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Epidemiology of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii colonization in neonatal intensive care units:A systematic review and meta-analysis
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作者 Donatien Serge Mbaga Sebastien Kenmoe +12 位作者 Seraphine Nkie Esemu Arnol Bowo-Ngandji Nene Kaah Keneh Jane-Francis Tatah Kihla Akoachere Hortense Kamga Gonsu Roland Ndip Ndip Jean Thierry Ebogo-Belobo Cyprien Kengne-Ndé Nicholas Tendongfor Jean Paul Assam Assam Lucy Mande Ndip Jacky Njiki Bikoï Sara Honorine Riwom Essama 《World Journal of Meta-Analysis》 2024年第1期1-10,共10页
BACKGROUND The rising prevalence of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii(CRAB)in neonatal intensive care units(NICUs)represents an escalating challenge in healthcare settings,particularly in managing hospital-... BACKGROUND The rising prevalence of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii(CRAB)in neonatal intensive care units(NICUs)represents an escalating challenge in healthcare settings,particularly in managing hospital-acquired infections(HAIs).Studies across various World Health Organization regions have documented a significant incidence of CRAB-related HAIs,with rates as high as 41.7 cases per 1000 patients in ICUs,accounting for 13.6%of all HAIs.These infections pose a doubled mortality risk compared to infections with carbapenem-susceptible Acinetobacter baumannii.A particularly concerning aspect of CRAB colonization is its asymptomatic nature,enabling its transmission through healthcare workers(HCWs)or the NICU environment to vulnerable neonates with developing immune systems.AIM To explore the prevalence of CRAB colonization in NICUs,focusing on neonates,healthcare workers,and the environmental samples,to enhance epidemiological understanding and inform targeted interventions.METHODS We conducted according to PRISMA 2020 checklist guidelines,a comprehensive literature search across multiple databases including MEDLINE(Ovid),EMBASE(Ovid),Global Health(Ovid),Web of Science,and Global Index Me-dicus.Studies were selected based on predetermined criteria,primarily involving neonates,HCWs,and environmental swabs,using culture or molecular methods to detect CRAB colonization.We excluded studies that did not specifically focus on NICUs,were duplicates,or lacked necessary data.The study selection and quality assessment were conducted independently by two reviewers.Data extraction involved collecting comprehensive details about each study.Our statistical analysis used a random-effects model to calculate the pooled prevalence and confidence intervals,stratifying results by regional location.We assessed study heterogeneity using Cochran's Q statistic and I²statistic,with regression tests employed to evaluate potential publication