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19号染色体开放阅读框5蛋白调节自噬活性与结直肠癌恶性程度的关系 被引量:2
1
作者 李胜龙 闫炳文 +3 位作者 王春敬 王明宇 乔鹏飞 王夫景 《癌症进展》 2020年第16期1664-1667,共4页
目的探讨19号染色体开放阅读框5(C19ORF5)蛋白在结直肠癌组织中的表达情况,分析C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌恶性程度的关系。方法收集141例结直肠癌患者的结直肠癌组织和癌旁正常组织,分别采用免疫组织化学染色方法和实时定量聚... 目的探讨19号染色体开放阅读框5(C19ORF5)蛋白在结直肠癌组织中的表达情况,分析C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌恶性程度的关系。方法收集141例结直肠癌患者的结直肠癌组织和癌旁正常组织,分别采用免疫组织化学染色方法和实时定量聚合酶链反应(PCR)检测两种组织中C19ORF5蛋白和mRNA表达情况,在电镜下观察组织的超微结构,分析C19ORF5蛋白对自噬活性的调节作用,比较不同临床特征结直肠癌患者结直肠癌组织中C19ORF5蛋白的表达情况。结果结直肠癌组织中C19ORF5蛋白的染色强度明显高于癌旁正常组织,Ⅰ/Ⅱ期结直肠癌组织中C19ORF5蛋白的染色强度明显高于Ⅲ/Ⅳ期结直肠癌组织,Ⅰ/Ⅱ期结直肠癌组织的自噬活性较高,Ⅲ/Ⅳ期结直肠癌组织的自噬活性较低。结直肠癌组织中C19ORF5 mRNA的表达水平明显高于癌旁正常组织,差异有统计学意义(P﹤0.01)。TNM分期为Ⅰ~Ⅱ期、癌胚抗原(CEA)升高、无肝转移结直肠癌患者结直肠癌组织中C19ORF5蛋白的高表达率分别高于TNM分期为Ⅲ~Ⅳ期、CEA正常、有肝转移的患者,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。结论在结直肠癌组织中,高表达的C19ORF5蛋白可增加肿瘤细胞的自噬活性,增加基因的稳定性,降低肿瘤的恶性程度。C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌的恶性程度呈负相关,C19ORF5可能是一种重要的抑癌基因。 展开更多
关键词 结直肠癌 19号染色体开放阅读框5 自噬
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C19ORF12对胃癌MKN45细胞增殖和化疗药敏感性的影响及其机制
2
作者 杨颖 赵伟 吕丹 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期687-693,共7页
目的:探讨19号染色体开放读码框12(C19ORF12)对胃癌MKN45细胞增殖和化疗药物敏感性的影响,并阐明其作用机制。方法:将胃癌MKN45细胞分为对照组和C19ORF12组。CCK-8法检测2组胃癌MKN45细胞的增殖活性,克隆形成实验检测2组胃癌MKN45细胞... 目的:探讨19号染色体开放读码框12(C19ORF12)对胃癌MKN45细胞增殖和化疗药物敏感性的影响,并阐明其作用机制。方法:将胃癌MKN45细胞分为对照组和C19ORF12组。CCK-8法检测2组胃癌MKN45细胞的增殖活性,克隆形成实验检测2组胃癌MKN45细胞克隆形成数,CCK-8法检测加入化疗药物阿霉素或过氧化氢(H2O2)后2各组胃癌MKN45细胞存活率,流式细胞术检测2组胃癌MKN45细胞凋亡率,激光共聚焦显微镜技术检测C19ORF12在胃癌MKN45细胞中的亚细胞定位,GEPIA分析癌症基因组图谱(TCGA)中C19ORF12 mRNA在正常胃组织和胃癌组织中的表达差异,KM-plot回顾性分析不同表达水平C19ORF12对胃癌患者预后的影响。结果:与对照组比较,C19ORF12组胃癌MKN45细胞增殖活性明显升高(P<0.05),克隆形成数升高(P<0.01)。阿霉素或H2O2作用后,与对照组比较,C19ORF12组胃癌MKN45细胞存活率升高(P<0.05或P<0.01),细胞凋亡率降低(P<0.01)。激光共聚焦显微镜下,C19ORF12主要定位于胃癌MKN45细胞的线粒体中。与正常胃组织比较,胃癌组织中C19ORF12 mRNA表达水平明显升高(P<0.01)。与低表达C19ORF12的胃癌患者比较,高表达C19ORF12的胃癌患者总体生存期明显缩短(P<0.01)。结论:C19ORF12能够促进胃癌细胞的增殖,并且降低胃癌细胞对化疗药物的敏感性。C19ORF12可以作为肿瘤治疗的潜在靶标。 展开更多
关键词 C19ORF12 胃肿瘤 细胞增殖 阿霉素 化疗药敏感性 活性氧
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C12ORF66对MYCN扩增的高危神经母细胞瘤细胞的活性调控
3
作者 贾安娜 战世佳 +4 位作者 张璇 郭金鑫 于永波 郭永丽 常艳 《基础医学与临床》 2024年第3期288-294,共7页
目的探究12号染色体开放阅读框66(C12ORF66)对MYCN扩增神经母细胞瘤(NB)细胞系活性的调控效应。方法通过R2数据库GSE16476和GSE49710数据集,分析MYCN扩增和MYCN非扩增NB细胞中C12ORF66表达量,以及C12ORF66表达量与患儿预后的相关性。RT-... 目的探究12号染色体开放阅读框66(C12ORF66)对MYCN扩增神经母细胞瘤(NB)细胞系活性的调控效应。方法通过R2数据库GSE16476和GSE49710数据集,分析MYCN扩增和MYCN非扩增NB细胞中C12ORF66表达量,以及C12ORF66表达量与患儿预后的相关性。RT-qRCR检测正常组织永生化细胞系、MYCN扩增及MYCN非扩增细胞系中C12ORF66 mRNA表达差异。构建瞬时敲低和稳定敲低C12ORF66的MYCN扩增细胞株,对照组和敲低组细胞进行实时无标记动态细胞分析(RTCA)、集落形成能力检测及Ki67免疫荧光染色。结果R2数据库分析显示MYCN扩增NB患儿样本中C12ORF66表达显著高于MYCN非扩增NB患儿样本,并且C12ORF66表达与患儿预后负相关(P<0.05)。细胞实验表明,与MYCN非扩增细胞系CHLA-255和SH-SY5Y相比,C12ORF66在MYCN扩增细胞系BE(2)-C和SK-N-BE(2)中表达显著升高(P<0.001)。瞬时或稳定敲低C12ORF66,MYCN扩增NB细胞增殖显著减缓(P<0.001),集落形成能力显著降低(P<0.001),Ki67阳性细胞比例显著减少(P<0.05)。结论C12ORF66在MYCN扩增NB患儿样本和细胞系中高表达,且与患儿预后负相关,敲低C12ORF66显著抑制NB细胞活性。 展开更多
