Pneumocystis jirovecii diagnosed by next-generation sequencing of bronchoscopic alveolar lavage fluid: A case report and review of literature

BACKGROUND The advent of molecular targeted agents and immune checkpoint inhibitors has greatly improved the treatment of advanced renal cell carcinoma(RCC), thus significantly improving patient survival. The incidence of rare drug-related adverse events has gained increased attention.CASE SUMMARY We report a patient with advanced RCC treated with multiple lines of molecular targeted agents and immune checkpoint inhibitors, who developed a pulmonary infection after treatment with everolimus in combination with lenvatinib. Determining the pathogenic organism was difficult, but it was eventually identified as Pneumocystis jirovecii by next-generation sequencing(NGS) of bronchoscopic alveolar lavage fluid(BALF) and successfully treated with trimethoprim-sulfamethoxazole.CONCLUSION Rare pulmonary infections caused by molecular targeted agents are not uncommon in clinical practice, but their diagnosis is difficult. Evaluating BALF with NGS is a good method for rapid diagnosis of such infections.

涂片与培养方法检测痰液和肺泡灌洗液中抗酸菌诊断肺结核的管理研究

目的评价痰液和肺泡灌洗液联合抗酸菌检测的临床应用价值,为肺结核临床诊疗决策提供参考。方法以在同一周内并行痰液涂片染色查找抗酸菌和/或分枝杆菌培养检查的可疑肺结核患者为研究对象,从医院LIS系统中收集、整理2021年1月—7月的相关检测数据,分析4种检测结果的同一性与差异性。结果①在272例患者中,痰涂片、肺泡灌洗液涂片、痰培养、肺泡灌洗液培养(以下分别称为“A”“B”“C”“D”)的阳性检出率分别为14.71%(40/272)、19.49%(53/272)、25.00%(67/268)和31.90%(74/232),4种检测作为平行试验的阳性率为37.50%(102/272);②A^(+)C^(+)、A^(-)C^(+)、A^(+)C^(-)、A^(-)C^(-)、A^(-)C N(上标中的“+”“-”“N”分别代表“阳性”“阴性”“未检测”,下同)和B^(+)D^(+)、B^(-)D^(+)、B^(+)D^(-)、B^(-)D^(-)、B^(-)D^(N)结果组合分别占14.71%(40/272)、13.97%(38/272)、0、69.85%(190/272)、1.47%(4/272)和19.12%(52/272)、8.82%(24/272)、0.37%(1/272)、56.99%(155/272)、14.71%(40/272);③A^(+)B^(+)、A^(+)B^(-)、A^(-)B^(+)、A^(-)B^(-)和A^(+)D^(+)、A^(+)D^(-)、A^(+)D^(N)、A^(-)D^(+)、A^(-)D^(-)、A^(-)D^(N)、A^(N)D^(+)、A^(N)D^(-)、A^(N)D^(N)结果组合分别占14.71%(40/272)、0、4.78%(13/272)、80.51%(219/272)和19.12%(52/272)、5.51%(15/272)、4.04(11/272)、8.09%(22/272)、51.74%(140/272)、10.29%(28/272)、0.74%(2/272)、0.37%(1/272)、0.37%(1/272)。结论较通常应用痰液检测抗酸菌而言,行肺泡灌洗液抗酸菌检测可以大幅提高肺结核病原学确诊率,值得临床大力推广应用。

肺泡灌洗液mNGS检测神经外科重症下呼吸道感染病原的应用

目的分析宏基因二代测序(mNGS)技术对神经外科重症下呼吸道感染患者肺泡灌洗液中病原体和肺炎克雷伯菌耐药基因检测。方法选取2020年6月至2022年6月河南省人民医院收治的196例神经外科重症下呼吸道感染患者作为研究对象。采集患者的肺泡灌洗液标本进行常规病原学与mNGS技术检测,对病原体进行分离鉴定,并计算2种检测方法的差异性;并检测肺炎克雷伯菌的耐药基因与药敏试验结果。结果常规病原学检测的阳性率为62.42%(122/196),mNGS技术检测阳性率为88.27%(173/196),mNGS技术检测高于常规病原学检测(χ^(2)=35.631,P<0.05);肺炎克雷伯菌经mNGS技术检出耐药基因包括超广谱β-内酰胺酶基因(SHV、TEM)与碳青霉烯酶基因(KPC);药敏试验结果显示,肺炎克雷伯菌对头孢唑林、头孢呋辛及头孢曲松的耐药率较高,分别为75.00%、66.67%及54.17%,对比阿培南及美罗培南的耐药率较低,分别为16.67%及12.50%。结论mNGS技术能够有效提高神经外科重症下呼吸道感染阳性检出率,可辅助评估肺炎克雷伯菌抗菌药物耐药性基因。

