA分析以及DNA歧异度结果一致显示各种群间无明显的遗传分化。

叶绿体atpB-rbcL序列分析在核果类果树系统发育研究中的应用

为重建核果类果树的系统发育,选择桃、李、梅、杏、樱桃各4～5个主要种或变种,共24个基因型,测定了其叶绿体非编码区atpB-rbcL序列。以桂樱为外种群,用PAUP软件计算数据集的得分,Modeltest筛选最佳模型和参数,Mega计算遗传距离、变异,最大简约法构建系统发育树。结果表明,1)atpB-rbcL在核果类果树各组间分子进化速率不同,差异公布不均衡;2)樱桃较其他核果类果树原始;李、梅、杏亲缘关系较近,梅、杏关系最近。核果类果树是一个单系群,由一个共同的祖先沿着2个方向进化,一枝进化为樱桃,另一枝沿不同的途径产生桃、李、梅、杏等核果类果树。

基于叶绿体DNA atpB-rbcL区序列探讨石蒜属种间系统发育关系

为了探讨石蒜属(Lycoris Herb.)植物的种间系统发育关系,对石蒜属植物95份材料,包括15种4变种及2个人工杂种的叶绿体DNAatpB-rbcL间隔区进行了测序,结合花部形态和核型特征,探讨了石蒜属种间系统关系及其可能的杂交起源。系统发育树的分析结果表明,矮小石蒜(L.radiata var.pumila)和换锦花(L.sprengeri)与2个人工杂交种、麦秆石蒜(L.straminea)、江苏石蒜(L.houdyshelii)、短蕊石蒜(L.caldwellii)和乳白石蒜(L.albiflora)具有密切的亲缘关系。atpB-rbcL序列揭示的石蒜属种间关系与染色体核型的分类结果部分一致,主要表现在具有近端部着丝粒(A)染色体的种与具有中部(M)和端部(T)着丝粒染色体的种各成一支,与形态和染色体分类结果一致;不同之处在于具有中部、端部和近端部着丝粒染色体的种分散在两个主要分支内,进一步验证了具有中部、端部和近端部3种着丝粒类型染色体组的石蒜,如麦秆石蒜、江苏石蒜、短蕊石蒜和乳白石蒜等,是杂交起源的假设,结合2个人工杂交种分析,揭示了短蕊石蒜和乳白石蒜的近端部着丝粒染色体来源于换锦花;麦秆石蒜和江苏石蒜近端部着丝粒染色体来源于矮小石蒜。

寒区ATPB基层抗冻性能研究

开级配沥青稳定碎石基层(ATPB)是一种路面内部排水结构。这种基层具有较大的空隙率,能及时排走滞留在路面内部的水分,并能有效地减少反射裂缝的发生。北方寒冷地区路面损坏很多时候是由于冻胀等因素所引起的,这种基层可以减小水分的冻胀作用,增加中面的使用寿命。文中研究ATPB基层材料的选择要求,用大型马歇尔试件进行冻融循环试验来描述其抗冻性能,分析ATPB基层抗冻性能的影响因素,并提出寒冷地区的适用性。

桫椤atpB-rbcL序列2种测序方法的比较分析

[目的]比较2种方法进行桫椤atpB-rbcL序列测定的测序效果。[方法]通过PCR产物直接测序和克隆测序对桫椤叶绿体atpB-rbcL基因间隔序列进行测定与分析。[结果]结果表明,桫椤atpB-rbcL序列直接测序所得峰形紊乱,PolyT后出现多重峰;克隆测序结果峰形清晰,无干扰。[结论]对于桫椤atpB-rbcL序列测定,克隆测序优于直接测序。

