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两株携带bla_(NDM)基因肠杆菌目细菌的分子流行病学特征研究
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作者 王健 李轶 +1 位作者 白振宇 崔世平 《中国合理用药探索》 CAS 2024年第6期33-39,共7页
目的:了解平顶山某医院两株携带bla_(NDM)基因肠杆菌目细菌临床分离株的分子流行病学特征,为该类病原菌的院内感染预防与控制提供理论依据。方法:收集2022年1~12月临床分离的耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌(CRE)。先通过聚合酶链反应(PCR)筛... 目的:了解平顶山某医院两株携带bla_(NDM)基因肠杆菌目细菌临床分离株的分子流行病学特征,为该类病原菌的院内感染预防与控制提供理论依据。方法:收集2022年1~12月临床分离的耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌(CRE)。先通过聚合酶链反应(PCR)筛选携带bla_(NDM)基因的CRE菌株,再对菌株携带的其他耐药基因[包括碳青霉烯酶、超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)和喹诺酮类耐药相关基因]进行扩增,并测序确认,通过多位点序列分型(MLST)的方法分析相同种属菌株间的亲缘关系。结果:收集的CRE中有2株检测到携带bla_(NDM)基因,其中1株为携带bla_(NDM)-1的弗氏柠檬酸杆菌,另1株为携带bla_(NDM)-5的大肠埃希菌。这两株菌同时携带多个耐药基因,表现为多重耐药。MLST结果显示,产NDM-1型金属酶的弗氏柠檬酸杆菌为ST85型,产NDM-5型金属酶的大肠埃希菌为ST736型,均不是常见流行克隆类型。采用bla_(NDM)探针进行Southern杂交的结果显示,bla_(NDM)-1基因定位于一个~54kb的质粒上,bla_(NDM)-5基因定位于一个~104kb的质粒上,两个携带bla_(NDM)基因的质粒均不能发生接合。结论:首次在平顶山地区报道携带bla_(NDM)基因的CRE菌株;两株菌均同时携带多个耐药基因;bla_(NDM)基因均位于质粒且都与插入序列(IS)移动元件相关,建议进一步加强院感监测及防控,防止耐药菌株的传播和流行。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌 新德里金属β-内酰胺酶(ndm) 感染 流行病学 耐药基因
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广东省某生猪屠宰场tet(X4)和bla_(NDM)阳性菌的流行特征
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作者 林宛楠 蔡钟鹏 +8 位作者 卢丽桃 吴敏怡 焦彦翔 岳超 陈家明 冯汇华 韩腾定 高延玲 吕鲁超 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2024年第5期21-29,共9页
为了探究广东省某生猪屠宰场中替加环素耐药基因tet(X4)和碳青霉烯耐药基因bla_(NDM)阳性菌的流行特征,本试验从广东省某生猪屠宰场采集94份不同来源样品(55份猪粪便、20份屠宰场环境和19份猪胴体),使用含替加环素和美罗培南的麦康凯琼... 为了探究广东省某生猪屠宰场中替加环素耐药基因tet(X4)和碳青霉烯耐药基因bla_(NDM)阳性菌的流行特征,本试验从广东省某生猪屠宰场采集94份不同来源样品(55份猪粪便、20份屠宰场环境和19份猪胴体),使用含替加环素和美罗培南的麦康凯琼脂培养基筛选替加环素和美罗培南不敏感菌株;采用PCR方法检测tet(X4)和bla_(NDM)基因阳性菌,并对阳性菌进行菌种鉴定;采用微量肉汤稀释法和琼脂稀释法测定阳性菌的药物敏感性。结果显示,所有样品的tet(X4)和bla_(NDM)阳性菌检出率分别为93.62%(88/94)和51.06%(48/94),其中tet(X4)基因阳性菌的检出率在猪粪便样品中最高(98.18%,54/55),其次是胴体样品(89.47%,17/19)和环境样品(85.00%,17/20);bla_(NDM)因阳性菌的检出率在环境样品中最高(80.00%,16/20),其次是猪粪便样品(47.27%,26/55)和胴体样品(31.58%,6/19)。2种耐药基因的主要携带菌种均为大肠杆菌,分别占比95.65%(88/92)和74.07%(40/54),另外也检测到tet(X4)阳性的弗格森埃希菌、阴沟肠杆菌和摩氏摩根菌,bla_(NDM)阳性的肺炎克雷伯菌、雷氏普罗威登斯菌和瓜里科州假单胞菌等。药敏试验结果显示,tet(X4)和bla_(NDM)阳性大肠杆菌均为多重耐药菌,其中tet(X4)阳性菌对四环素和氟苯尼考的耐药率为100%;bla_(NDM)阳性菌对头孢噻肟和头孢他啶的耐药率为100%;2种基因阳性菌均对黏菌素较为敏感。结果表明,该屠宰场tet(X4)和bla_(NDM)阳性菌污染严重,主要菌种为大肠杆菌。屠宰场tet(X4)和bla_(NDM)阳性菌的污染对食品安全和公共卫生构成威胁,提示应加强对生猪屠宰场中耐药菌污染情况调查和长期监测。 展开更多
关键词 tet(X4) bla_(ndm) 屠宰场 细菌耐药性
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奶牛养殖场环境中耐药基因bla_(NDM)的分布和传播特性分析
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作者 马妍 陈帅印 +2 位作者 丁冬 王亚 朱静媛 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2023年第6期828-835,共8页
