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Channel assignment and power allocation for throughput improvement with PPO in B5G heterogeneous edge networks
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作者 Xiaoming He Yingchi Mao +3 位作者 Yinqiu Liu Ping Ping Yan Hong Han Hu 《Digital Communications and Networks》 SCIE CSCD 2024年第1期109-116,共8页
In Beyond the Fifth Generation(B5G)heterogeneous edge networks,numerous users are multiplexed on a channel or served on the same frequency resource block,in which case the transmitter applies coding and the receiver u... In Beyond the Fifth Generation(B5G)heterogeneous edge networks,numerous users are multiplexed on a channel or served on the same frequency resource block,in which case the transmitter applies coding and the receiver uses interference cancellation.Unfortunately,uncoordinated radio resource allocation can reduce system throughput and lead to user inequity,for this reason,in this paper,channel allocation and power allocation problems are formulated to maximize the system sum rate and minimum user achievable rate.Since the construction model is non-convex and the response variables are high-dimensional,a distributed Deep Reinforcement Learning(DRL)framework called distributed Proximal Policy Optimization(PPO)is proposed to allocate or assign resources.Specifically,several simulated agents are trained in a heterogeneous environment to find robust behaviors that perform well in channel assignment and power allocation.Moreover,agents in the collection stage slow down,which hinders the learning of other agents.Therefore,a preemption strategy is further proposed in this paper to optimize the distributed PPO,form DP-PPO and successfully mitigate the straggler problem.The experimental results show that our mechanism named DP-PPO improves the performance over other DRL methods. 展开更多
关键词 B5G Heterogeneous edge networks PPO Channel assignment Power allocation throughput
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Improving throughput in SWIPT-based wireless multirelay networks with relay selection and rateless codes
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作者 Gaofei Huang Qihong Zhong +2 位作者 Hui Zheng Sai Zhao Dong Tang 《Digital Communications and Networks》 SCIE CSCD 2024年第4期1131-1144,共14页
