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2型糖尿病患者血浆中NETs标志物cfDNA,CitH3和MPO-DNA表达水平与视网膜病变程度相关性研究
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作者 王亚楠 朱晓楠 魏箐 《现代检验医学杂志》 CAS 2024年第6期79-83,共5页
目的探讨2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)患者血浆中性粒细胞外陷阱(neutrophil extracellular traps,NETs)标志物循环游离DNA(circulating free DNA,cfDNA)、髓过氧化物酶(myeloperoxidase,MPO)-DNA、瓜氨酸化组蛋白3(citrul... 目的探讨2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)患者血浆中性粒细胞外陷阱(neutrophil extracellular traps,NETs)标志物循环游离DNA(circulating free DNA,cfDNA)、髓过氧化物酶(myeloperoxidase,MPO)-DNA、瓜氨酸化组蛋白3(citrullinated histone 3,CitH3)表达水平与视网膜病变程度的相关性。方法选取2023年1~9月河南科技大学第一附属医院80例T2DM患者为研究对象,依据T2DM患者视网膜病变情况分为无糖尿病视网膜病变(non-diabetic retinopathy,NDR)组(n=30)、非增生型糖尿病视网膜病变(nonproliferative diabetic retinopathy,NPDR)组(n=26)和增生型糖尿病视网膜病变(proliferative diabetic retinopathy,PDR)组(n=24)。收集入选患者一般资料,检测血浆cfDNA,MPO-DNA及CitH3水平;采用Spearman相关性分析cfDNA,CitH3,MPO-DNA与T2DM患者视网膜病变严重程度的关系;ROC曲线分析cfDNA,CitH3,MPO-DNA及联合预测T2DM患者糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)发生的效能。结果NDR组、NPDR组和PDR组cfDNA(65.13±18.28,83.34±20.10,114.52±32.36ng/ml),CitH3(17.76±4.24,22.03±5.01,26.06±8.13 ng/ml),MPO-DNA(0.31±0.04,0.35±0.05,0.45±0.05)水平依次升高,差异具有统计学意义(F=28.755,13.335,62.470,均P<0.001);其中PDR组、NPDR组cfDNA,CitH3,MPO-DNA水平均高于NDR组(t=7.076,4.837,11.436;3.550,3.455,3.324),且PDR组cfDNA,CitH3,MPODNA水平高于NPDR组(t=4.127,2.128,7.065),差异具有统计学意义(均P<0.05)。Spearman相关性分析显示,cfDNA,CitH3,MPO-DNA与T2DM患者视网膜病变严重程度均呈正相关(r=0.659,0.470,0.744,均P<0.001)。ROC曲线显示,cfDNA,CitH3,MPO-DNA及联合检测曲线下面积[AUC(95%CI)]分别为0.846(0.758~0.934),0.776(0.674~0.878),0.847(0.764~0.930)和0.938(0.889~0.987),对于T2DM患者发生DR具有一定预测价值。结论DR患者血浆中NETs标志物cfDNA,MPO-DNA及CitH3水平升高,其水平与DR程度呈正相关,一定程度上可预测T2DM患者DR的发生情况,且联合预测价值最高。 展开更多
关键词 2型糖尿病 糖尿病视网膜病变 中性粒细胞外陷阱 循环游离dna 瓜氨酸化组蛋白3 髓过氧化物酶dna
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转移性结直肠癌cfDNA的早期动态变化与一线化疗疗效的相关性分析 被引量:1
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作者 孙子建 钟婕 +5 位作者 潘晓华 司理想 曹月鹏 陆建伟 杨柳 鲍军 《中国肿瘤外科杂志》 CAS 2023年第3期274-278,共5页
目的探讨转移性结直肠癌患者一线化疗期间循环游离DNA(cfDNA)的早期动态变化与一线化疗疗效及预后的相关性。方法纳入南京医科大学附属肿瘤医院2018年7月至2020年4月接受一线化疗的118例转移性结直肠癌患者,对其血浆中的cfDNA进行定量... 目的探讨转移性结直肠癌患者一线化疗期间循环游离DNA(cfDNA)的早期动态变化与一线化疗疗效及预后的相关性。方法纳入南京医科大学附属肿瘤医院2018年7月至2020年4月接受一线化疗的118例转移性结直肠癌患者,对其血浆中的cfDNA进行定量检测。分析患者的cfDNA基线水平与临床特征、cfDNA动态变化与无进展生存期(PFS)及治疗反应之间的相关性。结果患者的病理类型、有无肝转移、原发灶位置的不同分组间cfDNA水平差异有统计学意义(P<0.05)。而4周期化疗后cfDNA比值(化疗后cfDNA水平/cfDNA基线水平)≤1.215的患者PFS更长,客观缓解率(ORR)更高。通过多变量Cox回归分析,我们还发现一线化疗4周期后cfDNA比值是晚期结直肠癌患者一线化疗的独立预后因素。结论转移性结直肠癌cfDNA的基线水平与肿瘤侵袭性、肿瘤负荷相关,一线化疗期间cfDNA的早期动态变化可有效预测一线化疗疗效及预后。 展开更多
关键词 循环游离dna 转移性结直肠癌 一线化疗 化疗疗效 预后
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cfDNA浓度及完整性在癌症中的诊断及预后价值
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作者 应超 丁晖 蔡彦宁 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2023年第9期1185-1189,共5页