儿童难治性肺炎支原体肺炎肺泡灌洗液病菌量与Th1/Th2细胞免疫应答的相关性研究

目的探究儿童难治性肺炎支原体肺炎肺泡灌洗液病菌量与Th1/Th2细胞免疫应答的相关性。方法随机选择郑州大学附属儿童医院诊治的96例难治性肺炎支原体肺炎患儿为研究对象,根据肺泡灌洗液中肺炎支原体DNA含量进行分组,即>106/m L为高菌量组(n=35),103~106/m L为中菌量组(n=30),<103/m L为低菌量组(n=31)。检测三组患儿肺泡灌洗液的炎性因子水平,对比三组的炎性因子水平、肺部影像学与实验室检查结果、临床表现和基础情况,分析肺泡灌洗液中肺炎支原体DNA含量与炎性因子的相关性。结果在体温高于39℃、热程高于10天患儿占比以及总发热时间、使用抗生素后热程、住院时间、乳酸脱氢酶、血小板计数、中性粒细胞计数、淋巴细胞计数上,三组比较差异有统计学意义(P<0.05),白细胞计数比较差异无统计学意义(P>0.05);双侧或大量胸腔积液、肺不张或者大片肺实变发生率、白细胞介素-4(interleukin-4,IL-4)水平比较,差异有统计学意义(P<0.05),三组之间的双侧肺病变、左侧肺病变、右侧肺病变发生率以及肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、干扰素(interferon-γ,INF-γ)、IL-8水平比较差异无统计学意义(P>0.05);肺泡灌洗液中IL-4与肺炎支原体DNA水平呈正相关(P<0.05),肺泡灌洗液中TNF-α、INF-γ、IL-8与肺炎支原体DNA水平无相关性(P>0.05)。结论儿童难治性肺炎支原体肺炎肺泡灌洗液病菌量与Th1/Th2细胞免疫应答具有相关性,肺炎支原体DNA菌量越高,肺内外损害和肺部炎症越严重,Th1/Th2免疫应答失衡。

肺泡灌洗液白细胞介素-17A含量与重症肺炎患者预后的关系

目的探究肺泡灌洗液白细胞介素(IL)-17A含量与重症肺炎患者预后的关系。方法回顾性选取2021年1月至2023年1月第九〇九医院厦门大学附属东南医院收治的重症肺炎患者126例,收集患者的一般临床资料,采用单因素及多因素Logistic回归分析重症肺炎患者预后的影响因素,应用Pearson相关性分析急性生理学和慢性健康状况评价Ⅱ(APACHEⅡ)评分、IL-17A、Toll样受体4(TLR4)、高迁移率族蛋白B1(HMGB1)与重症肺炎患者发生死亡的相关性,绘制受试者工作特征曲线评估APACHEⅡ评分、IL-17A、TLR4、HMGB1指标单一检测对重症肺炎患者预后的预测价值。结果126例重症肺炎患者经门诊复查以及电话随访1年,有38例患者死亡,死亡率为33.16%。死亡组患者的APACHEⅡ评分、IL-17A、TLR4、HMGB1水平均高于生存组[(27±4)分比(25±3)分、(7.2±1.8)μg/L比(6.0±1.2)μg/L、(7.2±1.8)μg/L比(6.0±1.6)μg/L、(5.0±1.3)mg/L比(4.2±1.1)mg/L](P<0.01)。多因素Logistic回归分析结果显示,APACHEⅡ评分、IL-17A、TLR4、HMGB1升高是重症肺炎患者死亡的危险因素(OR=1.291,95%CI 1.103~1.511;OR=1.841,95%CI 1.299~2.609;OR=1.441,95%CI 1.053~1.973;OR=1.903,95%CI 1.211~2.989)(P<0.05或P<0.01)。Pearson相关性分析结果显示,APACHEⅡ评分、IL-17A、TLR4、HMGB1与重症肺炎患者死亡率均呈正相关(r=0.656,P<0.001;r=0.751,P<0.001;r=0.473,P<0.001;r=0.542,P<0.001)。IL-17A预测重症肺炎患者预后的曲线下面积高于其他各指标(P<0.05)。结论APACHEⅡ评分、IL-17A、TLR4、HMGB1升高是重症肺炎患者死亡的危险因素,其指标变化与患者预后具有明显相关性,IL-17A预测重症肺炎患者预后的效能优于其他指标。

