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类钙调磷酸酶B亚基蛋白GhCBL3-A01调控棉花黄萎病抗性的功能分析
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作者 高升旗 邵武奎 +3 位作者 赵准 邵盘霞 胡文冉 黄全生 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2023年第6期447-458,共12页
【目的】解析类钙调磷酸酶B亚基蛋白(calcium B-like protein,CBL)基因GhCBL3-A01在棉花抗黄萎病反应中的功能,为棉花抗病育种提供基因资源。【方法】从棉花基因组数据库获得GhCBL3-A01基因的同源序列,进行生物信息学分析。采用实时荧... 【目的】解析类钙调磷酸酶B亚基蛋白(calcium B-like protein,CBL)基因GhCBL3-A01在棉花抗黄萎病反应中的功能,为棉花抗病育种提供基因资源。【方法】从棉花基因组数据库获得GhCBL3-A01基因的同源序列,进行生物信息学分析。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)、茉莉酸甲酯(methyl jasminate,MeJA)和H2O2处理的棉株中GhCBL3-A01基因的表达量变化。利用病毒诱导的基因沉默(virus-induced gene silencing,VIGS)技术研究GhCBL3-A01在棉花抗黄萎病中的功能。通过检测活性氧积累以及相关基因的表达量,初步分析GhCBL3-A01的作用机制。【结果】陆地棉中GhCBL3-A01及其3个同源蛋白均含有3个CBL家族典型的EF-hand结构域。大丽轮枝菌、MeJA和H2O2处理后,GhCBL3-A01的表达量显著升高。VIGS沉默GhCBL3-A01导致病株率和病情指数显著降低,茎秆维管束褐变程度减轻,有病菌繁殖的茎段数量明显减少,增强了棉株对黄萎病的抗性。GhCBL3-A01基因沉默棉株叶片中活性氧积累增多,防御相关基因PR1、NPR1、PR4和PDF1.2以及茉莉酸信号通路关键基因AOS1、OPR3、MYC2和LOX2的表达量增加。【结论】GhCBL3-A01通过调控防御相关基因、茉莉酸信号通路基因的表达和活性氧积累负调控棉花对黄萎病的抗性,是提高棉花黄萎病抗性的候选基因。 展开更多
关键词 棉花 黄萎病 类钙调磷酸酶B亚基蛋白 GhCBL3-A01 抗病基因 病毒诱导的基因沉默
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两个菜心CBL基因的克隆、生物信息学分析及其表达特性分析 被引量:1
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作者 朱云娜 符质 +4 位作者 冯慧敏 王斌 沈雪晴 汤婉君 刘建国 《山东农业科学》 北大核心 2023年第7期1-9,共9页
本研究以‘油绿501’菜心(Brassica campestris L.ssp.chinensis var.utilis Tsen et Lee)为材料,采用同源克隆方法对其CBL1、CBL9基因进行克隆,运用DNAMAN和MEGA软件对其编码蛋白序列进行同源性分析和系统进化分析,并利用qRT-PCR技术... 本研究以‘油绿501’菜心(Brassica campestris L.ssp.chinensis var.utilis Tsen et Lee)为材料,采用同源克隆方法对其CBL1、CBL9基因进行克隆,运用DNAMAN和MEGA软件对其编码蛋白序列进行同源性分析和系统进化分析,并利用qRT-PCR技术分析二者在菜心组织中及不同氮素形态条件下的表达模式。结果表明:菜心CBL1、CBL9基因的cDNA全长均为642 bp,编码213个氨基酸,分别命名为BcCBL1和BcCBL9,具有CBL蛋白结合Ca2+所必需的EF-hand型结构域(EFh)。BcCBL1、BcCBL9编码的氨基酸序列与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、大白菜(Brassica rapa)等物种的同源性均达95%以上;二者分别与大白菜的BrCBL1、BrCBL9遗传距离最近,并与拟南芥AtCBL1、AtCBL9共同聚类为一支。BcCBL1和BcCBL9在菜心各组织器官中均有表达,前者在菜心叶片中表达水平较高,后者在菜心荚果等组织中表达水平较高;两者表达受氮素形态及水平影响,前者在低浓度NO_(3)^(-)或NH_(4)^(+)处理后上调表达,后者表达随NH_(4)^(+)浓度增加而上调表达。该研究结果可为进一步研究菜心CBL1和CBL9在氮素吸收利用过程中的功能及其调控机制提供一定理论基础。 展开更多
关键词 菜心 氮素形态 类钙调磷酸酶B亚基蛋白 基因克隆 生物信息学分析 表达分析
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谷子CBL基因鉴定及其在干旱、高盐胁迫下的表达分析 被引量:30