关键词 12号染色体开放阅读框66 SK-N-BE(2)细胞 MYCN扩增 细胞增殖
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钙黏蛋白家族成员3及11号染色体开放阅读框30基因多态性与支气管哮喘病儿易感性及糖皮质激素疗效的研究
4
作者 吴彩云 凌娟 王晓丽 《安徽医药》 CAS 2024年第6期1226-1231,共6页
目的探讨钙黏蛋白家族成员3(CDHR3)及11号染色体开放阅读框30(C11orf30,EMSY)基因多态性与支气管哮喘病儿易感性及糖皮质激素疗效。方法前瞻性选取2020年5月至2021年10月于泰州市第二人民医院就诊的支气管哮喘病儿132例作为易感组。均... 目的探讨钙黏蛋白家族成员3(CDHR3)及11号染色体开放阅读框30(C11orf30,EMSY)基因多态性与支气管哮喘病儿易感性及糖皮质激素疗效。方法前瞻性选取2020年5月至2021年10月于泰州市第二人民医院就诊的支气管哮喘病儿132例作为易感组。均接受糖皮质激素吸入治疗,并根据疗效分为疗效良好组和疗效不良组。选取同期体检的48例儿童作为对照组,采用倾向性匹配方法对易感组和对照组性别、年龄等基线资料进行匹配;采用PCR检测CDHR3及EMSY基因的单核苷酸多态性,计算其基因型频率和等位基因频率,基因位点的多态性与儿童支气管哮喘易感风险间的关系采用多因素logistic回归分析。对比疗效良好组和疗效不良组不同基因型分布。结果易感组和对照组经倾向性评分匹配后有36组配对成功(每组36例),匹配后基线资料对比差异无统计学意义(P>0.05)。匹配后易感组和对照组CDHR3基因rs6967330位点、EMSY基因rs12278256位点基因型频率及A等位基因频率比较差异有统计学意义(P<0.05)。多因素logistic回归分析显示:EMSY基因rs12278256位点AA基因型[OR=9.91,95%CI:(1.02,96.65)]、CDHR3基因rs6967330位点AA基因型[OR=10.09,95%CI:(1.08,94.02)]是支气管哮喘易感的危险因素(均P<0.05)。治疗12周后,24例(66.67%)为疗效良好组,其余12例(33.33%)归为疗效不佳组,两组CDHR3基因rs6967330位点基因型分布对比差异无统计学意义(P>0.05);两组EMSY基因rs12278256位点基因型分布对比差异有统计学意义(P<0.05),其中疗效良好组AA基因型分布频率[37.50%(9/24)]明显高于疗效不良组[0(0/12)](P<0.05)。结论CDHR3基因rs3847076位点以及EMSY基因rs12278256位点与儿童支气管哮喘易感有关,EMSY基因rs12278256位点与糖皮质激素治疗疗效相关。 展开更多
关键词 哮喘 钙黏蛋白家族成员3 11号染色体开放阅读框30 基因多态性 糖皮质激素 倾向性评分匹配
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基于生物信息数据分析C12ORF49在乳腺癌中的表达及其意义
5
作者 马强 李慧娟 吕运成 《华夏医学》 CAS 2024年第2期103-110,共8页
目的通过在线数据库分析12号染色体开放阅读框49(C12ORF49)在乳腺癌中的表达情况、临床意义及互作蛋白功能,为乳腺癌防治和预后预测提供新思路。方法使用Oncomine数据库及人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析C12ORF49基因和蛋白在乳腺癌不同... 目的通过在线数据库分析12号染色体开放阅读框49(C12ORF49)在乳腺癌中的表达情况、临床意义及互作蛋白功能,为乳腺癌防治和预后预测提供新思路。方法使用Oncomine数据库及人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析C12ORF49基因和蛋白在乳腺癌不同组织中的表达差异性,然后应用Kaplan-Meier Plotter数据库分析C12ORF49表达水平与不同病理特征乳腺癌患者预后的相关性,最后利用STRING数据库绘制C12ORF49互相作用蛋白网络图,并通过KOBAS生物分析平台进行KEGG功能富集分析。结果乳腺癌中C12ORF49的表达高于正常组织,乳腺癌C12ORF49 mRNA高表达患者的总生存时间(OS)及无远处转移生存时间(DMFS)更短,差异有统计学意义(P<0.05);C12ORF49可预测luminal B型乳腺癌患者的不良DMFS预后(P<0.05);C12ORF49对乳腺癌不良DMFS预后的影响可能独立于乳腺癌受体表达状态。C12ORF49可能通过NF-κB信号通路、TCR信号通路、血小板激活等生理过程(P<0.01,Corrected-P<0.01),促进乳腺癌进展。结论C12ORF49在乳腺癌组织中表达上调,其高表达水平对预测乳腺癌患者不良预后有重要意义,需进一步深入研究。 展开更多
关键词 12号染色体开放阅读框49 乳腺癌 生物信息学
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5'UTR在基因表达调控中的研究进展 被引量:4
6
作者 杜芳芳 马骏杰 +3 位作者 杨泽伟 赵雪莲 刘东宇 杨秀芹 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2021年第8期60-67,共8页
5'非翻译区(5'Untranslated Region,5'UTR)在基因表达调控中发挥重要作用,其不仅在翻译水平调控基因表达,还参与真核基因转录、转录后加工、成熟RNA运输等水平的调控。5'UTR介导的基因表达与自身存在的相关调控元件有关... 5'非翻译区(5'Untranslated Region,5'UTR)在基因表达调控中发挥重要作用,其不仅在翻译水平调控基因表达,还参与真核基因转录、转录后加工、成熟RNA运输等水平的调控。5'UTR介导的基因表达与自身存在的相关调控元件有关,主要包括内部核糖体进入位点、5'UTR二级结构、上游开放阅读框、上游起始密码子以及5'UTR内含子等元件,5'UTR异常可引起基因表达异常并引发疾病。本文综述了5'UTR调控基因表达的研究进展,以期为今后5'UTR的作用机制及相关疾病的诊断与治疗提供新的方向和理论依据。 展开更多