阿萨希毛孢子菌致重症肺炎病例报道3例并文献复习

阿萨希毛孢子菌可引起浅表性感染和侵袭性感染,在免疫功能低下的患者中导致严重甚至致命的感染。我院收治3例阿萨希毛孢子菌导致肺部感染的患者,行支气管镜检查,送检肺泡灌洗液,明确患者均感染该菌,在治疗上给予伏立康唑治疗,但病情进一步恶化,最终因全身多脏器功能衰竭死亡。我国关于该菌的报道仍较少,本案例的报道有助于对阿萨希毛孢子感染提供临床诊疗思路及方案。

气管镜联合肺泡灌洗液NGS检查在肺部感染的早期诊断及治疗中的应用

目的 探讨气管镜联合肺泡灌洗液NGS检查在肺部感染的早期诊断及治疗中的应用。方法 选取2022年1月—2023年6月本院收治的75例肺部感染患者作为研究对象,随机将患者分为对照组与观察组,对照组(37例)采用气管镜检查,观察组(38例)采用气管镜联合肺泡灌洗液NGS检查,比较两种检查方法的诊断准确度,并观察两组患者的临床症状消失时间及炎症因子水平。结果 气管镜联合肺泡灌洗液NGS检测的诊断准确度高于气管镜检测;观察组的发热消失时间、咳嗽消失时间、咯痰消失时间、肺部啰音消失时间、住院时间显著低于对照组(P<0.05)。治疗前,两组的WBC、CRP、PCT水平相比无显著差异(P>0.05);治疗后,观察组患者的WBC、CRP、PCT水平显著低于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论 气管镜联合肺泡灌洗液NGS检测在肺部感染的早期诊断中具有较高的准确度,能够缩短患者的临床症状消失时间和住院时间,并有助于更快速有效地降低炎症因子水平。

支气管肺泡灌洗液二代宏基因测序在肺部感染病原学诊断中的应用

目的探讨支气管肺泡灌洗液二代宏基因测序在肺部感染病原学诊断中的应用。方法选取淄博市第一医院2020年1月至2022年1月收治的80例肺部感染患者作为研究对象,通过病历号数字表抽签法将患者分为观察组(n=40)和对照组(n=40)。患者均接受支气管肺泡灌洗液检查,观察组在此基础上给予肺泡灌洗液二代宏基因测序检查。比较两组患者的支气管肺泡灌洗液病原菌分布情况、病原菌检出率以及治疗后的临床指标。结果本次80例肺部感染患者的肺泡灌洗液中共分离并获得96株病原菌。其中革兰氏阳性菌总共20株,占20.83%,其中以肺炎链球菌和金色葡萄球菌为主;革兰阴性菌总共72株,占75.00%,主要以鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌和流感嗜血杆菌为主;真菌总共3株,占3.12%,以白色念珠菌为主;对照组40例患者,通过常规病原菌检测结果检出阳性28例,占70.00%;观察组40例患者,通过二代宏基因测序结果检出阳性37例,占92.50%,相较于对照组,观察组检出率显著更高(P<0.05);相较于对照组,观察组患者30 d内和90 d内病死率均显著更低(P<0.05)。结论支气管肺泡灌洗液二代宏基因测序在肺部感染病原学诊断中的运用价值高,可有效提高检出率,可帮助临床上给予对应治疗。