癌症在世界范围内是一个重大的公共健康问题,有效的早期干预以及疗效监视可以降低肿瘤患者的发生以及死亡风险。在多数癌症中,外周血循环游离DNA(Circulating cell⁃free DNA,cfDNA)浓度及其完整性可能是一类有效的早期诊断、进展期患者... 癌症在世界范围内是一个重大的公共健康问题,有效的早期干预以及疗效监视可以降低肿瘤患者的发生以及死亡风险。在多数癌症中,外周血循环游离DNA(Circulating cell⁃free DNA,cfDNA)浓度及其完整性可能是一类有效的早期诊断、进展期患者识别以及预后监测指标。本文旨在综述cfDNA浓度及其完整性在不同癌症中的诊疗效能,并与当前临床上常用的肿瘤标志物进行对比,探讨该指标在临床实践中的应用价值以及前景。 展开更多
关键词 循环游离dna 完整性 诊断 预后
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Value of circulating cell-free DNA in diagnosis of hepatocelluar carcinoma 被引量:16
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作者 Ken Chen Hong Zhang +6 位作者 Li-Na Zhang Shao-Qing Ju Jing Qi Dong-Feng Huang Feng Li Qun Wei Jing Zhang 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2013年第20期3143-3149,共7页
AIM:To investigate the value of combined detection of circulating cell-free DNA(cfDNA),a-fetal protein(AFP) and a L-fucosidase(AFU) for diagnosis of hepatocellular carcinoma(HCC).METHODS:Serum samples from 39 HCC pati... AIM:To investigate the value of combined detection of circulating cell-free DNA(cfDNA),a-fetal protein(AFP) and a L-fucosidase(AFU) for diagnosis of hepatocellular carcinoma(HCC).METHODS:Serum samples from 39 HCC patients and 45 normal controls were collected.Branched DNA(bDNA) was used to detect the level of cfDNA,and a receiver operating characteristic curve was employed to evaluate the diagnostic sensitivity,specificity,accuracy,positive predictive value,negative predictive value,positive likelihood ratio,negative likelihood ratio and Youden index,and to assess the diagnostic efficiency and their correlations with the clinicopathological features.AFP and AFU were detected by chemiluminescence and colorimetry,respectively.The significance of combined detection of the three biomarkers was discussed.RESULTS:cfDNA level was increased in 22 of the 39 HCC samples and in 2 of the 45 normal controls.cfDNA level in HCC samples was significantly higher than that in normal controls(P < 0.05).There were significant differences in sex and extra-and intrahepatic metastasis(P < 0.05).There was no significant correlation between cfDNA,AFP and AFU in the detection of HCC.The sensitivity of combined detection of cfDNA with one marker(AFP or AFU) and cfDNA with two markers(AFP and AFU) was 71.8%,87.2% and 89.7% vs 56.4%,53.8% and 66.7% for cfDNA,AFP and AFU used alone,respectively,the difference being statistically significant(P < 0.05).CONCLUSION:Quantitative analysis of cfDNA is sensitive and feasible,and the combined detection of cfDNA with AFP or AFU or both could improve the diagnostic sensitivity for HCC. 展开更多
关键词 ALU BRANCHED dna circulating cell free dna DIAGNOSIS HEPATOCELLULAR carcinoma
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C-TIRADS联合cfDNA鉴别诊断甲状腺结节价值及临床效用评价 被引量:1
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作者 侯婷婷 夏燕妮 张红伟 《河北医药》 CAS 2023年第18期2736-2740,共5页
