期刊文献+
共找到21篇文章
< 1 2 >
每页显示 20 50 100
Inheritance of Chloroplast and Mitochondrial DNA in Chinese Fir (Cunninghamia lanceolata) 被引量:8
1
作者 奇文清 杨慧君 +1 位作者 薛勇彪 胡适宜 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1999年第7期695-699,共5页
The inheritance of mitochondrial (mt) DNA and chloroplast (cp) DNA was investigated in intergeneric hybrids from crossing between Cunninghamia lanceolata (Lamb.) Hook. and Cryptomeria fortunei Hooibrenk. The c... The inheritance of mitochondrial (mt) DNA and chloroplast (cp) DNA was investigated in intergeneric hybrids from crossing between Cunninghamia lanceolata (Lamb.) Hook. and Cryptomeria fortunei Hooibrenk. The chloroplast trnL trnF region and one intra genic segment of the mitochondrial gene, Cox Ⅲ, were amplified from those of the parents and hybrids by PCR using gene specific primers. Cp and mtDNA polymorphisms of the amplified regions were detected between the parents after restriction digestions. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis revealed that all the F 1 individuals possessed Cox Ⅲ restriction fragment patterns (characteristic of the paternal parent Cryptomeria fortunei ) and the trnL trnF region (identical to the maternal parent Cunninghamia lanceolata ) showing that a different mode of inheritance for organelle DNA has occurred in the hybrids. Furthermore, the maternal inheritance of chloroplast DNA is reported here for the first time in coniferophyta. 展开更多
关键词 Cunninghamia lanceolata Cryptomeria fortunei Inheritance of chloroplast DNA Inheritance of mitochondrial DNA Restriction fragment length polymorphism
下载PDF
Establishment of a Gene Expression System in Rice Chloroplast and Obtainment of PPT-Resistant Rice Plants 被引量:3
2
作者 LI Yi-nü SUN Bing-yao +3 位作者 SU Ning MENG Xiang-xun ZHANG Zhi-fang SHEN Gui-fang 《Agricultural Sciences in China》 CSCD 2009年第6期643-651,共9页
In contrast to the situation of random integration of foreign genes in nuclear transformation, the introduction of genes via chloroplast genetic engineering is characterized by site-specific pattern via homologous rec... In contrast to the situation of random integration of foreign genes in nuclear transformation, the introduction of genes via chloroplast genetic engineering is characterized by site-specific pattern via homologous recombination. To