儿童肺炎支原体肺泡灌洗液中细胞间黏附分子-1表达量与肺炎黏液栓形成的关系研究

目的探讨儿童肺炎支原体(MPP)肺泡灌洗液中细胞间黏附分子-1(ICAM-1)表达量与肺炎黏液栓形成的关系。方法本研究选取2022年8月至2023年11月期间在本院住院治疗的80例小儿MPP患儿作为研究对象。根据气管镜下黏液分泌的特点将此80例患儿分为研究组(即黏液栓组)55例,对照组(即非黏液栓组)25例,分析ICAM-1表达量与肺炎黏液栓形成的关系。结果研究组白细胞计数(WBC)、中粒粒细胞比率(N)、C反应蛋白(CRP)、乳酸脱氢酶(LDH)、ICAM-1水平均高于对照组(P<0.05);多因素logistic回归分析显示,WBC、N、CRP、LDH、ICAM-1为影响肺炎黏液栓形成的独立影响因素(P<0.05);研究组肺泡灌洗液中ICAM-1水平与WBC、N、CRP、LDH均呈正相关(P<0.05)。结论MPP患儿疾病越重,患儿体内的炎性反应也越强烈,ICAM-1的表达水平对MPP儿童炎性反应进程的影响是显著的。当其浓度升高时,可能导致肺炎黏液栓的形成。

麻杏石甘汤合清金化痰汤加减辅助西医治疗难治性肺炎支原体肺炎痰热闭肺证的临床效果观察

目的 观察麻杏石甘汤合清金化痰汤加减辅助西医治疗难治性肺炎支原体肺炎痰热闭肺证的临床效果。方法 前瞻性选取2020年3月至2023年3月东莞市中医院收治的150例痰热闭肺证难治性肺炎支原体肺炎患儿为对象,按照简单随机法将其分为两组,每组各75例。西医组给予西医治疗,汤剂组给予麻杏石甘汤合清金化痰汤加减辅助西医治疗。比较两组症状和体征消失时间,评估两组中医症状评分的差异,检测两组肺泡灌洗液(BALF)中MP-RNA病菌量及血清CXC趋化因子配体(CXCL)8、CXCL9、白细胞计数(WBC)、红细胞沉降率(ESR)、C反应蛋白(CRP)、白细胞介素(IL)-23的水平。结果 汤剂组的退热、止咳及水泡音消失时间、肺部影像学吸收时间分别为(2.05±0.68)、(6.69±1.21)、(10.12±1.89)、(15.24±2.61) d,均短于西医组[(3.89±1.54)、(8.14±1.45)、(13.64±2.13)、(18.52±3.49) d],差异均有统计学意义(P<0.05)。治疗10 d后,两组发热、咳嗽、气喘、咳黄黏痰等主要症状评分和面赤口渴、口唇发绀、烦躁不宁、咽喉肿痛等次要症状评分均较治疗前下降,且汤剂组治疗10 d后中医症状评分均低于西医组,差异均有统计学意义(P<0.05)。治疗10 d后,两组BALF中MP-RNA病菌量均较治疗前改善,汤剂组治疗10 d后BALF中MP-RNA病菌量优于西医组,差异均有统计学意义(P<0.05)。治疗10 d后,两组CXCL8、CXCL9、WBC、ESR、CRP、IL-23水平均较治疗前下降,且汤剂组治疗10 d后上述指标均低于西医组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论 麻杏石甘汤合清金化痰汤加减辅助西医治疗难治性肺炎支原体肺炎痰热闭肺证可促进症状和体征的消退,减少BALF中MP-RNA病菌量,可能与降低CXC趋化因子配体、WBC等指标的表达有关。

mNGS在肺部感染病原学中的诊断价值及应用分析

目的探讨宏基因组新一代测序(mNGS)在肺部感染病原体中的诊断价值及应用分析。方法选取2022年1月至2022年12月孝感市中心医院呼吸与危重症医学科收治的肺部感染(由常见的院内细菌如金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯杆菌、铜绿假胞单菌、大肠埃希菌、鲍曼不动杆菌等,病毒如单纯疱疹病毒、人类疱疹病毒7型等,真菌如白色念珠菌、曲霉菌等引起)患者258例作为研究对象。分别采集患者的肺泡灌洗液标本进行病原微生物mNGS检测与常规痰培养的检测,评估mNGS的诊断价值与应用分析。结果纳入研究的258例患者中,有200例患者通过mNGS检测得出,检出率为77.52%。有58例患者进行常规痰培养检测得出,检出率为22.48%。由此得出mNGS检测的病原微生物总检出率高于进行常规痰培养检测(P<0.05)。结论mNGS对肺部感染患者的病原微生物检出率高于常规痰培养检测,应用价值较高。但是具有一定的局限性。mNGS无法确定它所检测的序列是来自活菌还是死菌,同时也不能区分定植菌与致病菌。另外,mNGS的费用较高,临床上可酌情使用。

