BLM基因与胃癌免疫浸润水平及临床预后的相关性分析

目的探讨BLM基因与胃癌组织中免疫细胞浸润水平及患者预后的关系。方法通过TIMER数据库分析BLM基因在不同恶性肿瘤中的表达水平差异,并应用GEPIA数据库验证BLM基因在胃癌组织中的表达水平。对胃癌组织芯片(STC1602)进行免疫组织化学分析,并对比胃癌组织和正常胃黏膜组织BLM免疫组织化学结果,进一步验证BLM在胃癌组织中的表达差异。通过Kaplan-MeierPlotter数据库对BLM基因与胃癌患者的生存预后关系进行评估。利用TIMER数据库分析了BLM基因在胃癌组织中的表达与免疫细胞浸润水平的相关性。从基因表达综合数据库中获取了GSE84433和GSE62254胃癌数据集,进行了单样本基因集富集分析,以验证BLM基因的高表达是否会影响胃癌组织中免疫细胞的浸润水平。结果BLM基因在胃癌、结直肠癌、食管癌等恶性肿瘤组织中均高表达。BLM基因高表达水平的胃癌患者的总生存和首次进展后生存均较差。胃癌组织中BLM基因的mRNA表达水平与CD8^(+)T细胞、CD4^(+)T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞及树突状细胞的浸润水平呈负相关。结论BLM基因在胃癌组织中高表达,BLM基因的表达与胃癌组织中的免疫细胞浸润水平呈负相关,BLM基因可作为评估胃癌患者预后的标志物。

六种肿瘤细胞株BLM基因转录水平的研究

BLM基因的不同突变是导致Bloom综合征(Bloom'ssyndrome)的病因。BLM基因突变使姐妹染色单体互换率(sisterchromaticexchange,SCE)增高,细胞DNA修复功能降低,这样受损的DNA很容易随细胞分裂而传入子细胞,细胞稳定性下降。临床表现为免疫缺陷,恶性肿瘤易患体质等等。本研究对BLM基因在肿瘤细胞株和正常人中表达的差异进行研究,以期发现肿瘤新的发生机制,为寻找新的特异分子治疗靶点提供线索。应用PTPCR方法检测正常人造血细胞和六种肿瘤细胞株中BLM基因的mRNA水平,并作序列检测。结果表明,六种肿瘤细胞株均高表达BLMmRNA,但未见BLM基因结构异常,而正常人表达量很低(P<0.01)。结论:在本研究中的6种肿瘤细胞株高表达BLMmRNA,肿瘤细胞株和正常人BLMmRNA表达水平有显著差异性。BLM异常可能参与肿瘤的发生或是导致耐药的原因之一。

丝裂霉素诱发Jurkat细胞DNA损伤修复机制中blm基因的作用研究

本研究通过丝裂霉素(mitomycin C,MMC)诱发Jurkat细胞凋亡,了解Jurkat细胞DNA损伤后blm mRNA水平变化与细胞周期和凋亡之间关系及意义。用流式细胞术检测凋亡率和细胞周期变化;用半定量RT-PCR检测blm mRNA的表达水平。结果表明:0.4 g/L MMC分别诱导Jurkat细胞和正常成纤维细胞后,Jurkat细胞于24小时凋亡率为(11.42±0.013)%,此时(66.08±1.60)%的Jurkat细胞受阻于G2/M期;48小时时Jurkat细胞凋亡率反而下降(8.08±0.27)%,停滞于G2/M期Jurkat细胞下降为(33.96±1.05)%;正常成纤维细胞诱导后24小时与48小时凋亡率变化不明显,G2/M期细胞、G0-G1、S期细胞在24小时和48小时时变化不显著。2组细胞凋亡率和各期细胞所占比例的变化幅度比较显示,其差异显著有统计学意义(p<0.01)。Jurkat细胞blm mRNA表达水平不仅明显高于正常成纤维细胞(p<0.01),诱导48小时后blm mRNA表达水平明显较诱导24小时后增高,2组细胞间blm mRNA表达水平变化幅度比较差异显著(p<0.01)。结论:blm基因在MMC诱发Jurkat细胞DNA损伤修复过程中发挥重要作用,其mRNA表达异常可能是导致白血病耐药的原因之一。