bias.RESULTS We analyzed 737 records from five databases,ultimately including 13 studies from ten countries.For neonates,the pooled prevalence was 4.8%(95%CI:1.1%to 10.5%)with the highest rates observed in South-East Asia(10.5%;95%CI:2.4%to 23.3%).Among HCWs,a single Indian study reported a 3.3%prevalence.Environmental samples showed a prevalence of 2.3%(95%CI:0%to 9.3%),with the highest rates in South-East Asia(10%;95%CI:4.2%to 17.7%).Significant heterogeneity was found across studies,and no publication bias was detected.CONCLUSION This systematic review highlights a significant prevalence of CRAB colonization in neonates across various regions,particularly in South-East Asia,contrasting with lower rates in high-income countries.The study reveals a gap in research on HCWs colonization,with only a single study from India reporting moderate prevalence.Environmental samples indicate moderate levels of CRAB contamination,again higher in South-East Asia.These findings underscore the need for more extensive and focused research on CRAB colonization in NICUs,including exploring the roles of HCWs and the environment in transmission,understanding antimicrobial resistance patterns,and developing effective prevention measures. 展开更多
关键词 COLONIZATION carbapenem-resistant acinetobacter baumannii Neonatal intensive-care unit
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Bloodstream Infection with Carbapenem-resistant Klebsiella Pneumoniae and Multidrug-resistant Acinetobacter Baumannii:a Case Report 被引量:2
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作者 Hong-min Zhang Da-wei Liu +2 位作者 Xiao-ting Wang Yun Long Huan Chen 《Chinese Medical Sciences Journal》 CAS CSCD 2014年第1期51-54,共4页
IN the presence of septic shock, every hour in delaying the administration of effective antibiotics is associated with a measurable increase in mortality. This is especially true for neutropenic patients with septic s... IN the presence of septic shock, every hour in delaying the administration of effective antibiotics is associated with a measurable increase in mortality. This is especially true for neutropenic patients with septic shock. As there is a higher incidence of involving multi-drug resistant pathogens for neutropenic patients, the decision on antibiotics regime remains a challenge for physicians.2 Immunosuppression and previous antibacterial use are factors that promote the spread of multi-drug resistant pathogens, and the possibility of co-existing multi-drug resistant pathogens should be suspected when treating patients with these risk factors who developed refractory shock. Here we present a case with neutropenic fever and refractory shock whose blood culture yielded multi-drug resistant Acinetobacter baumannii and carbapenem- resistant Klebsiella pneumoniae. 展开更多
