鸡源鲍氏志贺菌hn03株的分子鉴定与演化分析

以鸡源鲍氏志贺菌为研究对象,根据GenBank中收录的相应序列针对8个看家基因thrB/thrC、trpC/tr-pB、purM/purN、mdh/argR设计相应引物,分别扩增出8个目的基因,然后克隆到pMD18-T vector,进一步测定序列,并将序列测定结果登陆GenBank。利用BLAST和ClustalX程序分析测序结果,构建了8个看家基因在染色体上4个区域的相应遗传进化树。由构建的系统进化树可知:志贺菌分为3个主要分支,且均落在大肠杆菌中,本研究中的分离菌株鸡源鲍氏志贺菌在染色体上4个区域的进化树中分布位置一致,均落在志贺菌3个主要分支中的第一分支;从整个基因水平上看,鸡源鲍氏志贺分离株应起源于人源志贺菌。

RAPD技术在志贺菌及沙门菌鉴别中的应用

以鸡鲍氏志贺菌、鸡白痢沙门菌和痢疾志贺菌为研究对象,分别提取基因组DNA,利用6条随机引物以随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对其基因组DNA进行了分析.结果表明,4条随机引物能较好地在这3种菌中检测到多态性分子标记.共扩增出了59个DNA片段,其中3个菌株共有的谱带有7条,而显示多态性的片段有52条,占88.1%.引物P6的扩增图谱可用于3株细菌的鉴别.在对3株细菌扩增中发现,鸡鲍氏志贺菌与人痢疾志贺菌的扩增条带相同率达67%,但各有自己的特征性谱带.鸡沙门菌与志贺菌的扩增谱带相差甚远.

鸡源鲍氏志贺菌的RAPD分析

【目的】确定鸡源鲍氏志贺菌的进化地位。【方法】选用6条随机引物（P1～P6）,采用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术,对1株鸡源鲍氏志贺菌、2株鸡白痢沙门菌、2株鸡肠致病性大肠杆菌和2株痢疾志贺菌共7株菌的基因组DNA进行分析,同时对个别特殊序列进行克隆测序,并在此基础上分析了鸡源鲍氏志贺菌与其他15个相关菌株的进化关系。【结果】6条随机引物中有4条引物（P1,P2,P4和P6）能较好地在志贺菌、鸡白痢沙门氏菌和鸡致病性大肠杆菌3种菌中检测到多态性分子标记;这4条有效引物共扩增出了64个DNA片段,其中7个菌株共有的谱带有3条,多态性片段有61条,多态率达95.3%。引物P2可根据扩增图谱将志贺菌和大肠杆菌与沙门菌鉴别出来;用引物P6对上述7株细菌进行扩增,发现同种菌株间谱带特别相似,其中鸡鲍氏志贺菌与人痢疾志贺菌扩增条带的相同率达66.7%,与鸡肠致病性大肠杆菌扩增条带的相同率达44.4%,而鸡白痢沙门菌与志贺菌的扩增谱带相差甚远,可用于3种细菌的鉴别。对扩增片段进行的测序及进化分析结果显示,鸡源鲍氏志贺菌与人源志贺菌的进化距离最近。【结论】鸡源鲍氏志贺菌可能是人源志贺菌的一个变异株或新的亚种。

鸡鲍氏志贺菌与痢疾志贺菌鸡白痢沙门菌及肠致病性大肠杆菌RAPD鉴别方法的建立

利用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术对鸡鲍氏志贺菌、鸡白痢沙门菌、肠致病性大肠杆菌和痢疾志贺菌的基因组DNA进行了研究，在此基础上分析了鸡鲍氏志贺菌与其他6个菌株的亲缘关系。结果显示，有4条随机引物的扩增多态性良好，共扩增出了64个DNA片段，其中4种菌共有的谱带有3条，而显示多态性的片段有61条，占95．3％。引物P2的扩增图谱不能将志贺菌和大肠杆菌鉴别开，但可将这2种菌与沙门菌鉴别出来；引物P6的扩增图谱清晰且3种菌间有明显差异，可用于上述3种细菌的鉴别。不同细菌间的遗传距离为0．128～0．790，根据遗传距离可将鸡鲍氏志贺菌等7个菌株分为3个聚类群，鸡鲍氏志贺菌分离株位于人痢疾志贺菌类群中，可能是人志贺菌的一个新的亚种。

包被LPS抗原检测鸡源鲍氏志贺氏菌抗体的间接ELISA方法的建立

以鸡源鲍氏志贺氏菌菌体提取的脂多糖(LPS)成分作为检测抗原,以辣根过氧化物酶标记的兔抗鸡IgG抗体为第二抗体,以TMB为显色剂,成功建立了检测鸡源鲍氏志贺氏菌抗体的间接ELISA方法.通过对间接ELISA反应条件的一系列研究,确定了各种最适工作条件:鸡源鲍氏志贺氏菌LPS抗原最适包被质量浓度为5mg·L-1,最适包被条件为4℃过夜;待检血清的最佳稀释度为1∶160,与包被抗原在37℃作用1 h;酶标二抗的最适工作浓度为1∶2 000,血清与酶标二抗的反应条件为37℃1 h;最适封闭条件为37℃作用1 h;底物最适反应条件为室温避光20 min;阴阳性临界值为0.385.经特异性试验、敏感性试验和重复性试验,表明建立的间接ELISA方法具有特异性强、敏感性高、重复性好等特点.