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小麦NBS类抗病基因同源cDNA序列的克隆与特征分析 被引量:9
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作者 张楠 王海燕 刘大群 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期605-610,615,共7页
根据已克隆植物抗病(R)基因NBS保守结构域设计简并引物,采用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(RACE),在小麦抗叶锈病近等基因系材料TcLr19中进行抗病同源基因cDNA全长的扩增。获得了1个通读的NBS类抗病同源基因S11A11cDNA序列,该序列全长29... 根据已克隆植物抗病(R)基因NBS保守结构域设计简并引物,采用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(RACE),在小麦抗叶锈病近等基因系材料TcLr19中进行抗病同源基因cDNA全长的扩增。获得了1个通读的NBS类抗病同源基因S11A11cDNA序列,该序列全长2923bp,编码878个氨基酸序列。生物信息学分析结果表明,该片段含有NB-ARC保守结构域和多个LRR结构域。聚类分析表明,S11A11编码的蛋白与小麦抗叶锈病基因Lr1编码的蛋白亲缘关系较近,而与Lr10亲缘关系较远。半定量RT-PCR分析表明,该基因在小麦叶片中为低丰度组成型表达。本研究在TcLr19小麦中成功获得了抗病基因同源序列,为最终克隆小麦抗叶锈病目的基因奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦 核苷酸结合位点(NBS) 抗病基因同源序列(rgas) cdna末端快速扩增技术(RACE) 半定量RT-PCR
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马铃薯kunitz型蛋白酶抑制子基因片段的分离及表达分析 被引量:2
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作者 李广存 金黎平 +3 位作者 谢开云 卞春松 段绍光 屈冬玉 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期403-406,共4页
以马铃薯高抗青枯病基因型ED13为材料,利用cDNA-RGA方法获得了青枯病菌处理和水对照处理之间的差异表达片段(KTI-likeEST)。该EST与kunitz-type抑制子基因高度同源,属于kunitz-type抑制子基因家族,是马铃薯半胱氨酸蛋白酶抑制子基因家... 以马铃薯高抗青枯病基因型ED13为材料,利用cDNA-RGA方法获得了青枯病菌处理和水对照处理之间的差异表达片段(KTI-likeEST)。该EST与kunitz-type抑制子基因高度同源,属于kunitz-type抑制子基因家族,是马铃薯半胱氨酸蛋白酶抑制子基因家族的重要成员。半定量RT-PCR分析表明该基因受青枯病菌的诱导,12h内启动表达,48h内表达量达最高。马铃薯半胱氨酸蛋白酶抑制子基因参与马铃薯对病原的抗病防御,推测所获得的KTI-likeEST也可能参与了马铃薯的抗病防御。 展开更多
关键词 马铃薯 马铃薯青枯病 cdna—rga KTI—like EST RT—PCR
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葡萄抗霜霉病基因同源序列的克隆与分析 被引量:1
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作者 樊金娟 王东旭 +2 位作者 刘长远 赵奎华 梁春浩 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期490-493,共4页
依据抗病基因在保守区域序列同源的原理,针对已知抗病基因NBS保守结构区域设计9条简并引物,以高抗霜霉病的葡萄品种贝达为材料,人工接种葡萄霜霉病菌15d后,应用PCR技术从叶片cDNA中分离出2条抗霜霉病基因同源序列VR5和VR16,并提交到Genb... 依据抗病基因在保守区域序列同源的原理,针对已知抗病基因NBS保守结构区域设计9条简并引物,以高抗霜霉病的葡萄品种贝达为材料,人工接种葡萄霜霉病菌15d后,应用PCR技术从叶片cDNA中分离出2条抗霜霉病基因同源序列VR5和VR16,并提交到Genbank,其中VR5含有507bp,登录编号为JQ763391;VR16含有562bp,登陆编号为JQ763392。2条序列均含有P-环(GGVGKTT)、kinase-2(VLDD)、kinase-3(GSRII)及HD(即GLPL)等植物抗病基因中的保守结构。聚类分析结果表明,VR5与亚麻抗病基因L6聚为一类,VR16与拟南芥抗病基因RPS2聚为一类,编码氨基酸序列同源性分别为38%和56%。 展开更多
关键词 葡萄 霜霉病 抗病基因同源序列 克隆 cdna
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柑橘黄龙病侵染相关抗病基因同源序列的克隆鉴定与表达分析 被引量:1
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作者 刘婷婷 殷幼平 +3 位作者 林亚玉 贤家旭 陈世伟 王中康 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期23-28,共6页
[目的]从黄龙病耐病寄主植物cDNA中筛选抗病基因相关序列并对其进行表达分析研究。[方法]根据已克隆的植物抗性基因表达产物NBS-LRR保守区域设计简并引物,以耐HLB的柑橘属柚cDNA为模板扩增RGAs,并进行实时荧光定量PCR。[结果]通过RFLP... [目的]从黄龙病耐病寄主植物cDNA中筛选抗病基因相关序列并对其进行表达分析研究。[方法]根据已克隆的植物抗性基因表达产物NBS-LRR保守区域设计简并引物,以耐HLB的柑橘属柚cDNA为模板扩增RGAs,并进行实时荧光定量PCR。[结果]通过RFLP分析及克隆测序共得到5个NBS类抗病基因相似序列(RGAs)片段,在GenBank上登录号为HM777043~HM777047。通过Clustalx、DNAMAN等软件分析5个RGAs及其推导的氨基酸的相似性,结果显示它们均含有典型NBS-LRR类抗性基因所具有的保守区域:P-loop、Kinase-2a、GL-PLAL,其与已克隆的烟草N、亚麻L6、拟南芥RPS2、RPS5、RPP8、RPM1等抗病基因在保守区域氨基酸水平上的相似性为19.71%~42.86%。根据得到的序列设计特异性引物,对5个RGAs在HLB侵染过程中的表达进行定量PCR,结果显示嫁接病芽接穗后的8次连续采样中5个RGA的表达受到不同程度的调控。[结论]表明5个RGAs可能与黄龙病的侵染有关。 展开更多
关键词 cdna 抗病基因相似序列 定量PCR 表达分析
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Isolation and Characterization of Mlo and NBS-LRR-like Gene Sequences in Wheat 被引量:5
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作者 李爱丽 孔秀英 +2 位作者 周荣华 马峙英 贾继增 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2003年第4期472-478,共7页