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作者 赵晋锋 余爱丽 +3 位作者 田岗 杜艳伟 郭二虎 刁现民 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期360-367,共8页
CBL/CIPK信号网络系统在植物对逆境应答过程中起重要作用。本文利用生物信息学方法从谷子基因组中鉴定出7个候选CBL基因,命名为SiCBL1~SiCBL7。分析表明谷子CBL基因在蛋白质序列和结构上非常保守,所有预测SiCBL基因都含有7~8个内含子... CBL/CIPK信号网络系统在植物对逆境应答过程中起重要作用。本文利用生物信息学方法从谷子基因组中鉴定出7个候选CBL基因,命名为SiCBL1~SiCBL7。分析表明谷子CBL基因在蛋白质序列和结构上非常保守,所有预测SiCBL基因都含有7~8个内含子,而且其外显子序列同源性很高并且大部分外显子含有相同的碱基数目。预测SiCBL基因均含有4个EF-Hand功能域而且相邻EF-Hand功能域之间的氨基酸数目非常保守。进化和聚类分析结果表明, CBL基因在陆生植物早期的进化过程中就已经存在,所有CBL基因被分为4个亚组。7个候选SiCBL基因中, 4个基因(SiCBL1、SiCBL2、SiCBL3和SiCBL5)受干旱胁迫诱导表达,3个(SiCBL1、SiCBL3和SiCBL7)受高盐胁迫诱导表达。SiCBL3基因在干旱胁迫下被强烈诱导可能意味着其在干旱应答中起重要作用。本文报道的谷子CBL基因丰富和完善了植物CBL成员, 为进一步研究CBL/CIPK网络系统在抗逆作物谷子逆境响应中的功能、机制奠定了基础。 展开更多
关键词 谷子 CBL基因 干旱
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植物CBL/CIPK网络系统逆境应答研究进展 被引量:16
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作者 赵晋锋 余爱丽 +4 位作者 王高鸿 田岗 王寒玉 杜艳伟 常海霞 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 2011年第4期32-38,共7页
大多数信号转导过程都伴随着细胞内钙离子浓度变化,CBL/CIPK信号系统是近几年在高等植物中发现的一类依赖于钙离子的信号系统,包括感知钙离子浓度变化的CBL蛋白(calcineurin B-like proteins)和与之互作的CIPK蛋白(CBL-interacting prot... 大多数信号转导过程都伴随着细胞内钙离子浓度变化,CBL/CIPK信号系统是近几年在高等植物中发现的一类依赖于钙离子的信号系统,包括感知钙离子浓度变化的CBL蛋白(calcineurin B-like proteins)和与之互作的CIPK蛋白(CBL-interacting protein kinase)。研究表明CBL/CIPK信号系统在植物对逆境应答过程中起重要作用。在介绍CBL和CIPK的结构和特征基础上对不同植物CBL/CIPK信号系统在逆境应答中的研究现状况进行了综述,以期为基因工程改良作物抗逆育种提供新的思路和种质资源。 展开更多
关键词 CBL CIPK 蛋白激酶 逆境应答
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两个谷子CIPK基因在非生物逆境胁迫下的表达分析 被引量:12
5
作者 余爱丽 赵晋锋 +5 位作者 王高鸿 杜艳伟 李颜方 张正 郭二虎 梁爱华 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期295-302,共8页
CIPK是一类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,该蛋白在植物响应逆境胁迫过程中发挥重要作用。本文利用生物信息学方法从谷子基因组中鉴定出2个CIPK基因,命名为Si CIPK6和Si CIPK16。序列分析表明Si CIPK6基因组序列长1994 bp,编码451个氨基酸;Si C... CIPK是一类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,该蛋白在植物响应逆境胁迫过程中发挥重要作用。本文利用生物信息学方法从谷子基因组中鉴定出2个CIPK基因,命名为Si CIPK6和Si CIPK16。序列分析表明Si CIPK6基因组序列长1994 bp,编码451个氨基酸;Si CIPK16基因组序列长1885 bp,编码473个氨基酸,2个基因均无内含子和可变剪切。生物信息学分析显示这2个基因在蛋白质序列和结构上与其他物种CIPK基因一样非常保守。实时定量PCR分析表明Si CIPK6和Si CIPK16在ABA、低温、高温、干旱、高盐诱导下表达量均有所上调,Si CIPK6基因在ABA、干旱和盐处理时表达量上调幅度较大,而Si CIPK16基因在低温、干旱和高温处理时表达量上调幅度较大。半定量PCR检测结果表明Si CIPK6和Si CIPK16两个基因在拔节、孕穗、灌浆期时均有表达,在相应生育时期受到干旱胁迫时它们表达量均有所提高。推测Si CIPK6和Si CIPK16基因在谷子的干旱或其他逆境胁迫中起一定作用。 展开更多