目的:了解奶牛养殖场环境中耐药基因bla_(NDM)的分布情况及传播特性。方法:采用PCR法从河南省焦作市某地2个奶牛养殖场的奶牛养殖场饲养环境、动物(鼻拭子、粪便)和工人(咽拭子、粪便)样本中检测并分离bla_(NDM)阳性菌株,对bla_(NDM)基... 目的:了解奶牛养殖场环境中耐药基因bla_(NDM)的分布情况及传播特性。方法:采用PCR法从河南省焦作市某地2个奶牛养殖场的奶牛养殖场饲养环境、动物(鼻拭子、粪便)和工人(咽拭子、粪便)样本中检测并分离bla_(NDM)阳性菌株,对bla_(NDM)基因阳性大肠杆菌进行系统进化群、多位点序列分型、耐药表型和耐药基因分析;通过接合试验验证bla_(NDM)基因的可转移性;质粒稳定性试验分析携带bla_(NDM)基因的质粒在宿主细菌中的稳定性。结果:bla_(NDM)基因在奶牛场的总检出率为35.5%,成年母牛中bla_(NDM)基因的阳性检出率高于犊牛(P<0.001),从动物和工人粪便共分离出17株bla_(NDM-5)阳性大肠杆菌,bla_(NDM-5)阳性大肠杆菌属于系统进化群A群(11.8%)和B1群(88.2%),存在3种不同ST型(ST_(48)、ST_(n-1)、ST_(n-2))。17株bla_(NDM-5)阳性大肠杆菌均是多耐药菌株。所有菌株的bla_(NDM)基因位于接合性质粒,可以通过质粒接合转移至受体菌株中,且经过36代无抗培养后仍能在宿主细菌中稳定存在。结论:bla_(NDM)基因在奶牛养殖场流行率较高,主要的细菌宿主是大肠杆菌,且bla_(NDM)基因可通过质粒的接合转移进行水平传播。 展开更多
关键词 奶牛养殖场 大肠杆菌 bla_(ndm)基因 多位点序列分型 药敏试验
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1株携带bla_(NDM-1)的临床多重耐药豚鼠气单胞菌的基因组及表型鉴定
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作者 李玲 周宏伟 张嵘 《临床检验杂志》 CAS 2023年第2期123-127,共5页
目的分析从粪便筛查分离出的产NDM-1型碳青霉烯酶的豚鼠气单胞菌(XX182)的抗菌药物耐药表型和基因组特征,阐明该菌株的抗菌药物耐药机制及其耐药性转移的能力。方法肉汤微量稀释法检测该菌株的抗菌药物敏感性,PCR检测碳青霉烯酶耐药基... 目的分析从粪便筛查分离出的产NDM-1型碳青霉烯酶的豚鼠气单胞菌(XX182)的抗菌药物耐药表型和基因组特征,阐明该菌株的抗菌药物耐药机制及其耐药性转移的能力。方法肉汤微量稀释法检测该菌株的抗菌药物敏感性,PCR检测碳青霉烯酶耐药基因亚型(bla_(NDM)、bla_(VIM)、bla_(IMP)、bla_(KPC)),接合试验检测耐药基因的可转移性,通过全基因组测序(WGS)和生物信息学分析明确该菌株的基因组特征。结果该菌株对头孢菌素、碳青霉烯类、环丙沙星和多黏菌素耐药,对替加环素、阿米卡星和氨曲南敏感。该菌株携带多种抗菌药物耐药基因,主要包括bla_(NDM-1)、bla_(MOX-6)、bla_(RSA-1)、bla_(TEM-1)、aac(3)-Ⅱd、cmlA5、arr-2等。毒力因子分析发现其携带有极鞭毛、侧鞭毛、Ⅵ型分泌系统(T6SS)和溶血素A等毒力因子。结论该豚鼠气单胞菌对碳青霉烯类抗菌药物耐药主要由产NDM-1型碳青霉烯酶导致,且bla_(NDM-1)耐药基因位于不可接合质粒上。尽管目前气单胞菌属对碳青霉烯类耐药率较低,但仍应加强对该克隆菌株的监测。 展开更多
关键词 豚鼠气单胞菌 多重耐药 基因组测序 bla_(ndm-1)
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ST11肺炎克雷伯菌QL5株携带的质粒pQL5-NDM-KPC的研究
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作者 马超越 王笑 +2 位作者 刘真真 贾楠 朱元祺 《中国实验诊断学》 2024年第4期401-404,共4页
目的探讨肺炎克雷伯菌QL5株携带编码碳青霉烯酶基因的质粒及其特性。方法基于二代Illumina和三代Nanopore测序技术平台获得菌株的基因组和质粒序列,然后用一系列软件分析菌株的生物学信息。S1核酸酶切脉冲场凝胶电泳、质粒液相接合试验... 目的探讨肺炎克雷伯菌QL5株携带编码碳青霉烯酶基因的质粒及其特性。方法基于二代Illumina和三代Nanopore测序技术平台获得菌株的基因组和质粒序列,然后用一系列软件分析菌株的生物学信息。S1核酸酶切脉冲场凝胶电泳、质粒液相接合试验和稳定性试验检测菌株携带的质粒特性。结果生信分析显示:肺炎克雷伯菌QL5株携带的bla_(NDM-1)和bla_(KPC-2)基因位于同一个IncC/IncFII(PHN7A8)/IncR杂合质粒上(命名为pQL5-NDM-KPC);QL5株携带的pQL5-NDM-KPC可发生bla_(NDM-1)基因所在区域的片段丢失。结论经检索,携带bla_(NDM-1)和bla_(KPC-2)基因位于同一个IncC/IncFII(PHN7A8)/IncR杂合质粒pQL5-NDM-KPC(GenBank序列号:OR253888)上,为国内外首次报道。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 blaKPC-2 blandm-1 质粒
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鸭源奇异变形杆菌和摩氏摩根菌的分离鉴定、NDM耐药基因检测及中药体外抑菌试验
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作者 石玉节 柴贝贝 张彦昕 《畜牧与饲料科学》 2023年第5期121-128,共8页
[目的]确定引起广东省某鸭场鸭群发病的细菌性病原,调查分离菌株对抗菌药物的敏感性及NDM耐药基因携带情况,并筛选出针对分离菌株具有较好体外抑制作用的单味中药。[方法]采集发病鸭只的肝脏、脾脏等病料样本进行细菌分离培养,采用16S r... [目的]确定引起广东省某鸭场鸭群发病的细菌性病原,调查分离菌株对抗菌药物的敏感性及NDM耐药基因携带情况,并筛选出针对分离菌株具有较好体外抑制作用的单味中药。[方法]采集发病鸭只的肝脏、脾脏等病料样本进行细菌分离培养,采用16S rDNA序列PCR扩增及测序比对方法确定分离菌株的种属,利用纸片扩散法(K-B法)测定分离菌株对13种抗菌药物的敏感性,应用PCR法检测10种NDM耐药基因在分离菌株中的分布情况,采用肉汤二倍稀释法测定14种单味中药对分离菌株的最小抑菌浓度(MIC)。[结果]经革兰染色镜检、生化鉴定及16S rDNA序列分析,从发病鸭病料中分离、鉴定出1株奇异变形杆菌(SK1株)和1株摩氏摩根菌(SK2株)。SK1株和SK2株均对新霉素、头孢他啶、头孢噻肟、头孢哌酮敏感,对多西环素、复方新诺明、恩诺沙星、氟苯尼考、多黏菌素B耐药。SK1株10种NDM耐药基因均未检出,SK2株携带blaNDM-1基因,其他9种NDM耐药基因未检出。博落回对SK1株的抑菌效果最好,MIC为3.906 mg/mL;连翘对SK2株的抑菌效果最好,MIC为3.906 mg/mL。[结论]引起该鸭场鸭群发病的主要病原菌为奇异变形杆菌和摩氏摩根菌,可使用新霉素、头孢菌素类抗菌药物及中药博落回、连翘对患病鸭只进行治疗。 展开更多
