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植物乳植杆菌YZH81胞外多糖基因簇的功能鉴定
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作者 赵芳 黄璐 +4 位作者 宦海琳 黄淑婷 张文君 梁晴晴 杨瑶 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2023年第23期118-126,共9页
为了研究植物乳植杆菌胞外多糖(EPS)的合成机制,本文选取一株具有较高EPS产量的植物乳植杆菌YZH81开展其EPS合成基因簇(cps)的研究。经全基因组测序、比对和分析,结果确定了YZH81菌株基因组含有两个cps基因簇,其中一个cps基因簇(cps1)... 为了研究植物乳植杆菌胞外多糖(EPS)的合成机制,本文选取一株具有较高EPS产量的植物乳植杆菌YZH81开展其EPS合成基因簇(cps)的研究。经全基因组测序、比对和分析,结果确定了YZH81菌株基因组含有两个cps基因簇,其中一个cps基因簇(cps1)的结构与功能尚未鉴定,而另一个cps基因簇(cps2)与其他已报道的植物乳植杆菌同源性很高。本研究实验敲除了cps1基因簇,与野生型YZH81菌株相比,YZH81△cps1菌株的EPS产量降低了52.28%,自聚集能力加速,粘附性降低,且清除1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(1,1-diphenyl-2-picryl-hydrazyl radical,DPPH·)能力下降了32.42%。该结果说明YZH81菌株的cps1基因簇与EPS合成相关,也为进一步研究该菌株EPS生物合成机制建立有利条件。 展开更多
关键词 植物乳植杆菌 胞外多糖(EPS) 荚膜多糖簇(cps cluster) 粘附性 益生菌
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青藏高原藏原羚携带海氏肠球菌的特征研究 被引量:2
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作者 蒙家嘉 董魁 +2 位作者 周娟 杨晶 徐建国 《疾病监测》 CAS 2020年第3期231-236,共6页
目的研究青藏高原野生动物藏原羚携带的海氏肠球菌特征。方法分离细菌,采用16S rRNA、rpoA基因序列比对方法鉴定藏原羚携带的海氏肠球菌。采用K-B纸片法进行药敏试验;使用COGs、SwissProt、CARD和VFDB等数据库对基因组进行分析;采用MUM... 目的研究青藏高原野生动物藏原羚携带的海氏肠球菌特征。方法分离细菌,采用16S rRNA、rpoA基因序列比对方法鉴定藏原羚携带的海氏肠球菌。采用K-B纸片法进行药敏试验;使用COGs、SwissProt、CARD和VFDB等数据库对基因组进行分析;采用MUMmer和TreeBest软件构建单核苷酸多态性系统进化树图。结果从15份藏原羚粪便样品分离到2株海氏肠球菌。生化分析、16S rRNA和rpoA基因序列分析支持其为海氏肠球菌的鉴定。基因组分析发现其携带荚膜多糖基因簇。系统进化树分析提示2株藏原羚源海氏肠球菌分别属于不同的进化分支,且都与动物源性菌株进化关系更近。2株菌对多种常用抗生素敏感。结论青藏高原藏原羚携带的病原菌海氏肠球菌基因组中存在荚膜多糖基因簇,利于其抵抗不利环境因素,提示YL69可能具备在人群中传播的潜力。 展开更多
关键词 海氏肠球菌 藏原羚 荚膜多糖基因簇 耐药性 基因组分析
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