目的 探讨中国超声甲状腺结节恶性危险分层指南(C-TIRADS)联合循环游离DNA(cfDNA)鉴别诊断甲状腺结节价值及临床效用。方法 回顾性选取2020年3月至2022年9月于我院甲状腺外科有明确病理结果的395例甲状腺结节患者的临床资料,其中良性结... 目的 探讨中国超声甲状腺结节恶性危险分层指南(C-TIRADS)联合循环游离DNA(cfDNA)鉴别诊断甲状腺结节价值及临床效用。方法 回顾性选取2020年3月至2022年9月于我院甲状腺外科有明确病理结果的395例甲状腺结节患者的临床资料,其中良性结节303例(良性组),恶性结节92例(恶性组)。比较2组一般资料、超声征象、C-TIRADS评分、cfDNA,采用受试者工作特征曲线(ROC)分析C-TIRADS评分、cfDNA及二者联合鉴别诊断甲状腺结节性质的价值,采用OR危险度分析C-TIRADS、cfDNA与甲状腺结节恶性风险的关系,采用临床决策曲线(DCA)分析不同鉴别诊断方案的临床效用。结果 恶性组有甲状腺癌家族史患者多于良性组(P<0.05);恶性组超声征象垂直位、极低回声、微钙化、边缘模糊或不规则或甲状腺外侵犯、实性表现患者多于良性组,彗星尾伪像患者少于良性组(P<0.05);恶性组C-TIRADS评分、cfDNA高于良性组(P<0.05);ROC分析显示,C-TIRADS、cfDNA及二者联合鉴别诊断甲状腺结节的AUC分别为0.843、0.812、0.939,C-TIRADS联合cfDNA的AUC大于C-TIRADS、cfDNA(P<0.05);OR危险度分析显示,C-TIRADS≥4分患者甲状腺结节恶性的风险是<4分患者的12.496倍(P<0.05);cfDNA≥63.70 ng/ml患者甲状腺结节恶性的风险是<63.70 ng/ml患者的9.863倍(P<0.05);绘制DCA曲线显示,C-TIRADS、cfDNA及二者联合鉴别诊断甲状腺结节均具有正向的临床净获益,且采用C-TIRADS联合cfDNA鉴别诊断时,临床效用进一步提高。结论 C-TIRADS联合cfDNA能相互弥补,提高对甲状腺结节的鉴别诊断价值,具有良好的临床效用,为临床鉴别恶性结节提供了一个无创、准确、便捷的方案,有助于提高甲状腺结节的诊疗水平。 展开更多
关键词 中国超声甲状腺结节恶性危险分层指南 cfdna 甲状腺结节 鉴别诊断价值 临床效用
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血清sST2、cfDNA预测重症肺炎患儿并发心肌损害的价值 被引量:2
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作者 刘晔 王敬 +3 位作者 赵春娟 刘田田 王贤 李芳 《标记免疫分析与临床》 CAS 2023年第1期86-90,共5页
目的探讨分析血清可溶性生长刺激表达基因2蛋白(sST2)、循环游离DNA(cfDNA)预测重症肺炎患儿并发心肌损害的价值。方法连续入选2020年12月至2021年12月期间我院收治的108例重症肺炎患儿,根据患者是否发生心肌损害分为合并心肌损害组22... 目的探讨分析血清可溶性生长刺激表达基因2蛋白(sST2)、循环游离DNA(cfDNA)预测重症肺炎患儿并发心肌损害的价值。方法连续入选2020年12月至2021年12月期间我院收治的108例重症肺炎患儿,根据患者是否发生心肌损害分为合并心肌损害组22例和无心肌损害组86例。入院时搜集患者临床资料,并采集患者血清样本,采用酶联免疫吸附法检测血清sST2、cfDNA水平,分析其水平与重症肺炎并发心肌损害的关系。结果合并心肌损害组血清sST2、cfDNA水平高于无心肌损害组(P<0.05)。单因素分析结果显示,合并心肌损害组年龄<3岁、并发呼吸衰竭、低蛋白血症、低氧血症、低钾血症、发病至入院时间3~7d、发病至入院时间>7d、血清sST2升高、血清cfDNA升高比例高于无心肌损害组(P<0.05)。Logistic回归分析结果显示,年龄<3岁、并发呼吸衰竭、低蛋白血症、低氧血症、低钾血症、低钠血症、发病至入院时间>3d、血清sST2升高、血清cfDNA升高是重症肺炎患儿并发心肌损害的独立危险因素(P<0.05)。血清sST2截断值为46.38ng/mL时,预测重症肺炎并发心肌损害的AUC为0.76(0.723~0.816),灵敏度为78.43%、特异性为73.25%;血清cfDNA截断值为427.59mg/L时,预测重症肺炎并发心肌损害的AUC为0.75(0.735~0.842),灵敏度为76.49%、特异性为74.31%;二者联合预测重症肺炎并发心肌损害的AUC为0.83(0.756~0.879),灵敏度为85.26%、特异性为73.42%。结论重症肺炎患儿血清sST2、cfDNA升高,其水平升高是心肌损害发生的独立威胁因素,对预测重症肺炎患儿并发心肌损害具有较好预测价值。 展开更多
关键词 可溶性生长刺激表达基因2蛋白 循环游离dna 重症肺炎 心肌损害 预测价值
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Abnormal DNA methylation as a cell-free circulating DNA biomarker for colorectal cancer detection:A review of literature 被引量:2
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作者 Michail Galanopoulos Nikolaos Tsoukalas +3 位作者 Ioannis S Papanikolaou Maria Tolia Maria Gazouli Gerassimos J Mantzaris 《World Journal of Gastrointestinal Oncology》 SCIE CAS 2017年第4期142-152,共11页
Colorectal cancer(CRC) is one of the most prevalent malignancies in the world. CRC-associated morbidity and mortality is continuously increasing, in part due to a lack of early detection. The existing screening tools ... Colorectal cancer(CRC) is one of the most prevalent malignancies in the world. CRC-associated morbidity and mortality is continuously increasing, in part due to a lack of early detection. The existing screening tools such as