关键词 5'UTR 内部核糖体进入位点 上游开放阅读框 上游起始密码子 二级结构 5'UTR内含子
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C5orf34在非小细胞肺癌中的表达及预后分析 被引量:1
7
作者 徐克明 冉安鹏 何丹 《新疆医科大学学报》 CAS 2020年第12期1561-1566,共6页
目的探讨5号染色体开放阅读框架34(chromosome 5 open reading frame 34,C5orf34)基因在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达情况及对手术患者预后的影响。方法对135例接受手术治疗的非小细胞肺癌患者的肿瘤及正常... 目的探讨5号染色体开放阅读框架34(chromosome 5 open reading frame 34,C5orf34)基因在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达情况及对手术患者预后的影响。方法对135例接受手术治疗的非小细胞肺癌患者的肿瘤及正常组织行免疫组织化学染色,通过Hscore评分标准对C5orf34基因表达进行分界,分析C5orf34基因的表达对癌组织的组织学分级、肿瘤大小和T分期的关系以及对术后患者无病生存期(disease-free survival,DFS)的影响。结果癌组织中的C5orf34基因表达显著高于正常肺组织(P<0.001);病理分期Ⅱ-Ⅲ期以及T2~T4的患者中C5orf34的阳性率显著高于病理分期I期以及T1的患者(P=0.012,0.002,0.012);C5orf34阳性患者的DFS显著低于C5orf34阴性患者(P=0.003),是影响DFS的重要因素。结论C5orf34是影响非小细胞肺癌无瘤生存预后的重要因素,尤其是在进展期肺癌中C5orf34阳性的患者更容易复发和转移;C5orf34可作为预测进展期非小细胞肺癌预后新指标。 展开更多
关键词 C5orf34 非小细胞肺癌 预后
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PAQosome各亚基的基本功能研究概况
8
作者 石榴 韩铭 +3 位作者 袁晓雪 叶峰 成军 蔺淑梅 《医学综述》 CAS 2023年第18期3549-3554,共6页
PAQosome可协助热激蛋白90组装大量的大型多亚基蛋白复合物,并参与蛋白质合成、核糖体生物发生、转录、剪接等基本细胞功能。目前,PAQosome各亚基作用的相关研究主要集中在肿瘤方面,其在多数肿瘤中上调,且与肿瘤的发生、发展、预后密切... PAQosome可协助热激蛋白90组装大量的大型多亚基蛋白复合物,并参与蛋白质合成、核糖体生物发生、转录、剪接等基本细胞功能。目前,PAQosome各亚基作用的相关研究主要集中在肿瘤方面,其在多数肿瘤中上调,且与肿瘤的发生、发展、预后密切相关。此外,其还与阿尔茨海默病的发生、淋巴细胞和生殖细胞的发育、纤维化的形成有关,而上述功能的实现依赖于PAQosome各亚基的功能差异。因此,深入认识PAQosome各亚基的基本功能有助于进一步指导后续PAQosome在非肿瘤疾病中功能的研究。 展开更多
关键词 PAQosome 前折叠亚单位 p53和DNA损伤调控分子1 非常规预折叠RNA聚合酶Ⅱ亚基5相互作用体 伴侣样普遍表达的预折叠蛋白 天冬酰胺合成酶结构域1上游开放读码框
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5′UTR在植物基因表达调控中的功能研究进展
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作者 徐志民 鄢梦雨 兰海燕 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期9-19,共11页
植物5′非翻译区(untranslated region,UTR)存在众多的调控元件,如内部核糖体进入位点、上游开放阅读框、内含子及各种二级结构,在基因表达调控中发挥重要作用。5′UTR还能够通过保留、删除或突变调控元件产生多个mRNA变体,从而影响翻... 植物5′非翻译区(untranslated region,UTR)存在众多的调控元件,如内部核糖体进入位点、上游开放阅读框、内含子及各种二级结构,在基因表达调控中发挥重要作用。5′UTR还能够通过保留、删除或突变调控元件产生多个mRNA变体,从而影响翻译效率。本文对植物5′UTR中涉及的各种调控元件及二级结构的作用机制进行了总结归纳,期望较为全面展示植物5′UTR的结构和功能,并为研究植物5′UTR的调控机制提供参考。 展开更多
关键词 5′UTR 上游开放阅读框 内含子 二级结构 基因表达调控
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人类珠蛋白相关基因上游开放阅读框的变异分析 被引量:3
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作者 叶宇华 张倩倩 +4 位作者 钟建美 黎倚红 张立 喻秋霞 徐湘民 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期232-240,共9页
β-地中海贫血症是一种珠蛋白生成障碍的常染色体隐性遗传病。而γ珠蛋白基因的开放表达和胎儿血红蛋白的合成,是缓解β地中海贫血病人临床表型的一个重要因素。本研究针对202个血红蛋白相关调控基因或mi RNA,对1802个β-地中海贫血症... β-地中海贫血症是一种珠蛋白生成障碍的常染色体隐性遗传病。而γ珠蛋白基因的开放表达和胎儿血红蛋白的合成,是缓解β地中海贫血病人临床表型的一个重要因素。本研究针对202个血红蛋白相关调控基因或mi RNA,对1802个β-地中海贫血症患者进行了目标区域捕获测序。通过生物信息学的分析,检测出了所有捕获区域内的突变。进一步对位于5′端非编码区(5′untranslated region,5′UTR)的突变进行系统扫描,共计寻找到41个影响u ORF(upstream open reading frame,u ORF)有或无的功能性突变。从中选取了CHTOP基因(chr1:153606541 C>T)和TGFB1基因(chr19:41859418 G>A)的两个突变,通过定点诱变和双荧光素酶报告实验,在体外证实这两个突变均可显著地改变下游基因的表达。该研究结果为β-地中海贫血症临床表型的精确诊断提供了潜在的筛查靶点。 展开更多