BLM基因在白血病骨髓细胞中的表达及其临床价值

目的探讨BLM基因在白血病骨髓细胞中的表达及其临床价值。方法选取2011年6月至2013年6月我院收治的68例初治白血病患者作为观察对象,采集患者治疗前后骨髓细胞标本,采用半定量反转录-聚合酶链反应(R T-P C R)测量B L M表达情况,比较不同年龄、性别等参数之间及治疗前后的B L M表达差异性。结果男性白血病患者较女性BLM基因阳性表达率高,差异有统计学意义;白细胞计数≥18×109/L的白血病患者BLM基因阳性表达率高于白细胞计数<18×109/L的患者,差异有统计学意义。治疗后、移植后患者BLM表达率均显著低于初诊(未经治疗)患者,差异有统计学意义;移植后的患者B L M基因阳性表达率显著低于药物治疗后的患者,差异有统计学意义。结论白血病患者B L M基因表达与患者的性别及白细胞计数水平有关,且患者接受药物治疗或移植治疗后,B L M阳性表达率和表达量变化均可提示患者疗效及预后,结论有待进一步研究。

猪BLM基因N端、C端的克隆及其在不同组织与疾病中的表达分析

为探究猪BLM解旋酶N端、C端的结构功能及其在不同组织和疾病中的相对表达量,本研究采用RT-PCR技术扩增从江香猪BLM基因N端和C端,利用生物信息学软件对克隆所获序列进行分析,同时采用实时荧光定量PCR技术分析BLM基因在猪不同组织及病样中的表达差异。结果显示,试验成功克隆了从江香猪BLM基因N端1 025bp和C端1 300bp序列,与GenBank中猪BLM基因序列(登录号:NM_001123084.1)同源性为100%;生物信息学软件预测显示,猪BLM基因序列长度为4 316bp,包含4 280bp的开放阅读框,编码一个由1 426个氨基酸组成的多肽链;氨基酸序列比对发现,猪BLM基因氨基酸序列与牛的同源性最高(85%);结构域预测表明,猪BLM基因有DEXDc、HELICc、RQC和HRDC 4个结构域;系统进化树分析表明,猪BLM基因与牛亲缘关系最近;实时荧光定量PCR结果显示,以心脏为对照,BLM基因在从江香猪各组织中均有表达,其中在睾丸中的相对表达量最高,其次为肺脏、肝脏、脾脏、心脏、肾脏、小肠和大肠,在睾丸和肺脏中的表达量均极显著高于其他组织(P<0.01);BLM基因在患繁殖与呼吸道综合征猪肺脏、患白血病鸡肝脏和患鸭瘟鸭肝脏中的表达水平均极显著或显著高于正常组织(P<0.01;P<0.05),提示BLM基因的变化可能也会导致动物疾病的发生。本试验结果可为后续畜禽BLM解旋酶原核表达载体的构建及其在重大疾病的发生和预防等研究提供理论依据。

敲除BLM基因的MDA-MB-231乳腺癌细胞株的构建

目的:应用规律成簇间隔短回文重复序列(CRISPR/Cas9)技术构建敲除BLM基因的人乳腺癌MDA-MB-231细胞株。方法:根据CRISPR/Cas9技术靶点设计原则,在BLM基因的3号外显子设计2条靶向小向导RNA(sgRNA),利用PX459 V2质粒载体,构建PX459 V2-sgRNA重组质粒;将建构成功的重组质粒转染至MDA-MB-231细胞中,通过嘌呤霉素筛选获得阳性克隆,使用Cruiser^(TM)核酸内切酶检测打靶效率,将打靶效率较高的阳性克隆进行单克隆培养,再利用免疫印迹法检测筛选出敲除BLM基因的MDA-MB-231乳腺癌细胞株。结果:测序结果表明重组质粒构建成功,免疫印迹法显示敲除BLM基因后的MDA-MB-231细胞中BLM蛋白明显降低,与空白对照组相比,BLM-KO组BLM表达水平明显低于对照组。结论:应用CRISPR/Cas9技术成功构建了BLM基因敲除的MDA-MB-231细胞株。

一例早期诊断的Bloom综合征患儿的BLM基因变异研究

目的探讨1例Bloom综合征患儿的临床和基因变异特点。方法分析总结1例13月龄患儿的临床资料,应用高通量测序技术对患儿进行基因变异分析,并应用Sanger测序法对变异基因的家系分布进行验证。结果患儿系足月小样儿,自生后食欲不振、重度生长迟缓,小头畸形,小下颌,智力发育正常。基因检测发现患儿的BLM基因c.1068+3A>C和c.1069-1G>C复合杂合变异,分别来自患儿父母。结论Bloom综合征在婴儿期主要表现为重度生长迟缓和小头畸形。BLM基因c.1068+3A>C和c.1069-1G>C复合杂合变异可能是患儿的致病原因,上述新变异丰富了BLM基因的变异谱。