This paper studies a dual-hop Simultaneous Wireless Information and Power Transfer(SWIPT)-based multi-relay network with a direct link.To achieve high throughput in the network,a novel protocol is first developed,in w... This paper studies a dual-hop Simultaneous Wireless Information and Power Transfer(SWIPT)-based multi-relay network with a direct link.To achieve high throughput in the network,a novel protocol is first developed,in which the network can switch between a direct transmission mode and a Single-Relay-Selection-based Cooperative Transmission(SRS-CT)mode that employs dynamic decode-and-forward relaying accomplished with Rateless Codes(RCs).Then,under this protocol,an optimization problem is formulated to jointly optimize the network operation mode and the resource allocation in the SRS-CT mode.The formulated problem is difficult to solve because not only does the noncausal Channel State Information(CSI)cause the problem to be stochastic,but also the energy state evolution at each relay is complicated by network operation mode decision and resource allocation.Assuming that noncausal CSI is available,the stochastic optimization issue is first to be addressed by solving an involved deterministic optimization problem via dynamic programming,where the complicated energy state evolution issue is addressed by a layered optimization method.Then,based on a finite-state Markov channel model and assuming that CSI statistical properties are known,the stochastic optimization problem is solved by extending the result derived for the noncausal CSI case to the causal CSI case.Finally,a myopic strategy is proposed to achieve a tradeoff between complexity and performance without the knowledge of CSI statistical properties.The simulation results verify that our proposed SRS-and-RC-based design can achieve a maximum of approximately 40%throughput gain over a simple SRS-and-RC-based baseline scheme in SWIPT-based multi-relay networks. 展开更多
关键词 Simultaneous wireless information and power TRANSFER Energy harvesting Relay networks throughput maximization
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鸭绿江口海域浮游植物粒级结构的环境差异响应
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作者 宋广军 宋伦 +3 位作者 吴金浩 王召会 胡超魁 刘桂英 《环境科学研究》 北大核心 2025年第1期78-89,共12页
海洋浮游植物面临着与气候及环境变化相关的新挑战,种种迹象表明,海水营养盐浓度下降和失衡,以及海水升温、酸化会导致海洋浮游植物粒级结构趋向小型化,但在自然海域这一趋势缺乏直接的验证与深入研究。本文在黄海北部的鸭绿江口设置了1... 海洋浮游植物面临着与气候及环境变化相关的新挑战,种种迹象表明,海水营养盐浓度下降和失衡,以及海水升温、酸化会导致海洋浮游植物粒级结构趋向小型化,但在自然海域这一趋势缺乏直接的验证与深入研究。本文在黄海北部的鸭绿江口设置了16个采样点,2020年3−12月期间,每月采集一次样品(包括浮游植物环境DNA样品和海水样品),对鸭绿江口海域浮游植物粒级结构和环境指标〔包括氮、磷、硅营养盐,水温、溶解氧(DO)、pH以及化学需氧量(COD)等〕进行了系统分析,利用非度量多维尺度分析(NMDS),筛选出各环境因子不同浓度梯度站位,结合高通量测序和实验室镜检手段对浮游植物粒级分级和定量,以验证鸭绿江口海域浮游植物粒级结构的环境差异响应。结果表明:鸭绿江口海域含氮营养盐平均浓度呈现出东西两侧河口区域较高、中部海域相对较低的分布特征,磷、硅营养盐的分布趋势与氮营养盐基本一致。同时,pH和DO浓度在西侧河口区域相对较低,而COD浓度在该区域相对较高。水温在3−12月期间呈倒U型变化趋势,7月达到最高值。验证结果表明,海水中氮、磷、硅营养盐浓度与小粒级浮游植物生物量均呈负相关,即营养盐浓度越低,小粒级浮游植物生物量占比越高。同时,水温的上升也促进了小粒级浮游植物的生长,使其生物量占比增加。此外,发现小粒级浮游植物对有机物的利用效率高于大粒级浮游植物,且对低氧环境具有一定的耐受性。这表现为小粒级浮游植物生物量占比随着COD浓度的升高而升高,随DO浓度的升高而下降。研究显示,近岸海域氮、磷、硅营养盐浓度下降以及水温上升、缺氧加剧,均可导致浮游植物粒级结构趋于小型化,这可能会对生态系统的稳定和海水贝类养殖业的可持续发展构成潜在威胁。因此在全球气候变化的背景下,建议对河口区域陆源氮、磷等营养盐的调控政策进行实时调整,以利于海洋生态系统的健康和海洋经济可持续发展。 展开更多