关键词 谷子 CIPK基因 逆境
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杜梨CBL1和CBL7基因对非生物逆境的响应 被引量:11
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作者 韩金龙 李慧 +2 位作者 丛郁 常有宏 蔺经 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期529-535,共7页
【目的】克隆2个杜梨类钙调磷酸酶B亚基蛋白(Calcineurin B-like protein,CBL)基因,并对其序列特征、表达特点及抗逆功能进行比较研究。【方法】采用电子克隆、RT-PCR和长片段PCR克隆了PbCBL1和PbCBL7的cDNA和DNA序列,利用生物信息学方... 【目的】克隆2个杜梨类钙调磷酸酶B亚基蛋白(Calcineurin B-like protein,CBL)基因,并对其序列特征、表达特点及抗逆功能进行比较研究。【方法】采用电子克隆、RT-PCR和长片段PCR克隆了PbCBL1和PbCBL7的cDNA和DNA序列,利用生物信息学方法进行序列分析,半定量RT-PCR检测它们的表达特点,原核表达初步比较研究上述2个基因的抗逆功能。【结果】杜梨PbCBL1 cDNA编码区为642 bp,编码213个氨基酸,对应基因组DNA序列长2 969 bp;PbCBL7 cDNA编码区为639 bp,编码212个氨基酸,对应基因组DNA序列长1 788 bp;PbCBL1和PbCBL7均由8个外显子和7个内含子组成。PbCBL1和PbCBL7编码的多肽均具有植物类钙调磷酸酶B亚基蛋白结合Ca2+所必需的4个EF手型结构和1个典型的植物钙调磷酸酶A亚基结合位点。未经处理的杜梨幼苗(对照)根和叶中PbCBL1和PbCBL7的表达非常微弱,NaCl、PEG6000、甘露醇和ABA处理后,它们在根和叶中的表达均上调,且PbCBL1在叶片中的表达量显著增加。2个CBL基因分别转入大肠杆菌BL21(DE3)后,均能够明显减轻NaCl、甘露醇和PEG6000对菌株的生长抑制,而转PbCBL1菌株的抗逆效果较为明显。【结论】PbCBL1和PbCBL7基因具备植物CBLs基因家族的固有特征,对盐碱、干旱、渗透胁迫和ABA处理均存在转录响应,上述基因的转入能够提高大肠杆菌BL21(DE3)对盐胁迫和渗透胁迫的耐受能力,转PbCBL1菌株的抗逆功能强于转PbCBL7菌株。 展开更多
关键词 杜梨 CBL基因 序列特征 表达特点 功能比较
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杜梨类钙调磷酸酶B亚基蛋白PbCBL10基因的克隆和表达特性研究 被引量:9
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作者 李慧 丛郁 +2 位作者 常有宏 蔺经 盛宝龙 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期550-556,共7页
【目的】为了探明杜梨类钙调磷酸酶B亚基蛋白(CalcineurinB—likeprotein,CBL)基因的序列特征和表达特点,【方法】以杜梨幼苗为试材,运用同源克隆和半定量RT—PCR对PbCBLIO基因进行克隆和表达分析。【结果】结果表明.PbCBLIO基因... 【目的】为了探明杜梨类钙调磷酸酶B亚基蛋白(CalcineurinB—likeprotein,CBL)基因的序列特征和表达特点,【方法】以杜梨幼苗为试材,运用同源克隆和半定量RT—PCR对PbCBLIO基因进行克隆和表达分析。【结果】结果表明.PbCBLIO基因编码区cDNA长度为801bp,编码的多肽由266个氨基酸组成。该多肽预测的等电点为4.56,估计的相对分子质量为30.45ku。其对应基因组DNA序列长1983bp,包括9个外显子和8个内含子。通过PSORT进行亚细胞定位分析发现PbCBLl0蛋白位于质膜上的几率最大。PbCBLIO基因编码的多肽具有4个钙离子结合域EF手形结构和1个钙调磷酸酶A亚基结合位点。PbCBLl0与番茄S1CBLIO(NP_001239045)和拟南芥AtCBLl0(NP_195026)蛋白间的同源性较高,分别为82%和77%,并与AtCBL10亲缘关系最近。PbCBL10基因在杜梨幼苗根、茎和叶片中均为诱导型表达,50~200mmol·L^(-1)CaCl2、20μmol·L^(-1)ABA、100mmol·L^(-1)NaCl、10%(w/v)PEG6000或180mmol·L^(-1)甘露醇处理后其表达量明显上调。【结论】PbCBLIO基因具备植物CBL基因家族的固有特征,能够响应胞内钙浓度变化,对ABA、盐碱、干旱和渗透胁迫均存在转录响应。 展开更多
