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Subcloning and Sequencing of the Form II Ribulose 1,5-Bisphosphate Carboxylase/Oxygenase from Rhodopseudomonas palustris 被引量:1
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作者 杜翠红 《High Technology Letters》 EI CAS 2003年第3期54-59,共6页
Rhodopseudomonas palustris, one of purple nonsulfur photosynthetic bacteria, fixes carbon dioxide via Calvin-Benson cycle and has been shown previously to express form I and form II ribulose-1,5-bisphosphate carboxyla... Rhodopseudomonas palustris, one of purple nonsulfur photosynthetic bacteria, fixes carbon dioxide via Calvin-Benson cycle and has been shown previously to express form I and form II ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (RubisCO). The gene cbbM, which encodes the form II enzyme from Rhodopseudomonas palustris, has been subcloned and sequenced. The deduced amino acid sequence is highly with the form II RubisCO from photosynthetic bacteria, including Rhodospirillum rubrum (PDB ID: 9rub), but appears to be more distantly related to the large subunit of the form I RubisCO found in photosynthetic bacteria, chemoautotrophic bacteria and higher plants. Several regions highly conserved among L 8S 8 and L x enzymes correspond with regions previously implicated in catalytic activity and subunit interactions. 展开更多
关键词 红色假单胞菌 光合细菌 二氧化碳 cbbm基因 基因克隆 核酮糖-1 5-二磷酸羟化/加氧酶
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南海表层海水参与卡尔文循环的固碳基因多样性研究 被引量:6
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作者 季凤云 明红霞 +8 位作者 李洪波 昝帅君 王建宁 苏洁 郭立梅 常永凯 石岩 关春江 樊景凤 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期4037-4043,共7页
为揭示南海北部表层海水中参与卡尔文循环的固碳基因多样性及其与环境因子的关系,本研究以卡尔文循环中的关键酶核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubis CO)的Ⅰ、Ⅱ型基因(cbbL、cbbM)作为分子标记,采用Illumina Miseq高通量测序技术对... 为揭示南海北部表层海水中参与卡尔文循环的固碳基因多样性及其与环境因子的关系,本研究以卡尔文循环中的关键酶核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubis CO)的Ⅰ、Ⅱ型基因(cbbL、cbbM)作为分子标记,采用Illumina Miseq高通量测序技术对海水中的固碳基因多样性进行分析,并结合多元统计分析的方法,探讨了固碳基因多样性与环境因子的关系.结果显示,在南海北部表层海水中,含cbbL基因固碳基因主要归属于变形菌门(Proteobacteria)、蓝藻门(Cyanobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes),其中,优势亚群分别是γ-变形菌亚门(45.3%)、蓝细菌(30.9%)和β-变形杆菌亚门(23.8%);而含cbbM基因的固碳菌群未检测到;近岸的A9站位与其他站位物种组成有一定的差异,异着色菌属(Allochromatium)、硫杆菌属(Thiobacillus)和硫单胞菌属(Thiohalomonas)为其特有菌属.相关性和冗余分析(RDA)结果显示,含cbbL基因的固碳基因丰度与水温、盐度呈显著负相关(p<0.01),与硝酸盐、亚硝酸盐、硅酸盐呈显著正相关(p<0.01). 展开更多
关键词 珠江口 卡尔文循环 cbbL基因 cbbm基因 固碳基因多样性
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