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C12ORF66对MYCN扩增的高危神经母细胞瘤细胞的活性调控
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作者 贾安娜 战世佳 +4 位作者 张璇 郭金鑫 于永波 郭永丽 常艳 《基础医学与临床》 2024年第3期288-294,共7页
目的探究12号染色体开放阅读框66(C12ORF66)对MYCN扩增神经母细胞瘤(NB)细胞系活性的调控效应。方法通过R2数据库GSE16476和GSE49710数据集,分析MYCN扩增和MYCN非扩增NB细胞中C12ORF66表达量,以及C12ORF66表达量与患儿预后的相关性。RT-... 目的探究12号染色体开放阅读框66(C12ORF66)对MYCN扩增神经母细胞瘤(NB)细胞系活性的调控效应。方法通过R2数据库GSE16476和GSE49710数据集,分析MYCN扩增和MYCN非扩增NB细胞中C12ORF66表达量,以及C12ORF66表达量与患儿预后的相关性。RT-qRCR检测正常组织永生化细胞系、MYCN扩增及MYCN非扩增细胞系中C12ORF66 mRNA表达差异。构建瞬时敲低和稳定敲低C12ORF66的MYCN扩增细胞株,对照组和敲低组细胞进行实时无标记动态细胞分析(RTCA)、集落形成能力检测及Ki67免疫荧光染色。结果R2数据库分析显示MYCN扩增NB患儿样本中C12ORF66表达显著高于MYCN非扩增NB患儿样本,并且C12ORF66表达与患儿预后负相关(P<0.05)。细胞实验表明,与MYCN非扩增细胞系CHLA-255和SH-SY5Y相比,C12ORF66在MYCN扩增细胞系BE(2)-C和SK-N-BE(2)中表达显著升高(P<0.001)。瞬时或稳定敲低C12ORF66,MYCN扩增NB细胞增殖显著减缓(P<0.001),集落形成能力显著降低(P<0.001),Ki67阳性细胞比例显著减少(P<0.05)。结论C12ORF66在MYCN扩增NB患儿样本和细胞系中高表达,且与患儿预后负相关,敲低C12ORF66显著抑制NB细胞活性。 展开更多
关键词 12号染色体开放阅读框66 SK-N-BE(2)细胞 MYCN扩增 细胞增殖
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HHV-8 ORF50启动子区序列分离、鉴定及在293细胞中启动活性分析 被引量:3
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作者 卢春 黄丽 +1 位作者 曾怡 徐亚林 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期523-526,共4页
目的:分离和鉴定人类疱疹病毒8型(HHV-8)ORF50基因上游启动子区序列,评价其在293细胞中启动活性。方法:以佛波酯(TPA)刺激的BCBL-1细胞总DNA为模板,PCR扩增HHV-8 ORF50启动子区序列,克隆进pGL-3基本载体中虫荧光素酶(Luciferase)报告基... 目的:分离和鉴定人类疱疹病毒8型(HHV-8)ORF50基因上游启动子区序列,评价其在293细胞中启动活性。方法:以佛波酯(TPA)刺激的BCBL-1细胞总DNA为模板,PCR扩增HHV-8 ORF50启动子区序列,克隆进pGL-3基本载体中虫荧光素酶(Luciferase)报告基因上游多克隆位点,分别构建含正反双向ORF50启动子重组报告质粒,并分别转染293细胞,作Lu-ciferase活性检测,计算相对Luciferase活性单位(RLU)。结果:①克隆的HHV-8 ORF50启动子区序列长655碱基(bp),含多个潜在推测AP1、SP1和ERE等转录因子结合序列;②ORF50启动子与正常pGL-3基本载体相比,其RLU增加了26.3倍;③TPA刺激后ORF50启动子与刺激前相比启动活性增加了4.1倍。结论:HHV-8 ORF50启动子区序列在293细胞中具有较强的启动活性;TPA可以作为一有效的阳性对照刺激物用于进一步鉴定ORF50启动子特性。 展开更多
关键词 人类疱疹病毒8 ORF50启动子 启动子活性
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人类疱疹病毒8型k12/T0.7基因亚型与Kaposi肉瘤的相关性研究 被引量:1
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作者 关灿彬 张德志 +3 位作者 吴秀娟 李婷婷 李幸丽 普雄明 《现代肿瘤医学》 CAS 2013年第9期2092-2095,共4页
目的:了解Kaposi肉瘤患者所感染的疱疹病毒8型(HHV-8)k12/T0.7基因亚型分类,初步探索k12/T0.7基因亚型与Kaposi肉瘤不同临床分型的相关性。方法:对30例病理诊断明确的Kaposi肉瘤石蜡包埋组织进行HHV-8 DNA提取、k12/T0.7基因扩增、双向... 目的:了解Kaposi肉瘤患者所感染的疱疹病毒8型(HHV-8)k12/T0.7基因亚型分类,初步探索k12/T0.7基因亚型与Kaposi肉瘤不同临床分型的相关性。方法:对30例病理诊断明确的Kaposi肉瘤石蜡包埋组织进行HHV-8 DNA提取、k12/T0.7基因扩增、双向测序。使用DNAMAN软件、ClustalW软件和PHYLIP软件包对测序结果进行系统发生学分析,确定HHV-8 k12/T0.7基因亚型。最后用Fisher确切概率法对结果进行统计学分析。结果:30例Kaposi肉瘤中有22例HHV-8阳性,阳性率为73.33%,其中7例艾滋病相关型患者HHV-8均阳性。30例HHV-8阳性患者中,10例为HHV-8 k12 A亚型,12例为A/C亚型。Kaposi肉瘤患者不同亚型间有无黏膜损害及临床分型的分布差异均无统计学意义(P>0.05)。结论:Kaposi肉瘤患者感染HHV-8 k12亚型以A亚型和A/C亚型为主,不同亚型与临床分型无关。 展开更多