关键词 浮游植物 高通量测序 粒级结构 环境差异 鸭绿江口海域
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基于高通量测序的青花菜KASP标记开发与应用
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作者 张振超 陶美奇 +4 位作者 潘永飞 孙国胜 王传友 安林海 戴忠良 《核农学报》 北大核心 2025年第3期513-521,I0003-I0005,共12页
为提高青花菜分子标记辅助育种水平,本研究基于高通量测序数据开发了70组KASP标记,并采用KASP检测平台对43份青花菜试验材料进行分型,根据分型结果筛选出分型效果好、多态性高的标记,用于指纹图谱构建、遗传关系确定和纯度鉴定。结果表... 为提高青花菜分子标记辅助育种水平,本研究基于高通量测序数据开发了70组KASP标记,并采用KASP检测平台对43份青花菜试验材料进行分型,根据分型结果筛选出分型效果好、多态性高的标记,用于指纹图谱构建、遗传关系确定和纯度鉴定。结果表明,70组KASP标记中,未分型成功有3个,未分型材料>5份有13个,多态性差的有6个,分型成功48个(成功率68.6%)。48个标记中,多态性信息含量(PIC)值≥0.30的标记有37个(占比77.08%),其中PIC值为0.37的标记数量最多,为11个,0.38的标记有3个。将48个标记的分型结果转化为二元编码数据,获得了43份青花菜育种材料的SNP-DNA指纹图谱。聚类分析结果发现,Br05与其他材料的遗传关系较远;Br12和Br19、Br33和Br34之间遗传系数均为100,Br14和Br32的遗传系数为99,表明两两间为同一株系的可能性大,这与在田间的表型观察结果基本一致。10组标记对30株Br19的一致性进行鉴定,发现纯度值区间为83.3%~96.7%,说明Br19株系间存在差异;采用10组标记对亲本Br19、Br35和杂交种F1(Br19×Br35)进行基因分型,结果有5个标记(SNP07、SNP09、SNP10、SNP11和SNP19)在三者间的分型结果不同,可用于杂交制种田F1(Br19×Br35)种子纯度鉴定。本研究结果对青花菜种质资源鉴定、分子标记辅助育种与新品种保护具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 高通量测序 竞争性等位基因特异性PCR 指纹图谱 纯度鉴定 分子标记
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福建养殖皱纹盘鲍线粒体基因组全测序及分析
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作者 王伟 《水产科学》 北大核心 2025年第1期100-107,共8页
为有效鉴别鲍的种类,探讨其来源,通过高通量测序获得福建养殖皱纹盘鲍线粒体基因组全序列,分析比较其序列与GenBank中收录的3个皱纹盘鲍线粒体基因组全序列或近全序列。试验结果显示,皱纹盘鲍线粒体基因组全长17037 bp,具有37个编码基因... 为有效鉴别鲍的种类,探讨其来源,通过高通量测序获得福建养殖皱纹盘鲍线粒体基因组全序列,分析比较其序列与GenBank中收录的3个皱纹盘鲍线粒体基因组全序列或近全序列。试验结果显示,皱纹盘鲍线粒体基因组全长17037 bp,具有37个编码基因,包括13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因。除控制区存在碱基差异外,当前4个皱纹盘鲍线粒体全序列基本一致。基于鲍属线粒体基因组全序列构建系统发育树,4个皱纹盘鲍聚为一支,再与红鲍、黑鲍及黑足鲍聚为一支,其中福建养殖皱纹盘鲍连江群体与韩国巨济群体关系较近。笔者分析了不同皱纹盘鲍群体间的线粒体碱基组成和鲍属贝类系统进化关系,试验结果丰富了皱纹盘鲍遗传信息库,可为东南沿海鲍种的鉴定和良种选育提供参考。 展开更多
关键词 皱纹盘鲍 线粒体基因组 系统发育 高通量测序
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磁场增强型高通量辉光放电溅射源的设计与研究
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作者 沈懿璇 万真真 +4 位作者 余兴 王海舟 王永清 朱一妃 刘少锋 《光谱学与光谱分析》 北大核心 2025年第2期410-419,共10页
高通量表征技术在金属材料分析领域具有重要应用价值,它能够实现对金属材料进行跨尺度的全域分析,评价材料表面宏观特性、微观不均匀性及局部缺陷。辉光放电溅射可沿样品表面的纵深方向,以大尺寸、平坦且快速的方式逐层剥蚀样品,再将暴... 高通量表征技术在金属材料分析领域具有重要应用价值,它能够实现对金属材料进行跨尺度的全域分析,评价材料表面宏观特性、微观不均匀性及局部缺陷。辉光放电溅射可沿样品表面的纵深方向,以大尺寸、平坦且快速的方式逐层剥蚀样品,再将暴露出真实显微组织的样品送至多种分析仪器中进行成分、性能、组织结构的分析,从而作为金属材料的高通量表征样品前处理环节的关键设备。在传统Grimm型辉光溅射源的基础上,本研究搭建了一种专为高通量实验设计的辉光放电溅射系统,该系统将辉光溅射尺度由mm级扩展至cm级,同时实验发现了大尺寸溅射会导致辉光放电强度及溅射速率降低这一现象。针对这一现象,结合通过COMSOL Multiphysics仿真计算的辉光放电电子运动轨迹、电子密度以及化学反应速率等结果,该研究提出了一种通过施加扫描磁场来增强辉光放电光谱(GD-OES)强度以及溅射速率的方法。实验选用T2紫铜样品来探究扫描磁场的增强效果,结果表明,应用扫描磁场增强装置可获得更强的光谱信号强度及更快的溅射速率。在保持放电电压和电流不变的前提下,Mo、Cu元素的光谱强度分别增至无磁场时的1.43~11.97倍和1.13~26.50倍。其中,Mo元素光谱强度最大值可达53421 Cts,Cu元素光谱强度最大值可达76948 Cts,分别是无磁场时的6.86倍、4.32倍。此外,该方法可以显著地提高溅射速率,当阳极筒孔径为?15 mm时,T2紫铜样品的溅射速率提高了4.35倍,最高可达2662.09 nm·min^(-1)。使用白光干涉仪和金相显微镜对溅射坑表面的平整度和显微组织图像进行了采集,结果显示磁场引入对溅射坑表面粗糙度未产生显著影响,同时能清晰地呈现样品的真实显微组织特征。综上,实验结果证实,应用扫描磁场增强装置可在确保溅射平整度不受影响的前提下,实现光谱信号强度和溅射速率的提升,为解决大尺寸溅射引起的低溅射速率问题提供了新方法。 展开更多
