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auf基因对禽致病性大肠杆菌鸭源株的细胞黏附及动物致病性的影响
被引量:
1
1
作者
王颢锦
汤芳
+5 位作者
诸葛祥凯
胡林
陈玲
李亚芯
李德志
戴建君
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期624-629,共6页
[目的]本文旨在研究禽致病性大肠杆菌auf基因的功能。[方法]利用Red同源重组技术敲除auf基因,构建DE205BΔauf缺失菌株,并分析缺失菌株和野生菌株的生物学特性及致病力差异。[结果]生物学特性试验表明:与野生菌株相比,缺失菌株的生长特...
[目的]本文旨在研究禽致病性大肠杆菌auf基因的功能。[方法]利用Red同源重组技术敲除auf基因,构建DE205BΔauf缺失菌株,并分析缺失菌株和野生菌株的生物学特性及致病力差异。[结果]生物学特性试验表明:与野生菌株相比,缺失菌株的生长特性未发生明显改变,但对酸性(乙酸,pH 4.0和5.0,20 min)、碱性(Tris-HCl,pH 10.0,30 min)和高渗环境(2.5 mol·L-1NaCl,1 h)的耐受能力极显著降低(P<0.001),其相对存活率分别降低86.7%、77.3%、59.0%和98.3%;抗血清杀菌能力也显著下降,在100%、50%及25%稀释度的血清中极显著降低(P<0.01);DE205BΔauf缺失菌株对DF-1细胞的相对黏附能力显著降低,下降了80.7%。动物试验表明:DE205BΔauf对小鼠及雏鸭的致病力及在其体内的定殖能力均降低。[结论]auf基因在禽致病性大肠杆菌的感染及致病过程中发挥重要作用。
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关键词
禽致病性大肠杆菌
菌毛
auf基因
黏附
下载PDF
职称材料
菜心群体中AUF2基因的遗传变异及其与农艺性状的关联分析
被引量:
2
2
作者
黄依琳
许玉富
+4 位作者
李荣华
李光光
张华
郭培国
夏岩石
《广东农业科学》
CAS
2023年第4期33-41,共9页
【目的】通过检测Auxin Up-regulated F-box protein2(AUF2)基因在菜心群体中的自然变异,挖掘其优异等位基因,为菜心分子辅助育种提供理论参考。【方法】采用PCR扩增后直接测序的方法,检测AUF2基因在156份菜心种质材料中的自然变异,利用...
【目的】通过检测Auxin Up-regulated F-box protein2(AUF2)基因在菜心群体中的自然变异,挖掘其优异等位基因,为菜心分子辅助育种提供理论参考。【方法】采用PCR扩增后直接测序的方法,检测AUF2基因在156份菜心种质材料中的自然变异,利用Tassel 5.0软件的混合线性模型(MLM)对AUF2基因的变异位点与菜心群体的株高、单株质量、最大叶长、最大叶宽、最大叶柄长和叶绿素含量(SPAD)等6个农艺性状进行关联分析,以期发现显著影响菜心农艺性状的变异位点,并确定其优异等位变异及单倍型。【结果】经测序分析,在AUF2基因的2996 bp扩增区域内共检测到34个变异位点,构成36个单倍型,表现出较高的核苷酸多样性(π=0.00503)和单倍型多样性(Hd=0.780),其上游非编码区1498 bp内含26个SNP和2个InDel位点,编码区960 bp内含5个SNP和1个InDel位点,而下游非编码区538 bp范围没有检测到变异位点。中性检验显示,AUF2基因在群体中的Tajima’s D值、Fu and Li’s D*值和Fu and Li’s F*值均为正值,且显著偏离中性选择,可能是群体平衡选择的结果。经关联分析发现,4个SNP位点与菜心的单株质量、最大叶长、最大叶宽和最大叶柄长等4个农艺性状呈显著相关性,其表型解释率在5.04%~6.52%范围;4个优异等位变异构成的单倍型Hap2能显著增加菜心的单株质量,极显著地提高最大叶柄长的长度。【结论】AUF2基因在菜心群体中存在丰富的变异,对菜心的部分农艺性状有显著影响,其优异等位变异和单倍型将有利于菜心品种的遗传改良。
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关键词
菜心
auf
2
基因
多态性
农艺性状
关联分析
优异等位位点
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职称材料
题名
auf基因对禽致病性大肠杆菌鸭源株的细胞黏附及动物致病性的影响
被引量:
1
1
作者
王颢锦
汤芳
诸葛祥凯
胡林
陈玲
李亚芯
李德志
戴建君
机构
南京农业大学动物医学院/农业部动物细菌学重点实验室