关键词 卡波西肉瘤 疱疹病毒8 人类 开放阅读框架 K12 T0 7基因型
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大黄鱼gdf-8Ⅱ开放阅读框序列克隆及分析 被引量:1
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作者 孙升 薛良义 童丽娟 《宁波大学学报(理工版)》 CAS 2009年第1期39-43,共5页
GDF-8是动物肌肉发育和生长过程中的负调控因子,对gdf-8的研究将有助于促进重要养殖鱼类大黄鱼的遗传育种.在已克隆大黄鱼gdf-8 Ⅰ的基础上,采用同源克隆策略,首次克隆了2 357 bp的大黄鱼gdf-8 Ⅱ开放阅读框序列(ORF),它由3个外显子、2... GDF-8是动物肌肉发育和生长过程中的负调控因子,对gdf-8的研究将有助于促进重要养殖鱼类大黄鱼的遗传育种.在已克隆大黄鱼gdf-8 Ⅰ的基础上,采用同源克隆策略,首次克隆了2 357 bp的大黄鱼gdf-8 Ⅱ开放阅读框序列(ORF),它由3个外显子、2个内含子组成,编码359个氨基酸,其中外显子Ⅲ与大黄鱼gdf-8 Ⅰ的外显子Ⅲ序列相似度较高,这提示外显子Ⅲ受到了高度的进化限制及其功能的重要性.基于gdf-8推导的氨基酸序列构建的系统树显示鱼类的gdf-8 Ⅱ是与gdf-8 Ⅰ不同的基因,有必要对gdf-8 Ⅱ基因进行进一步的研究. 展开更多
关键词 大黄鱼 gdf-8 开放阅读框 克隆
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钙黏蛋白家族成员3及11号染色体开放阅读框30基因多态性与支气管哮喘病儿易感性及糖皮质激素疗效的研究
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作者 吴彩云 凌娟 王晓丽 《安徽医药》 CAS 2024年第6期1226-1231,共6页
目的探讨钙黏蛋白家族成员3(CDHR3)及11号染色体开放阅读框30(C11orf30,EMSY)基因多态性与支气管哮喘病儿易感性及糖皮质激素疗效。方法前瞻性选取2020年5月至2021年10月于泰州市第二人民医院就诊的支气管哮喘病儿132例作为易感组。均... 目的探讨钙黏蛋白家族成员3(CDHR3)及11号染色体开放阅读框30(C11orf30,EMSY)基因多态性与支气管哮喘病儿易感性及糖皮质激素疗效。方法前瞻性选取2020年5月至2021年10月于泰州市第二人民医院就诊的支气管哮喘病儿132例作为易感组。均接受糖皮质激素吸入治疗,并根据疗效分为疗效良好组和疗效不良组。选取同期体检的48例儿童作为对照组,采用倾向性匹配方法对易感组和对照组性别、年龄等基线资料进行匹配;采用PCR检测CDHR3及EMSY基因的单核苷酸多态性,计算其基因型频率和等位基因频率,基因位点的多态性与儿童支气管哮喘易感风险间的关系采用多因素logistic回归分析。对比疗效良好组和疗效不良组不同基因型分布。结果易感组和对照组经倾向性评分匹配后有36组配对成功(每组36例),匹配后基线资料对比差异无统计学意义(P>0.05)。匹配后易感组和对照组CDHR3基因rs6967330位点、EMSY基因rs12278256位点基因型频率及A等位基因频率比较差异有统计学意义(P<0.05)。多因素logistic回归分析显示:EMSY基因rs12278256位点AA基因型[OR=9.91,95%CI:(1.02,96.65)]、CDHR3基因rs6967330位点AA基因型[OR=10.09,95%CI:(1.08,94.02)]是支气管哮喘易感的危险因素(均P<0.05)。治疗12周后,24例(66.67%)为疗效良好组,其余12例(33.33%)归为疗效不佳组,两组CDHR3基因rs6967330位点基因型分布对比差异无统计学意义(P>0.05);两组EMSY基因rs12278256位点基因型分布对比差异有统计学意义(P<0.05),其中疗效良好组AA基因型分布频率[37.50%(9/24)]明显高于疗效不良组[0(0/12)](P<0.05)。结论CDHR3基因rs3847076位点以及EMSY基因rs12278256位点与儿童支气管哮喘易感有关,EMSY基因rs12278256位点与糖皮质激素治疗疗效相关。 展开更多
关键词 哮喘 钙黏蛋白家族成员3 11号染色体开放阅读框30 基因多态性 糖皮质激素 倾向性评分匹配
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基于生物信息数据分析C12ORF49在乳腺癌中的表达及其意义
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作者 马强 李慧娟 吕运成 《华夏医学》 CAS 2024年第2期103-110,共8页