关键词 高通量实验 磁场 光谱增强 辉光放电光谱 溅射
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辣椒胞质雄性不育恢复基因CAPS标记的PARMS转换及其应用
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作者 陈金金 赵威 +4 位作者 徐小万 衡周 王恒明 吴智明 徐晓美 《核农学报》 CAS 北大核心 2025年第2期255-261,共7页
Co1Mod1-CAPS是一个可广泛应用于筛选辣椒胞质雄性不育恢复源的CAPS分子标记。为了将其转化为可高通量检测的分子标记以提高选择效率,本研究以Co1Mod1-CAPS标记扩增10份不同类型的辣椒三系材料,分析其扩增产物在不育系、保持系和恢复系... Co1Mod1-CAPS是一个可广泛应用于筛选辣椒胞质雄性不育恢复源的CAPS分子标记。为了将其转化为可高通量检测的分子标记以提高选择效率,本研究以Co1Mod1-CAPS标记扩增10份不同类型的辣椒三系材料,分析其扩增产物在不育系、保持系和恢复系材料间的序列差异,从而基于序列差异将其转化为PARMS高通量检测标记并对321份辣椒种质材料进行恢复源筛选。结果表明,在Co1Mod1-CAPS标记扩增产物第601个碱基处存在一个T→C碱基的变异,即不育系和保持系材料在该处的碱基均为T,而恢复系材料在该处的碱基为C,后基于该碱基变异成功将Co1Mod1-CAPS转化为高通量标记Co1Mod1-PARMS,并在321份种质材料中筛选出146份资源携带纯合恢复基因RfRf,其中小果形且辣味重的辣椒类型携带RfRf基因型的个体占比高,指形椒的占比最高,为59.5%,樱桃椒占比次之,为56.5%,甜椒类型辣椒(灯笼椒)携带RfRf基因型的个体占比最低,为8.3%。该研究结果与前人研究较为一致,表明该标记有效。因此,Co1Mod1-PARMS高通量检测标记可应用于辣椒胞质雄性不育恢复系的分子标记辅助选育,从而促使胞质雄性不育恢复系选育效率的提升。 展开更多
关键词 辣椒 胞质雄性不育 恢复系 高通量 分子标记辅助选育
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高通量测序技术在骨关节结核诊疗中的研究进展
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作者 徐子安 浦飞飞 +1 位作者 冯晶 夏平 《中国防痨杂志》 北大核心 2025年第2期224-230,共7页
骨关节结核约占肺外结核的10%,传统的诊断方法如分枝杆菌培养和免疫学检测存在敏感度低、误诊率和漏诊率高等问题。GeneXpert MTB/RIF在骨关节结核的诊断中具有重要作用,但存在无法检测其他病原菌、肺外结核检测敏感度有限等不足。高通... 骨关节结核约占肺外结核的10%,传统的诊断方法如分枝杆菌培养和免疫学检测存在敏感度低、误诊率和漏诊率高等问题。GeneXpert MTB/RIF在骨关节结核的诊断中具有重要作用,但存在无法检测其他病原菌、肺外结核检测敏感度有限等不足。高通量测序技术不仅提供了快速和精确的病原体检测方法,还在骨关节结核治疗指导和耐药性检测方面显示出巨大的潜力。作者就高通量测序技术在骨关节结核中的应用进行综述,以期为该疾病的诊断和治疗提供参考。 展开更多
关键词 结核 骨关节 高通量测序技术 药物耐受性
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Analysis of throughput and stability for ACK-ALOHA-CDMA channel
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作者 邵建华 殷奎喜 赵华 《Journal of Southeast University(English Edition)》 EI CAS 2009年第2期156-160,共5页
A new acknowledgment-type slotted-ALOHA code division multiple access (ACK-ALOHA-CDMA) channel which can be used in the inbound channels of very small aperture terminal(VSAT) networks is proposed in order to simpl... A new acknowledgment-type slotted-ALOHA code division multiple access (ACK-ALOHA-CDMA) channel which can be used in the inbound channels of very small aperture terminal(VSAT) networks is proposed in order to simplify the synchronization equipment of networks in the slotted-ALOHA- CDMA systems. By dividing all VSAT stations into M subsystems and sending out periodic inquiry signals from the Hub station