关键词 分离鉴定 ndm耐药基因 奇异变形杆菌 摩氏摩根菌 中药 体外抑菌作用
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1株可裂解bla_(NDM-5)及mcr-1阳性大肠杆菌噬菌体的分离与生物学特性 被引量:3
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作者 刘畅 刘教 +3 位作者 陈进 王勉之 熊文广 曾振灵 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期857-866,共10页
旨在分离1株可裂解bla_(NDM-5)及mcr-1阳性大肠杆菌的噬菌体,探究该噬菌体的生物学特性,为防控bla_(NDM-5)及mcr-1阳性大肠杆菌感染提供新的技术思路。对分离出的噬菌体进行透射电镜观察、最佳感染复数、一步生长曲线等生物学特性试验... 旨在分离1株可裂解bla_(NDM-5)及mcr-1阳性大肠杆菌的噬菌体,探究该噬菌体的生物学特性,为防控bla_(NDM-5)及mcr-1阳性大肠杆菌感染提供新的技术思路。对分离出的噬菌体进行透射电镜观察、最佳感染复数、一步生长曲线等生物学特性试验及全基因组测序分析。结果显示:成功分离出1株大肠杆菌噬菌体vB_EcoM-ZQ1,该噬菌体属于有尾病毒目,肌尾病毒科,其最佳感染复数为0.1,潜伏期为20 min,裂解期为10 min,裂解量为92 PFU·cell^(-1)。在温度4~55℃、pH4~10条件下,该噬菌体都有较高的活性。其对多重耐药大肠杆菌有一定裂解作用,裂解率为25.5%。该噬菌体基因全长149112 bp,GC含量为49.1%,共有184个ORF,其中70个ORF编码功能蛋白,有2个ORF编码tRNA,并未发现含有耐药基因与毒力因子;经BLAST比对发现,噬菌体与Shigella phage phiSboM-AG3有92.37%的相似性,基于噬菌体末端酶大亚基构建的同源进化树结果可得结论,噬菌体vB_EcoM-ZQ1和与沙门菌噬菌体pSal-SNUABM-02的亲缘关系最近。综上提示,噬菌体vB_EcoM-ZQ1,生物学特性稳定,基因结构完整,为后续bla_(NDM-5)及mcr-1阳性大肠杆菌感染的防控奠定了一定前期基础。 展开更多
关键词 噬菌体 生物学特性 大肠杆菌 bla_(ndm-5) mcr-1
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广西地区动物源bla_(NDM)阳性肠杆菌科细菌的流行病学和分子特征研究 被引量:1
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作者 张笑笑 马明香 司红彬 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2022年第12期106-114,共9页
旨在研究广西地区动物源bla_(NDM)阳性肠杆菌科细菌的流行现状和分子特征,并了解bla_(NDM)-5基因的遗传环境和传播特点。2020年6月从广西地区部分养殖场中采集样品130份,通过PCR测序筛选出bla_(NDM)阳性菌株,并进行菌种鉴定和耐药基因... 旨在研究广西地区动物源bla_(NDM)阳性肠杆菌科细菌的流行现状和分子特征,并了解bla_(NDM)-5基因的遗传环境和传播特点。2020年6月从广西地区部分养殖场中采集样品130份,通过PCR测序筛选出bla_(NDM)阳性菌株,并进行菌种鉴定和耐药基因的检测;药物敏感性试验和多位点序列分型(MLST)试验分别检测bla_(NDM)阳性分离株的耐药表型和菌株之间的同源性;选取一株代表性bla_(NDM)-5阳性菌株进行全基因组测序、质粒系统发育树的构建和比较基因组学分析,了解bla_(NDM)-5基因的遗传环境和传播情况。结果从样品中共分离出21株bla_(NDM)阳性菌株,分离率为16.15%,包括11株以序列型ST410型为主的bla_(NDM)-5阳性大肠杆菌、3株ST19型bla_(NDM)-1阳性柠檬酸杆菌和7株以ST629型为主的bla_(NDM)-5阳性肺炎克雷伯菌;PCR检出bla_(NDM)、blaCTX、blaCMY-2、tetA、aac(6′)-Ib、qnrB、cfr、fosA等多种耐药基因;药敏结果显示,菌株对美罗培南等13种抗菌药物表现出不同程度的耐药性,且都为多重耐药菌株;全基因组测序结果显示,bla_(NDM)-5定位于可转移的IncFII质粒上,其遗传环境为(IS26-bla_(NDM)-5-bleMBL-trpF-IS91-sul1-qacE-antI-dfrA-IntI1-IS26-Tn3);系统发育分析和比较基因组学分析结果显示,携带bla_(NDM)-5的IncFⅡ质粒可在动物和人类之间进行传播,且具有广泛的宿主。本研究表明bla_(NDM)基因在动物源肠杆科菌中广泛流行,给公众健康安全带来了严重的威胁,应加强对bla_(NDM)基因的监测和防控。 展开更多
关键词 动物源 肠杆菌科细菌 碳青霉烯类抗生素 bla_(ndm)基因
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High prevalence of multidrug-resistance in Acinetobacter baumannii and dissemination of carbapenemase-encoding genes bla_(OXA-23-like),bla_(OXA-24-like)and bla_(NDM-1) in Algiers hospitals 被引量:20