establish an expression system for alien genes in rice chloroplast, the intergenic region of ndhF and trnL was selected as target for sitespecific integration of PPT-resistant bar gene in this study. Two DNA fragments suitable for homologous recombination were cloned from rice chloroplast genome DNA using PCR technique, and the chloroplast-specific expression vector pRB was constructed by fusing a modified 16S rRNA gene promoter to bar gene together with terminator ofpsbA gene 3 sequence. Chloroplast transformation was carried out by biolistic bombardment of sterile rice calli with the pRB construct. Subsequently, the regenerated plantlets and seeds of progeny arising from reciprocal cross to the wild-type lines were obtained. Molecular analysis suggested that the bar gene has been integrated into rice chloroplast genome. Genetic analysis revealed that bar gene could be transmitted and expressed normally in chloroplast genome. Thus, the bar gene conferred not only selection pressure for the transformation of rice chloroplast genome, but PPT-resistant trait for rice plants as well. It is suggested that an efficient gene expression system in the rice chloroplast has been established by chloroplast transformation technique. 展开更多
关键词 Oryza sativa L. chloroplast transformation bar gene homologous fragments
下载PDF
Phylogenetic Relationships in the Genus <i>Spiraea</i>(Rosaceae) Inferred from the Chloroplast DNA Region, <i>trn</i>L-<i>trn</i>F 被引量:1
3
作者 Man Kyu Huh 《American Journal of Plant Sciences》 2012年第5期559-566,共8页
The 26 taxa of genus Spiraea (Rosaceae) in 14 Korean taxa and four taxa of them doubled in the world itself were collected and investigated phylogenetic relationships within these taxa using the chloroplast trnL-trnF ... The 26 taxa of genus Spiraea (Rosaceae) in 14 Korean taxa and four taxa of them doubled in the world itself were collected and investigated phylogenetic relationships within these taxa using the chloroplast trnL-trnF region. Sequence variation within the genus Spiraea was mostly due to insertion/deletion. Total alignment sequence of trnL-trnF region in genus Spiraea was 1004 positions, of which 126 were parsimony-informative, 149 variable, 23 singleton, and 847 constant characters. The base furtherance did not show a significant difference