关键词 Β-地中海贫血 突变 5′端非编码区 上游开放阅读框
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19号染色体开放阅读框5调节自噬活性与结直肠癌恶性程度和紫杉醇化疗敏感性的关系 被引量:1
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作者 闫炳文 李胜龙 +2 位作者 王春敬 乔鹏飞 王夫景 《中国医师进修杂志》 2020年第5期439-443,共5页
目的观察19号染色体开放阅读框5(C19ORF5)调节自噬活性与结直肠癌恶性程度和紫杉醇化疗敏感性的关系。方法选取哈尔滨医科大学附属第二医院2015—2017年141例结直肠癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织,采用免疫组织化学法和实时定量聚合酶... 目的观察19号染色体开放阅读框5(C19ORF5)调节自噬活性与结直肠癌恶性程度和紫杉醇化疗敏感性的关系。方法选取哈尔滨医科大学附属第二医院2015—2017年141例结直肠癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织,采用免疫组织化学法和实时定量聚合酶链反应法检测C19ORF5蛋白和mRNA的表达情况,探讨C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌恶性程度的相关性。141例患者均行术后化疗,91例采用常规化疗方案(卡培他滨联合奥沙利铂,常规化疗组),50例采用常规方案联合紫杉醇化疗(紫杉醇组),两组均治疗6个疗程。结果癌组织在透射电镜下可见自噬体,C19ORF5蛋白为淡黄色至棕褐色颗粒,表达于细胞质;癌组织C19ORF5蛋白染色强度明显强于正常组织,且Ⅱ期染色强度明显高于Ⅳ期。Ⅰ~Ⅱ期患者C19ORF5蛋白高表达率明显高于Ⅲ~Ⅳ期患者[83.3%(25/30)比17.1%(19/111)],差异有统计学意义(P<0.01)。癌组织C19ORF5 mRNA表达水平明显高于正常组织(1.17±0.45比0.82±0.29),差异有统计学意义(P<0.05)。癌组织C19ORF5蛋白表达水平与肿瘤分期、癌胚抗原和肝转移有关(P<0.01或<0.05),癌组织C19ORF5蛋白表达水平与淋巴结转移无关(P>0.05)。常规化疗组91例患者中,有效70例(76.9%),无效21例(23.1%);紫杉醇组50例患者中,有效42例(84.0%),无效8例(16.0%),两组有效率比较差异无统计学意义(P>0.05)。在常规化疗组中,有效患者和无效患者化疗前癌组织与化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平比较差异均无统计学意义(P>0.05);有效患者与无效患者化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。在紫杉醇组中,有效患者化疗前癌组织C19ORF5蛋白表达水平明显高于化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平(0.9±0.3比0.5±0.2),有效患者化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平明显低于无效患者(0.5±0.2比0.8±0.2),差异有统计学意义(P<0.05)。结论C19ORF5蛋白的高表达可以提高结直肠癌组织的自噬活性;C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌的恶性程度呈负相关;C19ORF5蛋白可能通过增强自噬活性提高紫杉醇化疗的敏感性。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 自噬 药物疗法 19号染色体开放阅读框5 紫杉醇
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髓源性生长因子的研究进展 被引量:1
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作者 韦利穆 王灿 +1 位作者 董小英 富路 《心血管病学进展》 CAS 2018年第6期956-959,共4页
近年来,以细胞为基础治疗急性心肌梗死得到了广泛关注,研究表明以骨髓来源细胞进行治疗能够取得很好的疗效。对急性心肌梗死患者的骨髓细胞进行分析发现,由骨髓来源的单核细胞和巨噬细胞分泌的蛋白质在骨髓细胞治疗急性心肌梗死中起到... 近年来,以细胞为基础治疗急性心肌梗死得到了广泛关注,研究表明以骨髓来源细胞进行治疗能够取得很好的疗效。对急性心肌梗死患者的骨髓细胞进行分析发现,由骨髓来源的单核细胞和巨噬细胞分泌的蛋白质在骨髓细胞治疗急性心肌梗死中起到重要作用,这种蛋白质被命名为髓源性生长因子。研究发现髓源性生长因子具有增强血管内皮细胞增殖,促进血管生成,保护心肌细胞的作用,现主要对髓源性生长因子的研究进展进行阐述。 展开更多
关键词 髓源性生长因子 19号染色体开放阅读框10
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Expression of p27Kip1, A Cell Cycle Repressor Protein with Dual Roles for Both Cancer Prevention and Promotion, Is Regulated Primarily at the Level of Unusual p27Kip1 mRNA—A Short Concept Proposal 被引量:2
