15种熊蜂全基因组SSR分布规律研究

【目的】阐明熊蜂全基因组SSR分布规律,为熊蜂SSR分子标记筛选及遗传进化分析提供参考依据。【方法】利用MSDB v2.4.3和Krait搜索15种已完成测序组装熊蜂(每个种代表1个亚属)基因组中的SSR序列,采用Excel 2019统计全基因组大小、GC含量、SSR类型、序列总数、相对丰度、相对密度、碱基重复类型及各重复类型相对丰度等相关信息,以Origin 2021进行绘图。【结果】基因组最大(262.4 Mb)的是西伯熊蜂;GC含量最高(39.40%)的是稳纹熊蜂,且其SSR序列总数最多(74676条)、相对丰度最高(323.53 loci/Mb)、相对密度最大(7094.37 bp/Mb)、及SSR占比最高(0.71%)。SSR类型中以纯合微卫星(P-SSR)最丰富,均占总SSR的92.00%以上,以卡氏熊蜂的占比最高(95.45%)、稳纹熊蜂的占比最低(92.07%)。除猛熊蜂和亲熊蜂外,其余13种熊蜂全基因组SSR的二碱基重复类型相对密度均最高(1362.789~2986.958 bp/Mb);除猛熊蜂、亲熊蜂和图氏熊蜂外,其余12种熊蜂全基因组SSR的二碱基重复类型总数和相对丰度均最高。15种熊蜂全基因组SSR出现频率较高的优势碱基序列有A、AG、AT、AAT、AAAT、AAAG、AATAT及AAAAG等,单碱基至五碱基重复类型的优势碱基序列相对丰度随着碱基数的增多而逐渐减小,而六碱基重复类型的优势碱基序列存在明显差异。【结论】15种熊蜂全基因组SSR总数与基因组大小不成正比,单碱基和二碱基重复类型在全基因组SSR中的占比均较高,三碱基、四碱基、五碱基和六碱基重复类型的占比则随着碱基数的增多而依次降低,即碱基重复次数越高其稳定性及多态性越低。每种熊蜂全基因组SSR都显示出特有的碱基重复类型相对丰度及优势碱基序列,今后可考虑以SSR分子标记为桥梁开展熊蜂遗传发育模式及其调控机制等相关研究。

EST-SSR标记的开发及其在木本植物中的分布特点

随着基因组学的发展和高通量测序技术的应用,EST在很多植物中开展起来,为开发EST分子标记奠定了基础。近年来EST-SSR在木本植物研究报道较多,主要介绍了EST-SSR开发的一般步骤,综述了木本植物中EST-SSR的分布特点及其原因,并对今后的发展进行展望。

以轴心为基准的膨胀式无间隙配合夹具结构与研究

对于以轴心为基准的夹具设计,国内的企业基本上采取刚性的轴与孔配合。对零部件而言,一般以内孔为定位基准,工艺对定位孔精度是按被加工齿轮精度提高一个精度等级要求;对夹具而言,一般以配合外圆面为定位基准,其精度公差是按零部件内孔精度的公差的1/3要求。这种精度的选取和结构方式就形成了零部件制造精度提升瓶颈,因为无限提高配合精度都无法完全消除配合间隙,只要存在配合间隙就无法消除定位的不确定性。针对上述问题,研究采用均匀膨胀式夹具结构设计,通过定位面均匀膨胀,实现与齿坯定位内孔无间隙配合。

基于测序的人类白细胞抗原分型和PCR短串联重复序列技术在人胚胎干细胞鉴定中的应用

目的探讨基于测序的人类白细胞抗原分型（HLA—sequencing—basedtyping，HLA-SBT）和PCR短串联重复序列（short tandem repeat，STR）技术在人胚胎干细胞（human embryonic stem cell，hESC）应用前检测中的运用，建立人胚胎干细胞系的基因型档案。方法人胚胎干细胞系SYSU-1、SYSU-3，分别培养到20代、40代，应用PCR寡核苷酸特异测序探针（sequence specific olignucleotide probe，SSO）技术检测两株细胞系的HLA-A、-B、-DR位点的低分辨分型，再利用HLA—SBT技术检测两株细胞系的HLA-A、-B、-DR位点的高分辨分型。应用PCR—STR技术检测两株细胞系的基因遗传标记。结果获得两株hESC细胞系的HLA高分辨分型和STR基因型。结论可以运用HLA—SBT和PCR．STR技术建立人胚胎干细胞应用前的基因型档案。