基于ITS、atpB-rbcL序列的醉翁榆(Ulmus gaussenii)与相近榆属植物的亲缘关系

濒危植物保护生物学研究已成为生态学领域的研究热点之一.为了廓清我国特有濒危植物醉翁榆(Ulmus gaussenii)与相近榆属植物的系统地位,用分子标记ITS和atpB-rbcL手段分析醉翁榆与其他榆属相关种的亲缘关系,结果表明:24种榆属植物atpB-rbcL扩增片段长度为735～834 bp,G+C的含量在29.3%～31.6%之间,并没有发生很大的偏差;基于ITS(包括5.8 s)扩增片段,醉翁榆与黑榆系的毛果旱榆、栓枝春榆以及榆系中的大果榆、脱皮榆(U.lamellosa)相近;基于atpB-rbcL扩增片段,醉翁榆与榆系中的大果榆、脱皮榆以及明陵榆的关系比较近,两种标记都表现出醉翁榆与黑榆系中变种毛果旱榆、栓枝春榆的关系比较近;atpB-rbcL的NJ和Bayesian树完全支持榆属组下的分类以及榆属系统的演化关系.

基于18S rDNA、rbcL和atpB序列的轮藻科植物的系统发育研究

为找到适宜用于轮藻科植物系统发育研究的分子片段,对本研究所选轮藻进行18S rDNA、rbcL、atpB及18S rDNA-rbcL-atpB三基因联合序列的多样性分析,并通过构建系统进化树的方法,开展系统发育研究.结果表明,18S rDNA序列较适宜用于研究轮藻科下两个族和各属间的分类问题,但进一步对属内轮藻进行分类需要借助变异程度更高的序列;rbcL、atpB序列变异程度高于18S rDNA序列,但两者不适宜单独用于轮藻科植物的系统发育研究;三基因联合序列的种间、种内遗传距离有一定差异,种间遗传距离(0.002~0.097)大于种内遗传距离(0~0.001),且所得进化树的拓扑结构与传统形态学分类结构一致,属内轮藻分类不再混乱,进化树呈现良好的拓扑结构.综上所述,18S rDNA-rbcL-atpB三基因联合分析后可将形态近似的轮藻分开,解决本研究选取的轮藻科植物的分类问题.

设ATPB的半刚性基层沥青路面结构疲劳特性分析

采用断裂力学方法给出了设沥青稳定排水基层(ATPB)的半刚性基层沥青路面结构裂缝尖端应力场和位移场,进而推导出了裂缝尖端的应力强度因子计算公式;利用有限元法分别计算了半刚性基层沥青路面结构和设ATPB的半刚性基层沥青路面结构裂缝尖端的应力强度因子,并利用Paris公式预估了这2种路面结构的疲劳寿命。结果表明:设ATPB可明显提高半刚性基层沥青路面结构疲劳寿命,具有延缓和抑制半刚性基层沥青路面结构反射裂缝的作用。

ATPB开级配沥青稳定碎石柔性基层在市政道路改造中的应用

反射裂缝是沥青路面的主要病害之一,针对这一问题,提出了大粒径沥青混合料作为柔性基层应用于市政道路。因为其具有良好的排水性和较高的耐久性,针对这一特性,在瓯江路二次成型中,应用ATPB沥青碎石大粒径沥青混合料作为基层,取得了良好的效果。

ATPB抑制沥青路面反射裂缝的研究

通过有限元法计算了半刚性基层沥青路面和铺设ATPB沥青路面结构的应力强度因子,并利用Paris公式预估了这两种路面结构的疲劳寿命,结果表明,ATPB可有效抑制半刚性基层沥青路面的反射裂缝。

ATPB合理空隙率的设计研究

首先对沥青路面内部设计渗入量进行分析研究,设计出不同空隙率的ATPB矿料级配,同时进行ATPB混合料的各项性能试验,分析并建立ATPB混合料空隙率与排水性能、空隙率与使用性能的相关关系。在此基础上,提出ATPB混合料合理空隙率的设计方法,为ATPB合理空隙率的研究奠定基础。