among total taxa. Although many taxa of genus Spiraea were well separated each other, many branches were not congruent with the taxon positions with botanical names. In addition, sequences of the chloroplast trnL-trnF region for same species are different from each other according to authors. The taxonomic identification of genus Spiraea are in need of revision. 展开更多
关键词 GENUS SPIRAEA chloroplast trnl-trnf Phylogenetic Relationships
下载PDF
除草剂抗性基因bar导入烟草叶绿体 被引量:17
4
作者 张中林 山松 +3 位作者 陈曦 刘春英 钱凯先 沈桂芳 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第5期574-578,共5页
将编码Phosphinothricin acetyltransferase的bar基因与水稻叶绿体psbA基因的启动子和终止子构建成表达盒,连同烟草叶绿体基因组同源片段rpl2-trnH-psbA和trnK-ORF509A以及选择标记基因aadA一起构建成烟草叶绿体转化载体pTZBA.基因枪法... 将编码Phosphinothricin acetyltransferase的bar基因与水稻叶绿体psbA基因的启动子和终止子构建成表达盒,连同烟草叶绿体基因组同源片段rpl2-trnH-psbA和trnK-ORF509A以及选择标记基因aadA一起构建成烟草叶绿体转化载体pTZBA.基因枪法转化烟草叶片,经壮观霉素筛选获得转化再生植株.分别以1.0kb的叶绿体同源片段trnK-ORF509A和0.6kb的bar基因为探针,对转基因烟草叶绿体DNA进行Southern杂交检测,证明外源基因已整合入烟草叶绿体基因组中.抗性试验表明,转基因植株具备除草剂(PPT)抗性. 展开更多
关键词 BAR基因 同源片段 烟草 aadA基因 除草剂 叶绿体
下载PDF
水稻叶绿体表达体系的建立及抗PPT叶绿体转化植株的获得 被引量:21
5
作者 李轶女 孙丙耀 +3 位作者 苏宁 孟祥勋 张志芳 沈桂芳 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期1849-1855,共7页
【目的】建立外源基因在水稻叶绿体中的表达体系。【方法】通过分析已公布的水稻叶绿体基因组全序列及其基因分布特点,选择ndhF与trnL的基因间序列作为除草剂PPT抗性基因bar定点整合的位点。以水稻叶绿体基因组DNA为模板,采用PCR方法克... 【目的】建立外源基因在水稻叶绿体中的表达体系。【方法】通过分析已公布的水稻叶绿体基因组全序列及其基因分布特点,选择ndhF与trnL的基因间序列作为除草剂PPT抗性基因bar定点整合的位点。以水稻叶绿体基因组DNA为模板,采用PCR方法克隆了两个适于水稻叶绿体基因组遗传转化的同源片段,构建了含水稻叶绿体16S高效表达启动子、外源基因bar、psbA基因的3′序列(终止子)以及两个同源片段的水稻叶绿体特异表达载体pRB。【结果】采用基因枪法转化水稻品种中花10号幼穗诱导的愈伤组织,并再生植株,获得转化体后代种子。对转化植株进行的分子检测结果表明,外源基因bar可能被整合到水稻叶绿体基因组中。后代种子的遗传学分析显示,外源基因bar可正常表达并遗传。【结论】利用所建立的水稻叶绿体外源基因表达体系,外源基因bar既可在水稻叶绿体基因组中正常表达,还可作为转化体筛选时的除草剂抗性选择标记。 展开更多
关键词 水稻 同源片段 BAR基因 叶绿体转化
下载PDF
甘薯叶绿体表达载体构建及其融合基因在叶绿体中的瞬间表达 被引量:7
6
作者 王玉华 张秀海 +3 位作者 吴忠义 王永勤 黄丛林 贾敬芬 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第9期1747-1755,共9页
利用叶绿体基因组进化中高度保守的特点,根据烟草叶绿体基因组全序列设计引物,从甘薯(Ipomoeabatatas)叶绿体基因组中克隆了2个相邻的功能基因rbcL(GenBank登录号为AY942199)和accD(GenBank登录号为AY942200),并以此作为定点整合外源基... 利用叶绿体基因组进化中高度保守的特点,根据烟草叶绿体基因组全序列设计引物,从甘薯(Ipomoeabatatas)叶绿体基因组中克隆了2个相邻的功能基因rbcL(GenBank登录号为AY942199)和accD(GenBank登录号为AY942200),并以此作为定点整合外源基因的同源重组片段。以来自叶绿体基因组的强启动子Prrn和Rps-bA-pro分别驱动选择标记基因aadA及phaC-gfp融合基因,构建成表达盒prrn-aadA-TpsbA-ter与RpsbA-pro-phaC-gfp-RpsbA-ter,然后将这2个表达盒串联在一起克隆进甘薯叶绿体同源片段中,获得甘薯叶绿体定点整合表达载体pSC-GFP。酶切分析证明,所构建的载体符合预期设计;采用该载体对甘薯叶片进行基因枪转化,结果显示,phaC-gfp融合基因可在叶绿体特异启动子和终止子的调控下在甘薯幼嫩叶片中瞬间表达,证明构建的载体pSC-GFP可用于甘薯叶绿体转化。 展开更多