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作者 Khadidja Khorsi Yamina Messai +2 位作者 Moufida Hamidi Houria Ammari Rabah Bakour 《Asian Pacific Journal of Tropical Medicine》 SCIE CAS 2015年第6期439-447,共9页
Objective:To assess and characterize antibiotic resistance in Acinetobacter baumannii strains recovered from 5 health-care facilities in Algiers.Methods:Antibiotic susceptibility testing was performed by agar diffusio... Objective:To assess and characterize antibiotic resistance in Acinetobacter baumannii strains recovered from 5 health-care facilities in Algiers.Methods:Antibiotic susceptibility testing was performed by agar diffusion and agar dilution methods,resistance genes were identified by PCR and sequencing,and molecular typing of isolates was carried out by enterobacterial repetitive intergenic consensus-PCR(ERIC-PCR).Results:Among 125 tested isolates,117(93.6% ) were multidrug-resistant.of which 94(75.2% ) were imipenem resistant.The bla_(ADC)and bla_(OXA-51-like) genes were detected in all isolates,in association with ISAba I sequence in 84% and 8% (imipenem resistant) of isolates,respectively.The bla_(OXA-23-like) and bla_(OXA-24-like)carbapenemase genes were delected in 67.02% and 20.21% of imipenem-resistant isolates,respectively.The bla_(OXA-23-like) gene is linked to ISAba1 or ISAba4 elements.The metallo-β-lactamase NDM-1 gene was found in 10(10.6% ) imipenem-resisianl strains from three hospitals,it is linked to ISAba125 clement in nine strains.Extended spectrum β-lactamases production was not detected.Imipenem and cefotaxime resistance phenolypes could not be transferred to Escherichia coli by conjugation.Outer membrane protein CarO gene was not delected in four imipenem-resisianl isolates.The aac(6')-1b.sul1,sul2,tetA and tetB genes were present in 5.31% .36.17% .77.65% .1.06% and 65.92% of strains,respectively.Class 1 integrons were detected in 23.4% strains.KRIC-PCR typing showed a genetic diversity among bla_(OXA-23-like) and bla_(OXA-24-like) positive strains,while clonality was observed among bla_(NDM-1)positives.Conclusions:This study highlighted the high prevalence of imipenem resistance in Acinetobacter baumannii in Algiers hospitals mediated mainly by bla_(OXA-23-like),bla_(OXA-24-like),and bla_(NDM-1) genes. 展开更多
关键词 ACINETOBACTER BAUMANNII MULTIDRUG-RESISTANCE CARBAPENEMASE carO Hospital Algiers
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广东地区黄羽肉鸡肠杆菌中碳青霉烯耐药基因的流行病学调查 被引量:1
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作者 马振报 庞虹 +4 位作者 许娃丽 王建丽 丁焕中 吴保庆 田浪 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2023年第4期19-26,共8页