colonoscopy, are invasive and yet high cost, affecting the willingness of patients to participate in screening programs. In recent years, evidence is accumulating that the interaction of aberrant genetic and epigenetic modifications is the cornerstone for the CRC development and progression by alternating the function of tumor suppressor genes, DNA repair genes and oncogenes of colonic cells. Apart from the understanding of the underlying mechanism(s) of carcinogenesis, the aforementioned interaction has also allowed identification of clinical biomarkers, especially epigenetic, for the early detection and prognosis of cancer patients. One of the ways to detect these epigenetic biomarkers is the cell-free circulating DNA(circ DNA), a blood-based cancer diagnostic test, mainly focusing in the molecular alterations found in tumor cells, such as DNA mutations and DNA methylation.In this brief review, we epitomize the current knowledge on the research in circ DNA biomarkers-mainly focusing on DNA methylation-as potential blood-based tests for early detection of colorectal cancer and the challenges for validation and globally implementation of this emergent technology. 展开更多
关键词 Colorectal cancer early detection Colorectal cancer screening circulating free dna Colorectal cancer blood-based biomarkers dna methylation blood biomarkers
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循环游离DNA在肾脏疾病中的研究进展
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作者 王学良 苑书婷 +1 位作者 李甜 席春生 《中国医药导报》 CAS 2024年第24期68-73,共6页
肾脏疾病是一类严重威胁人类健康的疾病,其发病率及死亡率高,寻求高灵敏度的生物学指标有助于早期诊断和改善预后。循环游离DNA是一类存在于血浆、尿液及其他体液中游离于细胞外的双链DNA片段。循环游离DNA参与机体内在的炎症反应和凝... 肾脏疾病是一类严重威胁人类健康的疾病,其发病率及死亡率高,寻求高灵敏度的生物学指标有助于早期诊断和改善预后。循环游离DNA是一类存在于血浆、尿液及其他体液中游离于细胞外的双链DNA片段。循环游离DNA参与机体内在的炎症反应和凝血过程,在肾脏疾病中显著升高,可作为肾脏疾病的潜在生物标志物,对疾病的诊断和预后有重大意义。本文对循环游离DNA的生物学特性、在肾脏疾病中的作用及应用进展进行综述,以期为肾脏疾病的早期诊断及预后提供参考。 展开更多
关键词 循环游离dna 肾脏疾病 生物标志物 诊断及预后
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多发性骨髓瘤血浆循环游离DNA定量检测和完整性分析
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作者 张岚鑫 蒋艺枝 +1 位作者 邱丽君 黄东平 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1106-1111,共6页
目的:研究血浆循环游离DNA(cf-DNA)在初诊多发性骨髓瘤(MM)患者筛查诊断中的作用,并探讨经化疗后患者的cf-DNA含量和完整性的变化在疾病评估中的作用。方法:收集35例初诊MM患者和18例健康志愿者的外周血标本,另选取MM患者中完成规范诱... 目的:研究血浆循环游离DNA(cf-DNA)在初诊多发性骨髓瘤(MM)患者筛查诊断中的作用,并探讨经化疗后患者的cf-DNA含量和完整性的变化在疾病评估中的作用。方法:收集35例初诊MM患者和18例健康志愿者的外周血标本,另选取MM患者中完成规范诱导化疗3个疗程的13例患者作为随访组。以ALU247片段及ALU115片段为目的基因,用荧光定量PCR检测患者及健康志愿者血浆中的cf-DNA含量,并以ALU247/ALU115比值计算cf-DNA的完整性。结果:MM患者ALU247、ALU115片段浓度和cf-DNA完整性均显著高于健康志愿者(均P<0.05)。经3个疗程诱导化疗的患者治疗后的ALU247和ALU115片段浓度以及cf-DNA的完整性均较治疗前显著降低(均P<0.05),且治疗前后cf-DNA完整性与血清M蛋白含量及骨髓异常浆细胞比例之间均存在较强正相关关系(r_(M蛋白)=0.703,r_(骨髓浆细胞)=0.705)。结论:cf-DNA对于MM的筛查诊断具有一定的积极意义。cf-DNA或许可以协同或者替代血清M蛋白含量及骨髓异常浆细胞比例评估患者的病情、疗效及预后。 展开更多
关键词 初诊多发性骨髓瘤 循环游离dna ALU247 ALU115 完整性
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磁共振动态增强结合血循环肿瘤细胞、循环游离DNA对乳腺癌的临床诊断研究
