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基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建多癌种癌症风险预测模型
1
作者
胡玉莲
齐健
+4 位作者
王姝洁
洪波
孙晓君
王宏志
聂金福
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2023年第4期597-603,共7页
目的 探究H4聚簇组蛋白6(H4C6)甲基化水平和循环游离DNA(cfDNA)浓度在正常组与肿瘤组之间的差异;基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建癌症风险预测模型并评估模型的预测性能。方法 使用磁珠法提取血液样本中的cfDNA;使用Qubit 4.0荧光定...
目的 探究H4聚簇组蛋白6(H4C6)甲基化水平和循环游离DNA(cfDNA)浓度在正常组与肿瘤组之间的差异;基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建癌症风险预测模型并评估模型的预测性能。方法 使用磁珠法提取血液样本中的cfDNA;使用Qubit 4.0荧光定量仪检测cfDNA浓度;利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测cfDNA的H4C6甲基化水平;使用Logistic回归算法构建H4C6甲基化水平联合cfDNA浓度的癌症风险预测模型;使用受试者工作特征(ROC)曲线和校准曲线评估模型的准确性;使用决策曲线分析(DCA)评估模型的临床效益。结果 联合H4C6甲基化水平与cfDNA浓度构建的模型区分肺癌、肝癌、结直肠癌、胃癌、泛癌与健康组的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.769、0.988、0.934、0.922、0.830;校准曲线的平均绝对误差小于0.05;DCA曲线的净收益大于0。结论 基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建的癌症风险预测模型有较好的预测性能,有助于给临床前决策提供合理且有效的建议,最终可能给患者提供有针对性的、个性化的癌症检测与诊断方案。
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关键词
H4C6甲基化水平
cfdna浓度
癌症风险预测
下载PDF
职称材料
可手术的非小细胞肺癌患者外周静脉血cfDNA总浓度及长片段DNA浓度的临床价值研究
被引量:
2
2
作者
贾殿军
王利军
+3 位作者
程险峰
刘毅
代俊利
宋冀
《医学信息》
2019年第4期91-93,98,共4页
目的探讨定量检测可手术的非小细胞肺癌患者外周血cfDNA总浓度及长片段DNA浓度的临床价值。方法选择2017年1月~12月承德市中心医院胸外科60例可手术的非小细胞肺癌患者为实验组,分别于手术前1 d、手术后7 d、手术后20 d采集外周静脉血...
目的探讨定量检测可手术的非小细胞肺癌患者外周血cfDNA总浓度及长片段DNA浓度的临床价值。方法选择2017年1月~12月承德市中心医院胸外科60例可手术的非小细胞肺癌患者为实验组,分别于手术前1 d、手术后7 d、手术后20 d采集外周静脉血液标本,同期于承德市中心医院体检中心选择60例健康体检者为对照组,采集外周静脉血液标本,定量检测两组标本血液中cfDNA总浓度及长片段DNA浓度,进行统计学分析。结果实验组患者手术前1 d外周静脉血中cfDNA总浓度较对照组升高,差异具有统计学意义(P<0.05);实验组患者术后7 d外周静脉血中cfDNA总浓度较术前1 d无明显变化,差异无统计学意义(P>0.05);实验组患者术后20 d外周静脉血中cfDNA总浓度较术前1 d、术后7 d降低,差异均有统计学意义(P<0.05)。实验组患者手术前1 d外周静脉血中长片段DNA浓度高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05);实验组患者术后7 d外周静脉血中长片段DNA浓度较术前1 d无明显变化,差异无统计学意义(P>0.05);实验组患者术后20 d外周静脉血中长片段DNA浓度较术前1 d、术后7 d降低,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论外周静脉血cfDNA总浓度及长片段DNA浓度可间接反映非小细胞肺癌患者肿瘤负荷状况,有望成为非小细胞肺癌辅助诊断、疗效评估及预后判断的参考指标。
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关键词
非小细胞肺癌
外周血
cfdna
总
浓度
长片段DNA
浓度
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职称材料
题名
基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建多癌种癌症风险预测模型
1
作者
胡玉莲
齐健
王姝洁
洪波
孙晓君
王宏志
聂金福