关键词 bloodstream infection neutropenic fever carbapenem-resistant Klebsiellapneumoniae acinetobacter baumannii
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Rapid and accurate detection of carbapenem-resistance gene by isothermal amplification in Acinetobacter baumannii 被引量:3
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作者 Shuang Liu Guangtao Huang +6 位作者 Yali Gong Xiaojun Jin Yudan Meng Yizhi Peng Junning Zhao Xiaolu Li Qin Li 《Burns & Trauma》 SCIE 2020年第1期136-147,共12页
Background:Acinetobacter baumannii(A.baumannii)is one of the pivotal pathogens responsible for nosocomial infections,especially in patients with low immune response,and infection with carbapenem-resistant A.baumannii ... Background:Acinetobacter baumannii(A.baumannii)is one of the pivotal pathogens responsible for nosocomial infections,especially in patients with low immune response,and infection with carbapenem-resistant A.baumannii has been increasing in recent years.Rapid and accurate detection of carbapenem-resistance genes in A.baumannii could be of immense help to clinical staff.Methods:In this study,a 15-μL reaction system for recombinase polymerase amplification(RPA)was developed and tested.We collected 30 clinical isolates of A.baumannii from the Burn Institute of Southwest Hospital of Third Military Medical University(Army Medical University)for 6 months and tested antibiotic susceptibility using the VITEK 2 system.A.baumannii was detected based on the blaOXA-51 gene by PCR,qPCR and 15μL-RPA,respectively.Sensitivity and specificity were evaluated.In addition,PCR and 15μL-RPA data for detecting the carbapenem-resistance gene blaOXA-23 were comparatively assessed.Results:The detection limit of the blaOXA-51 gene by 15μL RPA was 2.86 CFU/ml,with sensitivity comparable to PCR and qPCR.No positive amplification signals were detected in non-Acinetobacter isolates,indicating high specificity.However,only 18 minutes were needed for the 15μL RPA assay.Furthermore,an antibiotic susceptibility test showed that up to 90%of A.baumannii strains were resistant to meropenem and imipenem;15μL RPA data for detecting blaOXA-23 showed that only 10%(n=3)of A.baumannii isolates did not show positive amplification signals,and the other 90%of(n=27)isolates were positive,corroborating PCR results.Conclusion:We demonstrated that the new 15μL RPA assay for detecting blaOXA-23 in A.baumannii is faster and simpler than qPCR and PCR.It is a promising alternative molecular diagnostic tool for rapid and effective detection of A.baumannii and drug-resistance genes in the field and point-ofcare testing. 展开更多
关键词 acinetobacter baumannii Recombinase polymerase amplification Rapid detection carbapenem-resistance gene blaOXA-51 blaOXA-23
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耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌目标性监测 被引量:10