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作者 Isao Eto 《American Journal of Molecular Biology》 2018年第3期186-193,共8页
The p27Kip1 is a cell cycle repressor protein that regulates primarily the cell cycle transition from G1 to S phase and hence the DNA replication is in the S phase and cell division in the M phase. Expression of p27Ki... The p27Kip1 is a cell cycle repressor protein that regulates primarily the cell cycle transition from G1 to S phase and hence the DNA replication is in the S phase and cell division in the M phase. Expression of p27Kip1 protein has dual roles for both cancer prevention and promotion. For example, numerous nutritional and chemopreventive anti-cancer agents specifically increase the expression of p27Kip1 protein without directly affecting the expression of any other cell cycle regulatory proteins. On the other hand, pro-cancer agents (like glucose, insulin and other growth factors frequently seen in obesity and/or diabetes) specifically decrease the expression of p27Kip1 protein without directly affecting the expression of any other cell cycle regulatory proteins. Unlike expression of any other cell cycle regulatory proteins, expression of p27Kip1 protein is very unusual. The mRNA of p27Kip1 has a very long and unusual 5’-untranslated region (from -575 to -1 in human). It appears that the 5’-untranslated region of p27Kip1 mRNA forms two alternative secondary structures. One increases the expression of p27Kip1 protein when anti-cancer agents are added and another decrease the expression of p27K1p1 when pro-cancer agents are added. For this short concept proposal, Dr. Albert Einstein’s “visualized thought experiments (German: Gedanken experiment)” were used as a fundamental tool for understanding how either anti- or pro-cancer agents bring the primary structure of the 5’-untranslated region of p27Kip1 mRNA into two alternative secondary structures, thereby either increasing or decreasing, respectively, the translation initiation of p27Kip1 protein. 展开更多
关键词 P27KIP1 Cell Cycle Repressor Protein CANCER Prevention Anti-Cancer AGENTS CANCER PROMOTION Pro-Cancer AGENTS P27KIP1 MRNA 5-Prime-Untranslated Region Translation Initiation 5-Prime Cap Upstream open reading frame Internal Ribosome Entry Site
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Higher Concentrations of Glucose or Insulin Increase the Risk of Various Types of Cancer in Obesity or Type 2 Diabetes by Decreasing the Expression of p27Kip1, a Cell Cycle Repressor Protein 被引量:1
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作者 Isao Eto 《American Journal of Molecular Biology》 2020年第1期1-11,共11页
