辽宁部分地区猪圆环病毒3型cap蛋白的测序和遗传进化分析

为了解辽宁地区猪圆环病毒3型cap基因序列的遗传变异情况,以辽宁地区从检测为PCV3阳性的435份病料中,选择10份阳性样品进行PCV3 cap基因扩增和序列测定。经过扩增和测序比对,共获得了3条PCV3 cap基因序列。3条PCV3完整Cap基因全长650 bp,没有发生碱基的缺失或插入。3株PCV3核苷酸序列的同源性为9884%~995%。PCV3-2和PCV3-3为一个分支,PCV3-1作为一个独立分支,与参考序列相比,三者之间亲缘关系更加相近,说明近几年辽宁地区PCV3毒株存在一种新的进化方向。