关键词 甘薯 叶绿体同源片段 叶绿体表达载体 瞬间表达 中长链聚羟基脂肪酸酯
下载PDF
鸡爪槭种下分类群的DNA条形码筛选 被引量:9
7
作者 高健 孟婉姮 +1 位作者 杜芳 李俊清 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期734-743,共10页
槭属鸡爪槭(Acer palmatum Thunb.)是北温带广泛分布的一类园艺观赏树种,由于频繁的种内杂交渐渗导致其种下分类群的形态性状特征趋同,致使传统的形态学分类难以准确鉴定,新兴的DNA条形码技术为快速、准确的鉴定鸡爪槭种下分类群提供... 槭属鸡爪槭(Acer palmatum Thunb.)是北温带广泛分布的一类园艺观赏树种,由于频繁的种内杂交渐渗导致其种下分类群的形态性状特征趋同,致使传统的形态学分类难以准确鉴定,新兴的DNA条形码技术为快速、准确的鉴定鸡爪槭种下分类群提供了新的思路。本研究采用5个叶绿体DNA片段(rpl16、psbA-trnH、trnL-trnF、rbcL、matK)和核基因组ITS片段,运用PWG-distance和Tree-Building两种方法对鸡爪槭的8个分类群共32个个体进行DNA条形码分析。结果显示,单个叶绿体基因组片段(分辨率为0%~25%)或核rDNA ITS片段(12.5%)的分辨率较低,不同组合的叶绿体DNA片段(0%~62.5%)、叶绿体片段与核rDNA ITS片段(12.5%~50%)的分辨率则相对较高。其中,rpl16+psbA-trnH+trnL-trnF片段组合的分辨率最高(62.5%),较为符合DNA条形码快速、准确鉴定的要求,因此建议将其作为鸡爪槭种下分类群鉴定的DNA条形码。 展开更多
关键词 鸡爪槭 DNA条形码 叶绿体DNA片段 核基因组ITS片段 物种分辨率
下载PDF
五种杨树叶绿体DNA的提取及RFLP分析 被引量:5
8
作者 卢孟柱 卞祖娴 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 1992年第4期465-468,共4页
近几年,叶绿体DNA的研究越来越受到重视,因为叶绿体不仅是植物光合作用的器官,而且DNA分子结构紧凑,相对于核DNA而言,分子量小,结构简单,更易从分予水平上作精细分析。另外,叶绿体DNA具有稳定性、进化缓慢性及编码序列的保守性,因而是... 近几年,叶绿体DNA的研究越来越受到重视,因为叶绿体不仅是植物光合作用的器官,而且DNA分子结构紧凑,相对于核DNA而言,分子量小,结构简单,更易从分予水平上作精细分析。另外,叶绿体DNA具有稳定性、进化缓慢性及编码序列的保守性,因而是研究植物系统发育的好材料。虽然在许多植物中,叶绿体DNA分子非常保守。 展开更多
关键词 杨树 叶绿体 DNA 提取 RFLP
下载PDF
稻属叶绿体DNA限制性片段长度多态性 被引量:4
9
作者 朱世华 王明全 汪向明 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 1999年第3期139-142,共4页
对稻属(oryza)的14个种和李氏禾属(Leersia)的2个种共138份材料进行了叶绿体DNA限制性片段长度多态性的分析。用内切酶EcoRI酶切、4个叶绿体DNA探针杂交,共发现1o种叶绿体DNA变异类型。在稻属各个种内没有观察到叶绿体DNA的变异,... 对稻属(oryza)的14个种和李氏禾属(Leersia)的2个种共138份材料进行了叶绿体DNA限制性片段长度多态性的分析。用内切酶EcoRI酶切、4个叶绿体DNA探针杂交,共发现1o种叶绿体DNA变异类型。在稻属各个种内没有观察到叶绿体DNA的变异,叶绿体DNA变异类型基本上以稻属的染色体组型水平划分,因此认为精属的叶绿体DNA在进化过程中变异程度很低。推测CCDD组的o.alta、o.grandiglumis和o.latifolia及CC组的o.officinals和o.eichingeri各有共同的原始祖先。遗传距离分析显示CC、CCDD、BBCC组之间亲缘关系很近,这3个组与EE组亲缘关系也较近。李氏禾属的2个种L.perrieri和L.tisseranti与稻属的遗传距离很远。 展开更多
关键词 稻属 李氏禾属 叶绿体DNA 限制性片段长度
下载PDF
茶树叶绿体DNA的PCR-RFLP反应体系优化 被引量:1
10
作者 陈盛相 齐桂年 李欢 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第6期73-76,共4页