to the VSAT station, the channel model is established. By the means of deriving multi-access interference(MAI) and packet detecting probability, steady-state throughput is calculated. By applying diffusion process theory to the analysis of the stability of the ACK-ALOHA-CDMA channel, the drift parameter a(r), the diffusion parameter b(r) and the steady transition probability density p (r) are investigated. Simulation results indicate that significant performance improvement and high-bandwidth efficiency can be gained and one or two steady equilibrium points can be obtained by using this channel. Consequently, the ACK- ALOHA-CDMA channel is very suitable for cutting down on the expense of satellite VSAT systems and distributed packet radio networks. 展开更多
关键词 throughput STABILITY ACK-ALOHA-CDMA
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基于PacBio测序解析浓香型白酒酒醅发酵过程中细菌群落及其代谢特性变化
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作者 刘瑶 田新惠 +5 位作者 马超 王思思 唐玉明 冯军 刘成元 刘茂柯 《中国酿造》 北大核心 2025年第1期80-84,共5页
利用16S r RNA基因全长测序技术PacBio解析浓香型白酒酒醅发酵过程中细菌群落结构及其代谢特性变化,并对细菌菌群与挥发性风味物质间的相关性进行分析。结果表明,根据细菌群落多样性的变化,浓香型白酒酿造过程可分为变化期(0~14 d)和稳... 利用16S r RNA基因全长测序技术PacBio解析浓香型白酒酒醅发酵过程中细菌群落结构及其代谢特性变化,并对细菌菌群与挥发性风味物质间的相关性进行分析。结果表明,根据细菌群落多样性的变化,浓香型白酒酿造过程可分为变化期(0~14 d)和稳定期(14~80 d)。在种水平上注释到12种优势细菌(相对丰度≥1.00%),其中,金山醋酸乳杆菌(Acetilactobacillus jinshanensis)从酿造14 d开始相对丰度>90%。白酒酿造过程中的微生物与挥发性风味物质之间具有一定的相关性,其中,与未命名的罗尔斯通氏菌(Ralstonia sp.)、丝状菌(Thiothrix eikelboomii)相关的物质数量较多,2,4-二叔丁基苯酚和戊酸乙酯几乎与所有优势细菌种存在显著相关性(P<0.05)。功能预测结果表明,与白酒酿造相关的代谢通路中甘氨酸的生物合成和代谢、脂质代谢、核苷酸代谢的相对丰度在发酵过程中提高,但氨基酸代谢、其他次生代谢产物生物合成、辅因子和维生素代谢的相对丰度呈下降趋势。 展开更多
关键词 酒醅 浓香型白酒 高通量测序 群落结构
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基于超高通量筛选的D-阿洛酮糖3-差向异构酶定向进化
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作者 赵添龙 刘展志 +2 位作者 张凤山 吴敬 宿玲恰 《食品与发酵工业》 北大核心 2025年第2期105-109,共5页
D-阿洛酮糖是一种低热量的甜味剂,具有多种生理功能,如维持血糖平衡和调节脂质代谢等。目前,D-阿洛酮糖工业生产主要通过D-阿洛酮糖3-差向异构酶(D-allulose-3-epimerase,DAEase)催化D-果糖的差向异构反应实现,但DAEase的应用性能仍需... D-阿洛酮糖是一种低热量的甜味剂,具有多种生理功能,如维持血糖平衡和调节脂质代谢等。目前,D-阿洛酮糖工业生产主要通过D-阿洛酮糖3-差向异构酶(D-allulose-3-epimerase,DAEase)催化D-果糖的差向异构反应实现,但DAEase的应用性能仍需进一步提升以满足日益增长的市场需求。定向进化作为一种有效的分子改造策略,其筛选方法是限制效率的关键因素之一。通过构建并优化D-阿洛酮糖特异型生物传感器,结合微孔板筛选,对来自Clostridium cellulolyticum H10的DAEase(Cc DAEase)突变体文库进行超高通量筛选,最终获得了比活提高14.6%的优势突变体H209Q,其最适温度为60℃,最适pH值为7.5,并进一步解析了该突变体的构效关系。该研究证明了转录因子型生物传感器可以作为一种有效的定向进化筛选工具,为进一步优化DAEase的性能提供了可能性,亦为D-阿洛酮糖的工业制备提供了理论依据和技术支撑。 展开更多
关键词 D-阿洛酮糖3-差向异构酶 转录因子型生物传感器 超高通量筛选
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基于形态学和高通量测序的春季南澳海域浮游植物群落特征及其与环境因子关系
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作者 周志希 唐汇娟 +2 位作者 柯志新 刘甲星 周伟华 《热带海洋学报》 北大核心 2025年第1期53-65,共13页