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期624-629,共6页
基金
中央高校基本科研业务费专项资金(KYZ201326)
江苏省高校优势学科建设项目
文摘
[目的]本文旨在研究禽致病性大肠杆菌auf基因的功能。[方法]利用Red同源重组技术敲除auf基因,构建DE205BΔauf缺失菌株,并分析缺失菌株和野生菌株的生物学特性及致病力差异。[结果]生物学特性试验表明:与野生菌株相比,缺失菌株的生长特性未发生明显改变,但对酸性(乙酸,pH 4.0和5.0,20 min)、碱性(Tris-HCl,pH 10.0,30 min)和高渗环境(2.5 mol·L-1NaCl,1 h)的耐受能力极显著降低(P<0.001),其相对存活率分别降低86.7%、77.3%、59.0%和98.3%;抗血清杀菌能力也显著下降,在100%、50%及25%稀释度的血清中极显著降低(P<0.01);DE205BΔauf缺失菌株对DF-1细胞的相对黏附能力显著降低,下降了80.7%。动物试验表明:DE205BΔauf对小鼠及雏鸭的致病力及在其体内的定殖能力均降低。[结论]auf基因在禽致病性大肠杆菌的感染及致病过程中发挥重要作用。
关键词
禽致病性大肠杆菌
菌毛
auf基因
黏附
Keywords
avian pathogenic Escherichia coli
fimbriae
auf
gene
adhesive
分类号
Q939.94 [生物学—微生物学]
下载PDF
职称材料
题名
菜心群体中AUF2基因的遗传变异及其与农艺性状的关联分析
被引量:
2
2
作者
黄依琳
许玉富
李荣华
李光光
张华
郭培国
夏岩石
机构
广州大学生命科学学院作物抗逆国际合作研究中心
广州市农业科学研究院
出处
《广东农业科学》
CAS
2023年第4期33-41,共9页
基金
广州市科技计划项目(202102010414)
广东省乡村振兴战略专项资金种业振兴项目(2022-NPY-03-001)。
文摘
【目的】通过检测Auxin Up-regulated F-box protein2(AUF2)基因在菜心群体中的自然变异,挖掘其优异等位基因,为菜心分子辅助育种提供理论参考。【方法】采用PCR扩增后直接测序的方法,检测AUF2基因在156份菜心种质材料中的自然变异,利用Tassel 5.0软件的混合线性模型(MLM)对AUF2基因的变异位点与菜心群体的株高、单株质量、最大叶长、最大叶宽、最大叶柄长和叶绿素含量(SPAD)等6个农艺性状进行关联分析,以期发现显著影响菜心农艺性状的变异位点,并确定其优异等位变异及单倍型。【结果】经测序分析,在AUF2基因的2996 bp扩增区域内共检测到34个变异位点,构成36个单倍型,表现出较高的核苷酸多样性(π=0.00503)和单倍型多样性(Hd=0.780),其上游非编码区1498 bp内含26个SNP和2个InDel位点,编码区960 bp内含5个SNP和1个InDel位点,而下游非编码区538 bp范围没有检测到变异位点。中性检验显示,AUF2基因在群体中的Tajima’s D值、Fu and Li’s D*值和Fu and Li’s F*值均为正值,且显著偏离中性选择,可能是群体平衡选择的结果。经关联分析发现,4个SNP位点与菜心的单株质量、最大叶长、最大叶宽和最大叶柄长等4个农艺性状呈显著相关性,其表型解释率在5.04%~6.52%范围;4个优异等位变异构成的单倍型Hap2能显著增加菜心的单株质量,极显著地提高最大叶柄长的长度。【结论】AUF2基因在菜心群体中存在丰富的变异,对菜心的部分农艺性状有显著影响,其优异等位变异和单倍型将有利于菜心品种的遗传改良。
关键词
菜心
auf
2
基因
多态性
农艺性状
关联分析
优异等位位点
Keywords
flowering Chinese cabbage
auf
2 gene
polymorphism
agronomic trait
association analysis
elite allele
分类号
S634.5 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
auf基因对禽致病性大肠杆菌鸭源株的细胞黏附及动物致病性的影响
王颢锦
汤芳
诸葛祥凯
胡林
陈玲
李亚芯
李德志
戴建君
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
下载PDF
职称材料
2
菜心群体中AUF2基因的遗传变异及其与农艺性状的关联分析
黄依琳
许玉富
李荣华
李光光
张华
郭培国
夏岩石
《广东农业科学》
CAS
2023
2
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职称材料
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