目的通过在线数据库分析12号染色体开放阅读框49(C12ORF49)在乳腺癌中的表达情况、临床意义及互作蛋白功能,为乳腺癌防治和预后预测提供新思路。方法使用Oncomine数据库及人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析C12ORF49基因和蛋白在乳腺癌不同... 目的通过在线数据库分析12号染色体开放阅读框49(C12ORF49)在乳腺癌中的表达情况、临床意义及互作蛋白功能,为乳腺癌防治和预后预测提供新思路。方法使用Oncomine数据库及人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析C12ORF49基因和蛋白在乳腺癌不同组织中的表达差异性,然后应用Kaplan-Meier Plotter数据库分析C12ORF49表达水平与不同病理特征乳腺癌患者预后的相关性,最后利用STRING数据库绘制C12ORF49互相作用蛋白网络图,并通过KOBAS生物分析平台进行KEGG功能富集分析。结果乳腺癌中C12ORF49的表达高于正常组织,乳腺癌C12ORF49 mRNA高表达患者的总生存时间(OS)及无远处转移生存时间(DMFS)更短,差异有统计学意义(P<0.05);C12ORF49可预测luminal B型乳腺癌患者的不良DMFS预后(P<0.05);C12ORF49对乳腺癌不良DMFS预后的影响可能独立于乳腺癌受体表达状态。C12ORF49可能通过NF-κB信号通路、TCR信号通路、血小板激活等生理过程(P<0.01,Corrected-P<0.01),促进乳腺癌进展。结论C12ORF49在乳腺癌组织中表达上调,其高表达水平对预测乳腺癌患者不良预后有重要意义,需进一步深入研究。 展开更多
关键词 12号染色体开放阅读框49 乳腺癌 生物信息学
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19号染色体开放阅读框5蛋白调节自噬活性与结直肠癌恶性程度的关系 被引量:2
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作者 李胜龙 闫炳文 +3 位作者 王春敬 王明宇 乔鹏飞 王夫景 《癌症进展》 2020年第16期1664-1667,共4页
目的探讨19号染色体开放阅读框5(C19ORF5)蛋白在结直肠癌组织中的表达情况,分析C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌恶性程度的关系。方法收集141例结直肠癌患者的结直肠癌组织和癌旁正常组织,分别采用免疫组织化学染色方法和实时定量聚... 目的探讨19号染色体开放阅读框5(C19ORF5)蛋白在结直肠癌组织中的表达情况,分析C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌恶性程度的关系。方法收集141例结直肠癌患者的结直肠癌组织和癌旁正常组织,分别采用免疫组织化学染色方法和实时定量聚合酶链反应(PCR)检测两种组织中C19ORF5蛋白和mRNA表达情况,在电镜下观察组织的超微结构,分析C19ORF5蛋白对自噬活性的调节作用,比较不同临床特征结直肠癌患者结直肠癌组织中C19ORF5蛋白的表达情况。结果结直肠癌组织中C19ORF5蛋白的染色强度明显高于癌旁正常组织,Ⅰ/Ⅱ期结直肠癌组织中C19ORF5蛋白的染色强度明显高于Ⅲ/Ⅳ期结直肠癌组织,Ⅰ/Ⅱ期结直肠癌组织的自噬活性较高,Ⅲ/Ⅳ期结直肠癌组织的自噬活性较低。结直肠癌组织中C19ORF5 mRNA的表达水平明显高于癌旁正常组织,差异有统计学意义(P﹤0.01)。TNM分期为Ⅰ~Ⅱ期、癌胚抗原(CEA)升高、无肝转移结直肠癌患者结直肠癌组织中C19ORF5蛋白的高表达率分别高于TNM分期为Ⅲ~Ⅳ期、CEA正常、有肝转移的患者,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。结论在结直肠癌组织中,高表达的C19ORF5蛋白可增加肿瘤细胞的自噬活性,增加基因的稳定性,降低肿瘤的恶性程度。C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌的恶性程度呈负相关,C19ORF5可能是一种重要的抑癌基因。 展开更多
关键词 结直肠癌 19号染色体开放阅读框5 自噬
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髓源性生长因子的研究进展 被引量:1
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作者 韦利穆 王灿 +1 位作者 董小英 富路 《心血管病学进展》 CAS 2018年第6期956-959,共4页
近年来,以细胞为基础治疗急性心肌梗死得到了广泛关注,研究表明以骨髓来源细胞进行治疗能够取得很好的疗效。对急性心肌梗死患者的骨髓细胞进行分析发现,由骨髓来源的单核细胞和巨噬细胞分泌的蛋白质在骨髓细胞治疗急性心肌梗死中起到... 近年来,以细胞为基础治疗急性心肌梗死得到了广泛关注,研究表明以骨髓来源细胞进行治疗能够取得很好的疗效。对急性心肌梗死患者的骨髓细胞进行分析发现,由骨髓来源的单核细胞和巨噬细胞分泌的蛋白质在骨髓细胞治疗急性心肌梗死中起到重要作用,这种蛋白质被命名为髓源性生长因子。研究发现髓源性生长因子具有增强血管内皮细胞增殖,促进血管生成,保护心肌细胞的作用,现主要对髓源性生长因子的研究进展进行阐述。 展开更多
关键词 髓源性生长因子 19号染色体开放阅读框10
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C5orf34在非小细胞肺癌中的表达及预后分析 被引量:1