沥青稳定碎石排水基层(ATPB)混合料设计

结合山东高速公路沥青碎石排水基层混合料的设计实践,提出了沥青稳定碎石排水基层混合料的设计指标和设计方法。

叉蕨科是一个多系类群:基于叶绿体rbcL和atpB基因的分析

叉蕨科植物为泛热带分布,全世界约有20余属,中国产8属.本研究以属为单位进行类群取样,利用来自叶绿体基因组的两个基因(rbcL和atpB)对叉蕨科中国产全部8属植物进行系统发育重建,用以探讨叉蕨科及其科下系统发育关系.研究结果显示,传统(秦仁昌系统)的叉蕨科是一个多系类群,肋毛蕨属Ctenitis,轴鳞蕨属Dryopsis和节毛蕨属Lastreopsis应该从叉蕨科分出而作为鳞毛蕨科成员,黄腺羽蕨属Pleocnemia也暂时置于鳞毛蕨科.轴脉蕨属Ctenitopsis,沙皮蕨属Hemigramma,牙蕨属Pteridrys,地耳蕨属Quercifilix和叉蕨属Tectaria在系统发育树上聚为一支,形成一个得到强烈支持的单系类群.在rbcL单基因分析中,爬树蕨属Arthropteris同上述单系类群聚在一起.本研究基于叶绿体基因的证据对叉蕨科进行了重新定义.

沥青稳定排水基层(ATPB)合理级配范围研究

文章首先参照国内外公称最大粒径为20mm、25mm和30mm的ATPB矿料级配范围,初拟ATPB大致级配范围;接着采用均匀与正交试验设计方法,通过试验分析ATPB混合料的空隙率与不同孔径筛孔的通过率关系,建立空隙率与不同孔径筛孔的通过率的回归方程,结合内插法,提出公称最大粒径20mm、25mm和30mm的ATPB合理级配范围。

设ATPB的半刚性基层沥青混凝土路面结构分析及设计

设沥青稳定排水基层(ATPB)能将进入路面结构内的水分迅速排除到路面外,提高路面结构承载能力,同时可抑制半刚性基层沥青混凝土路面的反射裂缝,延长使用寿命。首先对沥青混凝土路面内部设计渗入量进行分析研究,建立ATPB混合料有效空隙率Ve最小值与沥青混凝土路面内部设计渗入率Ia(cm3/hcm2缝)、排水基层厚度h(cm)和路面纵坡iz(%)的多元回归模型。其次对设ATPB的半刚性基层沥青混凝土路面进行力学分析,建立沥青下面层层底弯拉应力xσ与排水基层模量E(MPa)、厚度h(m)、与沥青混凝土面层之间接触参数α的多元回归模型,并提出设ATPB的半刚性基层沥青混凝土路面的设计指标。进而提出满足排水功能与结构强度的ATPB的厚度设计方法,并将其成功应用于盐通高速公路试验路ATPB的厚度设计。

青红高速ATPB目标配合比设计与备料方案

青红高速沥青稳定排水基层(ATPB)试验路拟实施三种方案:方案一采用高粘附性沥青,方案二采用SBS改性沥青,方案三采用70#道路石油沥青;矿料均采用石灰岩,其中粗集料分为10～30mm、10～20mm和5～10mm三种规格(分别简称1#料、2#料和3#料);细集料分为3～5mm和0～3mm机制砂两种规格(简称4#料和5#料)。通过对青红高速试验路三种路面结构方案进行ATPB混合料目标配合比设计,并根据目标配合比设计结果给出了备料方案,以指导试验路工程施工。

青红高速ATPB试验路铺筑与检测

根据沥青稳定排水基层(ATPB)技术室内研究结果,在青红高速路面二标重车和轻车方向选取3个路段铺筑3种方案ATPB试验路。现场检测结果表明,3种方案ATPB试验路实施结果是令人满意的。

设ATPB的半刚性基层沥青路面力学分析

在设沥青稳定排水基层(ATPB)的半刚性基层沥青路面结构中,半刚性基层材料多采用无机结合料稳定碎砾石,其模量一般要大于ATPB模量,形成了一种“软夹层”的半刚性基层沥青路面结构。通过对青红高速设3种方案ATPB试验路路面结构的力学分析,结果表明,3种方案路面结构强度均能满足使用要求,但对方案3路面结构的竣工验收弯沉值应根据力学计算结果予以调整。