为了调查广东地区黄羽肉鸡肠杆菌的耐药性以及碳青霉烯耐药基因的流行病学特征,本研究于2020年8—10月从广东省4个黄羽肉鸡养殖场累计收集的248份样品中分离肠杆菌,利用大肠杆菌基因phoA和细菌16S rRNA进行菌种鉴定,采用琼脂扩散法和微... 为了调查广东地区黄羽肉鸡肠杆菌的耐药性以及碳青霉烯耐药基因的流行病学特征,本研究于2020年8—10月从广东省4个黄羽肉鸡养殖场累计收集的248份样品中分离肠杆菌,利用大肠杆菌基因phoA和细菌16S rRNA进行菌种鉴定,采用琼脂扩散法和微量肉汤稀释法测定肠杆菌对13种药物的敏感性,通过PCR方法检测bla_(NDM)、bla_(KPC)、bla_(OXA)和bla_(IMP)四种常见碳青霉烯类耐药基因,并对耐碳青霉烯肠杆菌进行全基因组测序分析,通过接合转移试验探究碳青霉烯耐药基因的水平传播特征。细菌分离和鉴定结果显示,共计分离肠杆菌206株,分离率为83.06%,其中包括186株大肠杆菌、18株肺炎克雷伯菌和2株阴沟肠杆菌。药物敏感性试验结果显示,肠杆菌对氨苄西林钠(94.66%)、复方新诺明(94.66%)、氟苯尼考(86.89%)、盐酸多西环素(70.87%)和硫酸新霉素(61.17%)的耐药性较高,对硫酸阿米卡星(5.83%)、美罗培南(3.40%)和硫酸黏菌素(1.46%)的敏感性较高。PCR结果显示,共有7株肠杆菌检测到碳青霉烯耐药基因,检出率为3.40%,包括5株bla_(NDM-5)基因阳性和2株bla_(OXA-181)基因阳性菌株。全基因组分析结果显示,7株耐碳青霉烯肠杆菌分别为3株大肠杆菌(携带bla_(NDM-5)基因)、2株拟肺炎克雷伯菌(携带bla_(NDM-5)基因)和2株阴沟肠杆菌(携带bla_(OXA-181)基因);7株耐碳青霉烯肠杆菌均携带有大量的耐药基因,且3株大肠杆菌可分为2个序列型(ST)。接合转移试验结果显示,7株耐碳青霉烯菌株均可通过质粒将携带的碳青霉烯耐药基因传播至工程菌C600。结果表明,广东地区黄羽肉鸡肠杆菌耐药状况严峻,耐碳青霉烯基因在肠杆菌的流行率较低,但可通过质粒接合方式发生水平传播,亟需加强监测。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯肠杆菌 流行病学 黄羽肉鸡 耐药性 bla_(ndm-5)基因 bla_(OXA-181)基因
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产bla_(NDM-1)肺炎克雷伯菌的高水平多黏菌素耐药株制备及耐药机制研究 被引量:2
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作者 梁振伟 胡辛欣 +6 位作者 聂彤颖 卢曦 李雪 王秀坤 杨信怡 李聪然 游雪甫 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期873-878,共6页
目的研究产bla_(NDM-1)肺炎克雷伯菌产生多黏菌素耐药的可能性,并对相关机制进行分析。方法通过黏菌素肉汤传代培养研究携带bla_(NDM-1)菌株产生多黏菌素耐药的可能性,并对分离出的耐药株通过PCR、Real-time PCR、脉冲场凝胶电泳等方法... 目的研究产bla_(NDM-1)肺炎克雷伯菌产生多黏菌素耐药的可能性,并对相关机制进行分析。方法通过黏菌素肉汤传代培养研究携带bla_(NDM-1)菌株产生多黏菌素耐药的可能性,并对分离出的耐药株通过PCR、Real-time PCR、脉冲场凝胶电泳等方法进行耐药分子机制研究。结果通过黏菌素肉汤传代培养,产bla_(NDM-1)肺炎克雷伯菌可进一步表现高水平多黏菌素耐药表型。检测发现耐药株中膜孔蛋白基因及双组分调节系统中多黏菌素耐药相关基因发生表达水平变化,可能导致菌株对多黏菌素高水平耐药。结论产bla_(NDM-1)肺炎克雷伯菌经黏菌素传代诱导培养后可进一步发展多黏菌素耐药,需要引起临床注意。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 bla_(ndm-1) 多黏菌素 诱导耐药
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江苏地区奶牛场bla NDM阳性大肠杆菌的分子流行病学 被引量:7
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作者 王警 张雪寒 +3 位作者 郭芸芸 张碧成 吴庆侠 何孔旺 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第2期391-397,共7页
为了调查江苏地区奶牛场大肠杆菌中blaNDM基因的分子流行病学特征。从江苏部分地区3个奶牛场采集样品134份,使用PCR和测序的方法筛选blaNDM阳性大肠杆菌,同时对其进行超广谱β-内酰胺酶类基因的检测,采用药敏试验检测blaNDM阳性大肠杆菌... 为了调查江苏地区奶牛场大肠杆菌中blaNDM基因的分子流行病学特征。从江苏部分地区3个奶牛场采集样品134份,使用PCR和测序的方法筛选blaNDM阳性大肠杆菌,同时对其进行超广谱β-内酰胺酶类基因的检测,采用药敏试验检测blaNDM阳性大肠杆菌对19种常用抗生素的敏感性,通过多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对携带NDM基因的大肠杆菌进行亲缘关系分析,通过质粒结合试验验证blaNDM基因的可转移性。结果显示,从134份奶牛场样品中共分离15株blaNDM阳性大肠杆菌,包括NDM-1和NDM-52种变体。15株blaNDM阳性大肠杆菌对多种抗生素均呈现不同程度的耐药,奶牛场15株blaNDM阳性大肠杆菌包括7种ST型,分别是ST410、ST846、ST206、ST101、ST1642、ST3076、ST1626,同一种ST型在粪便样品和环境样品中同时存在,表明相同ST型blaNDM阳性大肠杆菌可在动物与环境间相互传播。PFGE试验结果表明,15株blaNDM阳性大肠杆菌可以分为11个簇,同一样品的分离株倾向于相同的簇,在比较小的范围内存在PFGE图谱相同的现象;对15株菌株的结合子进行blaNDM基因的转移性试验结果表明,15株大肠杆菌的blaNDM耐药基因均通过质粒结合转移至受体菌J53。表明,blaNDM阳性大肠杆菌在江苏省部分地区奶牛场中流行相对较为严重,存在多重耐药现象,推测blaNDM基因主要通过质粒结合转移的方式进行水平传播,这为食品源耐药菌的监测及风险评估提供了依据。 展开更多
关键词 ndm耐药基因 大肠杆菌 多位点序列分型 药敏试验
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1株产GES-1型碳青霉烯酶铜绿假单胞菌的全基因组测序分析 被引量:2
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作者 郭庆昕 蔡加昌 +3 位作者 周宏伟 张嵘 蒋华蔚 胡燕燕 《临床检验杂志》 CAS 2021年第5期362-366,共5页