Research Aims: Obesity and type 2 diabetes are known to be associated with increased risk of various types of cancer. However, the molecular biological mechanism of how the risk of cancer is increased in obesity or ty... Research Aims: Obesity and type 2 diabetes are known to be associated with increased risk of various types of cancer. However, the molecular biological mechanism of how the risk of cancer is increased in obesity or type 2 diabetes is not known. The aim this research is to investigate if the decreased expression of p27Kip1, a cell cycle repressor protein, plays a central role in this mechanism. Research Methods, Previous Studies and Theoretical Backgrounds: It is well known that the expression of p27Kip1 is increased by numerous nutritional or chemopreventive anti-cancer agents. But it has never been known that the expression of p27Kip1 could be decreased, rather than increased, and the risk of cancer could be increased, rather than decreased. This problem was solved recently and this new analytical method was used in this study. Results: 1) The expression of p27Kip1 was indeed significantly decreased in human obese type 2 diabetic individuals relative to the lean normal controls. 2) The expression of p27Kip1 was also significantly decreased in genetically obese rodents relative to the lean normal controls. Additionally, in obese rodents, the concentrations of glucose or insulin were significantly increased relative to the lean normal controls. 3) Using human cells cultured in vitro it was found that the increased concentrations of glucose or insulin decrease the expression of p27Kip1. Conclusions: These results suggest that higher concentrations of glucose or insulin increase the risk of various types of cancer in obesity or type 2 diabetes by decreasing the expression of p27Kip1. 展开更多
关键词 OBESITY Type 2 Diabetes CANCER P27KIP1 MRNA Translation Initiation 5’-Untranslated Region (5’UTR) 5’-End Cap of P27KIP1 MRNA Upstream open reading frame (uORF) Internal RIBOSOME Entry Site (IRES)
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哺乳动物基因非翻译区开放阅读框架的分析
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作者 赵朝霞 李宏 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期583-588,共6页
在所分析的5’UTR序列中约19%的序列在阅读框1下含有AUG,约22%和24%的序列分别在阅读框2和阅读框3下含有AUG,而在3’UTR序列当中,无论是在哪个阅读框下,约71%含有AUG.这些AUG绝大多数都是以小ORF的形式出现的;分析小ORF序列以及与它们... 在所分析的5’UTR序列中约19%的序列在阅读框1下含有AUG,约22%和24%的序列分别在阅读框2和阅读框3下含有AUG,而在3’UTR序列当中,无论是在哪个阅读框下,约71%含有AUG.这些AUG绝大多数都是以小ORF的形式出现的;分析小ORF序列以及与它们相应的IC序列(阅读框间序列)长度,发现虽然3’UTR序列远远长于5’UTR序列,但是它们所包含的小ORF长度几乎没有差距,只是平均来说每一条3’UTR序列所包含的小ORF数量明显多于每一条5’UTR序列所包含的小ORF数量,而且dIC(下游阅读框间序列)比uIC(上游阅读框间序列)长很多,平均长50个碱基;第二类IC序列(UTR区相邻的两个阅读框之间的序列)的平均长度比其它两类IC序列(UTR区最后一个阅读框之后的序列)的平均长度小,而且又含有相对较多的终止密码;比较uORF序列与dORF序列密码子使用偏好的CAI值发现,尽管相差不大,但是无论在哪个阅读框下,uORF序列的CAI值都显著高于dORF序列的CAI值. 展开更多
关键词 哺乳动物基因 5’UTR 3’UTR 上游阅读框 下游阅读框 阅读框间序列 统计分析
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Analysis of molecular variation in porcine reproductive and respiratory syndrome virus in China between 2007 and 2012 被引量:2