关键词 杜梨 类钙调磷酸酶B亚基蛋白 基因克隆 表达特性
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水稻类钙调磷酸酶亚基B蛋白质在逆境胁迫下的表达 被引量:7
8
作者 贾霖 刘雨萌 +8 位作者 范伟 关明俐 贾盟 窦世娟 魏健 彭业博 刘丽娟 李莉云 刘国振 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期1-8,共8页
【目的】了解水稻CBL蛋白质在逆境胁迫下的表达模式进而探讨水稻耐逆的分子机理。【方法】采用基于抗体的蛋白质组学策略,以超级杂交稻父本9311为材料,采用免疫印迹(western blotting,WB)技术调查了CBL家族主要成员在冷、热、旱、淹和... 【目的】了解水稻CBL蛋白质在逆境胁迫下的表达模式进而探讨水稻耐逆的分子机理。【方法】采用基于抗体的蛋白质组学策略,以超级杂交稻父本9311为材料,采用免疫印迹(western blotting,WB)技术调查了CBL家族主要成员在冷、热、旱、淹和盐胁迫等5种逆境中的表达特征。【结果】发现CBL1、CBL5和CBL6在冷胁迫中表达下调,CBL1和CBL2在热胁迫中表达下调,CBL1和CBL5在旱胁迫中表现下调,而CBL6、CBL8和CBL10在旱胁迫中表现上调,CBL1、CBL5、CBL6、CBL8和CBL10在淹涝胁迫中表达上调,而CBL2表现下调。【结论】鉴定了水稻在重要逆境胁迫下发生丰度变化的6个CBL蛋白质。 展开更多
关键词 水稻 免疫印迹 逆境胁迫 CBL 蛋白质表达
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植物CBL基因家族的研究进展 被引量:15
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作者 董连红 史素娟 +6 位作者 S M Nuruzzaman Manik 苏玉龙 刘朝科 冯祥国 胡晓明 王倩 刘好宝 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期892-898,共7页
细胞中游离的Ca2+是植物细胞中普遍存在的第二信使,类钙调神经素B亚基蛋白CBL作为一种特殊的钙感受器在植物生长发育和逆境胁迫响应过程中发挥重要作用。本文主要对植物CBL家族的起源与进化、蛋白结构、亚细胞定位以及CBL的功能进行综述... 细胞中游离的Ca2+是植物细胞中普遍存在的第二信使,类钙调神经素B亚基蛋白CBL作为一种特殊的钙感受器在植物生长发育和逆境胁迫响应过程中发挥重要作用。本文主要对植物CBL家族的起源与进化、蛋白结构、亚细胞定位以及CBL的功能进行综述,并对今后钙感受器CBL家族的研究重点和发展方向进行了展望。 展开更多
关键词 Ca^2+信号 CBL CIPK 非生物逆境 信号转导
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注射用重组人钙调磷酸酶B亚基稳定性的初步研究 被引量:5
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作者 高锦 赵文军 +2 位作者 王艳丽 刘一群 魏群 《中国新药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期675-678,共4页
目的:对注射用重组人钙调磷酸酶B亚基(rhCNB)的稳定性进行初步研究,以确定其贮藏条件和有效期。方法:采用毛细管区带电泳(CZE),反相高效液相色谱(RP—HPLC),十二烷基磺酸钠一聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS—PAGE)非还原电泳、蛋... 目的:对注射用重组人钙调磷酸酶B亚基(rhCNB)的稳定性进行初步研究,以确定其贮藏条件和有效期。方法:采用毛细管区带电泳(CZE),反相高效液相色谱(RP—HPLC),十二烷基磺酸钠一聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS—PAGE)非还原电泳、蛋白质含量测定Bradford法、圆二色谱(CD)、pH值、生物学活性等检测方法,对rhCNB在贮藏温度条件下的稳定性进行了系统研究。结果及结论:3批注射用rhCNB于2℃~8℃贮藏24个月,各项指标:外观、pH值、蛋白含量、纯度、肽图谱、相对分子质量、CD光谱蛋白质二级结构及生物学活性均无明显变化,稳定性好,有效期可暂定为2年。 展开更多
关键词 重组人钙调磷酸酶B亚基(rhCNB) 稳定性 蛋白质二级结构 有效期
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日本血吸虫钙调神经磷酸酶B基因的获得和分析 被引量:4
11
作者 张愉快 肖建华 +5 位作者 王可耕 刘传爱 曾桥 万志刚 杨胜 杨秋林 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2004年第5期410-412,共3页