目的了解产GES-1型碳青霉烯酶铜绿假单胞菌的分子流行特征。方法采用Illumina HiSeq X10测序平台对1株产GES-1型碳青霉烯酶铜绿假单胞菌进行全基因组测序,通过Kleborate和ResFinder分析菌株的多位点序例分型(MLST)、毒力基因和抗菌药物... 目的了解产GES-1型碳青霉烯酶铜绿假单胞菌的分子流行特征。方法采用Illumina HiSeq X10测序平台对1株产GES-1型碳青霉烯酶铜绿假单胞菌进行全基因组测序,通过Kleborate和ResFinder分析菌株的多位点序例分型(MLST)、毒力基因和抗菌药物耐药基因,并分析blaGES-1基因的周围环境。结果经比对,本菌为ST235型,血清分型为O11型,共携带12个抗菌药物耐药基因,分别为aac(6′)-Ⅰb3、aadA10、aph(3′)-Ⅱb、aph(3′)-XV、bla_(GES-1)、bla_(OXA-50)、bla_(PAO)、crpP、sul1、tet(G)、fosA、catB7;bla_(GES-1)位于含有3150 bp的NODE_219片段中,该片段与GenBank中的KY860573菌株的72068—75217序列99.94%一致。其基因环境为位于上游的整合子1(intl1),β-内酰胺类耐药基因blaGES-1,氨基糖苷类/氟喹诺酮类耐药基因aac(6′)-Ⅰb3,氨基糖苷类耐药基因aph(3′)-XV及位于下游的插入序列ISPa21e。该菌包含有357个毒力基因,为exoU^(+)/exoS^(-)基因型。结论本菌为全球流行的高风险克隆ST235,exoU^(+)/exoS^(-)基因型。全基因组测序分析提供了bla_(GES-1)基因环境、基因分型、耐药基因、毒力基因等多种信息。 展开更多
关键词 碳青霉烯酶 铜绿假单胞菌 bla_(GES-1) 基因环境 基因测序
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青岛地区3家“三甲”医院ICU耐亚胺培南革兰氏阴性杆菌碳青霉烯酶基因型研究 被引量:4
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作者 宋晓萍 张宁欣 +2 位作者 王健 朱元祺 杨德胜 《中国药房》 CAS 北大核心 2018年第4期478-483,共6页
目的:分析青岛地区3家"三甲"医院重症监护病房(ICU)耐亚胺培南革兰氏阴性杆菌碳青霉烯酶的基因型,为临床防控和治疗耐药菌感染提供参考。方法:收集2013年1月-2016年6月青岛地区3家"三甲"综合性医院ICU分离的耐亚胺... 目的:分析青岛地区3家"三甲"医院重症监护病房(ICU)耐亚胺培南革兰氏阴性杆菌碳青霉烯酶的基因型,为临床防控和治疗耐药菌感染提供参考。方法:收集2013年1月-2016年6月青岛地区3家"三甲"综合性医院ICU分离的耐亚胺培南肺炎克雷伯菌(IRKP)、耐亚胺培南铜绿假单胞菌(IRPA)、耐亚胺培南鲍曼不动杆菌(IRAB)各60株,采用纸片扩散法进行药敏试验;采用Carba NP试验确证其碳青霉烯酶表型;采用聚合酶链反应法扩增其碳青霉烯酶基因,应用双脱氧链终止法进行双向测序,并与Gen Bank数据库进行Blast比对。结果:3种耐亚胺培南革兰氏阴性杆菌对哌拉西林、头孢唑林、亚胺培南西司他丁钠、庆大霉素等大部分临床常用抗菌药物的耐药率均较高,但对多黏菌素B敏感(耐药率均为0)。180株耐药菌株中,A、B、D类碳青霉烯酶阳性菌株分别有52、13、39株,检出率分别为28.89%、7.22%、21.67%。检出KPC-2、IMP-1、VIM-2、OXA-23基因的分别有52株(IRKP)、4株(IRPA)、8株(IRPA 7株、IRAB 1株)、39株(IRAB),检出率分别为28.89%、2.22%、4.44%、21.67%;未检出IMP-2、VIM-1、NDM-1、OXA-24、OXA-58基因。Blast比对结果显示,上述检出基因与Gen Bank数据库中的已知基因100%同源。结论:该地区3家"三甲"医院ICU耐亚胺培南革兰氏阴性杆菌的耐药情况严重,对大多数临床常用抗菌药物的敏感度均较低。检出的主要基因型包括KPC-2(肺炎克雷伯菌)、OXA-23(鲍曼不动杆菌)、IMP-1和VIM-2(铜绿假单胞菌)。 展开更多
关键词 青岛地区 “三甲”医院 重症监护病房 耐亚胺培南革兰氏阴性杆菌 碳青霉烯酶 CARBA NP试验 KPC基因 VIM基因 ndm基因 OXA基因
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耐碳青霉烯肠杆菌科细菌的耐药基因研究 被引量:6
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作者 张晓慧 张加玲 +1 位作者 戎建荣 侯辰蕊 《中国药物与临床》 CAS 2018年第4期627-630,共4页
近年来,随着碳青霉烯类药物的使用量增加,对碳青霉烯类抗生素敏感性降低甚至耐药的肠杆菌科细菌检出率呈持续上升趋势,出现了耐碳青霉烯肠杆菌科细菌(CRE)并且日益增多。肠杆菌科细菌对碳青霉烯类抗生素产生耐药的主要机制有:产碳青... 近年来,随着碳青霉烯类药物的使用量增加,对碳青霉烯类抗生素敏感性降低甚至耐药的肠杆菌科细菌检出率呈持续上升趋势,出现了耐碳青霉烯肠杆菌科细菌(CRE)并且日益增多。肠杆菌科细菌对碳青霉烯类抗生素产生耐药的主要机制有:产碳青霉烯酶、膜孔蛋白缺失或改变合并产Amp C酶或高产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)以及外排泵[1]。 展开更多
关键词 肠杆菌科 Kpn Eco CRE 耐碳青霉烯 碳青霉烯酶 耐药基因 亚胺培南 碳青霉烯类抗生素 ndm 耐药率
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肺炎克雷伯菌临床分布及其碳青霉烯酶基因型检测分析 被引量:5
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作者 熊流新 陆丽苗 《中国当代医药》 2019年第21期15-19,共5页