不同条件下小鼠肺泡巨噬细胞体外培养的实验研究

目的:应用文献报道的肺泡巨噬细胞(AMs)体外培养方法,利用GM-CSF、TGF-β和PPAR-γ激动剂罗格列酮(简称GTR)培养体系,分析不同年龄小鼠、不同来源前体细胞产生AM样细胞或AMs的特征。方法:收取不同周龄小鼠支气管肺泡灌洗液(BALF)、骨髓单个核细胞以及胚胎15~17 d小鼠肝脏单个核细胞,种入12孔板,置于GTR体系中培养。流式细胞术检测产出细胞AM表面标志分子F4/80、CD11b、CD170和CD11c表达。结果:培养后,光镜下BALF来源细胞基本呈圆形,骨髓来源细胞近半呈圆形,胎肝来源细胞85%左右呈圆形。4周龄小鼠BALF-AMs比例接近90%,比例和数量均随小鼠年龄增加而增加,12周龄小鼠BALF-AMs数量接近1×106个。4周龄小鼠骨髓源AM样细胞比例不到20%,8周龄和12周龄小鼠比例为40%~45%,数量随小鼠年龄增加而增加,12周龄小鼠骨髓源AM样细胞数量约为0.8×106个/孔。胎肝源AM样细胞比例约为84%,1个孔产出的AM样细胞约为4×106个。结论:不同年龄小鼠、不同来源前体细胞产生AM样细胞或AMs的纯度和数量有较大差别,应根据具体研究要求选择合适方法。

肺部结节或肿块患者肺泡灌洗液SHOX2和RASSF1A基因甲基化在肺癌诊断中的价值

目的通过肺组织活检或手术后病检结果来验证两基因甲基化指标检验肺部良、恶性结节诊断效能。方法进行前瞻性研究,收集2019年3月至2020年3月在云南省第三人民医院99例诊断为肺部结节、肿块的患者,行支气管镜检查收集支气管肺泡灌洗液(BALF)样本后,进行定期随访、肺穿刺活检、手术后病检。结果收集的99例肺部结节、肿块患者,经病理诊断后分为肺癌组(n=50)和良性肺疾病组(n=49)。肺癌组年龄(62.64±9.71)岁,良性肺疾病组年龄(60.48±13.69)岁,2组指标差异具有统计学意义(P=0.032);在肺癌的诊断过程中,发现SHOX2和RASSF1A基因任一阳性诊断肺癌的灵敏度分别为72%和58%,特异度分别为92.3%和95.9%。而这2个基因的联合检测在肺癌的诊断中表现出了更高的灵敏度,为0.84,远高于良性疾病组的0.102(P<0.001)。ROC曲线分析显示2个基因甲基化联合时灵敏度可提高至84%。结论肺泡灌洗液SHOX2和RASS1A基因甲基化检验对存在肺部结节或肿块影像表现的肺癌患者诊断具有良好的预测价值,在影像学和组织学诊断不明时,SHOX2和RASSF1A联合检验可以作为肺癌早期诊断的一个重要补充工具。