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作者 刘红梅 韩崇旭 +1 位作者 朱小平 韩东升 《中国感染控制杂志》 CAS 北大核心 2017年第7期593-595,共3页
目的了解耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)的临床分布和耐药特征。方法回顾性分析某院2015年1—12月所有住院患者送检标本CRAB检出情况,分析其药敏试验结果。结果 721株AB中检出CRAB231株,CRAB检出率为32.04%。1—4季度中每季度CRAB的检... 目的了解耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)的临床分布和耐药特征。方法回顾性分析某院2015年1—12月所有住院患者送检标本CRAB检出情况,分析其药敏试验结果。结果 721株AB中检出CRAB231株,CRAB检出率为32.04%。1—4季度中每季度CRAB的检出率分别为48.99%(73/149)、41.98%(68/162)、27.39%(63/230)、15.00%(27/180),呈下降趋势(P<0.001)。CRAB主要来源于痰标本(140株,60.61%),其次是创面分泌物(33株,14.28%)和尿标本(24株,10.39%)。CRAB主要来源科室为重症监护病房(101株,43.72%)、神经外科(37株,16.02%)及烧伤整形科(22株,9.52%)。CRAB对氨苄西林/舒巴坦、庆大霉素、左氧氟沙星、环丙沙星的耐药率为85.28%~90.48%,对妥布霉素的耐药率较低(19.48%),未发现对多粘菌素B耐药的菌株。结论 CRAB耐药性较为严重,应针对重点科室进行重点管理,采取科学防控举措,有效减少医院感染事件的发生。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌 crab 耐药性 监测
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替加环素单药及与5种抗菌药物联用对耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌的体外抑菌及生物膜清除作用研究 被引量:11
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作者 李佳慧 陈华乐 +4 位作者 张能华 周翠 张艺之 王冲 周铁丽 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2018年第2期121-126,共6页
目的评价替加环素单用及与其他5种临床常用抗菌药物分别联合使用,对耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(carbapenems-resistant Acinetobacter baumannii,CRAB)的体外抑菌及生物膜清除作用。方法微量肉汤稀释法测定替加环素、阿米卡星、美罗培南... 目的评价替加环素单用及与其他5种临床常用抗菌药物分别联合使用,对耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(carbapenems-resistant Acinetobacter baumannii,CRAB)的体外抑菌及生物膜清除作用。方法微量肉汤稀释法测定替加环素、阿米卡星、美罗培南、环丙沙星、黏菌素和舒巴坦对42株CRAB的最低抑菌浓度(minimal inhibititory concentration,MIC)和最低生物被膜清除浓度(minimal biofilm eradication concentration,MBEC)。棋盘稀释法测定替加环素分别联用阿米卡星、美罗培南、环丙沙星、黏菌素和舒巴坦对42株CRAB的MIC值和MBEC值,并计算分级抑菌浓度指数(fractional inhibitory concentration index,FICI)和分级生物膜清除浓度指数(fractional eradication concentration index,FECI)。结果替加环素与5种抗菌药物分别联用后,对CRAB的抑菌作用和生物被膜清除作用表现为协同或无关,均未发现拮抗现象。其中替加环素与阿米卡星联用后具有较高的协同抑菌率(47.6%,20/42),而替加环素与环丙沙星联用后则具有较高的生物膜协同清除率(30.9%,13/42)。结论与单药相比,替加环素与5种药物分别联用,对CRAB的体外抑菌及生物膜清除作用具有一定的增强效果。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌 替加环素 药物联用 微量肉汤稀释法 棋盘稀释法
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耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌耐药机制及分子流行病学研究 被引量:9
6
作者 杨秋 陆文婷 芮勇宇 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2015年第24期4129-4132,共4页
目的:阐明耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌(CRAB)主要耐药机制和分子流行病学特征。方法:PCR方法检测常见碳青霉烯酶基因,PCR-RELP分型及基因测序检测整合子Ⅰ和ISCR1,ERIC-PCR及聚类分析研究克隆相关性。结果:碳青霉烯酶基因NDM、IMP、VIM、OXA... 目的:阐明耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌(CRAB)主要耐药机制和分子流行病学特征。方法:PCR方法检测常见碳青霉烯酶基因,PCR-RELP分型及基因测序检测整合子Ⅰ和ISCR1,ERIC-PCR及聚类分析研究克隆相关性。结果:碳青霉烯酶基因NDM、IMP、VIM、OXA-23-like、OXA-24-like、OXA-51-like、OXA-58-like检出率分别为4.1%、22.9%、26.0%、67.7%、63.5%、46.8%、65.6%。整合子Ⅰ可变区分为12个耐药基因盒排列类型,A6和A12首次在鲍曼不动杆菌中发现;ISCR1可变区分为6个类型。将耐药机制、ERIC-PCR及聚类分析结合临床资料综合分析,CRAB感染患者均为散发,粪便中CRAB不是临床感染来源。结论:CRAB主要耐药机制是产碳青霉烯酶及整合子Ⅰ、ISCR1携带率高,ERIC-PCR基因分型结合耐药机制研究适用于分子流行病学调查。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌 碳青霉烯酶 整合子 ISCR ERIC-PCR