目的探讨肺炎克雷伯菌临床分布特征及检测其碳青霉烯酶基因型,为完善本院分子流行病学资料提供理论依据。方法对2015年1月~2017年12月本院患者送检的临床标本进行分离培养,采用BIOFOSUN微生物鉴定药敏分析系统进行细菌鉴定及药敏分析,采... 目的探讨肺炎克雷伯菌临床分布特征及检测其碳青霉烯酶基因型,为完善本院分子流行病学资料提供理论依据。方法对2015年1月~2017年12月本院患者送检的临床标本进行分离培养,采用BIOFOSUN微生物鉴定药敏分析系统进行细菌鉴定及药敏分析,采用WHONET5.6进行临床分布及耐药性分析;对亚胺培南耐药的肺炎克雷伯菌进行改良碳青霉烯类失活法试验(mCIM),PCR法检测碳青霉烯酶3种基因型(blaKPC、blaNDM、blaIMP),扩增产物使用BLAST软件分析;对mCIM试验结果与PCR结果进行一致性检验。结果共分离888株肺炎克雷伯菌,标本来源主要是痰液595株(67.0%)、尿液86株(9.7%)、分泌物80株(9.0%)、血液71株(8.0%);科室分布主要是新生儿科147株(16.6%)、呼吸科107株(12.0%)、普儿科103株(11.6%)、神经外科89株(10.0%)及ICU73株(8.2%)。肺炎克雷伯菌对大多数抗菌药物存在不同程度的耐药,耐药率低于15%的只有亚胺培南、美罗培南、阿米卡星及哌拉西林/他唑巴坦。对30株(3.4%)亚胺培南耐药的肺炎克雷伯菌进行mCIM试验,其中阳性29株(敏感性为96.7%);30株亚胺培南耐药的肺炎克雷伯菌中有7株扩增阳性,检出均为blaNDM基因型(敏感性为23.3%),mCIM试验结果与PCR结果一致性Kappa值为0.766;与此同时无检出blaKPC、blaIMP基因型。结论blaNDM基因型是本院肺炎克雷伯菌产碳青霉烯酶主要型别及对亚胺培南耐药的主要机制。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 碳青霉烯酶基因 改良碳青霉烯类失活法 ndm基因
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携带碳青霉烯酶基因鲍曼不动杆菌耐药性分析 被引量:1
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作者 邹自英 刘媛 王文博 《四川医学》 CAS 2021年第10期1042-1046,共5页
目的检测医院分离鲍曼不动杆菌携带碳青霉烯酶基因情况并分析其携带耐药基因与抗菌药物耐药性的相关性。方法采用VITEK2 Compact进行细菌鉴定,聚合酶链反应检测bla_(OXA-51)、bla_(OXA-23)、bla_(OXA-24)、bla_(OXA-58)、bla_(NDM-1)及b... 目的检测医院分离鲍曼不动杆菌携带碳青霉烯酶基因情况并分析其携带耐药基因与抗菌药物耐药性的相关性。方法采用VITEK2 Compact进行细菌鉴定,聚合酶链反应检测bla_(OXA-51)、bla_(OXA-23)、bla_(OXA-24)、bla_(OXA-58)、bla_(NDM-1)及bla_(IMP)碳青霉烯酶基因,按照CLSI 2020年标准进行药敏试验。结果150株鲍曼不动杆菌复合体检出bla_(OXA-51)基因阳性89株(59.33%),为鲍曼不动杆菌。89株鲍曼不动杆菌中70株(78.65%)携带bla_(OXA-23)基因;89株鲍曼不动杆菌未检出bla_(OXA-24)、bla_(OXA-58)、bla_(NDM-1)、bla_(IMP)基因。与bla_(OXA-51)基因阴性组比较,携带bla_(OXA-51)基因组对庆大霉素、妥布霉素、阿米卡星、复方新诺明、氨苄西林-舒巴坦的耐药性显著升高;同时携带bla_(OXA-51)及bla_(OXA-23)组对除头孢曲松、哌拉西林-他唑巴坦、替加环素、多黏菌素B外的所有检测药物的抗菌药物耐药性升高,差异有统计学意义(P<0.05)。结论本组研究的89株鲍曼不动杆菌对碳青霉烯酶基因抗菌药物耐药主要与表达D类bla_(OXA-51)、bla_(OXA-23)基因有关,携带相同耐药基因的克隆传播可能是医院鲍曼不动杆菌播散的主要原因。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 耐药 基因 bla_(OXA-23) bla_(OXA-51)
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基于blaCARB-17和toxR基因的副溶血弧菌双重PCR检测方法的建立 被引量:1
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作者 胡元庆 林凯玲 +1 位作者 周赞虎 李凤霞 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2020年第19期132-136,共5页
建立一种针对副溶血弧菌bla_(CARB-17)和toxR基因的双重PCR检测方法。按照副溶血弧菌的bla_(CARB-17)和toxR基因序列设计并合成引物,于同一反应体系中进行PCR扩增,优化退火温度、退火时间和引物比例,确定双重PCR的特异性和灵敏性,最后... 建立一种针对副溶血弧菌bla_(CARB-17)和toxR基因的双重PCR检测方法。按照副溶血弧菌的bla_(CARB-17)和toxR基因序列设计并合成引物,于同一反应体系中进行PCR扩增,优化退火温度、退火时间和引物比例,确定双重PCR的特异性和灵敏性,最后用实验室分离鉴定的副溶血弧菌分离株验证。结果表明:建立的双重PCR最佳退火条件是52℃30 s,引物比例1∶1,在同一体系中特异地扩增出副溶血弧菌的bla_(CARB-17)和toxR基因的303、350 bp片段,其它对照菌株均无扩增,表明该方法特异性良好。双重PCR的最低检测限达1×10~2 CFU/mL,对实验室鉴定的56个副溶血弧菌分离株验证均为阳性。建立的双重PCR方法操作简单、高效快速、特异性强,适用于副溶血弧菌的检测。 展开更多
关键词 副溶血弧菌 双重PCR bla_(CARB-17)基因 toxR基因 退火温度 退火时间 引物比例
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2016-2018年东莞地区耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌的耐药表型、耐药机制和分子流行病学分析 被引量:4
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作者 郭主声 吕飞 +7 位作者 谢树金 黄亚 林偲思 徐宝华 冯剑波 冯森 何芬 周谋清 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期798-805,共8页