目的 从日本血吸虫 (Schistosomajaponicum ,Sj)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新的蛋白基因 ,为日本血吸虫病的防治提供侯选疫苗和药物靶点。方法 构建日本血吸虫成虫cDNA文库 ,挑取重组阳性克隆进行测序 ,对部分序列进行步移... 目的 从日本血吸虫 (Schistosomajaponicum ,Sj)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新的蛋白基因 ,为日本血吸虫病的防治提供侯选疫苗和药物靶点。方法 构建日本血吸虫成虫cDNA文库 ,挑取重组阳性克隆进行测序 ,对部分序列进行步移法测序获取全长cDNA ,并进行生物信息学分析和登录。结果 获得了 1个日本血吸虫新基因 -钙调神经磷酸酶 (Calcineurin ,CaN)基因B(AY2 2 0 75 1) ,长 12 6 6bp ,编码 16 9个氨基酸 ,含有 2个“EF -hand”Ca+2 结合区域 ,与曼氏血吸虫CalcineurinB有 84 %的同源性。 展开更多
关键词 日本血吸虫 CDNA文库 步移法 生物信息学 钙调神经磷酸酶B 基因
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非生物胁迫诱导的玉米蛋白激酶基因ZmCIPK3的cDNA克隆和表达特性 被引量:6
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作者 边鸣镝 李文亮 +4 位作者 郭庆勋 王晶莹 周连霞 杨德光 黄丛林 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期52-57,共6页
类钙调磷酸酶B亚基互作蛋白激酶(calcineurin B-like calciumsensor interactingProtein Kinase,CIPK)在植物非生物胁迫信号转导中起重要作用。应用分子克隆的方法在玉米(Zea mays)中克隆了一个cDNA全长为1 350 bp的蛋白激酶基因ZmCIPK3... 类钙调磷酸酶B亚基互作蛋白激酶(calcineurin B-like calciumsensor interactingProtein Kinase,CIPK)在植物非生物胁迫信号转导中起重要作用。应用分子克隆的方法在玉米(Zea mays)中克隆了一个cDNA全长为1 350 bp的蛋白激酶基因ZmCIPK3(GenBank登录号为EU873319)。其编码的蛋白含有449个氨基酸,分子量为50.89kD,等电点为8.26。推断的ZmCIPK3催化结构域中包含蛋白激酶催化结构域保守的11个亚结构域,蛋白C端具有植物CIPK蛋白家族特有的包含24个氨基酸的NAF结构域。半定量RT-PCR结果表明,在玉米幼苗叶片中,ZmCIPK3响应甘露醇、氯化钠、ABA和4℃低温的诱导,其转录水平在12 h内呈上升趋势。ZmCIPK3是一个新的玉米蛋白激酶基因,响应多种非生物胁迫信号。 展开更多
关键词 玉米 类钙调磷酸酶B亚基互作蛋白激酶(CIPK) 非生物胁迫
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非生物胁迫下杜梨PbCBL4基因的表达 被引量:5
13
作者 李刚波 李慧 +2 位作者 丛郁 常有宏 蔺经 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第5期1132-1138,共7页
为揭示PbCBL4基因在杜梨抗逆防御机制中的作用,采用PCR方法克隆了杜梨PbCBL4基因的cDNA和DNA序列,利用半定量RT-PCR和原核表达分析了该基因对非生物胁迫的转录响应。结果表明:PbCBL4基因的cDNA长度为639 bp,编码一个含212个氨基酸的蛋白... 为揭示PbCBL4基因在杜梨抗逆防御机制中的作用,采用PCR方法克隆了杜梨PbCBL4基因的cDNA和DNA序列,利用半定量RT-PCR和原核表达分析了该基因对非生物胁迫的转录响应。结果表明:PbCBL4基因的cDNA长度为639 bp,编码一个含212个氨基酸的蛋白;基因组DNA长度为1 645 bp,包含8个外显子和7个内含子。PbCBL4编码的蛋白具有植物类钙调磷酸酶B亚基蛋白结合Ca2+所必需的4个EF手型结构,1个典型的植物钙调磷酸酶A亚基结合位点。PbCBL4与拟南芥AtCBL4亲缘关系最近,处于同一进化分支上。PbCBL4基因在杜梨叶中为诱导型表达,对盐碱、干旱、渗透胁迫和ABA处理均存在转录响应,而在杜梨根中检测不到该基因的表达;将其转入大肠杆菌BL21(DE3)后,能够明显减轻NaCl、甘露醇和PEG6000对该菌株的生长抑制。综上所述,PbCBL4基因主要在叶片中参与了杜梨对非生物胁迫的防御机制。转入PbCBL4的重组大肠杆菌对盐胁迫和渗透胁迫的耐受能力均得到提高。 展开更多
关键词 杜梨 CBL基因 基因特点 原核表达