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作者 徐克明 冉安鹏 何丹 《新疆医科大学学报》 CAS 2020年第12期1561-1566,共6页
目的探讨5号染色体开放阅读框架34(chromosome 5 open reading frame 34,C5orf34)基因在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达情况及对手术患者预后的影响。方法对135例接受手术治疗的非小细胞肺癌患者的肿瘤及正常... 目的探讨5号染色体开放阅读框架34(chromosome 5 open reading frame 34,C5orf34)基因在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达情况及对手术患者预后的影响。方法对135例接受手术治疗的非小细胞肺癌患者的肿瘤及正常组织行免疫组织化学染色,通过Hscore评分标准对C5orf34基因表达进行分界,分析C5orf34基因的表达对癌组织的组织学分级、肿瘤大小和T分期的关系以及对术后患者无病生存期(disease-free survival,DFS)的影响。结果癌组织中的C5orf34基因表达显著高于正常肺组织(P<0.001);病理分期Ⅱ-Ⅲ期以及T2~T4的患者中C5orf34的阳性率显著高于病理分期I期以及T1的患者(P=0.012,0.002,0.012);C5orf34阳性患者的DFS显著低于C5orf34阴性患者(P=0.003),是影响DFS的重要因素。结论C5orf34是影响非小细胞肺癌无瘤生存预后的重要因素,尤其是在进展期肺癌中C5orf34阳性的患者更容易复发和转移;C5orf34可作为预测进展期非小细胞肺癌预后新指标。 展开更多
关键词 C5orf34 非小细胞肺癌 预后
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乳腺癌中靶向抑制C8orf33基因表达的miRNA预测和验证的研究 被引量:1
10
作者 庄莹 樊伟平 +2 位作者 赵小芳 凌存保 杜欣娜 《重庆医学》 CAS 2020年第1期137-142,共6页
目的预测并初步验证乳腺癌中靶向抑制8号染色体开放阅读框33(C8orf33)基因表达的微小RNA(miRNA)。方法使用癌症基因组图谱(TCGA)高通量数据进行泛癌症分析,首次发现包括乳腺癌在内的多种肿瘤组织中C8orf33基因较正常组织高表达,使用该... 目的预测并初步验证乳腺癌中靶向抑制8号染色体开放阅读框33(C8orf33)基因表达的微小RNA(miRNA)。方法使用癌症基因组图谱(TCGA)高通量数据进行泛癌症分析,首次发现包括乳腺癌在内的多种肿瘤组织中C8orf33基因较正常组织高表达,使用该数据库进一步分析发现C8orf33基因在不同肿瘤组织中表达也有差异性。使用Oncomine对上述结果进行验证,Oncomine分析结果与TCGA高通量数据分析结果相一致。进一步通过starBase V2.0中PITA、clipExpNum和miRmap 3种软件预测可靶向抑制C8orf33基因表达的miRNA,分析结果取交集。使用TCGA RNAseq数据库对分析交集结果进行验证,进一步确定miRNA与C8orf33基因表达的相关性。结果TCGA数据分析结果发现C8orf33基因在膀胱癌、乳腺癌、卵巢癌和肺鳞癌组织中表达水平均高于正常组织。Oncomine验证结果发现C8orf33基因在包括乳腺癌在内的多种肿瘤组织中表达水平与正常组织不同,且在多种肿瘤组织中表达水平有差异。PITA、clipExpNum和miRmap软件进行预测并取交集获得9个miRNA,分别为:hsa-miR-370、hsa-miR-501、hsa-miR-502、hsa-miR-6131、hsa-miR-1294、hsa-miR-206、hsa-miR-328、hsa-miR-1321和hsa-miR-1-2。使用LinkedOmics网站访问TCGA数据库,分别验证预测所得的9个miRNA在乳腺癌组织中与C8orf33基因表达的相关性。分析结果发现hsa-miR-370与C8orf33基因表达呈负相关(r=-0.124,P=0.026)、hsa-miR-1294与C8orf33基因表达呈负相关(r=-0.116,P=0.001)、hsa-miR-1-2与C8orf33基因表达呈负相关(r=-0.108,P=0.003),其余miRNA与C8orf33基因表达均无相关性。结论乳腺癌中hsa-miR-370、hsa-miR-1294和hsa-miR-1-2具有潜在靶向抑制C8orf33基因表达的功能,可为乳腺癌诊断治疗提供新思路。 展开更多
关键词 高通量数据 8号染色体开放阅读框33 微小RNA 乳腺肿瘤
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C19ORF12对胃癌MKN45细胞增殖和化疗药敏感性的影响及其机制
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作者 杨颖 赵伟 吕丹 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期687-693,共7页