利用形态学鉴定和高通量测序技术,对2022年5月南澳海域浮游植物群落结构进行了研究,探讨其空间分布与环境因子的关系,并对两种不同方法得出的结果进行了比较和讨论。根据环境因子聚类分析,调查海域可分为近岸区域和远岸区域。通过形态... 利用形态学鉴定和高通量测序技术,对2022年5月南澳海域浮游植物群落结构进行了研究,探讨其空间分布与环境因子的关系,并对两种不同方法得出的结果进行了比较和讨论。根据环境因子聚类分析,调查海域可分为近岸区域和远岸区域。通过形态学方法鉴定浮游植物5门8纲27目39科52属10^(5)种,高通量测序鉴定出6门32纲97目155科272属543种,其中硅藻门(Bacillariophyta)和甲藻门(Dinophyta)为优势类群,分别平均占形态学鉴定结果的74.54%和24.78%以及高通量测序结果的17.52%和67.84%。形态学鉴定结果显示浮游植物丰度变化范围为0.11×10^(5)~6.85×10^(5)cells·L^(-1),与叶绿素a浓度分布显著相关,浮游植物多样性指数低于高通量测序方法。两种方法得到优势种均为7种,其中形态学鉴定结果中绝对优势种为扁面角毛藻(Chaetoceros compressus),高通量测序鉴定结果中绝对优势种为球形异帽藻(Heterocapsa rotundata)。相关性分析结果表明,春季影响南澳浮游植物群落结构的主要环境因子是pH、盐度和溶解态无机磷。利用形态学鉴定与高通量测序技术相结合的方法,可以更全面、更准确地描述浮游植物群落结构及多样性。 展开更多
关键词 南澳 浮游植物 群落结构 高通量测序 环境因子
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Throughput scheduling in cognitive radio networks based on immune optimization
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作者 柴争义 郑宝林 +1 位作者 沈连丰 朱思峰 《Journal of Southeast University(English Edition)》 EI CAS 2015年第4期431-436,共6页
To study the throughput scheduling problem under interference temperature in cognitive radio networks, an immune algorithm-based suboptimal method was proposed based on its NP-hard feature. The problem is modeled as a... To study the throughput scheduling problem under interference temperature in cognitive radio networks, an immune algorithm-based suboptimal method was proposed based on its NP-hard feature. The problem is modeled as a constrained optimization problem to maximize the total throughput of the secondary users( SUs). The mapping between the throughput scheduling problems and the immune algorithm is given. Suitable immune operators are designed such as binary antibody encoding, antibody initialization based on pre-knowledge, a proportional clone to its affinity and an adaptive mutation operator associated with the evolutionary generation. The simulation results showthat the proposed algorithm can obtain about 95% of the optimal throughput and operate with much lower liner computational complexity. 展开更多
关键词 cognitive radio networks throughput scheduling immune algorithm interference temperature
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机器学习辅助的烃类分子性质预测与燃料的高通量筛选
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作者 侯放 齐晓宁 +4 位作者 刘睿宸 李玲 王莅 张香文 李国柱 《含能材料》 北大核心 2025年第1期1-12,共12页
通过数据收集、结构优化和量化计算,建立了碳数从1到50的2899个烃类分子“结构-多种性质”数据集,性质包含熔点(T_(m))、沸点(T_(b))、密度(ρ)、0 K下的内能(U_(0))、298.15 K下的内能(U)、298.15 K下的焓(H)、298.15 K下的吉布斯自由... 通过数据收集、结构优化和量化计算,建立了碳数从1到50的2899个烃类分子“结构-多种性质”数据集,性质包含熔点(T_(m))、沸点(T_(b))、密度(ρ)、0 K下的内能(U_(0))、298.15 K下的内能(U)、298.15 K下的焓(H)、298.15 K下的吉布斯自由能(G)。以表示分子结构的库伦矩阵作为模型输入,建立了决策树回归模型、交叉验证的最小绝对收缩和选择算子回归模型、交叉验证的岭回归模型、极限梯度提升回归模型4种不同的机器学习模型。通过比较不同模型预测性质的精度得出,极限梯度提升回归模型更适用于预测烃类分子的熔点、沸点、密度等通过实验测得的性质,交叉验证的岭回归模型更适用于预测烃类分子的内能、焓、吉布斯自由能等能量的通过理论计算得到的性质。同时,最优的机器学习组合模型可以准确预测相同碳数、不同种类和同分异构体烃类分子的性质。使用最优的机器学习模型计算了34种已通过实验合成的高密度碳氢燃料的密度,计算值与实验值的平均绝对误差为0.0290 g·cm^(-3)。进而,预测了开源数据库GDB-13C中的319,893个烃类分子的燃料性质,并高通量筛选出了37种低凝固点、高密度的新型碳氢燃料候选分子。采用基团贡献法和DFT方法进一步计算了筛选出的碳氢分子的关键燃料性质,这些新型分子与典型燃料JP-10和QC的质量热值和比冲相当。 展开更多