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葡萄类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因VvCBL4的克隆与表达分析 被引量:3
14
作者 余义和 李秀珍 +4 位作者 郭大龙 杨英军 李桂荣 李学强 张国海 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期385-392,共8页
【目的】在京秀(Vitis vinifera‘Jingxiu’)葡萄中克隆类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因Vv CBL4及其启动子,分析Vv CBL4的表达特性与逆境胁迫的关系。【方法】用RACE技术克隆Vv CBL4的全长,实时荧光定量PCR检测Vv CBL4在不同逆境下的表达;用... 【目的】在京秀(Vitis vinifera‘Jingxiu’)葡萄中克隆类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因Vv CBL4及其启动子,分析Vv CBL4的表达特性与逆境胁迫的关系。【方法】用RACE技术克隆Vv CBL4的全长,实时荧光定量PCR检测Vv CBL4在不同逆境下的表达;用同源克隆技术获得Vv CBL4的启动子,在烟草叶片中瞬时表达分析Vv CBL4启动子的活性。【结果】Vv CBL4全长为959 bp,ORF为642 bp,编码213个氨基酸,具有3个EF手钙结合结构域。Vv CBL4在根部表达量最高,其次是果实。Vv CBL4的转录本能对干旱、低温和盐胁迫处理快速做出响应。Vv CBL4启动子富含与逆境响应相关的顺式作用元件。干旱、低温和盐胁迫处理能够增强启动子活性。【结论】获得Vv CBL4及其启动子序列,Vv CBL4的表达能对逆境胁迫做出响应,Vv CBL4启动子的活性受逆境胁迫诱导,说明Vv CBL4在葡萄逆境胁迫反应中具有重要的作用。 展开更多
关键词 葡萄 类钙调磷酸酶B亚基蛋白 VvCBL4 逆境 表达分析
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谷子CIPK基因(Seita.5G145900)对非生物逆境的响应 被引量:4
15
作者 赵晋锋 杜艳伟 +3 位作者 王高鸿 李颜方 赵根有 余爱丽 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期698-704,共7页
在谷子基因组中鉴定出一个CIPK(Seita.5G145900,命名为SiCIPK19)基因。为揭示SiCIPK19对逆境胁迫的响应,对其基因结构、蛋白特征、功能、进化等性状进行了系统的分析和预测,并用实时定量PCR(RT-qPCR)检测了其在谷子苗期不同逆境及关键... 在谷子基因组中鉴定出一个CIPK(Seita.5G145900,命名为SiCIPK19)基因。为揭示SiCIPK19对逆境胁迫的响应,对其基因结构、蛋白特征、功能、进化等性状进行了系统的分析和预测,并用实时定量PCR(RT-qPCR)检测了其在谷子苗期不同逆境及关键生育期干旱胁迫下的表达。结果表明,SiCIPK19基因位于谷子5号染色体,基因组序列长1353 bp,编码450个氨基酸,基因无可变剪切,且不含内含子。功能域分析和多序列比对发现,SiCIPK19蛋白具有非常保守的序列结构,与其他植物CIPK蛋白也非常相似。RT-qPCR分析表明,SiCIPK19基因被聚乙二醇6000(PEG 6000)、ABA、高盐和低温胁迫强烈诱导。此外,SiCIPK19基因在谷子拔节期、抽穗期和灌浆期干旱条件下参与了对干旱胁迫的响应,推测该基因参与谷子对非生物逆境的应答,尤其在抽穗期和灌浆期干旱胁迫应答中发挥重要作用。本研究结果为进一步分析CIPK基因逆境应答机制,以及利用基因工程方法改善谷子抗逆性和提高产量提供了理论支持。 展开更多
关键词 谷子 CBL互作蛋白激酶(CIPK) 基因 非生物逆境
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亚洲带绦虫成虫钙调神经磷酸酶B基因的克隆和生物信息学分析 被引量:3
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作者 黄江 胡旭初 +4 位作者 包怀恩 黄艳 余新炳 郎书源 廖兴江 《中国病原生物学杂志》 CSCD 2008年第1期23-26,共4页