影响BLM基因表达的miRNAs筛选及抑制效率研究

[目的]筛选调控BLM基因表达的miRNAs并研究其抑制效率。[方法]利用Target Scan Human 6.2、microRNA.org、PicTar以及miRsystem在线软件预测调控BLM基因表达的miRNAs;miRNA通过脂质体转染和特异茎环引物反转录、荧光定量PCR及Pfaffl算法检测miRNA对BLM基因表达的影响。[结果]初步筛选出hsa-miR-338-3p为调控BLM基因表达的miRNA;hsa-miR-338-3p抑制效率试验结果表明:当前列腺癌细胞(PC3)转染20μmol/L的hsamiR-338-3p minic时,实验组BLM表达量为对照组的0.44倍,抑制了BLM的表达(P<0.01);转染40μmol/L的hsa-miR-338-3p minic时,实验组BLM的表达量为对照组的2.55倍,促进了BLM的表达(P<0.01);转染60μmol/L的hsa-miR-338-3p minic时,实验组BLM的表达量为对照组的1.14倍,实验组与对照组差异不显著(P>0.05)。[结论]转染20μmol/L、40μmol/L和60μmol/L的hsa-miR-338-3p minic时BLM基因的表达量分别是对照组的0.44倍、2.55倍和1.44倍,转染不同剂量的miRNA对BLM基因的表达情况具有不同的影响。

沉默BLM DNA解旋酶基因对三阴性乳腺癌MDA-MB-468细胞增殖和凋亡的影响

目的探讨沉默BLM DNA解旋酶基因对三阴性乳腺癌MDA-MB-468细胞增殖和凋亡的影响。方法利用数据库分析BLM DNA解旋酶在乳腺癌组织中的表达情况及后评估价值,免疫组织化学技术检测三阴性乳腺癌、乳腺纤维腺瘤和癌旁组织中BLM DNA解旋酶表达,Western blot检测MCF-10A细胞、MCF-7细胞、MDA-MB-468细胞中BLM DNA解旋酶蛋白表达水平;合成siRNA序列沉默MDA-MB-468细胞中BLM DNA解旋酶基因的表达,选取沉默效率最高的siRNA-BLM 3序列构建shRNA干扰载体慢病毒;将慢病毒感染MDA-MB-468细胞分为shRNA-NC组和shRNA-BLM组,MTT、平板克隆形成实验检测细胞增殖能力,流式细胞术检测细胞凋亡情况,单细胞凝胶电泳技术检测与DNA损伤相关的细胞尾部DNA含量,免疫细胞化学检测DNA损伤标志物γ-H2AX表达情况,Western blot检测凋亡相关蛋白及DNA损伤修复蛋白表达情况。结果生物信息学分析显示BLM DNA解旋酶在乳腺癌组织中高表达,且与乳腺癌患者不良预后密切相关;三阴性乳腺癌组织BLM DNA解旋酶表达水平高于乳腺纤维腺瘤和癌旁组织(P<0.001);与MCF-10A细胞、MCF-7细胞比较,MDA-MB-468细胞中BLM DNA解旋酶蛋白表达水平升高(P<0.01);与未转染组比较,siRNA-BLM 3组BLM DNA解旋酶蛋白表达下调(P<0.05);与shRNA-NC组比较,shRNA-BLM组细胞增殖能力被抑制、凋亡率升高、尾部DNA含量增加、γ-H2AX阳性细胞比例升高(P<0.01)、凋亡相关蛋白Bax、cleaved Caspase-3、cleaved Caspase-8表达上调,Bcl-2及DNA损伤修复蛋白BRCA1、Rad51、BLM表达下调(P<0.05)。结论沉默BLM DNA解旋酶基因表达抑制三阴性乳腺癌细胞增殖,促进细胞凋亡,凋亡机制可能与细胞DNA损伤增加,DNA损伤修复相关蛋白受抑制有关。

CRISPR/Cas9技术敲除人前列腺癌PC-3细胞BLM解旋酶基因的研究

BLM解旋酶是人类RecQ解旋酶家族的重要一员,在DNA的复制、修复、重组、转录、端粒的维持等细胞代谢过程中具有重要的作用。BLM基因与前列腺癌易感性相关,可作为治疗前列腺癌的候选基因。该研究设计了5个Cas9/SgRNA载体,并通过T7E1酶筛选出活性最强的SgRNA3载体,利用脂质体LTX将其与供体载体共同导入前列腺癌PC-3细胞。BLa和Puro抗性筛选及荧光蛋白标记甄别获得带阳性标记的细胞。Western blot及RTq-PCR检测证明,前列腺癌PC-3细胞中的BLM解旋酶基因被成功敲除,为深入研究BLM解旋酶基因在前列腺癌中的作用提供了重要的科学数据。