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作者 Yuhang Cao Hongsheng Ouyang +4 位作者 Mingjun Zhang Fuwang Chen Xin Yang Daxing Pang Linzhu Ren 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2014年第3期183-188,共6页
In the present study, 89 porcine reproductive and respiratory syndrome virus(PRRSV) isolates in China during 2007 to 2012 were randomly selected from the GenBank genetic sequence database. Evolutionary characteristics... In the present study, 89 porcine reproductive and respiratory syndrome virus(PRRSV) isolates in China during 2007 to 2012 were randomly selected from the GenBank genetic sequence database. Evolutionary characteristics of these isolates were analyzed based on the sequences of non-struc-tural protein 2(Nsp2) and glycoprotein 5(GP5). The genetic variations of the isolates were also compared with six representative strains. The results showed that a high degree of genetic diversity exists among the PRRSV population in China. Highly pathogenic PRRSV isolates, with a discon-tinuous deletion of a 30 amino acid residue in the Nsp2 region, remained the most dominant virus throughout 2007–2012 in China. Owing to the extensive use of representative vaccine strains, natu-ral recombination events occurred between strains. Three isolates – HH08, DY, and YN-2011 – were more closely related to vaccine strains than the other isolates. Both YN-2011 and DY were the evolu-tionary products of recombination events between strains SP and CH-1R. The results of the present study provide useful information for the epidemiology of PRRSV as well as for vaccine development. 展开更多
关键词 porcine reproductive and respiratory syndrome virus(PRRSV) open reading frame(ORF) non-structural protein 2(Nsp2) glycoprotein 5(GP5 recombination
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基于高通量数据分析DNA甲基化和拷贝数畸变对C1orf26基因表达的影响
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作者 赵小芳 杜欣娜 《吉林医学》 CAS 2020年第6期1289-1291,共3页
目的:揭示乳腺癌中1号染色体开放阅读框26(Chromosome 1 Open Reading Frame 26,C1orf26)DNA甲基化和拷贝数畸变对表达的影响。方法:利用癌症多组学和临床数据库LinkedOmics分析DNA甲基化和拷贝数畸变对乳腺癌组织中C1orf26基因表达的... 目的:揭示乳腺癌中1号染色体开放阅读框26(Chromosome 1 Open Reading Frame 26,C1orf26)DNA甲基化和拷贝数畸变对表达的影响。方法:利用癌症多组学和临床数据库LinkedOmics分析DNA甲基化和拷贝数畸变对乳腺癌组织中C1orf26基因表达的影响。结果:C1orf26 mRNA水平与其基因拷贝数变化拷贝数畸变正相关(P<0.01),而与其DNA甲基化水平负相关(P<0.01);且LinkedOmics分析结果显示乳腺癌中C1orf26 mRNA水平分别受到组织学类型、肿瘤纯度和患者种族影响(P<0.05、P<0.01、P<0.01)。结论:C1orf26基因拷贝数畸变和DNA甲基化水平影响其表达,C1orf26可作为乳腺癌预后的潜在标志物。 展开更多
关键词 乳腺癌 1号染色体开放阅读框26 基因变化 预后
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构建C5orf13基因慢病毒载体对SGC-7901细胞恶性生物学行为的影响
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作者 张高丽 刘立业 《中华实用诊断与治疗杂志》 2022年第7期662-666,共5页