目的:探讨19号染色体开放读码框12(C19ORF12)对胃癌MKN45细胞增殖和化疗药物敏感性的影响,并阐明其作用机制。方法:将胃癌MKN45细胞分为对照组和C19ORF12组。CCK-8法检测2组胃癌MKN45细胞的增殖活性,克隆形成实验检测2组胃癌MKN45细胞... 目的:探讨19号染色体开放读码框12(C19ORF12)对胃癌MKN45细胞增殖和化疗药物敏感性的影响,并阐明其作用机制。方法:将胃癌MKN45细胞分为对照组和C19ORF12组。CCK-8法检测2组胃癌MKN45细胞的增殖活性,克隆形成实验检测2组胃癌MKN45细胞克隆形成数,CCK-8法检测加入化疗药物阿霉素或过氧化氢(H2O2)后2各组胃癌MKN45细胞存活率,流式细胞术检测2组胃癌MKN45细胞凋亡率,激光共聚焦显微镜技术检测C19ORF12在胃癌MKN45细胞中的亚细胞定位,GEPIA分析癌症基因组图谱(TCGA)中C19ORF12 mRNA在正常胃组织和胃癌组织中的表达差异,KM-plot回顾性分析不同表达水平C19ORF12对胃癌患者预后的影响。结果:与对照组比较,C19ORF12组胃癌MKN45细胞增殖活性明显升高(P<0.05),克隆形成数升高(P<0.01)。阿霉素或H2O2作用后,与对照组比较,C19ORF12组胃癌MKN45细胞存活率升高(P<0.05或P<0.01),细胞凋亡率降低(P<0.01)。激光共聚焦显微镜下,C19ORF12主要定位于胃癌MKN45细胞的线粒体中。与正常胃组织比较,胃癌组织中C19ORF12 mRNA表达水平明显升高(P<0.01)。与低表达C19ORF12的胃癌患者比较,高表达C19ORF12的胃癌患者总体生存期明显缩短(P<0.01)。结论:C19ORF12能够促进胃癌细胞的增殖,并且降低胃癌细胞对化疗药物的敏感性。C19ORF12可以作为肿瘤治疗的潜在靶标。 展开更多
关键词 C19ORF12 胃肿瘤 细胞增殖 阿霉素 化疗药敏感性 活性氧
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基于高通量数据分析DNA甲基化和拷贝数畸变对C1orf26基因表达的影响
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作者 赵小芳 杜欣娜 《吉林医学》 CAS 2020年第6期1289-1291,共3页
目的:揭示乳腺癌中1号染色体开放阅读框26(Chromosome 1 Open Reading Frame 26,C1orf26)DNA甲基化和拷贝数畸变对表达的影响。方法:利用癌症多组学和临床数据库LinkedOmics分析DNA甲基化和拷贝数畸变对乳腺癌组织中C1orf26基因表达的... 目的:揭示乳腺癌中1号染色体开放阅读框26(Chromosome 1 Open Reading Frame 26,C1orf26)DNA甲基化和拷贝数畸变对表达的影响。方法:利用癌症多组学和临床数据库LinkedOmics分析DNA甲基化和拷贝数畸变对乳腺癌组织中C1orf26基因表达的影响。结果:C1orf26 mRNA水平与其基因拷贝数变化拷贝数畸变正相关(P<0.01),而与其DNA甲基化水平负相关(P<0.01);且LinkedOmics分析结果显示乳腺癌中C1orf26 mRNA水平分别受到组织学类型、肿瘤纯度和患者种族影响(P<0.05、P<0.01、P<0.01)。结论:C1orf26基因拷贝数畸变和DNA甲基化水平影响其表达,C1orf26可作为乳腺癌预后的潜在标志物。 展开更多
关键词 乳腺癌 1号染色体开放阅读框26 基因变化 预后
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X染色体开放读码框架6在邻苯二甲酸二丁酯致雄性大鼠尿道下裂发生中的表达 被引量:1
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作者 魏俊峰 周耀军 +2 位作者 王勇 张力峰 张炜 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期709-710,共2页
目的观察x染色体开放读码框架6(CXorf6)在邻苯二甲酸二丁酯(DBP)致大鼠尿道下裂发生中的作用。方法于妊娠14—18d(GD24~18)实验和对照组各10只孕鼠分别给予DBP800mg/(kg·d)和豆油2ml/d灌胃,GDl9剖宫产统计尿道下裂发... 目的观察x染色体开放读码框架6(CXorf6)在邻苯二甲酸二丁酯(DBP)致大鼠尿道下裂发生中的作用。方法于妊娠14—18d(GD24~18)实验和对照组各10只孕鼠分别给予DBP800mg/(kg·d)和豆油2ml/d灌胃,GDl9剖宫产统计尿道下裂发生率,免疫印迹法和免疫组织化学法分析两组子鼠睾丸中CXorf6的表达。结果尿道下裂仅实验组发生,发生率为40.7%;CXorf6在尿道下裂组的相对表达量为0.323±0.014(n=10),对照组为0.706±0.016(n=10),差异有统计学意义(P〈0.05);CXorf6主要定位于睾丸间质和支持细胞,尿道下裂组CXorf6着色细胞数量减少,染色强度弱于对照组。结论DBP通过干预CXorf6的表达以影响睾丸的发育及雄激素的产生而导致尿道下裂的发生。 展开更多
关键词 X染色体开放读码框架6 邻苯二甲酸二丁酯 尿道下裂 睾丸
原文传递
新型分子标记物对甲状腺滤泡型肿瘤良恶性的鉴别诊断 被引量:6
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作者 张久丹 熊金华 王坚 《中华内分泌代谢杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1018-1020,共3页