通过正交设计对影响茶树聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)反应体系的主要因素进行优化,快速确立适合茶树叶绿体DNA PCR-RFLP分析的扩增体系和酶切体系。结果表明:最佳PCR扩增体系为100ng模板DNA、200μmol/L dNTPs、1.5mmol... 通过正交设计对影响茶树聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)反应体系的主要因素进行优化,快速确立适合茶树叶绿体DNA PCR-RFLP分析的扩增体系和酶切体系。结果表明:最佳PCR扩增体系为100ng模板DNA、200μmol/L dNTPs、1.5mmol/L MgCl2、50ng叶绿体引物、3U TaqDNA聚合酶、加ddH2O至25μL;最佳酶切体系为6μL扩增产物用量、2U限制性内切酶量、1×限制性内切酶buffer、加ddH2O至15μL,37℃酶切6h。利用优化的反应体系,对30个茶树品种叶绿体DNA进行PCR-RFLP扩增,可获得清晰扩增图谱和多态性酶切图谱。 展开更多
关键词 茶树 叶绿体DNA PCR—RFLP 优化
下载PDF
斑块大小对油松授粉期花粉量以及结实的影响 被引量:1
11
作者 鲍蕾 杨明博 王红芳 《生态科学》 CSCD 2015年第6期1-8,共8页
景观破碎化随着人类活动的增强而日益严重,因此理解其对物种的影响程度显得尤为重要。选取北京城市种植的14个不同大小和隔离度的油松斑块,通过斑块内花粉量观察、结实量分析并佐以自交率的分析,回答斑块大小和隔离度对花粉量的影响,以... 景观破碎化随着人类活动的增强而日益严重,因此理解其对物种的影响程度显得尤为重要。选取北京城市种植的14个不同大小和隔离度的油松斑块,通过斑块内花粉量观察、结实量分析并佐以自交率的分析,回答斑块大小和隔离度对花粉量的影响,以及花粉量对结实和自交率的影响。研究发现花粉量随着斑块增大而显著升高,但与隔离度没有显著关系。花粉量大的斑块中每个球果得到的总种子数和饱籽率趋于更多。5个斑块的自交率分析表明大斑块具有很低的自交率,而小斑块的自交率取决于花粉量,花粉量大的斑块具有较高的自交率,而花粉量小的斑块以异交以及斑块间花粉流为主。研究表明小斑快具有花粉量限制和自交率升高的双重风险,并因此导致繁殖适合度的下降。在森林物种保护和管理中,这些小斑块值得特殊关注。 展开更多
关键词 景观破碎化 油松 斑块花粉量 结实 父本分析 叶绿体微卫星
下载PDF
菊苣叶绿体同源片段的克隆及多顺反子定点整合表达载体的构建
12
作者 王玉华 韩晓玲 +1 位作者 黄丛林 贾敬芬 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2010年第1期11-17,共7页
利用叶绿体基因组进化中高度保守的特点,根据烟草叶绿体基因组全序列设计合成引物,从菊苣叶绿体基因组中扩增包括rps7-rps12-trnV-16S rDNA基因在内的一段序列(GenBank登录号为GQ199478),并以此作为定点整合外源基因的同源重组片段。以... 利用叶绿体基因组进化中高度保守的特点,根据烟草叶绿体基因组全序列设计合成引物,从菊苣叶绿体基因组中扩增包括rps7-rps12-trnV-16S rDNA基因在内的一段序列(GenBank登录号为GQ199478),并以此作为定点整合外源基因的同源重组片段。以叶绿体基因强启动子prrn驱动选择标记基因aadA及报告基因gfp构建多顺反子表达盒prrn-aadA-gfp-psbA-3,′然后将表达盒克隆进菊苣叶绿体同源片段中,获得菊苣叶绿体定点整合表达载体pJAG,酶切分析证明所构建的载体符合预期设计。该载体的构建为建立菊苣的叶绿体转化体系奠定基础,为进一步通过叶绿体基因工程手段将更多感兴趣的基因导入菊苣进行遗传改良,或以菊苣叶绿体作生物反应器生产动物口服疫苗等搭建技术平台。 展开更多
关键词 菊苣 叶绿体同源片段 多顺反子 定点整合表达载体
下载PDF
胞质雄性不育白菜叶绿体ndhJ-trnF区域序列发生变异
13
作者 蒋明 曹家树 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第5期497-502,共6页
以来自Polima胞质甘蓝型油菜雄性不育源转育获得的不育白菜'Bpol97-05A'和其回交亲本即保持系'Bajh97-01B'为材料,利用cDNA扩增片段长度多态性(cDNA-AFLP)技术获得一条长约330bp的特异片段P1708,RT-PCR验证确认该序列... 以来自Polima胞质甘蓝型油菜雄性不育源转育获得的不育白菜'Bpol97-05A'和其回交亲本即保持系'Bajh97-01B'为材料,利用cDNA扩增片段长度多态性(cDNA-AFLP)技术获得一条长约330bp的特异片段P1708,RT-PCR验证确认该序列为不育白菜材料所特有,经测序和BLAST比对,发现该片段除54bp的插入序列外,其余部分与大白菜和甘蓝叶绿体ndhJ-trnF基因之间的一段序列完全一致.根据基因区域两端的保守部位设计引物,以Polima不育白菜DNA和可育甘蓝型油菜的DNA为模板,分别获得了长约1900bp的序列,比较序列发现:不育白菜与可育白菜、甘蓝型油菜的DNA序列存在一定差异,'Bpol97-05A'中除多个位点发生变异外,另有108bp的插入序列,该插入由2个长度为54bp的重复序列组成,重复序列中除5′端3个碱基CTT外,其余部分均与trnF基因3′端51bp完全相同. 展开更多
关键词 白菜 cDNA扩增片段长度多态性(cDNA-AFLP) ndhJ-trnF区域 序列变异 细胞质雄性不育 叶绿体基因
下载PDF
黑麦属种间叶绿体DNA的变异性和种系发生的关系
14