目的构建5号染色体开放阅读框13(chromosome 5 open reading frame 13,C5orf13)基因siRNA慢病毒载体,探讨其对胃癌SGC-7901细胞增殖、迁移和侵袭的影响。方法针对人C5orf13基因设计3个不同的siRNA靶点,构建重组质粒,包装GV115慢病毒。... 目的构建5号染色体开放阅读框13(chromosome 5 open reading frame 13,C5orf13)基因siRNA慢病毒载体,探讨其对胃癌SGC-7901细胞增殖、迁移和侵袭的影响。方法针对人C5orf13基因设计3个不同的siRNA靶点,构建重组质粒,包装GV115慢病毒。取对数生长期SGC-7901细胞,分为KD1组、KD2组、KD3组和阴性对照组,前3组分别转染3个不同siRNA靶点的GV115慢病毒,阴性对照组转染阴性对照慢病毒。转染72 h,用嘌呤霉素筛选稳转细胞株,4组转染效率均>90%时,采用实时荧光定量PCR法检测4组细胞C5orf13 mRNA相对表达量,筛选出表达最低的KD2组细胞为C5orf13敲低组。取SGC-7901细胞为空白对照组。采用MTT实验检测空白对照组、阴性对照组、C5orf13敲低组转染后培养0、24、48、72、96 h时细胞增殖吸光度(optical density,OD)值,采用细胞划痕实验检测细胞迁移能力,采用Transwell小室实验检测细胞侵袭能力。结果KD1组(0.45±0.04)、KD2组(0.25±0.02)、KD3组(0.49±0.04)细胞C5orf13 mRNA相对表达量均低于阴性对照组(1.00±0.04)(P<0.05),KD1组、KD3组均高于KD2组(P<0.05),KD1组与KD3组比较差异无统计学意义(P>0.05)。空白对照组、阴性对照组、C5orf13敲低组转染后培养0 h时细胞增殖OD值比较差异无统计学意义(P>0.05);C5orf13敲低组转染后培养24、48、72、96 h时细胞增殖OD值(0.30±0.01、0.51±0.03、0.62±0.03、0.93±0.13)均低于空白对照组(0.36±0.03、0.64±0.03、0.81±0.04、1.39±0.10)和阴性对照组(0.36±0.02、0.63±0.02、0.79±0.05、1.30±0.07)(P<0.05),空白对照组与阴性对照组比较差异均无统计学意义(P>0.05)。C5orf13敲低组细胞迁移率[(0.24±0.01)%]及侵袭率[(3.07±0.13)%]均低于空白对照组[(0.41±0.05)%、(4.91±0.66)%]和阴性对照组[(0.38±0.03)%、(4.70±0.23)%](P<0.05),空白对照组与阴性对照组比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论构建的C5orf13基因siRNA慢病毒载体可明显下调SGC-7901细胞C5orf13表达,抑制SGC-7901细胞增殖、迁移及侵袭能力。 展开更多
关键词 胃癌 5号染色体开放阅读框13基因 慢病毒载体 SGC-7901细胞 细胞增殖 细胞迁移 细胞侵袭
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X染色体开放读码框架6在邻苯二甲酸二丁酯致雄性大鼠尿道下裂发生中的表达 被引量:1
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作者 魏俊峰 周耀军 +2 位作者 王勇 张力峰 张炜 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期709-710,共2页
目的观察x染色体开放读码框架6(CXorf6)在邻苯二甲酸二丁酯(DBP)致大鼠尿道下裂发生中的作用。方法于妊娠14—18d(GD24~18)实验和对照组各10只孕鼠分别给予DBP800mg/(kg·d)和豆油2ml/d灌胃,GDl9剖宫产统计尿道下裂发... 目的观察x染色体开放读码框架6(CXorf6)在邻苯二甲酸二丁酯(DBP)致大鼠尿道下裂发生中的作用。方法于妊娠14—18d(GD24~18)实验和对照组各10只孕鼠分别给予DBP800mg/(kg·d)和豆油2ml/d灌胃,GDl9剖宫产统计尿道下裂发生率,免疫印迹法和免疫组织化学法分析两组子鼠睾丸中CXorf6的表达。结果尿道下裂仅实验组发生,发生率为40.7%;CXorf6在尿道下裂组的相对表达量为0.323±0.014(n=10),对照组为0.706±0.016(n=10),差异有统计学意义(P〈0.05);CXorf6主要定位于睾丸间质和支持细胞,尿道下裂组CXorf6着色细胞数量减少,染色强度弱于对照组。结论DBP通过干预CXorf6的表达以影响睾丸的发育及雄激素的产生而导致尿道下裂的发生。 展开更多
关键词 X染色体开放读码框架6 邻苯二甲酸二丁酯 尿道下裂 睾丸
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新型分子标记物对甲状腺滤泡型肿瘤良恶性的鉴别诊断 被引量:6
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作者 张久丹 熊金华 王坚 《中华内分泌代谢杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1018-1020,共3页
收集29例甲状腺结节组织标本,提取总RNA,分别进行RT-PCR在核酸水平上检测所取甲状腺组织中4种目的基因C10rf24、DDIT3、HMGA2、TFF3的表达水平。与正常甲状腺组织相比,C10rt24mRNA在滤状腺瘤中的表达下调,在滤泡状癌中的表达上调;D... 收集29例甲状腺结节组织标本,提取总RNA,分别进行RT-PCR在核酸水平上检测所取甲状腺组织中4种目的基因C10rf24、DDIT3、HMGA2、TFF3的表达水平。与正常甲状腺组织相比,C10rt24mRNA在滤状腺瘤中的表达下调,在滤泡状癌中的表达上调;DDIT3和HMGA2mRNA在滤泡状腺瘤和滤泡状癌中的表达均上调,且在滤泡状癌中的表达高于滤泡状腺瘤:TFF3mRNA在滤泡状癌和滤泡状腺瘤中均下调。甲状腺肿瘤组织中C10rt24、DDIT3、HMGA2、TFF3对甲状腺滤泡状癌和滤泡状腺瘤的鉴别有一定价值. 展开更多
关键词 甲状腺滤泡状癌 染色体1开放读码框24 DNA损伤诱导转录物3 高迁移率族蛋白A2 肠三叶因子
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