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循环微生物DNA:一个新的肿瘤早筛生物标志物
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作者 陈慧娟 周启明 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期1696-1703,共8页
目前在全球范围内,肿瘤的发病率和致死率依旧处于较高的水平,严重威胁人类健康。基于液体活检的肿瘤早筛技术能实现肿瘤的早诊断和早治疗,对肿瘤的预防具有重要意义。微生物在肿瘤的发生、发展中扮演着重要的角色,目前已有11种微生物被... 目前在全球范围内,肿瘤的发病率和致死率依旧处于较高的水平,严重威胁人类健康。基于液体活检的肿瘤早筛技术能实现肿瘤的早诊断和早治疗,对肿瘤的预防具有重要意义。微生物在肿瘤的发生、发展中扮演着重要的角色,目前已有11种微生物被列为了1类致癌微生物。肿瘤内部存在瘤种特异性的微生物组,主要存在肿瘤细胞和免疫细胞中。肿瘤患者体内的循环微生物DNA(circulating microbial DNA,cmDNA)、主要来源于凋亡与坏死肿瘤组织细胞内微生物的被动释放,肿瘤组织细胞的主动分泌以及肠道菌群的转移等。cmDNA具有特异的生物学特征,具备成为肿瘤生物标志物的潜能。多项研究表明,通过检测cmDNA能进行多种肿瘤,例如乳腺癌、肺癌、结直肠癌、黑色素瘤等的早期筛查。本文简要介绍了人类肿瘤与微生物的关系、cmDNA的来源和生物学特征及cmDNA在肿瘤早筛中应用的研究进展。 展开更多
关键词 肿瘤微生物组 循环微生物dna 液体活检 肿瘤早筛
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Novel directions of precision oncology:circulating microbial DNA emerging in cancer-microbiome areas 被引量:2
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作者 Liting You Juan Zhou +6 位作者 Zhaodan Xin J.Spencer Hauck Feifei Na Jie Tang Xiaohan Zhou Zichen Lei Binwu Ying 《Precision Clinical Medicine》 2022年第1期46-62,共17页
Microbiome research has extended into the cancer area in the past decades.Microbes can affect oncogenesis,progression,and treatment response through various mechanisms,including direct regulation and indirect impacts.... Microbiome research has extended into the cancer area in the past decades.Microbes can affect oncogenesis,progression,and treatment response through various mechanisms,including direct regulation and indirect impacts.Microbiota-associated detectionmethods and agents have been developed to facilitate cancer diagnosis and therapy.Additionally,the cancermicrobiome has recently been redefined.The identification of intra-tumoral microbes and cancer-related circulating microbial DNA(cmDNA)has promoted novel research in the cancer–microbiome area.In this review,we define the human system of commensal microbes and the cancer microbiome from a brand-new perspective and emphasize the potential value of cmDNA as a promising biomarker in cancer liquid biopsy.We outline all existing studies on the relationship between cmDNA and cancer and the outlook for potential preclinical and clinical applications of cmDNA in cancer precision medicine,as well as critical problems to be overcome in this burgeoning field. 展开更多
关键词 circulating microbial dna liquid biopsy cancer-microbiome-immunity intra-tumor microbiome cancer precision diagnosis and therapy
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内循环UASB中微生物群落多样性分析研究
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作者 于鲁冀 陈涛 +2 位作者 宋宏杰 刘培 孔德芳 《环境工程》 CAS CSCD 北大核心 2013年第S1期116-119,共4页
应用聚合酶链式反应(polymerase chajn reaction,PCR)结合变形梯度凝胶电泳(denature gadient gel elecophoresis,DGGE)技术对内循环UASB反应器内活性污泥的微生物多样性进行分析。通过OMEGA试剂盒的方式提取活性污泥中微生物的基因组D... 应用聚合酶链式反应(polymerase chajn reaction,PCR)结合变形梯度凝胶电泳(denature gadient gel elecophoresis,DGGE)技术对内循环UASB反应器内活性污泥的微生物多样性进行分析。通过OMEGA试剂盒的方式提取活性污泥中微生物的基因组DNA,以细菌通用引物进行16S rDNA基因V3高变异区域PCR扩增,再将PCR产物(约200bp)进行变性梯度凝胶电泳分离(变形梯度为30%~60%),从而获得表征污泥样中微生物群落特征的DNA指纹图谱。借助Quantity One软件对不同污泥样进行多样性分析。研究表明,内循环UASB反应器内不同取样口取得的活性污泥虽有着共同的和不同的微生物种属,但DGGE图谱中多为共同带,少有特征带,污泥样品间的相似性很高、微生物群落多样性基本一致。反应器内污泥混合均匀、微生物种类丰富,反应器运行稳定且有很强的抗冲击能力。 展开更多
关键词 微生物多样性 内循环UASB 变性梯度凝胶电泳 颗粒污泥 16S Rdna 相似性分析
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