作者 徐乃瑜 村井耕二 常脇恒一郎 《武汉植物学研究》 CSCD 1991年第1期81-88,共8页
为了获得有关黑麦属种间关系、黑麦属与小麦属和山羊草属种系发牛关系的新资料,应用Ban HI等8种限制性核酸内切酶酶解黑麦属5个种的叶绿体DNA,进行琼脂糖凝胶电泳,分析其酶解图谱。结果表明,黑麦属种叶绿体基因组的大小与小麦属和山羊... 为了获得有关黑麦属种间关系、黑麦属与小麦属和山羊草属种系发牛关系的新资料,应用Ban HI等8种限制性核酸内切酶酶解黑麦属5个种的叶绿体DNA,进行琼脂糖凝胶电泳,分析其酶解图谱。结果表明,黑麦属种叶绿体基因组的大小与小麦属和山羊草属的叶绿体基因组非常相似。根据黑麦属5个种遗传距离的估算,并与小麦属和山羊草属已知叶绿体基因组间所观察到的遗传距离相比,黑麦属叶绿体基因组的分化很少;这些资料进一步证实黑麦属的近代起源;并表明黑麦属、小麦属和山羊草属间的亲缘关系是非常密切的。 展开更多
关键词 黑麦属 叶绿体DNA 种系发生
下载PDF
被子植物叶绿体基因及其表达
15
作者 杨秀海 《江西农业学报》 1994年第1期59-65,共7页
本文简要综述了叶绿体DNA分子结构、叶绿体基因的功能及其表达产物。着重阐述了被子植物叶绿体DNA与细胞质雄性不育的关系;借助cpDNA限制性片段分析,许多学者认为由于cpDNA分子的缺失、突变或插入,叶绿体DNA可能... 本文简要综述了叶绿体DNA分子结构、叶绿体基因的功能及其表达产物。着重阐述了被子植物叶绿体DNA与细胞质雄性不育的关系;借助cpDNA限制性片段分析,许多学者认为由于cpDNA分子的缺失、突变或插入,叶绿体DNA可能涉及到CMS的产生,为了得到cpDNA在CMS中起作用的肯定性结论和在分子水平上解释被子植物细胞质雄性不育的机理,作者提出了应该进一步采取的措施。 展开更多
关键词 叶绿体 细胞质 雄性不育 基因表达
下载PDF
羊草叶绿体非编码区多态性标记筛选及群体遗传多样性 被引量:3
16
作者 杨艳婷 侯向阳 +4 位作者 魏臻武 乔志宏 常春 任卫波 武自念 《草业学报》 CSCD 北大核心 2018年第10期147-157,共11页
为筛选多态性丰富的羊草叶绿体非编码区片段,本研究以9个不同地理位置的羊草居群为材料,通过对12个叶绿体非编码区DNA片段测序及其序列间变异分析试图从中找出有遗传差异的叶绿体DNA(cpDNA)片段,并利用有多态性的cpDNA片段进行遗传多样... 为筛选多态性丰富的羊草叶绿体非编码区片段,本研究以9个不同地理位置的羊草居群为材料,通过对12个叶绿体非编码区DNA片段测序及其序列间变异分析试图从中找出有遗传差异的叶绿体DNA(cpDNA)片段,并利用有多态性的cpDNA片段进行遗传多样性分析。结果表明,序列ndhF-rpl32、trnL-trnF、trnC-ycf6、aptI-aptH具有比较丰富的变异,可作为下一步研究野生羊草群体遗传学和谱系地理学较为理想的分子标记。在37个羊草个体4条非编码区片段的合并序列中,共检测到15种单倍型,单倍型多态性(Hd)为0.928,核苷酸多态性(Pi)为0.00101;遗传分化指数(Fst)为0.58884,基因流(Nm)为0.17,基因流较小;中性检验Tajima’s D(-1.08542)和Fu’s Fs(-5.301)均为负值,且差异不显著(P>0.10),推测羊草遵循中性进化理论,可能经历过种群扩张;AMOVA结果显示,65%的分子变异出现在居群间,35%出现在居群内;Mantel检验得到,遗传距离与地理距离具有显著相关性(r=0.449,P<0.05);居群分化值Nst 0.386(0.1865)大于Gst 0.234(0.1506),差异显著(P<0.05),表明羊草居群存在分子谱系地理结构。通过系统发育树分析得到,羊草15个单倍型分为两大分支,H2和H10聚为一支,它们与别的居群个体亲缘关系较远,其余单倍型聚为另一支;单倍型网络图显示,H2和H12、H10和H12亲缘关系较远,与系统发育树分析结果基本一致。本研究为羊草的种质资源保护、谱系地理学研究等工作奠定了基础。 展开更多
关键词 羊草 叶绿体非编码区片段 多态性标记 单倍型 遗传多样性
下载PDF
传统中药材麦冬的DNA条形码鉴定 被引量:2
17
作者 王广艳 《安徽农学通报》 2016年第24期17-21,共5页
该文分析了DNA条形码序列(ITS、psb A-trnH、matK、rbcL和trn L-F)对采自10个不同产区的麦冬进行PCR扩增及测序。结果表明,ITS序列变异位点为11 bp且较稳定。叶绿体序列的变异位点较低。本研究构建了ITS及联合叶绿体片段与ITS的系统发育... 该文分析了DNA条形码序列(ITS、psb A-trnH、matK、rbcL和trn L-F)对采自10个不同产区的麦冬进行PCR扩增及测序。结果表明,ITS序列变异位点为11 bp且较稳定。叶绿体序列的变异位点较低。本研究构建了ITS及联合叶绿体片段与ITS的系统发育树,4个叶绿体片段各自构建的系统发育树结果不理想,以ITS构建的系统发育树为主。广西桂林、贵州贵定与浙江余杭聚为一支;四川什都、四川珙县与广东肇庆聚为一支;云南麻栗坡与云南石林聚为一支;江西庐山与湖南桑植聚为另一分支,位于发育树基部;以上分支均得到G+C含量和遗传距离的支持,种内具有较近的亲缘关系。ITS序列具有稳定的变异位点和鉴定位点,能够准确的鉴定不同产地的麦冬,基于ITS构建的系统发育树能够较好的区分其亲缘关系。 展开更多