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作者 张倩 俱京涛 +1 位作者 张雅琼 张春谦 《安徽医药》 CAS 2024年第4期732-736,I0003,共6页
目的探讨磁共振动态增强(DCE-MRI)结合血循环肿瘤细胞(CTCs)、循环游离DNA(cfDNA)对乳腺癌的诊断价值。方法选取沧州市人民医院2020年6月至2021年11月符合纳入标准的乳腺癌病人82例(乳腺癌组)。另选同期65例乳腺良性病变且未合并其他疾... 目的探讨磁共振动态增强(DCE-MRI)结合血循环肿瘤细胞(CTCs)、循环游离DNA(cfDNA)对乳腺癌的诊断价值。方法选取沧州市人民医院2020年6月至2021年11月符合纳入标准的乳腺癌病人82例(乳腺癌组)。另选同期65例乳腺良性病变且未合并其他疾病者作为良性组。比较两组DCE-MRI定量参数、CTCs、cfDNA水平,对比MRI特征,分析DCE-MRI结合CTCs、cfDNA诊断乳腺癌的价值。结果乳腺癌组DCE-MRI定量参数速度常数(K^(trans))值、速率常数(K_(ep))值、Alu247/115水平及CTCs计数分别为(0.18±0.04)min、(1.32±0.27)min、(12.97±2.14)个/毫升、0.97±0.32,比良性组高(0.05±0.01)min、(0.51±0.11)min、(10.15±1.45)个/毫升、0.55±0.12(P<0.05)。良性组边缘多光滑,形状规则,内部强化以均匀为主,时间-信号强度曲线(TIC)以Ⅰ型多见,早期增强率<60%;乳腺癌组边缘毛刺征、形状不规则,内部不均匀强化为主,以TIC分型Ⅲ型多见,早期增强率<60%占比高。两组MRI形态表现比较差异有统计学意义(P<0.05)。淋巴结转移、Ⅲ~Ⅳ期者CTCs数量、Alu247/115水平明显高于无淋巴结转移、Ⅰ~Ⅱ期者(P<0.05)。受试者操作特征(ROC)曲线分析结果显示,三者联合(DCE-MRI+CTCs+cfDNA)诊断乳腺癌的曲线下面积(AUC)、灵敏度、特异度分别为0.86、0.93、0.84,诊断效果优于单一检测CTCs、cfDNA检测(P<0.05)。结论乳腺癌病人CTCs、cfDNA存在异常表达,可能与病人临床分期、淋巴结转移有关,相对单一实验室检测,DCE-MRI结合CTCs、cfDNA检测能获取更多可靠信息。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 肿瘤细胞 循环 磁共振成像 循环游离dna 诊断价值
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血浆循环游离DNA水平及其完整性用于肺结节良恶性的诊断研究 被引量:1
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作者 居冠军 施民新 +4 位作者 樊怿辉 陈赛华 刘红利 龚海鹏 朱桂娟 《实用临床医药杂志》 CAS 2023年第7期25-29,共5页
目的 探讨血浆循环游离DNA(cfDNA)水平及其完整性对肺结节良恶性的诊断价值。方法 选取110例肺结节患者作为研究对象,根据病理诊断结果分为良性肺结节组60例与恶性肺结节组50例,另选取同期健康体检者30例设为对照组。采用酶联免疫吸附... 目的 探讨血浆循环游离DNA(cfDNA)水平及其完整性对肺结节良恶性的诊断价值。方法 选取110例肺结节患者作为研究对象,根据病理诊断结果分为良性肺结节组60例与恶性肺结节组50例,另选取同期健康体检者30例设为对照组。采用酶联免疫吸附试验检测血浆癌胚抗原(CEA)、细胞角蛋白19片段抗原21-1(CYFRA21-1)水平,采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测血浆cfDNA水平和cfDNA完整性;绘制受试者工作特征(ROC)曲线,分析并比较血浆cfDNA水平、cfDNA完整性、CEA、Cyfra21-1单独和联合应用对恶性肺结节的诊断效能。结果 恶性肺结节组血浆cfDNA、CEA、Cyfra21-1水平依次为1 154.83(452.85,1 642.31)、7.93(3.21,10.31)、5.75(2.85,8.12) ng/mL,分别高于良性肺结节组的385.43(176.45,704.55)、2.67(1.36,5.45)、2.74(1.43,3.96) ng/mL,差异有统计学意义(P<0.001);恶性肺结节组患者cfDNA完整性为0.68(0.47,0.91),高于良性肺结节组的0.37(0.26,0.59),差异有统计学意义(P<0.001)。血浆cfDNA水平和cfDNA完整性与恶性肺结节患者性别、年龄、是否吸烟、肿瘤直径、病理类型、TNM分期、肿瘤分化程度、淋巴结转移均无相关性(P>0.05)。ROC曲线显示,血浆cfDNA水平、cfDNA完整性诊断恶性肺结节的曲线下面积、敏感度、特异度均大于或高于CEA、Cyfra21-1;血浆cfDNA、CEA、Cyfra21-1水平和cfDNA完整性联合诊断恶性肺结节的敏感度、特异度均高于四者单独检测,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 血浆cfDNA水平和cfDNA完整性对恶性肺结节具有一定的诊断价值,可作为肺结节良恶性辅助诊断的分子生物学指标。 展开更多
关键词 循环游离dna 肺结节 良恶性 血浆 癌胚抗原 细胞角蛋白19片段抗原21-1
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DNA甲基化谱:流淌的生命脉律——纪念DNA双螺旋结构发现70周年
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作者 廖端芳 张佳 +1 位作者 卢光明 李凯 《湖南中医药大学学报》 CAS 2023年第7期1315-1319,共5页
70年前,随着DNA双螺旋结构的发现,人类进入基因组时代;21世纪初,人类基因组测序完成及对转录组、蛋白质组和表观遗传的研究,人类继而进入后基因组时代;近年对DNA甲基化的深入研究,预示更为神秘宽广的表观遗传组学时代已经到来。人体血... 70年前,随着DNA双螺旋结构的发现,人类进入基因组时代;21世纪初,人类基因组测序完成及对转录组、蛋白质组和表观遗传的研究,人类继而进入后基因组时代;近年对DNA甲基化的深入研究,预示更为神秘宽广的表观遗传组学时代已经到来。人体血液中大量存在的甲基化DNA构成甲基化谱,作为一个整合性指标,有如一曲流淌的生命脉律,反映不同细胞的生理或病理状态。精准分析甲基化谱,具有诊断疾病特别是肿瘤早筛早诊的价值;同时可作为人类健康、乃至天赋的量化评估指标;也可用于中医体质辨识与证型分类及中药材溯源、真伪识别和品种改良。本文介绍表观遗传组学时代甲基化谱的重要意义,以纪念DNA双螺旋结构发现70周年。 展开更多