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耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌转座子基因检测及同源性分析 被引量:1
7
作者 豆清娅 邹明祥 +3 位作者 李军 胡咏梅 王海晨 沈辉 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期1007-1012,共6页
目的探讨耐碳青霉烯类药物鲍曼不动杆菌的转座子基因Tn2006、Tn2008分布及其同源性,为医院感染控制提供实验室依据。方法收集91株对碳青霉烯类药物耐药的非重复鲍曼不动杆菌,PCR检测转座子基因Tn2006和Tn2008,并对扩增产物进行测序及BL... 目的探讨耐碳青霉烯类药物鲍曼不动杆菌的转座子基因Tn2006、Tn2008分布及其同源性,为医院感染控制提供实验室依据。方法收集91株对碳青霉烯类药物耐药的非重复鲍曼不动杆菌,PCR检测转座子基因Tn2006和Tn2008,并对扩增产物进行测序及BLAST分析;采用重复序列引物聚合酶链反应(REP-PCR)分析CRAB同源性;采用多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)技术对23株CRAB进行同源性分析,利用Bio Numerics软件分析最小生成树。结果在检测的91株CRAB中,40株菌Tn2006基因阳性,Tn2008基因均为阴性;利用REP-PCR方法可将91株CRAB分为A、B、C、D、E、F和G 7个型别,菌株数分别为79株、4株、2株、2株、1株、2株和1株,A型又分为A1和A2两个亚型,分别为46株和33株,所有被检测医院均出现A型菌株;利用MLST分型方法可将23株CRAB分为8个序列型别(ST型),其中ST92型9株、ST195型5株、ST365型3株、ST138型2株、ST75型和ST381型各1株,发现2个新STs型,即STnl(1-15-3-2-2-56-3)和STn2(1-81-3-2-2-3-3)。结论本地区临床分离CRAB存在克隆流行,以A型为主,主要通过转座子Tn2006进行传播,ST92和ST195是本地区CRAB主要ST分型。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 crab 碳青霉烯类药物 同源性 转座子 Tn2006 Tn2008
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不同生物膜形成能力耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌的Bap基因分析 被引量:1
8
作者 方甜甜 任宝军 +4 位作者 宋沧桑 唐树荣 李兴德 杨焕芝 刘德华 《中国药物评价》 2022年第2期148-152,共5页
目的:对不同生物膜形成能力耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)的bap耐药基因进行分析。方法:本研究纳入某院2019年2月至2020年9月临床分离的36株CRAB,采用结晶紫半定量法测定CRAB的生物膜形成能力,采用PCR法检测其中10株菌株的bap耐药基... 目的:对不同生物膜形成能力耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)的bap耐药基因进行分析。方法:本研究纳入某院2019年2月至2020年9月临床分离的36株CRAB,采用结晶紫半定量法测定CRAB的生物膜形成能力,采用PCR法检测其中10株菌株的bap耐药基因。结果:10株临床分离的CRAB中,bapⅠ和bapⅣ的检出率均为100%,bapⅢ的检出率均为0%。bapⅡ的总检出率为70%,其中生物膜形成能力弱阳性组的bapⅡ检出率为60%,生物膜形成能力阳性组的bapⅡ检出率为80%。从耐药率看,10株细菌中,头孢唑啉、厄它培南、氨曲南和阿莫西林/棒酸的耐药率均为100%,替加环素的耐药率均为0%(均为敏感)。bapⅡ检出组的妥布霉素、头孢吡肟、头孢噻肟、头孢曲松、亚胺培南、美罗培南、头孢哌酮/舒巴坦、环丙沙星、左氧氟沙星、庆大霉素和哌拉西林/他唑巴坦的耐药率均高于bapⅡ未检出组。结论:CRAB的生物膜形成能力可能随着BAPⅡ检出率的增高而增强。CRAB的耐药性除与耐药基因有关,还可能与bap基因多态性有关。 展开更多
关键词 生物膜 耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(crab) Bap基因
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耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌耐药基因检测及同源性 被引量:14
9
作者 周鹏鹏 陈娜 +3 位作者 朱柯蕙 贾晨冉 张峰波 季萍 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期526-532,共7页