经电子支气管镜下肺泡灌洗液行宏基因组测序在呼吸机相关性肺炎的应用价值

目的探讨经电子支气管镜下肺泡灌洗液行宏基因组二代测序(mNGS)在呼吸机相关性肺炎(VAP)患者中的应用价值,为患者的临床诊断及针对性治疗提供相关参考依据。方法40例VAP患者作为研究对象,根据随机数字表法分为对照组与mNGS组,各20例。两组均行经电子支气管镜下肺泡灌洗,对照组应用传统病原微生物检测,mNGS组应用mNGS。对比两组患者的病原体种类检出率、病原体种类数检出率、抗生素使用强度(包括抗生素使用率及使用时间)、机械通气时间、重症加强护理病房(ICU)住院时间、多器官功能障碍综合征(MODS)发生率及两种检测方式对VAP的诊断效能。结果mNGS组患者的细菌检出率为80.00%,明显高于对照组的20.00%(P<0.05);两组真菌、病毒检出率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。mNGS组患者病原体种类数>2种检出率为30.00%,明显高于对照组的0(P<0.05)。mNGS诊断VAP的曲线下面积(AUC)为0.941,明显大于传统病原微生物检测的0.714(P<0.05)。mNGS组患者的抗生素使用率55.00%明显低于对照组的90.00%,抗生素使用时间(11.21±2.08)d、机械通气时间(11.96±2.90)d、ICU住院时间(19.03±3.94)d明显短于对照组的(15.87±2.53)、(15.47±3.82)、(22.18±4.55)d,MODS发生率5.00%明显低于对照组的30.00%(P<0.05)。结论经电子支气管镜下肺泡灌洗液行mNGS在VAP患者中的应用价值较高,可以有效提高患者感染病原体的检出率,显著减少抗生素的使用强度及机械通气时间,对患者病情快速准确诊断、及时采取针对性治疗措施意义重大。

不同取材方法及检测技术在重症肺炎病原学诊断中的应用

目的:不同取材方法标本的合格率、不同微生物检测技术结果阳性率有差异,探究不同取材方法及检测技术在重症肺炎病原学诊断中的应用,以期提高病原学诊断的准确性。方法:回顾性分析2018年1月—2020年12月中国人民解放军联勤保障部队第九〇四医院收治的123例重症肺炎患者的临床资料,同时收集患者经鼻或气管插管留痰培养、肺泡灌洗液培养、肺泡灌洗液宏基因组二代测序技术(mNGS)病原检测等数据,对标本的合格率及阳性率进行分析。结果:123例患者中经鼻或者气管插管留痰标本合格率70%、病原菌生长41例(33.3%),肺泡灌洗液标本合格率92%、病原菌生长76例(61.8%)、肺泡灌洗液mNGS病原菌核酸片段检出107例(86.9%)。经抗感染、抗休克、器官支持等治疗后,115例患者治愈出院,8例死亡。结论:肺泡灌洗液mNGS可以提高重症肺炎患者病原诊断阳性率,可为临床治疗提供依据。

宏基因靶向三代测序在下呼吸道感染病原体检测的诊断效能和临床价值

目的比较宏基因靶向三代测序与传统血培养对于下呼吸道感染病原菌诊断性能差异。方法选取2022年7月到2023年7月下呼吸道感染患者90例,收集患者临床资料,采集肺泡灌洗液分别进行培养和宏基因靶向三代测序,比较两个方法的阳性率、一致性,病原体检出分布,混合感染检出率,耐药检出情况等。结果90例患者中,宏基因靶向三代测序和培养的阳性率分别为84.4%和24.4%,宏基因阳性率高于培养(P<0.05),无论在细菌、真菌还是特殊病原体上,宏基因的检出率均高于培养,尤其是在非常见病原体、体外难以培养或生长缓慢的病原体上,宏基因混合感染检出率高于培养,宏基因检出3例细菌耐药基因,并有2例在药敏试验中得到验证。结论相较于传统培养,宏基因靶向三代测序在下呼吸道感染病原微生物诊断上时效性更好,阳性率更高,病原微生物种类、数量检出更多,混合感染检出率更高,且能预测微生物抗生素耐药性,具有更高的诊断价值和临床意义。

肺泡灌洗液mNGS技术在痰菌阴性肺结核患者诊断中的应用

目的:分析肺泡灌洗液宏基因组二代测序(Metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术在痰菌阴性肺结核患者诊断中的应用价值。方法:选取2020年1月至2023年12月我院收治的60例痰菌阴性疑似肺结核患者作为研究对象,所有患者均采集肺泡灌洗液标本,并行抗酸染色及mNGS技术检查,以临床诊断结果为金标准,分析两种检查手段的诊断效能。结果:临床诊断结果显示,60例痰菌阴性疑似肺结核患者中,48例痰菌阴性肺结核患者,12例非肺结核患者;所有患者中被确诊为痰菌阴性肺结核患者48例,以男性(60.42%)、年龄<50岁(68.75%)、有吸烟史(52.08%)、病灶累及右肺上叶(47.92%)、形态为肺叶/段实变(72.92%)等为主;肺泡灌洗液mNGS技术诊断痰菌阴性肺结核的准确度、敏感度分别为90.00%、87.50%,高于抗酸染色诊断的73.33%、68.75%(P<0.05)。结论:肺泡灌洗液mNGS技术对痰菌阴性肺结核具有较高的诊断效能,相较于抗酸染色能提高诊断的准确度及敏感度。