关键词 机器学习 烃类分子 高密度碳氢燃料 性质预测 高通量筛选
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氧化苦参碱对牙周膜干细胞干性标志物表达和成骨分化的作用
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作者 罗晶 雍敏 +8 位作者 陈琦 杨长怡 赵恬 马静 梅冬兰 虎金鹏 杨昭君 王钰然 刘博 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第19期3992-3999,共8页
背景:人牙周膜干细胞是牙周再生组织工程潜在的功能细胞,然而长期体外培养会导致牙周膜干细胞干性减低并发生复制性衰老,从而影响其治疗效果。目的:探讨氧化苦参碱在体外对牙周膜干细胞干性维持和骨向分化的影响,并寻找潜在的影响机制... 背景:人牙周膜干细胞是牙周再生组织工程潜在的功能细胞,然而长期体外培养会导致牙周膜干细胞干性减低并发生复制性衰老,从而影响其治疗效果。目的:探讨氧化苦参碱在体外对牙周膜干细胞干性维持和骨向分化的影响,并寻找潜在的影响机制。方法:采用组织块酶消化法从人牙周膜组织中分离、培养得到牙周膜干细胞,并使用流式细胞仪进行间充质细胞表面标志物鉴定。用0,2.5,5,10μg/mL氧化苦参碱孵育牙周膜干细胞,通过CCK8实验检测氧化苦参碱对牙周膜干细胞增殖活性的影响,筛选后续实验合适的药物质量浓度,采用Western blot检测牙周膜干细胞中干细胞非特异性蛋白SOX2和OCT4的表达,采用qRT-PCR、Western blot检测牙周膜干细胞中成骨相关基因和蛋白表达水平。结果与结论:①CCK8实验结果显示2.5μg/mL氧化苦参碱对牙周膜干细胞增殖活性有显著增强作用,后续实验选用2.5μg/mL氧化苦参碱进行干预;②与空白对照组相比,氧化苦参碱组牙周膜干细胞的干性标志物SOX2蛋白表达水平变化不明显(P>0.05),OCT4蛋白表达明显上调(P<0.05);③与成骨诱导组相比,氧化苦参碱+成骨诱导组牙周膜干细胞成骨相关基因ALP、RUNX2 mRNA表达及成骨相关蛋白ALP蛋白表达明显下调(P<0.05);④氧化苦参碱上调牙周膜干细胞干性标志物表达,抑制牙周膜干细胞骨向分化,高通量测序结果表明可能与WNT2、WNT16、COMP、BMP6有关。 展开更多
关键词 牙周膜干细胞 苦参碱类生物碱 成骨 细胞增殖 氧化苦参碱 干性维持 高通量测序
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谷氨酸棒杆菌3-磷酸甘油酸脱氢酶的定向进化改造研究
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作者 黄新燕 孙慕娇 +7 位作者 杜穆花 潘越 张心语 张瑶函 徐宁 刘君 鞠建松 魏亮 《食品与发酵工业》 北大核心 2025年第3期89-96,共8页
3-磷酸甘油酸脱氢酶(3-phosphoglycerate dehydrogenase,PGDH)是L-丝氨酸生物合成途径的限速酶,是影响L-丝氨酸高效合成的关键。该研究以来源于谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)的PGDH为研究对象,通过对其酶学性质进行测试分... 3-磷酸甘油酸脱氢酶(3-phosphoglycerate dehydrogenase,PGDH)是L-丝氨酸生物合成途径的限速酶,是影响L-丝氨酸高效合成的关键。该研究以来源于谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)的PGDH为研究对象,通过对其酶学性质进行测试分析发现,Cg-PGDH的酶活性仅为1.98 U/mg,而且热稳定性较差,严重制约了L-丝氨酸的高效生物合成。针对这一关键问题,该研究采用定向进化和高通量筛选的方法对Cg-PGDH进行改造,提高酶的催化活性和热稳定性。通过多轮筛选,最终获得了5个催化活性显著提升的突变体,P85Q、D365Y、A389T、A183V、I231V。其中,突变体P85Q的酶活性提升了1.55倍,并显著提高了酶的温度稳定性,最适催化温度达到60℃。随后该研究对P85Q、D365Y、A389T、A183V、I231V等5个突变体的突变位点进行组合突变,获得了温度稳定性进一步提高的突变体P85Q-D365Y。通过对Cg-PGDH突变位点的三维结构解析和分子动力学模拟实验发现,尽管突变体P85Q与D365Y的突变位点不位于Cg-PGDH催化活性中心,但是可通过蛋白结构形变增强Cg-PGDH活性中心130~140区间loop的稳定性,从而增加了酶的底物亲和性和催化活性。相关研究成果为进一步解析PGDH催化机制,提高PGDH催化活性提供了重要的研究基础和方向。 展开更多
关键词 谷氨酸棒杆菌 3-磷酸甘油酸脱氢酶 定向进化 高通量筛选 温度稳定性 分子动力学模拟
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石油污染胁迫下碱蓬根际土壤微生物群落的响应变化
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作者 李奎民 袁园利 +1 位作者 李梦龙 张旭旺 《环境科学学报》 北大核心 2025年第1期355-363,共9页