关键词 麦冬 ITS 叶绿体片段 遗传距离 亲缘关系
下载PDF
Glacial Refugia of Ginkgo biloba and Human Impact on Its Genetic Diversity:Evidence from Chloroplast DNA 被引量:7
18
作者 Wei Gong Zhen Zeng Ye-Ye Chen Chuan Chen Ying-Xiong Qiu Cheng-Xin Fu 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2008年第3期368-374,共7页
Variations in the trnK region of chloroplast DNA were investigated in the present study using polymerase chain reactionrestriction fragment length polymorphism to detect the genetic structure and to infer the possible... Variations in the trnK region of chloroplast DNA were investigated in the present study using polymerase chain reactionrestriction fragment length polymorphism to detect the genetic structure and to infer the possible glacial refugia of Ginkgo biloba L. in China. In total, 220 individuals from 12 populations in China and three populations outside China were analyzed, representing the largest number of populations studied by molecular markers to date. Nineteen haplotypes were produced and haplotype A was found in all populations. Populations in south-western China, including WC, JF, PX, and SP, contained 14 of the 19 haplotypes and their genetic diversity ranged from 0.771 4 to 0.867 6. The TM population from China also showed a high genetic diversity (H = 0.848 5). Most of the genetic variation existed within populations and the differentiation among populations was low (GsT = 0.2). According to haplotype distribution and the historical record, we suggest that populations of G. biloba have been subjected to extensive human impact, which has compounded our attempt to infer glacial refugia for Ginkgo. Nevertheless, the present results suggest that the center of genetic diversity of Ginkgo is mainly in south-western China and in situ conservation is needed to protect and preserve the genetic resources. 展开更多
关键词 chloroplast DNA Ginkgo biloba glacial refugia human activities polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism
原文传递
青藏高原蕨麻的分子谱系地理学研究
19
作者 白世俊 李军乔 +1 位作者 刘欣 吕博文 《草业学报》 2024年第11期84-105,共22页