收集29例甲状腺结节组织标本,提取总RNA,分别进行RT-PCR在核酸水平上检测所取甲状腺组织中4种目的基因C10rf24、DDIT3、HMGA2、TFF3的表达水平。与正常甲状腺组织相比,C10rt24mRNA在滤状腺瘤中的表达下调,在滤泡状癌中的表达上调;D... 收集29例甲状腺结节组织标本,提取总RNA,分别进行RT-PCR在核酸水平上检测所取甲状腺组织中4种目的基因C10rf24、DDIT3、HMGA2、TFF3的表达水平。与正常甲状腺组织相比,C10rt24mRNA在滤状腺瘤中的表达下调,在滤泡状癌中的表达上调;DDIT3和HMGA2mRNA在滤泡状腺瘤和滤泡状癌中的表达均上调,且在滤泡状癌中的表达高于滤泡状腺瘤:TFF3mRNA在滤泡状癌和滤泡状腺瘤中均下调。甲状腺肿瘤组织中C10rt24、DDIT3、HMGA2、TFF3对甲状腺滤泡状癌和滤泡状腺瘤的鉴别有一定价值. 展开更多
关键词 甲状腺滤泡状癌 染色体1开放读码框24 DNA损伤诱导转录物3 高迁移率族蛋白A2 肠三叶因子
原文传递
应用多重实时荧光PCR方法检测副溶血性弧菌及其毒力基因 被引量:7
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作者 林雪 陈泽辉 +1 位作者 翁琴云 张建梅 《中国卫生检验杂志》 CAS 2015年第6期870-872,共3页
目的应用多重实时荧光PCR方法检测113株食物中毒副溶血性弧菌分离株多种毒力基因携带情况。方法用水煮法提取菌株DNA后,利用四重实时荧光PCR方法对DNA同时进行4种基因的检测。结果所有的菌株均携带tlh基因,96株菌株(84.96%)携带tdh基... 目的应用多重实时荧光PCR方法检测113株食物中毒副溶血性弧菌分离株多种毒力基因携带情况。方法用水煮法提取菌株DNA后,利用四重实时荧光PCR方法对DNA同时进行4种基因的检测。结果所有的菌株均携带tlh基因,96株菌株(84.96%)携带tdh基因,9株菌株(7.96%)携带trh基因及62株菌株(54.87%)携带orf8基因的菌株同时tdh基因检测为阳性,无同时携带trh基因和orf8基因的菌株。trh、tdh基因和orf8基因阳性的菌株分布在O1-O4血清群。结论本市大部分食物中毒菌株携带除tlh基因外的1种或1种以上的毒力基因,一半以上的菌株为大流行株;四重实时荧光PCR方法可以同时鉴定和检测副溶血性弧菌及毒力基因,建议作为食源性暴发事件的常规检测方法,获得更快速、准确、完整的结果。 展开更多
关键词 荧光定量聚合酶链反应 副溶血性弧菌 食物中毒 不耐热直接溶血毒素基因 耐热直接溶血毒素基因 耐热直接溶血相关毒素基因 开放性读码框8
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19号染色体开放阅读框5调节自噬活性与结直肠癌恶性程度和紫杉醇化疗敏感性的关系 被引量:1
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作者 闫炳文 李胜龙 +2 位作者 王春敬 乔鹏飞 王夫景 《中国医师进修杂志》 2020年第5期439-443,共5页
目的观察19号染色体开放阅读框5(C19ORF5)调节自噬活性与结直肠癌恶性程度和紫杉醇化疗敏感性的关系。方法选取哈尔滨医科大学附属第二医院2015—2017年141例结直肠癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织,采用免疫组织化学法和实时定量聚合酶... 目的观察19号染色体开放阅读框5(C19ORF5)调节自噬活性与结直肠癌恶性程度和紫杉醇化疗敏感性的关系。方法选取哈尔滨医科大学附属第二医院2015—2017年141例结直肠癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织,采用免疫组织化学法和实时定量聚合酶链反应法检测C19ORF5蛋白和mRNA的表达情况,探讨C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌恶性程度的相关性。141例患者均行术后化疗,91例采用常规化疗方案(卡培他滨联合奥沙利铂,常规化疗组),50例采用常规方案联合紫杉醇化疗(紫杉醇组),两组均治疗6个疗程。结果癌组织在透射电镜下可见自噬体,C19ORF5蛋白为淡黄色至棕褐色颗粒,表达于细胞质;癌组织C19ORF5蛋白染色强度明显强于正常组织,且Ⅱ期染色强度明显高于Ⅳ期。Ⅰ~Ⅱ期患者C19ORF5蛋白高表达率明显高于Ⅲ~Ⅳ期患者[83.3%(25/30)比17.1%(19/111)],差异有统计学意义(P<0.01)。癌组织C19ORF5 mRNA表达水平明显高于正常组织(1.17±0.45比0.82±0.29),差异有统计学意义(P<0.05)。癌组织C19ORF5蛋白表达水平与肿瘤分期、癌胚抗原和肝转移有关(P<0.01或<0.05),癌组织C19ORF5蛋白表达水平与淋巴结转移无关(P>0.05)。常规化疗组91例患者中,有效70例(76.9%),无效21例(23.1%);紫杉醇组50例患者中,有效42例(84.0%),无效8例(16.0%),两组有效率比较差异无统计学意义(P>0.05)。在常规化疗组中,有效患者和无效患者化疗前癌组织与化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平比较差异均无统计学意义(P>0.05);有效患者与无效患者化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。