目的从亚洲带绦虫(Taenia asiatica)成虫cDNA文库中克隆亚洲带绦虫成虫钙调神经磷酸酶B基因(calci—neurinB),并分析和预测其编码蛋白的结构和功能。方法构建亚洲带绦虫成虫cDNA质粒文库,从文库中识别钙调神经磷酸酶B基因并进行... 目的从亚洲带绦虫(Taenia asiatica)成虫cDNA文库中克隆亚洲带绦虫成虫钙调神经磷酸酶B基因(calci—neurinB),并分析和预测其编码蛋白的结构和功能。方法构建亚洲带绦虫成虫cDNA质粒文库,从文库中识别钙调神经磷酸酶B基因并进行生物信息学分析和登录。结果该基因登录号为ABN14963.1,是全长基因,长度747bp,编码区为56~563,编码169个氨基酸;无跨膜区,蛋白的理化性质稳定;含有4个“EF—hand”Ca^2+结合区域;与Gen—Bank中日本血吸虫同源基因的一致性达90%,相似性达95%;预测3个主要的抗原表位99~104、20~25、23~28在钙调神经磷酸酶B蛋白空间结构的分子表面。结论应用生物信息学方法从亚洲带绦虫成虫cDNA文库中筛选出一个钙调神经磷酸酶B基因。 展开更多
关键词 亚洲带绦虫 钙调神经磷酸酶B基因 CDNA 生物信息学
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香蕉钙调神经磷酸酶B亚基样蛋白基因MaCBL1的克隆及序列分析 被引量:3
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作者 李美英 徐碧玉 +3 位作者 杨小亮 刘菊华 张建斌 金志强 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第26期11257-11259,共3页
[目的]为香蕉钙调神经磷酸酶B亚基样蛋白基因MaCBL1调控机理的研究奠定基础。[方法]根据在香蕉果实抑制缩减文库中获得的一个CBL基因片段,采用PCR方法克隆了MaCBL1基因全长cDNA序列并对其进行了初步的生物信息学分析。[结果]MaCBL1基因c... [目的]为香蕉钙调神经磷酸酶B亚基样蛋白基因MaCBL1调控机理的研究奠定基础。[方法]根据在香蕉果实抑制缩减文库中获得的一个CBL基因片段,采用PCR方法克隆了MaCBL1基因全长cDNA序列并对其进行了初步的生物信息学分析。[结果]MaCBL1基因cDNA序列全长1 078 bp,编码213个氨基酸残基。多重序列比对结果显示,MaCBL1推导的氨基酸序列与其他植物来源的CBL基因的氨基酸序列同源性较高。遗传进化分析表明MaCBL1与其他植物如杨树、甘蓝、沙冬青、棉花和水稻的CBL基因的亲缘关系较近,并在同一个进化枝上。[结论]该研究为进一步研究香蕉钙调神经磷酸酶B亚基样蛋白对香蕉生长发育、果实的成熟调控及对各种逆境反应的调控提供了依据。 展开更多
关键词 香蕉 钙调神经磷酸酶B亚基样蛋白基因 克隆 序列分析
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生物信息学方法筛选华支睾吸虫成虫功能基因——钙调神经磷酸酶B亚基样蛋白 被引量:2
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作者 张红梅 余新炳 +1 位作者 徐劲 吴忠道 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2005年第4期300-302,共3页
目的本文通过建立华支睾吸虫成虫cDNA文库,筛选其功能基因。方法应用SMART方法构建华支睾吸虫成虫cDNA文库,进行大量EST测序,然后应用生物信息学方法将EST序列与GenBank中登陆的序列进行同源性比对、序列拼接及基因完整性判断;并应用NCB... 目的本文通过建立华支睾吸虫成虫cDNA文库,筛选其功能基因。方法应用SMART方法构建华支睾吸虫成虫cDNA文库,进行大量EST测序,然后应用生物信息学方法将EST序列与GenBank中登陆的序列进行同源性比对、序列拼接及基因完整性判断;并应用NCBI上的RPSBLAST对所筛选基因的保守域进行搜索比对,利用PredictProtein分析、预测其功能域及二级结构。结果从华支睾吸虫成虫cDNA文库中筛选的钙调神经磷酸酶B亚基样蛋白(CsCBLP)基因,经同源性分析,CsCBLP与褐家鼠钙调神经磷酸酶(CaN)同源性为53%,与尾刺耐格里原虫CaNB同源性为40%,与新小杆线虫属结合蛋白的同源性为51%;保守域的比对及功能域、二级结构的预测显示所筛选的CsCBLP是钙调神经磷酸酶B亚基的的类似物,属于钙结合蛋白家族。结论应用生物信息学方法从华支睾吸虫成虫cDNA文库中筛选出钙调神经磷酸酶B亚基样蛋白基因。 展开更多
关键词 生物信息学 筛选 华支睾吸虫 成虫 功能基因 钙调神经磷酸酶B亚基样蛋白 EST
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CIPK9: a calcium sensor-interacting protein kinase required for low-potassium tolerance in Arabidopsis 被引量:23
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作者 Girdhar K Pandey Yong Hwa Cheongx +3 位作者 Beom-Gi Kim John J Grant Legong Li Sheng Luan 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2007年第5期411-421,共11页