关键词 dna甲基化 甲基化谱 游离核酸 表观遗传 肿瘤早筛
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系统性红斑狼疮患者外周血不同形式循环游离DNA(cfDNA)的水平和免疫活性比较 被引量:2
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作者 黄建军 李志 +3 位作者 程龙 张鹏 李小宁 冯钢 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期633-640,共8页
目的检测并分析不同形式循环游离DNA(cfDNA)在系统性红斑狼疮(SLE)患者外周血含量和对巨噬细胞和树突状细胞的刺激活性。方法募集58例SLE患者、66例非SLE自身免疫性疾病患者(non-SLE)和60例正常对照,提取血浆中总cfDNA、外泌体cfDNA和... 目的检测并分析不同形式循环游离DNA(cfDNA)在系统性红斑狼疮(SLE)患者外周血含量和对巨噬细胞和树突状细胞的刺激活性。方法募集58例SLE患者、66例非SLE自身免疫性疾病患者(non-SLE)和60例正常对照,提取血浆中总cfDNA、外泌体cfDNA和免疫复合物cfDNA,采用荧光法检测不同形式cfDNA含量,采用抗体捕获法检测不同形式cfDNA总甲基化水平。体外诱导培养巨噬细胞和树突状细胞,分别与DNA酶1样分子3(DNASE1L3)或IgG特异性降解酶处理前后的SLE来源的外泌体或免疫复合物共培养,采用多重荧光微球法检测巨噬细胞炎性蛋白1a(MIP-1a)、MIP-1b、白细胞介素4(IL-4)、IL-1β、IL-2、白细胞介素1受体拮抗剂(IL-1ra)、单核细胞趋化蛋白1(MCP-1)、IL-6、IL-9、IL-10、IL-12、IL-8、肿瘤坏死因子α(TNF-α)、α干扰素(IFN-α)和IFN-γ分泌以及细胞表面CD40、CD80和CD86。结果SLE组、non-SLE组外泌体cfDNA和免疫复合物cfDNA水平显著增加,SLE患者组也显著高于non-SLE组,单纯cfDNA在三组间无明显变化。除单纯cfDNA以外,SLE患者血浆不同类型cfDNA甲基化水平均显著低于non-SLE组和健康人群。消化酶处理后的外泌体和免疫复合物刺激分泌的MIP-1a、MIP-1b、IL-4、IL-1β、IL-2、IL-1ra、MCP-1、IL-6、IL-9、IL-8、TNF-α和IFN-α水平显著低于未经处理的刺激物,DNASE1L3处理后的外泌体和免疫复合物刺激后分泌的细胞因子量也显著低于IgG酶消化处理后得刺激物。与处理前相比,SLE患者来源的外泌体和免疫复合物经DNASE1L3处理后,对CD80、CD86和CD40在巨噬细胞和树突状细胞的刺激反应性均显著降低(CD86在巨噬细胞上的反应性无明显改变);IgG特异性降解酶降解处理前后的刺激对CD80、CD86和CD40在两种细胞的反应性表现不一,但总体上呈下降趋势。结论SLE患者血浆外泌体和免疫复合物cfDNA水平显著升高,可刺激巨噬细胞和树突状细胞产生较强应答。 展开更多
关键词 循环游离dna(cfdna) 系统性红斑狼疮(SLE) 外泌体 巨噬细胞 树突状细胞
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血CTCs和cfDNA联合检测与传统肿瘤标志物检测在辅助诊断乳腺癌中的应用价值比较 被引量:9
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作者 程朝晖 徐伟明 陈玉珠 《临床和实验医学杂志》 2020年第9期994-997,共4页
目的比较血循环肿瘤细胞(CTCs)、循环游离DNA(cf DNA)联合检测与传统肿瘤标志物糖蛋白抗原153(CA153)检测在辅助诊断乳腺癌中的应用价值。方法回顾性选择2017年1月到2019年6月在安徽省第二人民医院收治的82例被确诊的乳腺癌患者为乳腺癌... 目的比较血循环肿瘤细胞(CTCs)、循环游离DNA(cf DNA)联合检测与传统肿瘤标志物糖蛋白抗原153(CA153)检测在辅助诊断乳腺癌中的应用价值。方法回顾性选择2017年1月到2019年6月在安徽省第二人民医院收治的82例被确诊的乳腺癌患者为乳腺癌组,选取同期收治的50例乳腺良性疾病患者为乳腺良性疾病组,50例于该院体检的健康女性为对照组。采用ROCHE化学发光仪检测血清CA153水平;采用qPCR检测血浆cf DNA基因水平(241 bp hTERT和100 bp hTERT)和完整性(241 bp hTERT/100 bp hTERT);采用Ce1l Search系统检测血CTCs;受试者工作曲线(ROC)分析血CA153、cf DNA与CTCs诊断乳腺癌的诊断价值。结果乳腺癌组患者的血CTCs阳性表达率为37. 80%,明显高于乳腺良性疾病组的16. 00%(P <0. 05),明显高于对照组的12. 00%(P <0. 05);乳腺癌组的血CA153、241 bp hTERT、100 bp hTERT、241 bp hTERT/100 bp hTERT水平均明显高于乳腺良性疾病组(P <0. 05),乳腺良性疾病组的血CA153、241 bp hTERT、100 bp hTERT、241 bp hTERT/100 bp h TERT水平均明显高于对照组(P <0. 05);ROC分析显示,血cf DNA 241 bp hTERT、100 bp hTERT、241 bp hTERT/100 bp hTERT以及三者联合诊断乳腺癌的曲线下面积(AUC)依次为0. 865、0. 725、0. 870和0. 950;血CTCs和CA153诊断乳腺癌的AUC为0. 609和0. 733,明显低于cf DNA诊断的0. 950。结论血cf DNA对乳腺癌具有较高的诊断价值,有望应用于乳腺癌患者的临床辅助诊断。 展开更多
关键词 乳腺癌 血循环肿瘤细胞 循环游离dna 糖蛋白抗原153
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外周血CTCs、cfDNA联合检测在肝癌早期筛查中的应用价值分析 被引量:6
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作者 阎其均 翁羽 朱付英 《临床输血与检验》 CAS 2020年第4期429-433,共5页