青藏高原的隆升以及第四纪冰期气候的循环波动,对于青藏高原及其周边地区动植物的分布和遗传结构具有很大的影响。蕨麻是青藏高原极富营养、药用和生态价值的特有植物资源,蕨麻和鹅绒委陵菜的分类关系及分布在学术界存在争议,分子谱系... 青藏高原的隆升以及第四纪冰期气候的循环波动,对于青藏高原及其周边地区动植物的分布和遗传结构具有很大的影响。蕨麻是青藏高原极富营养、药用和生态价值的特有植物资源,蕨麻和鹅绒委陵菜的分类关系及分布在学术界存在争议,分子谱系地理学研究将为蕨麻遗传多样性形成机制及推断该物种迁移演化历史提供依据。以蕨麻为研究对象,对采集的30个居群的810个个体进行了叶绿体trnL-trnF序列和核基因ITS测序,揭示遗传变异在居群内和居群间的分布格局,结合群体遗传学和系统发生学,分析该物种的遗传结构与历史事件之间的关联,揭示物种及物种内不同种群形成现有分布格局的历史原因和演化过程。主要结论有:1)蕨麻具有较高水平的遗传多样性。cpDNA trnL-trnF片段共检测到40种单倍型,16个为共享单倍型,占比40%,24个为居群特有单倍型,占比60%,遗传多样性h=0.7078,单倍型多样性Hd=0.8217,核苷酸多样性π=0.010641,总遗传多样性HT=0.849;nrDNA ITS片段共检测到128种单倍型,共享单倍型42种,占比32.8%,居群特有单倍型86种,占比67.2%,遗传多样性h=0.7633,单倍型多样性Hd=0.8168,核苷酸多样性π=0.003584,总遗传多样性HT=0.844。2)居群内的遗传多样性大于居群间的遗传多样性。序列分析结果为居群内和居群间的遗传多样性都很高(cpDNA trnL-trnF:HT=0.849,居群内平均遗传多样性HS=0.640;nrDNA ITS序列:HT=0.844,HS=0.763,HT均大于HS)。蕨麻居群分为3个组:青海高原组、横断山脉组和藏南谷地组。蕨麻的遗传变异主要来源于居群内部。3)蕨麻种群具有明显的谱系地理结构。cpDNA trnL-trnF序列和nrDNA ITS遗传多态性分析及地理分布模式检验,cpDNA trnL-trnF序列:遗传分化系数G_(ST)=0.246,N_(ST)=0.417,nrDNA ITS序列:G_(ST)=0.096,N_(ST)=0.522,N_(ST)均显著大于G_(ST)(P<0.001),表明蕨麻所有居群单倍型存在显著的谱系地理结构,两种方法的结果高度一致。分子变异分析(AMOVA)表明,大部分遗传变异(59.69%)存在于居群内部,居群间分化水平很高(F_(ST)=0.40313)。4)共享单倍型和特有单倍型均由古老单倍型衍生而来。cpDNA trnL-trnF和nrDNA序列中央连接网状图呈以共享单倍型M4和H9位于中心,M_(1)、M_(3)和H_(2)、H_(10)、H_(11)、H_(12)位于主干位置的星状结构,其余共享单倍型和特有单倍型均由这些古老单倍型衍生而来,两者结果一致。5)蕨麻种群大小和范围发生过大规模扩张。利用cpDNA trnL-trnF和nrDNA序列进行歧点分析,前者歧点分布呈单峰曲线,表明近期群体大小和范围有大规模扩张发生;后者的歧点分布呈双峰曲线,反映基因谱系的高度复杂性,但Tajima’s D,Fu and Li’s D和Fu and Li’s F均为负值,且结果显著,且离差平方和(SSD)和扩张评估指数(H_(Rag))的统计检验不显著,表明蕨麻居群近期有扩张的可能。6)蕨麻存在3个冰期避难所,即东喜马拉雅区域、青藏高原东南边缘及横断山脉区域。 展开更多
关键词 蕨麻 叶绿体trnl-trnf序列 核基因ITS 青藏高原 分子谱系地理学
下载PDF
柴达木野生黑果枸杞的空间遗传结构 被引量:1
20
作者 王春成 马松梅 +1 位作者 张丹 王绍明 《植物生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期661-668,共8页
基于cp DNA序列,研究柴达木野生黑果枸杞(Lycium ruthenicum)的遗传多样性、遗传结构和单倍型进化关系,可为其种群的遗传保护提供理论依据。该研究基于3个筛选的叶绿体多态引物:psb A-trn H、psb K-psb I和trn V,利用群体遗传分析方法... 基于cp DNA序列,研究柴达木野生黑果枸杞(Lycium ruthenicum)的遗传多样性、遗传结构和单倍型进化关系,可为其种群的遗传保护提供理论依据。该研究基于3个筛选的叶绿体多态引物:psb A-trn H、psb K-psb I和trn V,利用群体遗传分析方法研究柴达木盆地野生黑果枸杞的遗传变异格局:利用软件DnaSP6.0和Permut2.0计算分子多样性指标,利用分子方差分析研究组间和种群间的遗传变异来源,利用单倍型网络分析和主坐标分析研究单倍型的聚类关系;利用最大似然树和贝叶斯系统树分析单倍型的谱系进化关系。结果显示:叶绿体序列psb A-trn H、psb K-psb I和trn V拼接后的总长度为1454 bp,鉴别出14个核苷酸变异位点,共定义了7个单倍型。种群间总的遗传多样(hT)和种群内遗传多样性(hS)分别为0.916和0.512。AMOVA分析结果表明,80%以上的遗传变异来源于组间和种群间。叶绿体单倍型的贝叶斯系统树和最大似然树均表明柴达木盆地黑果枸杞种群聚为2支:德令哈和格尔木为一支,诺木洪为另一支。单倍型网络和主坐标分析结果揭示的拓扑结构和聚类关系与系统树一致。Mantel检验结果表明柴达木黑果枸杞种群间的遗传距离与地理距离存在显著的弱相关关系(r=0.5911,p=0.0009)。柴达木盆地黑果枸杞种群具有较高的遗传多样性,种群间遗传分化显著。从遗传多样性保护的角度而言,具有较高遗传多样性的诺木洪林业站和格尔木新乐村种群可划分为保护管理单元。 展开更多
关键词 黑果枸杞 柴达木盆地 叶绿体片段 遗传变异 遗传结构
原文传递
上一页 1 2 下一页 到第
使用帮助 返回顶部