Potassium is one of the major macro-nutrients essential for a number of cellular processes in plants. Low potassium level in the soil represents a limiting factor for crop production. Recent studies have identified po... Potassium is one of the major macro-nutrients essential for a number of cellular processes in plants. Low potassium level in the soil represents a limiting factor for crop production. Recent studies have identified potassium transporters that are involved in potassium acquisition, and some of them are critical for potassium nutrition under low potassium conditions. However, little is understood on the molecular components involved in low potassium signaling and responses. We report here the identification ofa calcineurin B-like protein-interacting protein kinase (CIPK9) as a critical regulator of low potassium response in ,Arabidopsis. The CIPK9 gene was responsive to abiotic stress conditions, and its transcript was inducible in both roots and shoots by potassium deprivation. Disruption of CIPK9 function rendered the mutant plants hypersensitive to low potassium media. Further analysis indicated that K^+ uptake and content were not affected in the mutant plants, implying CIPK9 in the regulation of potassium utilization or sensing processes. 展开更多
关键词 CALCIUM calcineurin-b like protein protein kinase potassium nutrition signal transduction
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HPLC和MALDI-TOF-MS法分析重组人钙调磷酸酶B亚基的纯度和肽图谱 被引量:3
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作者 高锦 王艳丽 魏群 《北京师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期114-119,共6页
用反相高效液相色谱 (RP HPLC)法对重组人钙调磷酸酶B亚基 (rhCNB)的纯度和肽图谱进行了测定 ,以比较不同批次产品的纯度及其一级结构的一致性 ,对其进行质量控制 .并用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI TOF MS)法进行验证 .结... 用反相高效液相色谱 (RP HPLC)法对重组人钙调磷酸酶B亚基 (rhCNB)的纯度和肽图谱进行了测定 ,以比较不同批次产品的纯度及其一级结构的一致性 ,对其进行质量控制 .并用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI TOF MS)法进行验证 .结果表明 ,运用梯度洗脱RP HPLC法能对样品进行纯度检查和肽图谱分析 ,测得 3批样品纯度均达到 98%以上 ,肽图谱能达到批间一致 .同时用MALDI TOF MS法测定 ,纯度结果二者相符 ,质谱肽图经计算机辅助分析 ,确证rhCNB一级结构与天然CNB一致 .证明该方法灵敏、准确、可靠 . 展开更多
关键词 重组人钙调磷酸酶B亚基(rhCNB) 高效液相色谱法 基质辅肋激光解吸电离飞行时间质谱法 纯度 肽图谱
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