为研究杆菌肽锌对断奶獭兔盲肠菌群和免疫功能的影响,本研究选用40只28日龄断奶獭兔,随机平均分为在基础日粮中添加杆菌肽锌(40 mg/kg)的实验组和不添任何抗生素的对照组。采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)和荧光定量PCR(...为研究杆菌肽锌对断奶獭兔盲肠菌群和免疫功能的影响,本研究选用40只28日龄断奶獭兔,随机平均分为在基础日粮中添加杆菌肽锌(40 mg/kg)的实验组和不添任何抗生素的对照组。采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)和荧光定量PCR(q PCR)方法对断奶獭兔盲肠菌群和TLR2、TLR4 m RNA表达水平进行检测,ELISA对外周血细胞因子进行测定。PCR-DGGE结果表明,与对照组比较,实验组盲肠菌群丰富度、多样性和均匀度等均无显著变化(p>0.05)。q PCR检测表明,实验组的梭菌类群XIVa显著降低(p<0.05)。在免疫功能调节方面,实验组外周血细胞因子IL-1、IL-2、IL-4、TNF-α的浓度显著升高(p<0.05);TLR2、TLR4 m RNA的相对表达量总体呈上调趋势。以上结果表明,杆菌肽锌作为断奶獭兔饲料添加剂,对盲肠菌群结构没有显著影响,但能够增强机体免疫力。展开更多
要获得高质量的测序结果,一个重要的前提是提供高质量的DNA样品。该研究旨在比较4种样本预处理方法和目前国内通用的3种试剂盒对于盲肠内容物基因组DNA提取的质量,并通过扩增子测序结果分析宁都黄鸡盲肠菌群组成及其多样性,为进一步探...要获得高质量的测序结果,一个重要的前提是提供高质量的DNA样品。该研究旨在比较4种样本预处理方法和目前国内通用的3种试剂盒对于盲肠内容物基因组DNA提取的质量,并通过扩增子测序结果分析宁都黄鸡盲肠菌群组成及其多样性,为进一步探索肠道微生物在宁都黄鸡生长中的作用,乃至未来禽微生态制剂的研发奠定基础。结果表明:QIAGEN、BioTeke或BIOMIGA公司试剂盒提取的基因组DNA用于扩增子测序,所得肠道微生物菌群Beta多样性分析结果无显著差异(P>0.05),而Shannon指数和Simpson指数组间差异显著(P<0.05),提示采用不同试剂盒可能对高通量测序分析结果产生影响。宁都黄鸡肠道微生物组成丰富,共检测到21个门、50个纲、80个目、134个科、268个属,相对丰度较高的菌群是拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、广古菌门(Euryarchaeota)和变形菌门(Proteobacteria),相对丰度较高的前3个属分别是甲烷杆菌属(Methanobrevibacter)、理研菌科RC9肠菌群(Rikenellaceae RC9 gut group)和拟杆菌属(Bacteroides)。宁都黄鸡盲肠菌群组成特征再次证明了宿主系统发生地位对肠道菌群结构起到的重要影响作用。展开更多
文摘为研究杆菌肽锌对断奶獭兔盲肠菌群和免疫功能的影响,本研究选用40只28日龄断奶獭兔,随机平均分为在基础日粮中添加杆菌肽锌(40 mg/kg)的实验组和不添任何抗生素的对照组。采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)和荧光定量PCR(q PCR)方法对断奶獭兔盲肠菌群和TLR2、TLR4 m RNA表达水平进行检测,ELISA对外周血细胞因子进行测定。PCR-DGGE结果表明,与对照组比较,实验组盲肠菌群丰富度、多样性和均匀度等均无显著变化(p>0.05)。q PCR检测表明,实验组的梭菌类群XIVa显著降低(p<0.05)。在免疫功能调节方面,实验组外周血细胞因子IL-1、IL-2、IL-4、TNF-α的浓度显著升高(p<0.05);TLR2、TLR4 m RNA的相对表达量总体呈上调趋势。以上结果表明,杆菌肽锌作为断奶獭兔饲料添加剂,对盲肠菌群结构没有显著影响,但能够增强机体免疫力。
文摘要获得高质量的测序结果,一个重要的前提是提供高质量的DNA样品。该研究旨在比较4种样本预处理方法和目前国内通用的3种试剂盒对于盲肠内容物基因组DNA提取的质量,并通过扩增子测序结果分析宁都黄鸡盲肠菌群组成及其多样性,为进一步探索肠道微生物在宁都黄鸡生长中的作用,乃至未来禽微生态制剂的研发奠定基础。结果表明:QIAGEN、BioTeke或BIOMIGA公司试剂盒提取的基因组DNA用于扩增子测序,所得肠道微生物菌群Beta多样性分析结果无显著差异(P>0.05),而Shannon指数和Simpson指数组间差异显著(P<0.05),提示采用不同试剂盒可能对高通量测序分析结果产生影响。宁都黄鸡肠道微生物组成丰富,共检测到21个门、50个纲、80个目、134个科、268个属,相对丰度较高的菌群是拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、广古菌门(Euryarchaeota)和变形菌门(Proteobacteria),相对丰度较高的前3个属分别是甲烷杆菌属(Methanobrevibacter)、理研菌科RC9肠菌群(Rikenellaceae RC9 gut group)和拟杆菌属(Bacteroides)。宁都黄鸡盲肠菌群组成特征再次证明了宿主系统发生地位对肠道菌群结构起到的重要影响作用。