碱蓬是典型的盐碱先锋植物,在滨海湿地污染修复中具有重要的应用潜力.为探究石油污染胁迫对碱蓬及其根际土壤微生物群落的影响,设置低(L)-中(M)-高(H)石油污染负荷的实验组,以不添加石油的实验组作为对照(BC),采用扩增子高通量测序对土... 碱蓬是典型的盐碱先锋植物,在滨海湿地污染修复中具有重要的应用潜力.为探究石油污染胁迫对碱蓬及其根际土壤微生物群落的影响,设置低(L)-中(M)-高(H)石油污染负荷的实验组,以不添加石油的实验组作为对照(BC),采用扩增子高通量测序对土壤微生物群落进行解析.结果表明,石油污染会显著抑制碱蓬的生长,其根际土壤pH与总磷含量受石油浓度影响最为显著.石油污染会促进土壤中胞外多糖的分泌,但是对胞外蛋白及土壤酶活无显著影响.石油污染会降低土壤微生物群落的多样性,促使群落结构发生改变.各处理组中优势菌门均为变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidota)、放线菌门(Actinobacteriota)和厚壁菌门(Firmicutes),优势菌属为海杆菌属(Marinobacter)、噬甲基菌属(Methylophaga)、食烷菌属(Alcanivorax)、假单胞菌属(Pseudomonas)和康氏菌属(Kangiella),且优势菌属的相对丰度在石油污染胁迫下均有显著增加.此外,石油污染胁迫会显著影响碱蓬根际土壤中石油降解相关基因的丰度.本研究表明石油污染胁迫会改变碱蓬根际土壤的理化性质与微生物群落结构,研究结果可为理解石油污染对滨海湿地生态系统的影响提供科学依据. 展开更多
关键词 碱蓬 石油污染 高通量测序 微生物群落
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染色体外环状DNA在疾病及畜禽表型中的调控作用研究进展
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作者 仲翠微 陈亚玲 +1 位作者 王健 李辉 《中国畜牧杂志》 北大核心 2025年第1期106-114,共9页
染色体外环状DNA(Extrachromosomal Circular DNA,eccDNA)是一种在真核细胞中普遍存在的独立于染色体外的双链环状DNA分子,它在基因表达调控、编码功能性蛋白质或RNA中发挥关键作用,并参与免疫炎症反应、促进肿瘤发生等多种生理和病理过... 染色体外环状DNA(Extrachromosomal Circular DNA,eccDNA)是一种在真核细胞中普遍存在的独立于染色体外的双链环状DNA分子,它在基因表达调控、编码功能性蛋白质或RNA中发挥关键作用,并参与免疫炎症反应、促进肿瘤发生等多种生理和病理过程,因此eccDNA的研究日益受到关注。为鉴定和研究eccDNA的特性,科学家们开发了一系列研究工具,并基于测序数据构建了eccDNA综合性数据库,但eccDNA的来源、发生机制、生物学功能及如何准确鉴定等尚不明确。目前,在牛、家鸽等畜禽中已鉴定出eccDNA,但其在畜禽领域的研究仍处于起步阶段。本文总结了eccDNA分类、生物学功能以及主要研究方法等方面的研究进展,以期为其后续在医学及畜牧领域研究提供参考。 展开更多
关键词 染色体外环状DNA 机体生理调控 生物标志物 高通量测序
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基于材料基因组的电池材料研究
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作者 赵倩 任玉荣 《常州大学学报(自然科学版)》 2025年第1期1-14,共14页
材料基因组计划(MGI)的核心理念是通过计算、实验和数据“三位一体”的方式,变革传统的“试错法”材料研发模式,加速材料从发现到应用的全过程。近年来,国内外研究人员在基于材料基因组的电池材料研发方面开展了一系列工作。文章主要围... 材料基因组计划(MGI)的核心理念是通过计算、实验和数据“三位一体”的方式,变革传统的“试错法”材料研发模式,加速材料从发现到应用的全过程。近年来,国内外研究人员在基于材料基因组的电池材料研发方面开展了一系列工作。文章主要围绕材料基因组技术,分别介绍了高通量计算、高通量实验和材料数据库三大要素的主要内容及其在电池材料领域的典型研究范例,指出借助材料基因组技术,可以并行的方式研究成分、结构、温度、合成方法等的变化对电池材料能量密度、循环性能、安全性等的影响,总结了该研究领域亟待解决的问题并展望了未来发展方向。 展开更多
关键词 材料基因组 电池材料 高通量计算 高通量实验 材料数据库
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面向6G沉浸式通信的信道编码
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作者 张华滋 王俊 童文 《移动通信》 2025年第2期2-10,共9页
6G预期会承载虚拟现实(VR)、生成式人工智能(GenAI)等需要大数据量、沉浸式体验的业务。作为一个全球统一的移动通信标准,6G将会有超过十年的商用周期,期间会出现一些目前还没有问世的新兴应用,将对极致连接有更高的需求。根据ITU的建议... 6G预期会承载虚拟现实(VR)、生成式人工智能(GenAI)等需要大数据量、沉浸式体验的业务。作为一个全球统一的移动通信标准,6G将会有超过十年的商用周期,期间会出现一些目前还没有问世的新兴应用,将对极致连接有更高的需求。根据ITU的建议,6G峰值数据速率需要在5G信道编码的基础上至少有10到20倍的提升,这就需要在6G提出新的编译码方案,或基于现有编码方案进行演进。为此,探讨了沉浸式通信对信道编译码的需求,阐述了对于未来峰值速率场景,需要进一步降低译码复杂度,降低功耗。然后,基于现有Polar码和LDPC码方案给出了比较,揭示Polar码在低复杂度区间具有更优的纠错性能。进一步提出了增强的高吞吐Polar编译码方案,并对它们的译码效率进行了理论分析。 展开更多
关键词 6G 沉浸式通信 信道编码 高吞吐 Polar码
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