文摘目的利用生物信息学方法探究肝癌和糖尿病共有的基因特征和致病机制。方法在GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中下载肝癌数据集(GSE121248)和糖尿病数据集(GSE29221),通过R语言包进行差异分析,Venn图获取共有的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。对DEGs进行GO(gene ontology)和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析,Cytoscape软件获取PPI(protein protein interaction)网络中的关键模块和核心基因。在NetworkAnalyst数据库中进行基因、转录因子和mi-RNA的网络互作分析。DGIdb数据库用于基因与药物的互作分析。通过Kaplan-Meier Plotter数据库分析核心基因的预后价值。结果共筛选出39个DEGs,这些DEGs在细胞外基质、胰岛素样生长因子受体信号通路的正调控、肝素结合和P53通路等信号通路中显著富集。共筛选出6个核心基因(THBS1、DCN、BGN、COL14A1、LUM、PCOLC),其中2个核心基因(DCN、THBS1)可与相关肿瘤治疗药物互作,1个核心基因(DCN)与肝癌患者预后相关。结论DCN可能是治疗糖尿病并发肝癌的潜在药物靶点。
文摘目的:通过对原代培养的大鼠睾丸间质细胞进行邻苯二甲酸二乙基己酯(di-2-ethylhexyl phthalate,DEHP)染毒,探讨DEHP体外对大鼠睾丸间质细胞凋亡通路Caspase-3和Caspase-9表达以及细胞凋亡的影响。方法:体外分离和原代培养大鼠睾丸间质细胞,用不同浓度的DEHP(10、50、100 nmol/L)染毒24 h。荧光定量PCR法检测间质细胞Caspase-3和Caspase-9 mRNA表达,Western印迹检测间质细胞Caspase-3和Caspase-9蛋白表达,流式细胞术检测间质细胞凋亡率。结果:与对照组相比,DEHP各组睾丸间质细胞Caspase-3 mRNA(1.69±0.38 vs3.82±0.39、6.91±0.40、15.47±0.40)和蛋白(0.18±0.09 vs 0.32±0.10、0.61±0.08、0.89±0.09)表达显著增加(P均<0.05),Caspase-9 mRNA(2.24±0.41 vs 5.16±0.43、9.61±0.45、19.22±0.43)和蛋白(0.26±0.07 vs0.40±0.08、0.68±0.09、0.96±0.08)表达也显著增加(P均<0.05),细胞凋亡率(4.36±1.11 vs 7.52±1.09、12.72±1.10、24.59±1.11)也显著增加(P均<0.05),呈浓度依赖关系。结论:DEHP可通过激活细胞凋亡Caspase通路而诱导大鼠睾丸间质细胞凋亡,进而影响间质细胞功能。