机构
中国科学技术大学生命科学学院
中国科学院广州生物医药与健康研究院
中国科学院合肥物质科学研究院健康与医学技术研究所
中国科学院合肥肿瘤医院检验科
出处
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2023年第4期597-603,共7页
基金
国家自然科学基金(编号:81872438)
中国科学院合肥物质科学研究院院长基金青年“火花”项目(编号:YZJJ2022QN43)。
文摘
目的 探究H4聚簇组蛋白6(H4C6)甲基化水平和循环游离DNA(cfDNA)浓度在正常组与肿瘤组之间的差异;基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建癌症风险预测模型并评估模型的预测性能。方法 使用磁珠法提取血液样本中的cfDNA;使用Qubit 4.0荧光定量仪检测cfDNA浓度;利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测cfDNA的H4C6甲基化水平;使用Logistic回归算法构建H4C6甲基化水平联合cfDNA浓度的癌症风险预测模型;使用受试者工作特征(ROC)曲线和校准曲线评估模型的准确性;使用决策曲线分析(DCA)评估模型的临床效益。结果 联合H4C6甲基化水平与cfDNA浓度构建的模型区分肺癌、肝癌、结直肠癌、胃癌、泛癌与健康组的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.769、0.988、0.934、0.922、0.830;校准曲线的平均绝对误差小于0.05;DCA曲线的净收益大于0。结论 基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建的癌症风险预测模型有较好的预测性能,有助于给临床前决策提供合理且有效的建议,最终可能给患者提供有针对性的、个性化的癌症检测与诊断方案。
关键词
H4C6甲基化水平
cfdna浓度
癌症风险预测
Keywords
H4C6 methylation level
cfdna
concentration
cancer risk prediction
分类号
R730.43 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
可手术的非小细胞肺癌患者外周静脉血cfDNA总浓度及长片段DNA浓度的临床价值研究
被引量:
2
2
作者
贾殿军
王利军
程险峰
刘毅
代俊利
宋冀
机构
承德医学院
北京起因科技有限公司
承德市中心医院放化疗中心
出处
《医学信息》
2019年第4期91-93,98,共4页
文摘
目的探讨定量检测可手术的非小细胞肺癌患者外周血cfDNA总浓度及长片段DNA浓度的临床价值。方法选择2017年1月~12月承德市中心医院胸外科60例可手术的非小细胞肺癌患者为实验组,分别于手术前1 d、手术后7 d、手术后20 d采集外周静脉血液标本,同期于承德市中心医院体检中心选择60例健康体检者为对照组,采集外周静脉血液标本,定量检测两组标本血液中cfDNA总浓度及长片段DNA浓度,进行统计学分析。结果实验组患者手术前1 d外周静脉血中cfDNA总浓度较对照组升高,差异具有统计学意义(P<0.05);实验组患者术后7 d外周静脉血中cfDNA总浓度较术前1 d无明显变化,差异无统计学意义(P>0.05);实验组患者术后20 d外周静脉血中cfDNA总浓度较术前1 d、术后7 d降低,差异均有统计学意义(P<0.05)。实验组患者手术前1 d外周静脉血中长片段DNA浓度高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05);实验组患者术后7 d外周静脉血中长片段DNA浓度较术前1 d无明显变化,差异无统计学意义(P>0.05);实验组患者术后20 d外周静脉血中长片段DNA浓度较术前1 d、术后7 d降低,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论外周静脉血cfDNA总浓度及长片段DNA浓度可间接反映非小细胞肺癌患者肿瘤负荷状况,有望成为非小细胞肺癌辅助诊断、疗效评估及预后判断的参考指标。
关键词
非小细胞肺癌
外周血
cfdna
总
浓度
长片段DNA
浓度
Keywords
Non-small cell lung cancer
Total concentration of peripheral blood
cfdna
Long fragment DNA concentration
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建多癌种癌症风险预测模型
胡玉莲
齐健
王姝洁
洪波
孙晓君
王宏志
聂金福
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
可手术的非小细胞肺癌患者外周静脉血cfDNA总浓度及长片段DNA浓度的临床价值研究
贾殿军
王利军
程险峰
刘毅
代俊利
宋冀
《医学信息》
2019
2
下载PDF
职称材料
已选择
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