目的通过研究东莞地区的耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌(carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)的耐药情况和基因分型,研究耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)的亲缘性、耐药机制和bla_(KPC... 目的通过研究东莞地区的耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌(carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)的耐药情况和基因分型,研究耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)的亲缘性、耐药机制和bla_(KPC-2)基因环境,为临床寻找控制和治疗该致病菌的更优方案提供参考。方法回顾性收集2016年1月—2018年12月东莞市人民医院、东莞东华医院、康华医院、东莞市中医院和东莞市妇幼保健院等十三所医院的住院患者的CRE菌株进行常规微生物培养、鉴定和药敏试验。以美罗培南或亚胺培南纸片法(K-B法)或最小抑菌浓度(MIC)测定法对肠杆菌目细菌进行初筛;采用改良Hodge试验、亚胺培南-EDTA双纸片协同试验和CIM试验检测CRE产酶情况;聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测并鉴定CRE的碳青霉烯类耐药基因(bla_(KPC)、bla_(NDM)、bla_(IMP)、bla_(DHA)、bla_(CTX-M)和bla_(CMY)),以及CRKP的多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)和孔蛋白(OmpK35、OmpK36和OmpK37);通过Junction PCR、Mapping PCR和Crossing PCR检测bla_(KPC-2)基因环境;使用WHONET 5.6软件统计分析CRE临床分离株在标本和科室中的分布与耐药情况,以及碳青霉烯酶基因在科室中的分布情况。结果从37217株肠杆菌目细菌中共检出131株CRE(占0.35%),其中肺炎克雷伯菌79株(占60.31%)、大肠埃希菌21株(占16.03%)和阴沟肠杆菌12株(占9.16%);检出CRE的临床科室主要为ICU(66株,占50.38%);在检出CRE的标本中,位于前3位分别是痰液标本(56株,占42.75%)、尿液标本(21株,占16.03%)、伤口分泌物标本(12株,占9.16%);CRE对目前临床中常使用的抗菌药物表现出高耐药性,仅对阿米卡星耐药率较低,为21.38%。检测104株CRE(包括肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌和阴沟肠杆菌)发现的碳青霉烯酶有KPC-2型(57,54.81%)、NDM-1型(7株,6.73%)和NDM-5型(2株,1.92%);其中,CRKP主要为ST11型(49株,占62.03%),其次为ST1型(25株,占31.65%);ompK35(75株,占94.94%)、ompK36(77株,占97.47%)和ompK37(79株,占100%)发生突变的占比高;bla_(KPC-2)的基因环境主要为B1型突变型(38株,占48.10%),其次为A型突变型(14株,占17.72%)。结论2016—2018年东莞地区临床CRE检出率为0.35%,耐药性强,其中,CRKP主要为ST11型,主要流行的是KPC-2型,其基因环境为B1型突变型,而且孔蛋白突变占比极高,这提示东莞地区bla_(KPC-2)基因主要通过质粒进行传播,并且孔蛋白突变在CRE中发挥重要作用,院内感染医务工作者应根据该菌科室分布、耐药情况和耐药机制等特点,采取合理有效的预防和治疗方法。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌 多位点序列分型 孔蛋白 bla_(KPC-2) 基因环境
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耐碳青霉烯鼠伤寒沙门菌的药敏及分子特征分析
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作者 王燕 王云英 +3 位作者 蒋敏 张雨虹 任艳丽 孙滨 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期813-819,共7页
目的分析鼠伤寒沙门菌的耐药情况及分子特征,为临床治疗和感染防控提供依据。方法对我院分离的鼠伤寒沙门菌CYEY-S001,采用VITEK2-Compact全自动微生物分析系统和K-B纸片法对药敏结果进行检测。通过全基因组测序分析其基因和分子特征,... 目的分析鼠伤寒沙门菌的耐药情况及分子特征,为临床治疗和感染防控提供依据。方法对我院分离的鼠伤寒沙门菌CYEY-S001,采用VITEK2-Compact全自动微生物分析系统和K-B纸片法对药敏结果进行检测。通过全基因组测序分析其基因和分子特征,并进行质粒接合试验,研究质粒的可转移性。利用碳青霉烯酶表型试验检测其实所含的碳青霉烯酶类型,PCR确认其携带的耐药基因,质粒复制子分型确定质粒类型。结果该鼠伤寒沙门菌CYEY-S001对除氨曲南之外的青霉素类、头孢菌素类和碳青霉烯类抗生素全部耐药,全基因组测序分析表明其为ST34型鼠伤寒沙门菌,含有bla_(NDM-5)、aac(6’)-Iaa、floR、cmlA1、sul3和tet(A)等多种耐药基因。携带的质粒类型为IncHI2,bla_(NDM-5)位于该质粒上,可通过水平转移,结合子获得了与鼠伤寒沙门菌完全一致的耐药结果。3种碳青霉烯酶表型试验均正确识别出了其携带碳青霉烯酶的类型为金属β-内酰胺酶。结论碳青霉烯耐药鼠伤寒沙门菌对感染治疗和预防控制带来了新的挑战。新发现的IncHI2-bla_(NDM-5)质粒存在向其他细菌物种横向传播的风险。 展开更多
关键词 鼠伤寒沙门菌 碳青霉烯耐药 表型检测 质粒复制子分型 IncHI2-bla_(ndm-5)
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