目的探讨某三甲医院耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)耐药基因携带情况及同源性。方法收集该院2017年10月—2018年10月共40株CRAB,采用聚合酶链式反应(PCR)检测耐药基因携带情况,同时应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析其同源性。结果40株CRA... 目的探讨某三甲医院耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)耐药基因携带情况及同源性。方法收集该院2017年10月—2018年10月共40株CRAB,采用聚合酶链式反应(PCR)检测耐药基因携带情况,同时应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析其同源性。结果40株CRAB对大部分抗菌药物耐药率在90%左右,对替加环素的耐药率相对较低,为2.9%(未包括中介)。耐药基因ADC检出率为100%,其他耐药基因检出率较高的依次为OXA-51(36株,90.0%)、qacE△1-sull(32株,80.0%),未检测出KPC基因。每株CRAB菌株检出2~8种耐药基因,以检出6种耐药基因的菌株最多(15株,37.5%);检出的耐药基因组合中,以同时检出ADC+OXA-23+OXA-51基因最多(29株,72.5%),其次为ADC+intl1+qacE△1-sull基因(26株,65.0%)、ADC+qacE△1-sull+ant(3″)-Ⅰ基因(19株,47.5%),11株(27.5%)同时检出ADC+ant(3″)-Ⅰ+aac(3)-Ⅰ基因。PFGE同源性检测分出19种不同型别,每种型别1~9株不等,其中A5型有9株,A18型有8株,主要来自重症监护病房。结论该院CRAB对临床常见抗菌药物呈高度耐药,OXA-23和OXA-51两种基因最有可能是引起该院鲍曼不动杆菌耐药的主要因素,同源性分析显示该院不同病区存在CRAB医院感染传播。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌 耐药基因 脉冲场凝胶电泳 同源性
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生物被膜态和游离态临床耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌转录组的差异分析
10
作者 刘巍巍 国果 +6 位作者 吴兆颖 毛成菊 李忠旬 贾利娜 尚小丽 彭建 吴建伟 《贵州医科大学学报》 CAS 2021年第11期1249-1257,共9页
目的了解临床分离的耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)生物被膜态和游离态的转录组差异,探究生物被膜形成的机制。方法从住院病人痰液或血液样本分离CRAB 4、55、78及117菌株,挑取单菌落分别培养生物被膜态菌(A组)和游离态菌(B组),采用Tri... 目的了解临床分离的耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)生物被膜态和游离态的转录组差异,探究生物被膜形成的机制。方法从住院病人痰液或血液样本分离CRAB 4、55、78及117菌株,挑取单菌落分别培养生物被膜态菌(A组)和游离态菌(B组),采用Trizol法提取2组细菌核糖核酸(RNA)样本进行转录组测序;使用DESeq软件进行差异表达基因(DEGs)分析,通过GOSeq R软件进行基因本体(GO)富集分析,通过KOBAS软件进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;选择8个DEGs,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证转录组测序分析结果。结果RNA样品完整无污染满足测序要求,测序数据错误率不超过0.03%;A与B组相比鉴定到407个差异基因,其中212条基因为上调表达,195条基因为下调表达,涉及铁的摄取和转运、菌毛合成的调控、生化代谢酶类及转录调节因子等;GO分析显示,GO条目主要富集于分子功能类别和生物过程类别;KEGG分析显示,DEGs富集到硫代谢、ATP结合盒(ABC)转运系统、万古霉素耐药、群体感应及阳离子抗菌肽耐药等多条通路;选取的8个差异基因通过qRT-PCR进行验证,结果与转录组结果趋势一致。结论临床分离的CRAB菌株,其生物被膜态和游离态存在基因表达差异,生物被膜的形成涉及多基因和多信号通路参与。 展开更多
关键词 细菌 耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌 生物被膜 游离菌 转录组 差异表达基因
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基于RNA-Seq技术分析不同生物被膜形成能力的临床耐药鲍曼不动杆菌基因表达差异
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作者 刘巍巍 国果 +6 位作者 吴兆颖 毛成菊 李忠旬 贾利娜 尚小丽 彭建 吴建伟 《贵州医科大学学报》 CAS 2021年第11期1241-1248,1270,共9页
目的了解不同生物被膜形成能力的临床分离耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌菌株(CRAB)基因表达的差异。方法选取8株临床分离CRAB,将生物被膜形成能力强的菌株4、55、78、117号作为强生物被膜(BF)组,将生物被膜形成能力弱的菌株13、177、191、19... 目的了解不同生物被膜形成能力的临床分离耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌菌株(CRAB)基因表达的差异。方法选取8株临床分离CRAB,将生物被膜形成能力强的菌株4、55、78、117号作为强生物被膜(BF)组,将生物被膜形成能力弱的菌株13、177、191、196号作为弱生物被膜(WBF)组,培养两组菌株形成生物被膜,分别提取RNA进行文库构建和转录组测序(RNA-Seq),以鲍曼不动杆菌AB030(NZ_CP009257.1)的基因组作为参考基因组对测序数据进行分析,鉴定差异表达基因(DEGs),并进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,选取8个DEGs利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证转录组测序结果。结果RNA样品完整无污染,测序数据错误率为0.03%;BF组与WBF组相比,鉴定到171个DEGs,其中106条基因为上调表达,65条基因为下调表达;这些基因主要涉及DNA结合、膜蛋白、菌毛调控、ATP的合成和分解等;GO分析显示较多基因被注释到生物过程部分,KEGG分析显示DEGs富集到多种物质代谢途径;选取的8个DEGs利用qRT-PCR进行验证,结果与转录组测序结果趋势一致。结论不同生物被膜形成能力的临床CRAB的基因表达存在差异,多基因和多条信号通路影响生物被膜的形成。 展开更多