在紫杉醇组中,有效患者化疗前癌组织C19ORF5蛋白表达水平明显高于化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平(0.9±0.3比0.5±0.2),有效患者化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平明显低于无效患者(0.5±0.2比0.8±0.2),差异有统计学意义(P<0.05)。结论C19ORF5蛋白的高表达可以提高结直肠癌组织的自噬活性;C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌的恶性程度呈负相关;C19ORF5蛋白可能通过增强自噬活性提高紫杉醇化疗的敏感性。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 自噬 药物疗法 19号染色体开放阅读框5 紫杉醇
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Optogenetic control of GGGGCC repeat-containing RNA phase transition 被引量:1
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作者 Xiong Li Shengyi Lu +1 位作者 Boxun Lu Xiaoli Sun 《Fundamental Research》 CAS 2022年第6期843-850,共8页
The GGGGCC(G_(4)C_(2))hexanucleotide repeat expansion in the C9ORF72 gene is a major cause of both hereditary amyotrophic lateral sclerosis and familial frontotemporal dementia.Recent studies have shown that G_(4)C_(2... The GGGGCC(G_(4)C_(2))hexanucleotide repeat expansion in the C9ORF72 gene is a major cause of both hereditary amyotrophic lateral sclerosis and familial frontotemporal dementia.Recent studies have shown that G_(4)C_(2)hexanucleotide repeat-containing RNA transcripts((G_(4)C_(2))_(n)RNA)could go through liquid-liquid phase separation to form RNA foci,which may elicit neurodegeneration.However,the direct causality between these abnormal RNA foci and neuronal toxicity remains to be demonstrated.Here we introduce an optogenetic control system that can induce the assembly and phase separation of(G_(4)C_(2))_(n)RNA foci with blue light illumination in human cells,by fusing a specific(G_(4)C_(2))_(n)RNA binding protein as the linker domain to Cry2,a protein that oligomerizes in response to blue light.Our results demonstrate that a higher number of G_(4)C_(2)repeats have the potential to be induced into more RNA foci in the cells.Both spontaneous and induced RNA foci display liquid-like properties according to FRAP measurements.Computational simulation shows strong consistency with the experimental results and supports the effect of our system to promote the propensity of(G_(4)C_(2))_(n)RNA towards phase separation.This system can thus be used to investigate whether(G_(4)C_(2))_(n)RNA foci would disrupt normal cellular processes and lead to pathological phenotypes relevant to repeat expansion disorders. 展开更多
关键词 RNA aggregates Liquid-liquid phase separation OPTOGENETICS chromosome 9 open reading frame 72(C9ORF72 )Amyotrophic lateral sclerosis