支气管镜检查及肺泡灌洗液NGS对HIV阳性肺结核的诊断价值

目的评价支气管镜检查及肺泡灌洗液二代基因测序对HIV阳性肺结核的诊断价值。方法收集2019年1月至2022年1月石家庄市第五医院的30例HIV阳性临床疑似肺结核或具有肺结核相关体征/症状且行支气管镜检查者的病例资料(其中24例送检肺泡灌洗液NGS)。分析其支气管镜下表现;利用ROC曲线评价肺泡灌洗液NGS及Xpert对HIV阳性肺结核的诊断价值;利用ROC曲线评价痰液、支气管镜及支气管镜联合痰液对HIV阳性肺结核的诊断价值。结果支气管镜检查结果:淋巴结瘘3例,新生物10例,瘢痕、狭窄3例,支气管炎性改变9例,未见异常5例;BALF NGS和Xpert诊断HIV阳性肺结核敏感度分别为71%、47%,特异度均为100%,ROC曲线下的面积值为0.85、0.74;痰液、支气管镜、痰液联合支气管镜诊断HIV阳性肺结核的敏感度分别为41%、68%、86%,特异度分别为88%、100%、88%,ROC曲线下的面积值为0.64、0.84、0.87。结论支气管镜检查及肺泡灌洗液二代基因测序是诊断HIV阳性肺结核的重要工具。

基于Illumina平台mNGS技术在老年社区获得性肺炎肺泡灌洗液病原学诊断中的应用

目的 探讨基于Illumina平台宏基因组二代测序(mNGS)技术在老年社区获得性肺炎(CAP)肺泡灌洗液病原学检查中的应用。方法 选取2022年1月至2022年6月内江第一人民医院收治的疑诊老年CAP患者200例为研究对象,比较肺泡灌洗液mNGS病原体检测与传统细菌培养鉴定法对老年CAP的诊断价值。结果 200例患者经病原学检查共检出阳性154例(77.00%),其中细菌感染119例(59.50%)、病毒感染59例(29.50%)、真菌感染30例(15.00%)、肺炎支原体感染11例(5.50%)、肺炎衣原体感染7例(3.50%),包含混合感染50例(25.00%);mNGS共检出阳性183例(91.5%),其中细菌感染127例(63.50%)、病毒感染96例(48.00%)、真菌感染37例(18.50%)、肺炎支原体感染29例(14.50%)、肺炎衣原体感染15例(750%),包含混合感染75例(37.50%);mNGS阳性检出率、混合感染检测率较传统细菌培养高,差异有统计学意义(χ^(2)=15.845、7.723,P<0.05);mNGS检测时间较传统细菌培养鉴定短,差异有统计学意义(t=86.888,P<0.05);以临床诊断为金标准,mNGS诊断老年CAP的灵敏度、特异度为97.31%、85.71%,传统细菌培养灵敏度、特异度为71.43%、80.64%。结论 基于Illumina平台mNGS对病原体具有较高的检出率,检测时间更短,检测灵敏度、特异度更好,可以为老年CAP临床诊断提供重要依据。

长春市儿童急性下呼吸道感染的病原学分析

目的了解长春市儿童下呼吸感染病原学特征及其分布规律,为本地区儿童下呼吸道感染的临床治疗提供的参考依据。方法采用Realtime PCR方法对2018年12月至2019年11月份采集的73份儿童支气管肺泡灌洗液标本进行28种病原及亚型检测。结果儿童下呼吸道感染中非典型病原体以支原体为主,病毒病原以呼吸道腺病毒、EB病毒、副流感病毒以主,细菌病原感染以流感嗜血杆菌为主。不同的病原体表现不同的流行期。结论通过对长春市儿童下呼吸道感染进行多病原检测,掌握病原流行特点,不同季节的呼吸道病原谱不一致。