关键词 细菌 耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌 生物被膜形成能力 菌毛 外膜蛋白 信号通路 差异表达基因
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耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌裂解性噬菌体PA103的生物学特性及全基因组分析
12
作者 张改 靳静 +6 位作者 陈松建 王书伟 李振江 刘肖 李亚辉 张欢欢 王山梅 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第10期1182-1188,1193,共8页
目的 探讨耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii,CRAB)噬菌体PA103的生物学特性及全基因组信息。方法 以CRAB临床菌株A103为宿主菌,采用双层平板法在市政污水中分离得到1株裂解性噬菌体PA103;通过双... 目的 探讨耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii,CRAB)噬菌体PA103的生物学特性及全基因组信息。方法 以CRAB临床菌株A103为宿主菌,采用双层平板法在市政污水中分离得到1株裂解性噬菌体PA103;通过双层平板法观察噬菌斑形态;通过透射电镜观察噬菌体形态特征;调查PA103的噬菌谱、一步生长曲线及对温度和酸碱的稳定性;应用蛋白酶K/SDS法提取噬菌体基因组DNA;对PA103进行基因组测序、拼装;用RAST在线预测软件对基因组中可能存在的开放读码框进行预测;用MEGA 11.0软件以末端酶大亚基构建进化树,用Mauve软件进行比较基因组学分析。结果 试验分离得到1株可以裂解CRAB的裂解性噬菌体,命名为PA103;它可以在宿主菌A103的菌苔上形成直径约2 mm完全透明的噬菌斑,周围环绕宽为3~4 mm的半透明晕环;透射电镜显示PA103属于有尾噬菌体,头部和尾部直径长度约64 nm和120 nm;一步生长曲线显示PA103的潜伏期约为40 min,爆发期约为15 min,爆发量约为17 PFU/cell;噬菌体PA103在50、60℃,pH 5.0~9.0的环境下,均能保持相对稳定的活性;PA103的基因组全长45 225 bp, G+C含量为37.82%,全基因组预测含86个开放阅读框,其中29个为功能蛋白,其余57个被注释为假定蛋白;共线性分析结果显示噬菌体PA103与噬菌体LZ35的局部共线性区域的数目、方向、排列顺序和长度非常相似;进化树构建结果显示噬菌体PA103应属于Obolenskviru属成员。结论 新型噬菌体PA103具有较强的鲍曼不动杆菌裂解能力,可为噬菌体防治耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌的感染提供参考。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌 噬菌体 生物学特性 基因组分析
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一株耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌噬菌体的分离鉴定和临床应用
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作者 刘自强 潘勇军 +7 位作者 谭新 杨永清 熊敏 周宁 侯洁薇 丁训梅 马迎飞 余加林 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期3035-3048,共14页
【背景】耐药菌感染是人类生命健康的重要威胁,寻找抗生素替代或辅助疗法迫在眉睫,噬菌体是细菌的天敌,有很大的开发潜力。【目的】分离针对耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii, CRAB)的烈性噬菌体... 【背景】耐药菌感染是人类生命健康的重要威胁,寻找抗生素替代或辅助疗法迫在眉睫,噬菌体是细菌的天敌,有很大的开发潜力。【目的】分离针对耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii, CRAB)的烈性噬菌体,治疗患者CRAB肺部感染,为噬菌体疗法的推广积累经验。【方法】用CRAB临床菌株NAB11B做宿主菌,从医院污水中分离新噬菌体,进行生物学特征和基因组特点的表征、分析后制备成高纯度的噬菌体制剂,通过雾化吸入的方式治疗肺部CRAB感染,评估噬菌体疗法的有效性和安全性。【结果】分离到一株新噬菌体,命名为AB_SZL4,其潜伏期短、增殖速度快、抑菌能力强、生物学稳定性高且不携带有害基因。在临床应用中,噬菌体鸡尾酒联合抗生素疗法能快速清除肺部病原菌,且未见明显噬菌体相关不良反应。【结论】AB_SZL4是一株有极大临床应用潜力的烈性噬菌体。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌 噬菌体 生物学特性 基因组学分析 噬菌体疗法
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经修饰CHROMagar不动杆菌显色培养联合MALDI-TOF-MS快速筛查肠道耐碳青霉烯鲍氏不动杆菌的研究 被引量:1
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作者 卫丽 乔甫 +3 位作者 林吉 黄文治 张晓霞 宗志勇 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第19期2893-2897,共5页