目的探讨外周血循环肿瘤细胞(CTCs)、游离DNA(cfDNA)联合检测在肝癌早期筛查中的应用价值。方法选取我院2017年9月~2019年8月收治的182例高度疑似肝癌患者,根据病理学检查结果将其分为癌症组和良性组。采用t检验分析两组患者临床指标及... 目的探讨外周血循环肿瘤细胞(CTCs)、游离DNA(cfDNA)联合检测在肝癌早期筛查中的应用价值。方法选取我院2017年9月~2019年8月收治的182例高度疑似肝癌患者,根据病理学检查结果将其分为癌症组和良性组。采用t检验分析两组患者临床指标及外周血CTCs、cfDNA的差异,Pearson相关性分析癌症组患者外周血CTCs、cfDNA水平与肝功能指标、相关肿瘤标志物的关系,利用受试者工作特征曲线(ROC)评价外周血CTCs、cfDNA检测在早期肝癌筛查中的诊断效能。结果癌症组患者血清AFP、γ-GT、CEA、ALT、AST、ALP及外周血CTCs、cfDNA水平均高于良性组,差异均有统计学意义(P<0.05)。经Pearson相关性分析发现,癌症组外周血CTCs、cfDNA水平与AFP、CEA及肝功能水平均呈正相关性(P<0.05);肝癌不同分期外周血CTCs、cfDNA水平比较差异具有统计学意义(P<0.05);ROC曲线显示,CTCs诊断肝癌的AUC为0.854,最佳临界值为4个/5 mL,灵敏度为75.54%,特异性为86.05%;cfDNA诊断肝癌AUC为0.831,最佳临界值为19.38 ng/mL,灵敏度为78.42%,特异性为79.07%;二者联合诊断肝癌的AUC、灵敏度和特异性分别为0.923、82.01%和90.70%。结论肝癌患者外周血CTCs、cfDNA水平升高,CTCs、cfDNA联合检测对肝癌的早期筛查具有更高的临床价值。 展开更多
关键词 循环肿瘤细胞 游离dna 肝癌 筛查价值
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血CTCs、cfDNA检测在乳腺癌中的应用 被引量:6
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作者 常立伟 杨东炜 刘东辰 《分子诊断与治疗杂志》 2020年第10期1298-1302,共5页
目的探究血循环肿瘤细胞(CTCs)、循环游离DNA(cfDNA)检测在乳腺癌中的应用价值。方法选取2014年4月至2016年4月经手术治疗的乳腺疾病患者163例,其中85例术后病理确诊为乳腺癌(乳腺癌组),另78例为乳腺良性疾病患者(良性疾病组),同时募集... 目的探究血循环肿瘤细胞(CTCs)、循环游离DNA(cfDNA)检测在乳腺癌中的应用价值。方法选取2014年4月至2016年4月经手术治疗的乳腺疾病患者163例,其中85例术后病理确诊为乳腺癌(乳腺癌组),另78例为乳腺良性疾病患者(良性疾病组),同时募集同期入院体检健康女性50例(对照组)。观察各组血CTCs、cfDNA及传统肿瘤标志物(CA125、CA153及CEA)水平,采用受试者工作特征曲线(ROC)描述上述指标单项及联合检测对乳腺癌患者的诊断价值,同时分析血CTCs、cfDNA水平与乳腺癌患者临床病理特征及预后的关系。结果乳腺癌组血CTCs、cfDNA、CA125、CA153及CEA均高于良性疾病组和对照组,差异具有统计学意义(P<0.05),但良性疾病组和对照组比较差异无统计学意义(P>0.05);血CTCs、cfDNA单独或联合及三项联合检测诊断乳腺癌的AUC分别为0.752、0.885、0.857、0.852,均高于传统肿瘤标志物诊断,差异具有统计学意义(P<0.05);肿瘤大小≥2 cm乳腺癌患者血CTCs阳性率高于肿瘤大小<2 cm者,差异具有统计学意义(P<0.05);有淋巴结转移者cfDNA阳性率高于无转移者,差异具有统计学意义(P<0.05);术后3年,疾病进展者CTCs、cfDNA阳性率均高于无疾病进展组,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论血CTCs、cfDNA检测对于乳腺癌有较高的诊断价值,且与患者临床病理特征及预后密切相关。 展开更多
关键词 循环肿瘤细胞 循环游离dna 传统肿瘤标志物 乳腺癌
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血浆cfDNA浓度检测在食管癌放射治疗疗效评估中的应用效果
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作者 葛国通 蒋晓东 《广西医科大学学报》 CAS 2022年第11期1742-1746,共5页
目的:探讨血浆循环核酸(cfDNA)浓度检测在食管癌放射治疗疗效评价中的应用效果。方法:将2019年1—12月徐州医科大学附属连云港医院收治的120例食管癌患者作为研究组,同期选取120例健康体检者作为对照组。检测治疗前、后血浆cfDNA浓度与... 目的:探讨血浆循环核酸(cfDNA)浓度检测在食管癌放射治疗疗效评价中的应用效果。方法:将2019年1—12月徐州医科大学附属连云港医院收治的120例食管癌患者作为研究组,同期选取120例健康体检者作为对照组。检测治疗前、后血浆cfDNA浓度与血清肿瘤标志物水平。研究组治疗3个月后,根据疗效评估结果将患者分为完全缓解组、部分缓解组和无缓解组,比较各组上述指标。血浆cfDNA浓度用于评估食管癌放疗疗效并进行受试者工作特征(ROC)曲线分析,计算最佳界值,并对该界值进行验证。结果:研究组治疗前、后血浆cfDNA浓度、血清肿瘤标志物水平均高于对照组(P<0.05),但在治疗后呈下降趋势。完全缓解组、部分缓解组、无缓解组治疗后3个月血浆cfDNA浓度和血清肿瘤标志物水平逐渐上升,除完全缓解组与部分缓解组的血清SCC-Ag、CA72-4水平差异不显著(P>0.05),其余指标差异均具有统计学意义(P<0.05)。通过ROC曲线分析,血浆cfDNA浓度评估食管癌放疗疗效最佳界限值为150 ng/mL,灵敏度与特异性分别为96.33%、95.88%。经验证评估疗效准确性为99.17%。结论:血浆cfDNA浓度与食管癌放疗效果有关,疗效评定结果越好血浆cfDNA浓度越低,血浆cfDNA有望成为食管癌患者的疗效评定指标。 展开更多
关键词 食管癌 放射治疗 循环核酸 肿瘤标志物
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结直肠癌患者血浆cfDNA检测方法的建立及临床应用评估 被引量:1
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作者 朱赟洁 马峥尧 +6 位作者 沈敏娜 周琰 黄斐 陈馨宁 张春燕 王蓓丽 郭玮 《检验医学》 CAS 2022年第6期561-567,共7页