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构建C5orf13基因慢病毒载体对SGC-7901细胞恶性生物学行为的影响
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作者 张高丽 刘立业 《中华实用诊断与治疗杂志》 2022年第7期662-666,共5页
目的构建5号染色体开放阅读框13(chromosome 5 open reading frame 13,C5orf13)基因siRNA慢病毒载体,探讨其对胃癌SGC-7901细胞增殖、迁移和侵袭的影响。方法针对人C5orf13基因设计3个不同的siRNA靶点,构建重组质粒,包装GV115慢病毒。... 目的构建5号染色体开放阅读框13(chromosome 5 open reading frame 13,C5orf13)基因siRNA慢病毒载体,探讨其对胃癌SGC-7901细胞增殖、迁移和侵袭的影响。方法针对人C5orf13基因设计3个不同的siRNA靶点,构建重组质粒,包装GV115慢病毒。取对数生长期SGC-7901细胞,分为KD1组、KD2组、KD3组和阴性对照组,前3组分别转染3个不同siRNA靶点的GV115慢病毒,阴性对照组转染阴性对照慢病毒。转染72 h,用嘌呤霉素筛选稳转细胞株,4组转染效率均>90%时,采用实时荧光定量PCR法检测4组细胞C5orf13 mRNA相对表达量,筛选出表达最低的KD2组细胞为C5orf13敲低组。取SGC-7901细胞为空白对照组。采用MTT实验检测空白对照组、阴性对照组、C5orf13敲低组转染后培养0、24、48、72、96 h时细胞增殖吸光度(optical density,OD)值,采用细胞划痕实验检测细胞迁移能力,采用Transwell小室实验检测细胞侵袭能力。结果KD1组(0.45±0.04)、KD2组(0.25±0.02)、KD3组(0.49±0.04)细胞C5orf13 mRNA相对表达量均低于阴性对照组(1.00±0.04)(P<0.05),KD1组、KD3组均高于KD2组(P<0.05),KD1组与KD3组比较差异无统计学意义(P>0.05)。空白对照组、阴性对照组、C5orf13敲低组转染后培养0 h时细胞增殖OD值比较差异无统计学意义(P>0.05);C5orf13敲低组转染后培养24、48、72、96 h时细胞增殖OD值(0.30±0.01、0.51±0.03、0.62±0.03、0.93±0.13)均低于空白对照组(0.36±0.03、0.64±0.03、0.81±0.04、1.39±0.10)和阴性对照组(0.36±0.02、0.63±0.02、0.79±0.05、1.30±0.07)(P<0.05),空白对照组与阴性对照组比较差异均无统计学意义(P>0.05)。C5orf13敲低组细胞迁移率[(0.24±0.01)%]及侵袭率[(3.07±0.13)%]均低于空白对照组[(0.41±0.05)%、(4.91±0.66)%]和阴性对照组[(0.38±0.03)%、(4.70±0.23)%](P<0.05),空白对照组与阴性对照组比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论构建的C5orf13基因siRNA慢病毒载体可明显下调SGC-7901细胞C5orf13表达,抑制SGC-7901细胞增殖、迁移及侵袭能力。 展开更多
关键词 胃癌 5号染色体开放阅读框13基因 慢病毒载体 SGC-7901细胞 细胞增殖 细胞迁移 细胞侵袭
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2株新型冠状病毒全基因测序及插入和终止突变分析
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作者 韩淑琪 《预防医学论坛》 2022年第5期330-334,共5页
目的 分析2株新型冠状病毒基因进化变异情况及分子特征。方法 利用二代测序技术,对2份新型冠状病毒核酸检测阳性样本进行全基因组测序。利用生物信息学软件对基因序列进行分析。结果 获得长度分别为29 826 bp和29 837 bp的两条新型冠状... 目的 分析2株新型冠状病毒基因进化变异情况及分子特征。方法 利用二代测序技术,对2份新型冠状病毒核酸检测阳性样本进行全基因组测序。利用生物信息学软件对基因序列进行分析。结果 获得长度分别为29 826 bp和29 837 bp的两条新型冠状病毒全基因序列,与Wuhan-Hu-1株基因序列同源性分别为99.96%和99.97%。两条序列的N蛋白均发生S194L变异,N蛋白S194磷酸化位点和N192潜在糖基化位点消失。其中序列1的3 647~3 648 bp之间插入了CCCAC序列,导致非结构蛋白3(NSP3)发生移码突变,即编码一种新的无跨膜结构、含有完整泛素样结构域的NSP3Δ蛋白。序列2发生了C27978T突变,导致开放读码框8(ORF8)发生终止突变,即编码1个新的仅含28个氨基酸的截短型ORF8蛋白。结论 新型冠状病毒进化变异方式复杂多样,插入突变和终止突变可能改变相关蛋白的结构和性质,应加大新型冠状病毒的病原学监测力度。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 全基因组测序 突变 非结构蛋白3 开放读码框8
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