目的探讨初步建立经修饰的CHROMagar不动杆菌显色培养联合基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)的方法用于快速筛查肠道耐碳青霉烯鲍氏不动杆菌(CRAB)。方法采集2017年4-6月入住医院ICU的319名患者直肠拭子并接种至含4μg/m... 目的探讨初步建立经修饰的CHROMagar不动杆菌显色培养联合基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)的方法用于快速筛查肠道耐碳青霉烯鲍氏不动杆菌(CRAB)。方法采集2017年4-6月入住医院ICU的319名患者直肠拭子并接种至含4μg/ml美罗培南的CHROMagar不动杆菌显色培养基,MALDI-TOF-MS鉴定可疑菌株。快速筛查结果用recA基因测序分析及美罗培南MIC值进行验证。结果快速筛查到18.18%(58/319)的患者肠道携带CRAB。recA基因测序分析显示该58株菌全为鲍氏不动杆菌,且有57株对美罗培南耐药,符合率高达98.28%(57/58)。结论经修饰的CHROMagar不动杆菌显色培养联合MALDI-TOF-MS可快速筛查肠道耐碳青霉烯鲍氏不动杆菌,特异性高、稳定性好,对医院感染早期监测与积极防控具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 CHROMagar不动杆菌显色培养基 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 耐碳青霉烯鲍氏不动杆菌 直肠拭子 快速筛查
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1例肠道穿孔患者耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌治疗的药学监护 被引量:1
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作者 斯日古楞 乌丹 史录文 《世界临床药物》 2022年第2期183-188,共6页
目的探讨临床药师在肠道穿孔继发耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌所致血流感染抗感染治疗中的作用。方法临床药师参与1例耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌所致血流感染患者的抗感染治疗,协助医师制订早期经验性抗感染方案。根据患者病情变化及辅助检... 目的探讨临床药师在肠道穿孔继发耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌所致血流感染抗感染治疗中的作用。方法临床药师参与1例耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌所致血流感染患者的抗感染治疗,协助医师制订早期经验性抗感染方案。根据患者病情变化及辅助检查结果,临床药师先后建议停用比阿培南,给予头孢哌酮钠舒巴坦钠3.0 g q6h 静脉注射(intravenous injection,ivgtt)联合替加环素100.0 mg q12h ivgtt,后期加用多黏菌素B 50.0 mg q12h ivgtt抗感染治疗。结果医师采纳临床药师建议,经过24 d抗感染治疗及拔除腹腔引流管等侵袭性导管后,患者症状好转,血培养连续阴性,转入普通病房继续治疗。结论对于复杂重症感染,临床药师参与制订个体化的抗感染治疗方案,有利于促进抗菌药物的合理使用,提高治疗的有效率和成功率。 展开更多
关键词 肠道穿孔 耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌 血流感染 抗感染治疗
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庆阳地区耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌耐药基因检测及其同源性分析 被引量:3
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作者 侯娟娟 李娟 杨君 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2017年第12期1292-1296,共5页
目的对庆阳地区碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌进行耐药基因检测及其同源性分析。方法收集我院2015年3~12月分离的29株碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌,其中ICU病房18株、呼吸内科4株、骨科4株、神经外科3株,采用MIC法及K-B法进行药敏试验,PCR... 目的对庆阳地区碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌进行耐药基因检测及其同源性分析。方法收集我院2015年3~12月分离的29株碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌,其中ICU病房18株、呼吸内科4株、骨科4株、神经外科3株,采用MIC法及K-B法进行药敏试验,PCR方法检测菌株NDM-1、OXA-51、OXA-23、OXA-24及OXA-58基因的携带情况,脉冲场凝胶电泳(plused-field gel electrophoresis,PFGE)法对菌株进行分子分型,并通过非加权配对算术平均法(unweighted pair group average method,UPGMA)进行聚类,构建聚类树。结果 29株碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌中,复方新诺明和丁胺卡那耐药率为54%和62%,左氧氟沙星耐药率为10%,其他药物均为100%;OXA-51和OXA-23阳性菌株分别为27(93.1%)和26株(89.7%),未检出NDM-1金属酶、OXA-58和OXA-24型基因;共检出12个PFGE型别,分别命名为PT1~12型,最常见的PFGE型别为PT4型,共包含14株菌(48.3%),分别分离自4个病区,其中9株为ICU病房,2株为呼吸内科,2株为神经外科,1株为骨科。其次常见的为PT1和PT7型,分别包含4株和2株菌;其他9个型别分别仅对应1株菌。结论我院分离的碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌分子型别相对集中,提示存在不同病区之间的院内感染传播;OXA-51和OXA-23基因可能是鲍曼不动杆菌耐碳青霉烯类的主要原因;未检出NDM-1金属酶、OXA-58和OXA-24基因。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌 耐药基因 同源性
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