Based on both cDNA sequence of barley powdery mildew resistance control element Mlo and DNA sequence of the known putative disease resistance gene from Triticum monococcum L., we designed some primers to amplify resis... Based on both cDNA sequence of barley powdery mildew resistance control element Mlo and DNA sequence of the known putative disease resistance gene from Triticum monococcum L., we designed some primers to amplify resistant homologous sequences in the near isogenic lines (NILs) of powdery mildew resistance using RT-PCR method. Two expressed cDNA fragments were isolated from wheat genome. One showed 83% homology to the Mlo gene of barley. The other contained two possible open reading frames (ORFs). NBS conservative domains 2, 3 of disease resistance gene and 13 LRR structures similar to rice Pib protein terminal were found respectively in the two ORFs. It indicated that the latter fragment belongs to NBS-LRR-like genes. The obvious difference of RT-PCR products was observed between the before challenged and the challenged for 72 h by Blumeria graminis f. sp. tritici, which, implied that this sequence could be associated with disease resistance of wheat. Using nulli-tetrasomic lines of 'Chinese Spring', the NBS-LRR-like gene had been located on chromosome 1D. 展开更多
关键词 MLO NBS-LRR cdna cloning NIL rga
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黄瓜抗病基因同源序列的表达分析 被引量:4
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作者 许春梅 秦智伟 +1 位作者 丁国华 周秀艳 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期24-28,共5页
对黄瓜抗霜霉病品种东农129进行霜霉菌诱导,以稳定表达的18S RNA基因做对照,用RT-PCR半定量的方法分析黄瓜抗病基因同源序列(RGAs)的表达情况。结果表明,霜霉菌能诱导RGA基因的表达,经霜霉菌诱导后多数RGA基因相对表达量增强。说明了RG... 对黄瓜抗霜霉病品种东农129进行霜霉菌诱导,以稳定表达的18S RNA基因做对照,用RT-PCR半定量的方法分析黄瓜抗病基因同源序列(RGAs)的表达情况。结果表明,霜霉菌能诱导RGA基因的表达,经霜霉菌诱导后多数RGA基因相对表达量增强。说明了RGA基因的表达情况和霜霉菌密切相关。用半定量RT-PCR研究RGA基因的表达具有操作简单,特异性高,可靠性强的优点。 展开更多
关键词 黄瓜 rgas cdna 表达
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Isolation and Characterization of NBS-LRR Class Resistance Homologous Gene from Wheat 被引量:3
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作者 ZHANG Nan WANG Shen WANG Hai-yan LIU Da-qun 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2011年第8期1151-1158,共8页
One resistance gene analog fragment named RGA-CIN14 was isolated from TcLr19 wheat,which contains kinase-2,kinase-3a,and the GLPL motif of the NBS-spanning region,using degenerated primers according to the nucleotide ... One resistance gene analog fragment named RGA-CIN14 was isolated from TcLr19 wheat,which contains kinase-2,kinase-3a,and the GLPL motif of the NBS-spanning region,using degenerated primers according to the nucleotide binding site (NBS) conserved domain.Based on the RGA-CIN14,a full-length cDNA,CIN14,which was 2 987 bp encoding 880 amino acids,was obtained by using the method of the rapid amplification cDNA ends (RACE).Bioinformatics analysis showed that the deduced amino acids of CIN14 protein consisted of a NB-ARC conserved domain and many leucine-rich repeats (LRR) domains.The phylogenetic tree analysis indicated a considerable identity of the protein encoded by CIN14 with that of wheat leaf rust resistance gene Lr1,but a lower similarity with Lr21.The expression profile of the CIN14 gene detected by semi-quantitative RT-PCR showed that the CIN14 gene was not induced by Puccinia triticina and it was a constitutive gene with low abundance in the wheat leaf tissue.The resistance homology sequence was successfully obtained,which provides the shortcut for cloning of the resistance gene in TcLr19 wheat. 展开更多
关键词 wheat leaf rust resistance gene NBS-LRR resistance gene analogs rgas) rapid amplification cdna end (RACE) RT-PCR
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