目的建立基于下一代测序(NGS)平台的检测结直肠癌患者血浆循环游离DNA(cfDNA)的方法,并进行性能确认和临床应用评价。方法在NGS平台上构建测定结直肠癌患者血浆cfDNA的检测系统(简称结直肠癌cfDNA panel)。对结直肠癌cfDNA panel的准确... 目的建立基于下一代测序(NGS)平台的检测结直肠癌患者血浆循环游离DNA(cfDNA)的方法,并进行性能确认和临床应用评价。方法在NGS平台上构建测定结直肠癌患者血浆cfDNA的检测系统(简称结直肠癌cfDNA panel)。对结直肠癌cfDNA panel的准确性、精确性、可用于抽提的最少样本量和投入量、分析灵敏度、分析特异性等性能指标进行评估。比较结直肠癌cfDNA panel与Miseq Dx二代测序平台及突变扩增阻滞系统(ARMS)(肿瘤组织样本)的一致性。结果结直肠癌cfDNA panel的准确性为99.97%,对预期突变的检出率为100%。可用于血浆抽提的样本起始量为1 mL,cfDNA投入量为10 ng,分析灵敏度为0.2%。10000 mg/L血红蛋白、500 mg/L胆红素或2%脂肪乳对结直肠癌cfDNA panel抽提无影响。结直肠癌cfDNA panel与Miseq Dx二代测序平台和ARMS(肿瘤组织样本)的一致性分别为94.12%和90.91%,结直肠癌cfDNA panel与Miseq Dx二代测序平台检测KRAS、NRAS、BRAF、PIK3CA的阳性符合率和阴性符合率分别为100%和99.60%。结论结直肠癌cfDNA panel的检测性能符合临床应用要求,且血浆cfDNA结果与肿瘤组织结果高度一致,可作为组织活检的有益补充。 展开更多
关键词 循环游离dna 结直肠癌 下一代测序 实验室自建项目
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细胞游离DNA在胆道癌诊断中的价值:一项meta分析
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作者 杨越 何开举 +3 位作者 宗家豪 杨自逸 吴向嵩 龚伟 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期1175-1185,共11页
目的·采用meta分析方法全面评价细胞游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)对胆道癌(biliary tract cancer,BTC)的诊断准确性,探究样本来源、检测方法以及截断值选择等对诊断效果的影响,为更好开展临床应用提供依据。方法·检索8个中... 目的·采用meta分析方法全面评价细胞游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)对胆道癌(biliary tract cancer,BTC)的诊断准确性,探究样本来源、检测方法以及截断值选择等对诊断效果的影响,为更好开展临床应用提供依据。方法·检索8个中英文数据库中关于cfDNA对BTC诊断价值的前瞻性或回顾性研究,截止时间为2023年4月。根据纳入和排除标准进行筛选和数据提取,用Spearman秩相关分析评估阈值效应,运用Cochran Q检验、I^(2)检验分析纳入研究间的异质性。拟合双变量混合效应模型,计算总体敏感度、特异度和曲线下面积(area under the curve,AUC)等统计量,判断诊断性能。同时,基于研究类型、样本量大小、检测方式、样本来源和诊断参照标准进行亚组分析。结果·共纳入28项诊断性试验,用诊断性试验准确性质量评价工具2(Diagnostic Accuracy Studies Tool Version 2,QUADAS-2)评价均属于中-高等质量研究,Spearman秩相关分析提示存在阈值效应,合并统计量后求得敏感度(Sen合并)为0.80(95%CI 0.67~0.88),特异度(Spe_(合并))为0.96(95%CI 0.92~0.98),阳性似然比(PLR合并)为22.7(95%CI 9.4~55.2),阴性似然比(NLR合并)为0.21(95%CI 0.12~0.36),诊断比数比(DOR合并)为108(95%CI 31~374)。综合受试者工作特征(summary receiver operating characteristic,SROC)曲线的AUC为0.96(95%CI 0.94~0.98),提示cfDNA对BTC的诊断效能较高。亚组分析结果提示,选择不同的检测方式和样本来源的准确度和敏感度有所不同。结论·cfDNA检测对诊断BTC敏感度和特异度较高,适用于经影像学和常规肿瘤标志物初筛怀疑有恶性风险的患者,但检测方法和样本来源的选择仍需进一步开展面向更广泛人群的临床研究来进一步规范。 展开更多
关键词 META分析 胆道癌 细胞游离dna 诊断
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一种模拟游离DNA阳性质控品的制备方法及表征
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作者 方艳 王霞 +1 位作者 董莲华 杨靖亚 《计量学报》 CSCD 北大核心 2023年第3期361-367,共7页
通过优化一种新型的机理未明确的类酶解作用体系(reaction system, RS),直接作用带有KRAS G12C,KRAS G12D,EGFR L858R和EGFR T790M突变的肿瘤细胞系SW1573,SNU-C2B和NCI-H1975,通过对RS体系作用时间及作用的细胞数量的优化,可以裂解细... 通过优化一种新型的机理未明确的类酶解作用体系(reaction system, RS),直接作用带有KRAS G12C,KRAS G12D,EGFR L858R和EGFR T790M突变的肿瘤细胞系SW1573,SNU-C2B和NCI-H1975,通过对RS体系作用时间及作用的细胞数量的优化,可以裂解细胞基因组DNA制备得到一种可以高度模拟人体血浆游离DNA(cfDNA)阳性质控品。经芯片电泳检测获得的模拟cfDNA片段长度集中于(166±16) BP,与正常人体血浆cfDNA大小一致;通过微滴数字PCR检测显示RS制备的DNA片段和gDNA在目标突变位点处具有一致的突变丰度。表明经RS体系制备得到的DNA片段可以作为一种cfDNA的阳性质控品。 展开更多
关键词 计量学 游离dna 阳性质控品 模拟cfdna 突变丰度 数字PCR
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